Actin | |
---|---|
G-aktiini. Siihen liittyvä ADP-molekyyli ja kaksiarvoinen kationi esitetään. | |
Tunnisteet | |
Symboli | aktiini |
Pfam | PF00022 |
Interpro | IPR004000 |
PROSITE | PDOC00340 |
SCOP | 2btf |
SUPERPERHE | 2btf |
Saatavilla olevat proteiinirakenteet | |
Pfam | rakenteet |
ATE | RCSB ATE ; PDBe ; ATEj |
ATE-summa | 3D malli |
Mediatiedostot Wikimedia Commonsissa |
Aktiini on pallomainen proteiini , josta muodostuu mikrofilamentteja – yksi eukaryoottisolujen sytoskeleton pääkomponenteista . Aktiini koostuu 376 aminohappotähteestä, joiden molekyylipaino on noin 42 kDa ja halkaisija 4-9 nm. Sillä on 2 muotoa: monomeerinen G-aktiini ja polymeroitu muoto (F-aktiini). Yhdessä myosiiniproteiinin kanssa se muodostaa lihasten tärkeimmät supistumiselementit - sarkomeerien aktomyosiinikompleksit . Sitä esiintyy pääasiassa sytoplasmassa, mutta sitä löytyy myös pieniä määriä solun tumassa [1] [2] .
Elektronimikroskoopin kuvat osoittivat, että G-aktiinilla on pallomainen rakenne; Röntgenkristallografia on kuitenkin osoittanut, että jokainen näistä palloksista koostuu kahdesta uralla erotetusta lohkosta. Tämä rakenne on "ATPaasilaskos", joka on entsymaattisen katalyysin kohta, joka sitoo ATP:tä ja Mg2 + :a ja hydrolysoi edellisen ADP:ksi ja orgaaniseksi fosfaatiksi. Tämä laskos on konservoitunut rakenne, jota esiintyy myös muissa proteiineissa [3] . G-aktiini toimii vain, kun se sisältää joko ADP:tä tai ATP:tä urassaan, mutta ATP:hen sitoutunut muoto on vallitseva soluissa, kun aktiini on läsnä monomeerisessa muodossaan [4] .
Sisältää 374 aminohappotähdettä. Sen N-pää on erittäin hapan ja alkaa asetyloidusta aspartaatista sen aminoryhmässä. Vaikka sen C-pää on emäksinen ja muodostuu fenyylialaniinista , jota edeltää kysteiini [5] .
Tertiäärinen rakenne muodostuu kahdesta alueesta, jotka tunnetaan nimellä suuri ja pieni, jotka on erotettu toisistaan uralla. Tämän alapuolella on syvempi lovi, jota kutsutaan "uraksi". Molemmilla rakenteilla on vertailukelpoinen syvyys [6] .
Topologiset tutkimukset ovat osoittaneet, että proteiini, jolla on suurin domeeni vasemmalla puolella ja pienin domeeni oikealla puolella. Tässä kohdassa pienempi domeeni on puolestaan jaettu kahteen: alidomeeni I (alempi asema, tähteet 1-32, 70-144 ja 338-374) ja alidomeeni II (ylempi asema, tähteet 33-69). Suurempi domeeni on myös jaettu kahteen: aliverkkoalue III (alempi, tähteet 145–180 ja 270–337) ja aliverkkoalue IV (ylempi, tähteet 181–269). Alialueiden I ja III paljaita alueita kutsutaan "hampaisiksi" päiksi, kun taas domeenien II ja IV paljaita alueita kutsutaan "teräkkäiksi" päiksi.
F-aktiinin klassisessa kuvauksessa sanotaan, että sillä on rihmamainen rakenne, jota voidaan pitää joko yksisäikeisenä vasenkätisenä kierteenä, jonka kiertymä on 166° kierreakselin ympäri ja jonka aksiaalinen siirtymä on 27,5 Å , tai yksijuosteinen oikeakätinen heliksi, jonka ristiväli on 350-380 Å, ja jokaista aktiinimolekyyliä ympäröi 4 muuta. Aktiinipolymeerin symmetria 2,17 alayksiköllä kierteen kierrosta kohti on ristiriidassa kiteiden muodostumisen kanssa, mikä on mahdollista vain täsmälleen 2, 3, 4 tai 6 alayksikön symmetrialla per kierros [7] [8] .
F-aktiinipolymeerillä uskotaan olevan rakenteellista polaarisuutta, koska kaikki mikrofilamenttialayksiköt osoittavat samaan päähän. Tämä johtaa nimeämiskäytäntöön: päätä, jossa on aktiinialayksikkö, jossa on ATP-sitoutumiskohta, kutsutaan "(-)-pääksi", kun taas vastakkaista päätä, jossa rako suuntautuu toiseen lähellä olevaan monomeeriin, kutsutaan "( +) loppu Termit "terävä" ja "hampainen", jotka viittaavat mikrofilamenttien kahteen päähän, ovat peräisin niiden ulkonäöstä transmissioelektronimikroskoopilla, kun näytteitä tutkitaan "koristeeksi" kutsutulla valmistustekniikalla. Tämä myosiini muodostaa polaarisia sidoksia aktiinimonomeerejä, mikä johtaa konfiguraatioon, joka näyttää nuolelta, jonka varressa on rei'itys, jossa varsi on aktiinia ja litteys on myosiinia. Tämän logiikan mukaisesti mikrofilamentin päätä, jossa ei ole ulkonevaa myosiinia, kutsutaan pisteeksi. nuolta (-pää) ja toista päätä kutsutaan piikkipääksi (+pää) [9] .S1-fragmentti koostuu myosiini II:n pään ja kaulan alueista. Fysiologisissa olosuhteissa G-aktiini (monomeerinen muoto) muuttuu F-aktiiniksi ( polymeerimuodossa) ATP:n avulla, missä ATP:n rooli on olennainen.
Polymeerisen aktiinin, jota kutsutaan F-aktiiniksi, muodostumisprosessiin kuuluu monomeerisen G-aktiinin sitoutuminen ATP-molekyyliin Mg 2+ -, Ca 2+ -ionien läsnä ollessa , stabiilien aktiinioligomeerien ja -pallosten muodostuminen. yksittäiset aktiinipolymeerifilamentit ja niiden haarautuminen. Tämän seurauksena muodostuu orgaanisia fosfaatti- ja ADP-molekyylejä. Aktiinimikrofilamentit muodostuvat 2 F-aktiinifilamentin kierteisellä kierteellä, joissa aktiinimolekyylit ovat yhteydessä toisiinsa ei-kovalenttisilla sidoksilla [10]
Jokaisella tällaisella mikrofilamentilla on kaksi päätä, jotka eroavat ominaisuuksiltaan: aktiinimonomeerit kiinnittyvät yhteen (tätä kutsutaan pluspääksi) ja dissosioituvat toisesta (miinuspää). Aktiinimonomeerien kiinnittymis- ja dissosiaationopeuksien suhde määrää sen, piteneekö vai lyheneekö filamentti [10] .
Biologiset moottorit | |
---|---|
motoriset proteiinit | |
Katso myös: Molekyylimoottorit |
![]() |
---|