Karnitiini palmitoyylitransferaasi I

Karnitiini palmitoyylitransferaasi I
Käytettävissä olevat rakenteet
ATEOrtologinen haku: PDBe RCSB
Tunnisteet
Symbolit CPT1A , karnitiinipalmitoyylitransferaasi 1A (maksa), CPT1, CPT1-L, L-CPT1, karnitiinipalmitoyylitransferaasi 1A
Ulkoiset tunnukset OMIM: 600528 MGI: 1098296 Homologi: 1413 GeneCards: 1374
Tähän liittyvät perinnölliset sairaudet
Sairauden nimi Linkit
lihavuus
dyslipidemia
karnitiinipalmitoyylitransferaasi I:n puutos
ortologit
Erilaisia Ihmisen Hiiri
Entrez
Yhtye
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001031847
NM_001876

NM_013495

RefSeq (proteiini)

NP_001027017
NP_001867

NP_038523

Locus (UCSC) Chr 11: 68,75 – 68,84 Mb Chr 19: 3,37 – 3,44 Mb
PubMed- haku [5] [6]
Muokkaa (ihminen)Muokkaa (hiiri)

Karnitiinipalmitoyylitransferaasi I , myös karnitiiniasyylitransferaasi I , karnitiiniasyyli-CoA-transferaasi I tai palmitoyyli-CoA-transferaasi I ( karnitiini palmitoyylitransferaasi I , lyhenne CPT1  ) on mitokondrioentsyymi, yksi karnitiini-O-palmitoyylitransferaasin ( 3.1.EC )2- muodoista . Arkistoitu 5. toukokuuta 2016 Wayback Machinessa ), kuuluu asyylitransferaasiperheeseen [1] . Katalysoi asyyliryhmän (-COR) siirtymistä asyyli-CoA-rasvahappomolekyylistä, jossa on pitkä hiilivetyketju, karnitiinimolekyyliin , jolloin muodostuu asyylikarnitiinia ja vapaata koentsyymi A -molekyyliä . Usein reaktion tuote on palmitoyylikarnitiini (tästä entsyymin nimi), mutta myös muut rasvahappojäännökset (asyyliryhmät – COR) voivat toimia substraattina [2] [3] . Yksi useista karnitiinin kuljetusjärjestelmän entsyymeistä . Tätä entsyymiä koodaava geeni sijaitsee 11. kromosomissa - CPT1A Arkistoitu 10. syyskuuta 2016 Wayback Machinessa .

Entsyymillä on 3 isoformia: CPT1A, CPT1B ja CPT1C. CPT1 liittyy mitokondrioiden ulkokalvoon. Tämän entsyymin aktiivisuutta voidaan vähentää malonyyli-CoA:lla (joka on estäjä), joka on rasvahappojen biosynteesiin osallistuva metaboliitti. Karnitiinipalmitoyylitransferaasi I:llä on tärkeä rooli erilaisissa aineenvaihduntahäiriöissä, kuten esimerkiksi diabeteksessa . Kiteen rakennetta ei kuitenkaan vielä tunneta, minkä vuoksi sen tarkkaa vaikutusmekanismia ei tunneta.

Rakenne

CPT1 viittaa kiinteään kalvoproteiiniin , joka liittyy ulompaan mitokondriokalvoon peptidiketjun transmembraanialueiden kautta. Sekä terminaaliset N- että C-domeenit sijaitsevat kalvon sytoplasmisella puolella [4] .

Kaikki kolme entsyymin isoformia löytyvät nisäkkäiden kudoksista. Maksan isoformi (CPT1A tai CPTI-L) sijaitsee kaikkien kehon solujen mitokondrioissa, lukuun ottamatta luurankolihassoluja ja ruskeita rasvakudossoluja [5] [6] . Lihaksen isoformi (CPT1B tai CPTI-M) on voimakkaasti ilmentyvä proteiini, jota tuotetaan sydämen sydänlihassoluissa, luustolihassoluissa (lihassoluissa) ja ruskeissa rasvakudossoluissa [4] [5] [6] . Kolmas isoformi, aivot (CPT1C), eristettiin vuonna 2002, ja se sijaitsee pääasiassa aivoissa ja kiveksissä . Tästä lomakkeesta tiedetään vähän [7] [8] .

Kaikkien CPT1-isoformien tarkkaa rakennetta ei ole vielä määritetty, vaikka in silico -malleja on luotu läheisesti sukulaisten CPT1-entsyymien - asyylikarnitiinitransferaasien, kuten karnitiiniasetyylitransferaasin (CRAT) perusteella [9] .

