Pax6

parillinen laatikko 6

PDB renderöinti perustuu 2cue.
Käytettävissä olevat rakenteet
ATE Ortologinen haku: PDBe , RCSB
Tunnisteet
SymboliPAX6  ; AN; AN2; D11S812E; MGDA; WAGR
Ulkoiset tunnuksetOMIM:  607108 MGI :  97490 Homologeeni :  1212 GeneCards : PAX6 Gene
RNA-ekspressioprofiili
Lisää tietoa
ortologit
NäytäIhmisenHiiri
Entrez508018508
YhtyeENSG00000007372ENSMUSG00000027168
UniProtP26367P63015
RefSeq (mRNA)NM_000280.4NM_001244198.1
RefSeq (proteiini)NP_000271.1NP_001231127.1
Locus (UCSC)Chr 11:
31,81 – 31,84 Mb		Chr 2:
105,67 – 105,7 Mb
Hae PubMedistä[yksi][2]

Pax6 eli tyypin II aniridiaproteiini tai okulorombiini  on kudosspesifinen transkriptiotekijäproteiini . Ihmisillä se on koodattu PAX6 -geenissä .

Toiminnot

Pax6 on PAX-geeniperheen jäsen . Se toimii " pääsäätelygeeninä  " silmien ja muiden aistielinten sekä joidenkin hermo- ja epidermaalisten kudosten ja muiden homologisten rakenteiden kehityksessä, jotka yleensä syntyvät ektodermaalista alkuperää olevista kudoksista. On kuitenkin havaittu, että muut komentogeenit ovat välttämättömiä silmien kehittymiselle, ja siksi geenien ilmaisu "ohjauskeskus" voi olla epätarkka [1] . Tämä transkriptiotekijä tunnetaan parhaiten osallisuudestaan ​​kohdunulkoisten silmien indusoituun ilmentymiseen, ja sillä on lääketieteellistä merkitystä, koska heterotsygoottisilla mutanteilla on monenlaisia ​​silmävaurioita, kuten ihmisten aniridia [2] .

Eläinten monimuotoisuus

Pax6-proteiinin toiminnot ovat samankaltaisia ​​eläimissä, joilla on kahdenvälinen symmetria. Esimerkiksi Drosophila melanogasterissa oleva hiiren Pax6-proteiini laukaisee kohdunulkoisten silmien muodostumisen raajoihin ja muihin kehon osiin. Ihmisen ja hiiren Pax6-proteiinilla on sama aminohapposekvenssi [3] . Pax6- lokuksen genominen organisaatio vaihtelee merkittävästi lajien välillä, mukaan lukien erot eksonien , cis-säätelyelementtien ja transkription aloituskohtien lukumäärässä ja jakautumisessa . . Ensimmäinen työ Pax6-geenin organisoimiseksi tehtiin viiriäisellä, mutta hiiren lokusta on tutkittu tarkemmin. Sillä on vähintään kaksi promoottoria (P0 ja P1), 16 eksonia ja vähintään 6 tehostajaa . 16 vahvistettua eksonia on numeroitu 0:sta 13:een, ja niihin on lisätty eksoni α, joka sijaitsee eksonien 4 ja 5 välissä ja joihin sovelletaan vaihtoehtoista eksonin 5a silmukointia. Jokainen omaan proksimaaliseen eksoniinsa liittyvä promoottori (eksoni 0 P0:lle, eksoni 1 P1:lle) johtaa siihen, että sen transkripti silmukoituu vaihtoehtoisesti 5'-transloitumattomalle alueelle. Uskottiin, että Drosophilan Pax6:n neljä ortologia, vain kahden geenin, silmättömän ja lelun geenituotteet, ovat toiminnallisesti homologisia selkärankaisten kanonisen Pax6-isoformin geenituotteiden kanssa, kun taas kahden muun Drosophila-geenin geenituotteet, EYG ja sen TOE-kopio ovat toiminnallisesti homologisia Pax6 (5a) selkärankaisten isoformien geenituotteiden kanssa.

Isoformit

Selkärankaisten Pax6- lokus koodaa vähintään kolmea erillistä proteiini-isoformia , jotka muodostavat kanonisen Pax6:n, Pax6:n (5a) ja Pax6:n (ΔPD).

Kanoninen Pax6-proteiini sisältää N-terminaalisia parillisia domeeneja , jotka linkkerillä on liitetty parilliseen homeodomeeniin ja proliini/seriini/treoniini (P/S/T)-rikkaaseen C-terminaaliseen domeeniin. Parillinen domeeni ja parityyppinen homeodomeeni ovat DNA:ta sitovia, kun taas P/S/T-rikkaalla alueella on transaktivaatiotoiminto. Pax6(5a) on 5a-eksonin vaihtoehtoisen silmukoinnin tuote, joka on seurausta 14 radikaalin liittämisestä parialueelle, mikä muuttaa DNA:ta sitovan aktiivisuuden mallia. Nukleotidisekvenssi vastaa linkkerin aluetta, joka koodaa kolmen vaihtoehtoisen translaation laukaisevan tripletin sarjaa, josta muodostuu kolmas Pax6-isoformi. Yhdessä ne tunnetaan nimellä Pax6 (ΔPD) tai parittomia isoformeja. Lisäksi kaikilla kolmella geenituotteella on parilliset domeenit. Parittomien proteiinien molekyylipainot ovat 43, 33 tai 32 kDa riippuen käytetystä triggeritripletistä. Pax6:n transatkivaatiotoiminto selittyy C-terminaalisen P/S/T-rikkaan domeenin vaihtelevalla pituudella, joka ulottuu jopa 153 ihmisen ja hiiren proteiinien radikaaliin.

Muistiinpanot

  1. ↑ Fernald R.D.  Eyes : monimuotoisuus, kehitys ja evoluutio  // Brain, Behavior and Evolution : päiväkirja. - 2004. - Voi. 64 , nro. 3 . - s. 141-147 . - doi : 10.1159/000079743 . — PMID 15353906 .
  2. ↑ Davis LK, Meyer KJ, Rudd DS, Librant AL, Epping EA, Sheffield VC, Wassink TH Pax6 3'-deleetio johtaa aniridiaan, autismiin ja henkiseen jälkeenjääneisyyteen  // Human Genetics  : Journal  . - 2008. - Toukokuu ( osa 123 , nro 4 ) - s. 371-378 . - doi : 10.1007/s00439-008-0484-x . — PMID 18322702 .
  3. ↑ Gehring WJ, Ikeo K. Pax 6: silmän morfogeneesin ja silmän  evoluution hallitseminen //  Trends : päiväkirja. - 1999. - syyskuu ( osa 15 , nro 9 ). - s. 371-377 . - doi : 10.1016/S0168-9525(99)01776-X . — PMID 10461206 .

Kirjallisuus

Linkit