Human Proteome -projekti

Human Proteome Project ( HPP ) on kansainvälinen hanke, jonka tarkoituksena on luoda proteomikartta, joka sisältää kaikki ihmisen genomin koodaamat proteiinit . Hankkeen päätehtävänä on proteomisten karttojen laatiminen veriplasman , maksan ja aivojen pääproteiineista [1] .

Historia

Kansainvälinen hanke "Human Proteome" alkoi syyskuussa 2010 Sydneyssä , ja siitä tuli jatkoa "Human Genome" -projektille [2] . Human Proteome -projektiin osallistuu kuusi aloitteentekijämaata: Korean tasavalta , USA , Venäjän federaatio , Ruotsi , Kanada ja Iran ). Asetetun ongelman laajuuden ja työn arvioidulla työvoimaintensiivisyydellä mitattuna Human Proteome -projekti osoittautui paljon suuremmiksi kuin Human Genome -projekti. Vaikka ihmisen genomi koostuu noin 20 tuhannesta geenistä, proteiinien määrä ihmiskehossa erilaisten proteiinien proteomuotojen vuoksi ylittää 2 miljoonaa [3] . Lisäksi, toisin kuin genomi, proteomi muuttuu jatkuvasti riippuen solunsisäisten ja ulkoisten tekijöiden vaikutuksesta, ja itse asiassa se on joukko proteiineja, jotka on kiinnitetty ajassa tiettyyn biologiseen kohteeseen ja tietyssä tilanteessa.

Menetelmät

Kansainvälisen yhteisön hyväksymistä proteomin tutkimusmenetelmistä yhdeksi menestyneimmistä kehittyvistä on noussut kromosomi- tai geenikeskeinen lähestymistapa, jossa proteiinianalyysin tulokset kartoitetaan niitä vastaaviin proteiinia koodaaviin geeneihin . Tieteellisen tehtävän virallistaminen geenikeskeisen lähestymistavan ansiosta tekee sen toteuttamisesta paljon realistisempaa verrattuna vaihtoehtoisiin lähestymistapoihin (kokonaisproteiinien tyypitys), jolloin voit keskittyä tietyn kromosomin geenien koodaamiin proteiineihin ja siten hajottaa projektin erillisiin osiin. osaprojektit - kromosomiparien lukumäärän mukaan ihmisen genomissa [4] .

Katso myös

Muistiinpanot

  1. ↑ Dedov, I. I., Tyulpakov, A. N., Chekhonin, V. P., Baklaushev, V. P., Archakov, A. I., & Moshkovsky, S. A. Henkilökohtainen lääketiede: nykytila ​​ja tulevaisuudennäkymät // Venäjän lääketieteen akatemian tiedote. - 2012. - T. 67 , nro 12 . - S. 4-12 . — ISSN 0869-6047 . - doi : 10.15690/vramn.v67i12.474 .
  2. ↑ Legrain P., Aebersold R., Archakov A., Bairoch A., Bala K., Beretta L., Bergeron J., Borchers CH, Corthals GL, Costello CE et ai. Ihmisen proteomiprojekti: nykytila ​​ja tulevaisuuden suunta // Molecular & cellular proteomics. - 2011. - T. 10 , nro 7 . - S. M111. 009993 . - doi : 10.1074/mcp.M111.009993 .
  3. ↑ Archakov A., Zgoda V., Kopylov A., Naryzhny S., Chernobrovkin A., Ponomarenko E., Lisitsa A. Kromosomikeskeinen lähestymistapa pullonkaulojen voittamiseen Human Proteome Projectissa // Proteomiikan asiantuntijakatsaus. - 2012. - T. 9 , nro 6 . - S. 667-676 . - doi : 10.1021/pr300821n .
  4. ↑ Ponomarenko, E. A., Zgoda, V. G., Kopylov, A. T., asianajaja, E. V., Ilgisonis, E. V., Lisitsa, A. V., & Archakov, A. I. Venäjä kansainvälisessä hankkeessa “human proteome”: first results and prospects // Biomedical chemistry. - 2015. - T. 61 , nro 2 . - S. 169-175 . - doi : 10.18097/PBMC20156102169 .

Kirjallisuus