Tärkeä rakenteellinen ero CPT1:n ja CPT2:n, CRAT:n ja karnitiinioktanoyylitransferaasin (COT) välillä on, että CPT1 sisältää ylimääräisen domeenin N-päässä noin 160 aminohappoa . Havaittiin, että tämä N-terminaalinen lisädomeeni on tärkeä avainentsyymi-inhibiittorimolekyylille, malonyyli-CoA:lle [10] .

CPT1A:ssa ja CPT1B:ssä on ehdotettu kahta erilaista sitoutumiskohtaa. A-kohta tai CoA -kohta näyttää sitovan sekä malonyyli-CoA:ta että palmitoyyli-CoA:ta sekä muita koentsyymi A:ta sisältäviä molekyylejä. Entsyymin uskotaan sitovan näitä molekyylejä vuorovaikutuksen kautta koentsyymiosan kanssa. On ehdotettu, että malonyyli-CoA voi toimia CPT1A:n kilpailevana estäjänä tässä kohdassa. Toisessa, O-kohdassa , uskotaan, että malonyyli-CoA sitoutuu paljon tiukemmin kuin A-kohdassa . Toisin kuin A -kohta , O-kohta sitoutuu malonyyli-CoA:han malonaattidikarbonyyliryhmän kautta [11] . Malonyyli-CoA:n sitoutuminen entsyymiin A- ja O -kohtien kautta estää CPT1A:n toimintaa eliminoimalla entsyymin karnitiinin sitoutumisen.

Reaktiomekanismi

Koska entsyymin kiderakenteesta ei ole tietoa, CPT1-katalyysin tarkkaa mekanismia ei vielä tunneta. Pari erilaista mahdollista mekanismia CPT1:lle on oletettu, joihin molempiin liittyy histidiinitähde , His473 , joka toimii keskeisenä katalyyttikohtana. Yksi tällainen mekanismi perustuu alla esitettyyn karnitiiniasetyylitransferaasimalliin, jossa His473-tähde deprotonoi karnitiinin, kun taas viereinen seriinitähde stabiloi oksianionin tetraedristä välituotetta .


Toinen mekanismi perustuu oletukseen, että on olemassa ns. katalyyttinen triadi, joka koostuu aminohappotähteistä Cys-305 , His-473 ja Asp-454 , jotka suorittavat katalyyttisen asyylin siirtoa [12] . Tämä katalyyttinen mekanismi käsittää kovalenttisen tioasyylientsyymivälituotteen muodostumisen Cys-305:n kanssa.

Biologiset toiminnot

Karnitiinipalmitoyylitransferaasijärjestelmä on tärkeä vaihe pitkäketjuisten rasvahappojen beetahapetuksessa . Pitkäketjuiset rasvahapot, kuten palmitoyyli-CoA, toisin kuin lyhyt- ja keskipitkäketjuiset rasvahapot, eivät voi diffundoitua vapaasti mitokondrioiden sisäisen kalvon läpi (se on läpäisemätön), tätä siirtymää varten on karnitiinisukkula , joka kuljettaa ne matriisiin [13] .

Karnitiinipalmitoyylitransferaasi I on järjestelmän ensimmäinen komponentti ja karnitiinin kuljetusjärjestelmän nopeutta rajoittava kemiallinen reaktio , joka katalysoi asyyliryhmän siirtymistä koentsyymistä A karnitiiniin palmitoyylikarnitiinin muodostuessa. Translokaasin ( karnitiini-asyylikarnitiinitranslokaasi , CACT) avulla palmitoyylikarnitiini siirtyy helpotetun diffuusion ( antiportin ) kautta sisäisen mitokondriokalvon kautta matriisiin.

Asyyliryhmän akseptorina toimimalla karnitiinilla voi myös olla rooli solunsisäisen koentsyymi A -poolin: asyyli-CoA/CoA-suhteen säätelyssä [14] .

Asetus

Malonyyli-CoA estää CPT1:tä, vaikka tarkkaa eston mekanismia ei tunneta. Luustolihaksen ja sydänlihaksen isoformin CPT1 (CPT1B) on osoitettu olevan 30-100 kertaa herkempi malonyyli-CoA:n estämiselle kuin analoginen CPT1A-isoformi. Tämä esto on hyvä kohde tuleville yrityksille säädellä CPT1:tä aineenvaihduntahäiriöiden hoidossa [15] .

