Ku80

Röntgenkorjaus, joka täydentää viallista korjausta kiinanhamsterin soluissa 5 (kaksisäikeen katkeaminen uudelleen)

ATE :n renderöinti perustuu 1jeq.
Käytettävissä olevat rakenteet
ATE Ortologinen haku: PDBe , RCSB
Tunnisteet
SymboliXRCC5  ; KARP-1; KARP1; KU80; KUB2; Ku86; NFIV
Ulkoiset tunnuksetOMIM:  194364 MGI :  104517 Homologeeni :  40681 GeneCards : XRCC5 Gene
EY-numero3.6.1. EY 3.6.1.
RNA-ekspressioprofiili
Lisää tietoa
ortologit
NäytäIhmisenHiiri
Entrez752022596
YhtyeENSG00000079246ENSMUSG00000026187
UniProtP13010P27641
RefSeq (mRNA)NM_021141NM_009533
RefSeq (proteiini)NP_066964NP_033559
Locus (UCSC)Chr 2:
216,11 – 216,21 Mb		Chr 1:
72,31 – 72,39 Mb
Hae PubMedistä[yksi][2]

Ku80  on proteiini , jota XRCC5 -geeni koodaa ihmisissä . [1] Yhdessä Ku70 - proteiinin kanssa Ku80-proteiini muodostaa heterodimeerin, joka sitoutuu DNA:n kaksoisjuostekatkojen päihin ja jota tarvitaan DNA:n korjaamiseen epähomologisella pään liittämisellä ( NHEJ ). Ku - proteiinia tarvitaan myös V(D)J-rekombinaatioon , joka käyttää NHEJ-reittiä luomaan erilaisia ​​vasta-aineen antigeeniä sitovia kohtia nisäkkään immuunijärjestelmään .

Ku:ta tarvitaan myös ylläpitämään telomeerien pituutta ja hiljentämään lähes telomeerisiä geenejä. [2]

Ku löydettiin ensin potilailta, joilla oli systeeminen lupus erythematosus ja joilla oli korkeat vasta-ainetiitterit tätä proteiinia vastaan. [yksi]

Ku80:lla on useita muita nimiä:

Kliininen merkitys

Tämän geenin harvinainen mikrosatelliittipolymorfismi liittyy kasvaimiin potilailla, joiden herkkyys radioaktiivisuudelle vaihtelee . [3]

Vuorovaikutukset

Ku80:n proteiini-proteiinivuorovaikutukset NCOA6 :n , [4] [5] GCN5L2 :n , [6] Ku70 :n , [6] [7] [8] [9] [10] ATP-riippuvaisen Werner-oireyhtymän helikaasin kanssa on esitetty, [11] [ 12] Tyrosiinikinaasi 2, [13] c-Abl-proteiini DNA-riippuvaisen proteiinikinaasin homologisella kinaasikatalyyttialueella, [14] [15] [7] TERF2IP , [16] telomeerikäänteistranskriptaasi, [17] POU2F1 [18 ] ] [15] ja PCNA - proteiini . [15] [19] [20]