Asetyyli-CoA-karboksylaasi (ACC), entsyymi, joka katalysoi malonyyli-CoA:n muodostumista asetyyli-CoA:sta, on tärkeä rooli rasvahappojen aineenvaihdunnan säätelyssä . Tutkijat osoittivat, että ACC2 - poistohiiret johtivat rasvan ja painon laskuun verrattuna villityypin hiiriin. Tämä on seurausta vähentyneestä ACC-aktiivisuudesta, joka aiheuttaa myöhemmin malonyyli-CoA-pitoisuuksien laskun. Nämä alentuneet malonyyli-CoA-tasot puolestaan ​​estävät CPT1:n eston, mikä johtaa vähäiseen rasvahappojen hapettumisen lisääntymiseen [16] . Koska sydän- ja luustolihassoluilla on alhainen kyky syntetisoida rasvahappoja, ACC voi toimia pelkästään säätelyentsyyminä näissä soluissa.

Lääketieteellinen merkitys

Ihmisillä on kuvattu vain "CPT1A"-puutos (karnitiinipalmitoyylitransferaasi I -puutos) [17] . Tämä on harvinainen sairaus, jolle on tunnusomaista suuri hypoketonyymisen hypoglykemian, kohtausten, hepaattisen enkefalopatian ja vastasyntyneiden äkillisen lapsen kuoleman riski [18] .

CPT1 liittyy myös tyypin 2 diabetekseen ja insuliiniresistenssiin .

Euroopan multippeliskleroosin hoito- ja tutkimuskomitean (ECTRIMS) vuoden 2015 kongressissa esitelty uusi tutkimus viittaa siihen, että CPT1:llä voi olla myös rooli multippeliskleroosin (MS) patologiassa [19] . Tutkijat havaitsivat, että CPT1-geenin mutaatiot näyttävät suojaavan multippeliskleroosilta tietyissä populaatioissa. Tämä hypoteesi on, että lipidiaineenvaihdunnan lisääntyminen voi johtaa hermosolujen demyelinisaatioon ( myeliinin tuhoutuminen ), mikä mahdollistaa autoimmuunihyökkäyksen hermosoluja vastaan. John Dirk Nyland PhD ja kollegat Aalborgin yliopistosta Tanskasta ovat toimittaneet tietoja, jotka osoittavat, että MS-taudin eläinmalleissa CPT1:tä estää etomoksiri-niminen molekyyli, mikä todennäköisimmin lievittää taudin oireita [20] . Tutkijat etsivät parhaillaan tukea sairaiden ihmisten kliiniseen tutkimukseen.

Vuorovaikutuksia muiden proteiinien kanssa

CPT1:n tiedetään olevan vuorovaikutuksessa erilaisten proteiinien kanssa, mukaan lukien NDUF -perheen proteiinit , PKC1 ja ENO1 [21] .

Knockout CPT1A shRNA - kirjastoseulonnalla estää HIV-1 :n replikaatiota viljellyissä Jurkat T-soluissa [22] .

Muistiinpanot

  1. Jogl G., Tong L. Karnitiiniasetyylitransferaasin kiderakenne ja vaikutukset katalyyttiseen mekanismiin ja rasvahappojen kuljetukseen  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 2003. - tammikuu ( osa 112 , nro 1 ). - s. 113-122 . - doi : 10.1016/S0092-8674(02)01228-X . — PMID 12526798 .
  2. van der Leij FR, Huijkman NC, Boomsma C., Kuipers JR, Bartelds B. Ihmisen karnitiiniasyylitransferaasigeenien   genomiikka // Molecular Genetics and Metabolism : päiväkirja. - 2000. - Voi. 71 , no. 1-2 . - s. 139-153 . - doi : 10.1006/mgme.2000.3055 . — PMID 11001805 .
  3. Bonnefont JP, Djouadi F., Prip-Buus C., Gobin S., Munnich A., Bastin J. Karnitiini palmitoyylitransferaasit 1 ja 2: biokemialliset, molekyyliset ja lääketieteelliset näkökohdat   // Molecular Aspects of Medicine : päiväkirja. - 2004. - Voi. 25 , ei. 5-6 . - s. 495-520 . - doi : 10.1016/j.mam.2004.06.004 . — PMID 15363638 .
  4. 1 2 Yamazaki N., Yamanaka Y., Hashimoto Y., Shinohara Y., Shima A., Terada H. Ihmisen lihastyypin karnitiini palmitoyylitransferaasi I:tä koodaavan geenin rakenteelliset piirteet  //  FEBS Letters : päiväkirja. - 1997. - Kesäkuu ( nide 409 , nro 3 ). - s. 401-406 . - doi : 10.1016/S0014-5793(97)00561-9 . — PMID 9224698 .
  5. 1 2 Brown NF, Hill JK, Esser V., Kirkland JL, Corkey BE, Foster DW, McGarry JD Hiiren valkoiset rasvasolut ja 3T3-L1 -solut osoittavat poikkeavaa karnitiinipalmitoyylitransferaasi (CPT) I -isoformin ilmentymistä erilaistumisen aikana. CPT I- ja CPT II -entsyymien kudosten ja lajien välinen ilmentyminen  //  The Biochemical Journal : päiväkirja. - 1997. - lokakuu ( osa 327 (Pt 1) ). - s. 225-231 . — PMID 9355756 .
  6. 1 2 Lee J., Ellis JM, Wolfgang MJ Rasvahappojen hapettumista tarvitaan termogeneesiin ja se voimistaa oksidatiivisen stressin aiheuttamaa tulehdusta  //  Cell Reports : päiväkirja. - 2015. - tammikuu ( osa 10 , nro 2 ). - s. 266-279 . - doi : 10.1016/j.celrep.2014.12.023 . — PMID 25578732 .
  7. Price N., van der Leij F., Jackson V., Corstorphine C., Thomson R., Sorensen A., Zammit V. Uusi aivoissa ekspressoitu proteiini, joka liittyy karnitiinipalmitoyylitransferaasi I  :een // Genomics  :  Journal. - Academic Press , 2002. - Lokakuu ( nide 80 , nro 4 ). - s. 433-442 . - doi : 10.1006/geno.2002.6845 . — PMID 12376098 .
  8. Lavrentyev EN, Matta SG, Cook GA Kolmen karnitiinipalmitoyylitransferaasi-I-isoformin ilmentyminen rotan aivojen 10 alueella ruokinnan, paaston ja diabeteksen aikana  //  Biokemialliset ja biofysikaaliset tutkimukset : päiväkirja. - 2004. - Helmikuu ( osa 315 , nro 1 ) . - s. 174-178 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.01.040 . — PMID 15013442 .
  9. Morillas M., López-Viñas E., Valencia A., Serra D., Gómez-Puertas P., Hegardt FG, Asins G. Karnitiinin palmitoyylitransferaasi I: n rakennemalli, joka perustuu  The//karnitiiniasetyylitransferaasikiteeseen  : päiväkirja. - 2004. - Toukokuu ( nide 379 , nro kohta 3 ). - s. 777-784 . - doi : 10.1042/BJ20031373 . — PMID 14711372 .
  10. Woldegiorgis G., Dai J., Arvidson D. Structure-Function Studies with the Mitokondrial Carnitine Palmitoyl Transferases I and II  //  Monatshefte fur Chemie : Journal. - 2005. - Voi. 136 , nro. 8 . - s. 1325-1340 . - doi : 10.1007/s00706-005-0334-7 .
  11. López-Viñas E., Bentebibel A., Gurunathan C., Morillas M., de Arriaga D., Serra D., Asins G., Hegardt FG, Gómez-Puertas P. Määritelmä kahden malonyylin funktionaalisella ja rakenteellisella analyysillä CoA-kohdat karnitiinipalmitoyylitransferaasi 1A:ssa  (englanniksi)  // The Journal of Biological Chemistry  : Journal. - 2007. - Kesäkuu ( nide 282 , nro 25 ). - P. 18212-18224 . - doi : 10.1074/jbc.M700885200 . — PMID 17452323 .
  12. Liu H., Zheng G., Treber M., Dai J., Woldegiorgis G. Lihaksen karnitiinipalmitoyylitransferaasi I:n kysteiiniskannausmutageneesi paljastaa, että yksi kysteiinijäännös (Cys-305) on tärkeä  katalyysille  The//  : lehti. - 2005. - Helmikuu ( osa 280 , nro 6 ). - P. 4524-4531 . - doi : 10.1074/jbc.M400893200 . — PMID 15579906 .
  13. Berg JM, Tymoczo JL, Stryer L, "Biochemistry", 6. painos 2007
  14. Jogl G., Hsiao YS, Tong L. Karnitiiniasyylitransferaasien rakenne ja toiminta  //  Annals of the New York Academy of Sciences : päiväkirja. - 2004. - marraskuu ( osa 1033 , nro 1 ). - s. 17-29 . - doi : 10.1196/annals.1320.002 . — PMID 15591000 .
  15. Shi J., Zhu H., Arvidson DN, Woldegiorgis G. Ihmisen sydänlihaksen karnitiinipalmitoyylitransferaasi I:n ensimmäiset 28 N-terminaalista aminohappojäännöstä ovat välttämättömiä malonyyli-CoA-herkkyydelle ja korkean affiniteetin sitoutumiselle  //  Biochemistry : Journal. - 2000. - Helmikuu ( osa 39 , nro 4 ). - s. 712-717 . doi : 10.1021 / bi9918700 . — PMID 10651636 .
  16. Abu-Elheiga L., Oh W., Kordari P., Wakil SJ Asetyyli-CoA-karboksylaasi 2 -mutanttihiiriä suojataan liikalihavuudelta ja diabetekselta, jotka johtuvat runsasrasvaisista/hiilihydraattisista ruokavalioista   // Proceedings of the National Academy of Sciences of Amerikan Yhdysvallat  : lehti. - 2003. - syyskuu ( osa 100 , nro 18 ). - P. 10207-10212 . - doi : 10.1073/pnas.1733877100 . — PMID 12920182 .
  17. Ogawa E., Kanazawa M., Yamamoto S., Ohtsuka S., Ogawa A., Ohtake A., Takayanagi M., Kohno Y. Karnitiini palmitoyylitransferaasin IA puutteen kahden mutaation ilmentymisanalyysi  //  Journal of Human Genetics : päiväkirja. - 2002. - Voi. 47 , nro. 7 . - s. 342-347 . - doi : 10.1007/s100380200047 . — PMID 12111367 .
  18. Collins SA, Sinclair G., McIntosh S., Bamforth F., Thompson R., Sobol I., Osborne G., Corriveau A., Santos M., Hanley B., Greenberg CR, Vallance H., Arbor L. Karnitiinipalmitoyylitransferaasi 1A (CPT1A) P479L:n esiintyvyys elävillä vastasyntyneillä Yukonissa, Luoteisterritorioissa ja Nunavutissa  //  Molecular Genetics and Metabolism : päiväkirja. - 2010. - Vol. 101 , ei. 2-3 . - s. 200-204 . - doi : 10.1016/j.ymgme.2010.07.013 . — PMID 20696606 .
  19. Wilner, AN (1. joulukuuta 2015), Exploring a New Mechanism of action for MS Drugs, asiantuntijahaastattelu John Dirk Nielandin kanssa, PhD , Medscape , < http://www.medscape.com/viewarticle/854957 > . Haettu 3. joulukuuta 2015. Arkistoitu 25. toukokuuta 2016 Wayback Machinessa 
  20. Nieland JD Nieland JG Mørkholt AS Bolther L Nielsen S (7.–10.10.2015), Abstract P1497. CPT1a-mutaatio johtaa tietä uusille lääkkeille multippeliskleroosin hoitoon, Euroopan multippeliskleroosin hoito- ja tutkimuskomitean (ECTRIMS) 31. kongressi, Barcelona, ​​Espanja, lopullinen ohjelma 
  21. Havugimana PC, Hart GT, Nepusz T., Yang H., Turinsky AL, Li Z., Wang PI, Boutz DR, Fong V., Phanse S., Babu M., Craig SA, Hu P., Wan C. , Vlasblom J., Dar VU, Bezginov A., Clark GW, Wu GC, Wodak SJ, Tillier ER, Paccanaro A., Marcotte EM, Emili A. Acensus of human soluble protein complexes  (englanti)  // Cell . - Cell Press , 2012. - Elokuu ( nide 150 , nro 5 ). - s. 1068-1081 . - doi : 10.1016/j.cell.2012.08.011 . — PMID 22939629 .
  22. Yeung ML, Houzet L., Yedavalli VS, Jang KT Genominlaajuinen lyhyt hiusneula-RNA-seulonta jurkat-T-soluista ihmisen proteiinien varalta, jotka edistävät tuottavaa HIV-1-replikaatiota  // The  Journal of Biological Chemistry  : Journal. - 2009. - Heinäkuu ( osa 284 , nro 29 ). - P. 19463-19473 . - doi : 10.1074/jbc.M109.010033 . — PMID 19460752 .

Katso myös