Muistiinpanot

  1. ↑ 1 2 Entrez Gene: XRCC6-röntgenkorjaus, joka täydentää viallista korjausta kiinalaisen hamsterin soluissa 6 (Ku autoantigeeni, 70 kDa) .
  2. ↑ Boulton SJ, Jackson SP Ku-riippuvaisen ei-homologisen päiden liitosreitin komponentit osallistuvat telomeerisen pituuden ylläpitoon ja telomeeriseen vaimentamiseen  // EMBO  J. : päiväkirja. - 1998. - maaliskuu ( osa 17 , nro 6 ). - P. 1819-1828 . - doi : 10.1093/emboj/17.6.1819 . — PMID 9501103 .
  3. ↑ Entrez Gene: XRCC5-röntgenkorjaus, joka täydentää viallista korjausta kiinanhamsterin soluissa 5 (kaksoisjuosteen katkeaminen uudelleen; Ku-autoantigeeni, 80 kDa) . Arkistoitu alkuperäisestä 8. maaliskuuta 2010.
  4. ↑ Ko, ​​​​L; Cardona G R., Chin W W. Kilpirauhashormonireseptoria sitova proteiini, LXXLL-motiivia sisältävä proteiini, toimii yleisenä koaktivaattorina  (englanniksi)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America  : Journal. – YHDYSVALLAT, 2000 . - Toukokuu ( osa 97 , nro 11 ). - P. 6212-6217 . — ISSN 0027-8424 . — PMID 10823961 .
  5. ↑ Ko, ​​​​Lan; Chin William W. Ydinreseptorin koaktivaattori kilpirauhashormonireseptoria sitova proteiini (TRBP) on vuorovaikutuksessa siihen liittyvän DNA-riippuvaisen proteiinikinaasin kanssa ja stimuloi sitä  //  J. Biol. Chem.  : päiväkirja. – Yhdysvallat, 2003 . — Maaliskuu ( osa 278 , nro 13 ). - P. 11471-11479 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M209723200 . — PMID 12519782 .
  6. ↑ 12 Barlev , N.A.; Poltoratsky V., Owen-Hughes T., Ying C., Liu L., Workman J L., Berger S L. GCN5-histoniasetyylitransferaasiaktiivisuuden repressio bromodomeenivälitteisen sitoutumisen ja fosforylaation kautta Ku-DNA-riippuvaisen proteiinikinaasikompleksin avulla  (englanniksi)  // Mol. solu. Biol. : päiväkirja. - YHDYSVALLAT, 1998 . — Maaliskuu ( osa 18 , nro 3 ). - s. 1349-1358 . — ISSN 0270-7306 . — PMID 9488450 .
  7. ↑ 1 2 Gell, D; Jackson S P. Proteiini-proteiini-vuorovaikutusten kartoitus DNA-riippuvaisessa proteiinikinaasikompleksissa  // Nucleic Acids Res  . : päiväkirja. — ENGLANTI, 1999 . — Syyskuu ( osa 27 , nro 17 ). - P. 3494-3502 . — PMID 10446239 .
  8. ↑ Yang, C.R.; Yeh S., Leskov K., Odegaard E., Hsu H L., Chang C., Kinsella T J., Chen D. J., Boothman D A. Ku70:tä sitovien proteiinien (KUBs  ) eristäminen  // Nucleic Acids Res. : päiväkirja. — ENGLANTI, 1999 . — Toukokuu ( osa 27 , nro 10 ). - s. 2165-2174 . — ISSN 0305-1048 . — PMID 10219089 .
  9. ↑ Singleton, BK; Torres-Arzayus M I., Rottinghaus S T., Taccioli G E., Jeggo PA. Ku80:n C-pää aktivoi DNA-riippuvaisen proteiinikinaasin katalyyttisen alayksikön   // Mol . solu. Biol. : päiväkirja. - YHDYSVALLAT, 1999 . — Toukokuu ( osa 19 , nro 5 ). - s. 3267-3277 . — ISSN 0270-7306 . — PMID 10207052 .
  10. ↑ Song, K; Jung D., Jung Y., Lee S G., Lee I. Ihmisen Ku70:n vuorovaikutus TRF2:n kanssa  (eng.)  // FEBS Lett. : päiväkirja. - ALANKOMAAT, 2000 . - Syyskuu ( osa 481 , nro 1 ) . - s. 81-5 . — ISSN 0014-5793 . — PMID 10984620 .
  11. ↑ Karmakar, Parimal; Snowden Carey M., Ramsden Dale A., Bohr Vilhelm A. Ku-heterodimeeri sitoutuu Werner-proteiinin molempiin päihin ja toiminnallinen vuorovaikutus tapahtuu Wernerin N-päässä  // Nucleic Acids Res  . : päiväkirja. – Englanti, 2002 . — elokuu ( osa 30 , nro 16 ). - P. 3583-3591 . — PMID 12177300 .
  12. ↑ Li, B; Comai L. Ku:n ja werner-oireyhtymän proteiinin välinen funktionaalinen vuorovaikutus DNA:n  loppukäsittelyssä //  J. Biol. Chem.  : päiväkirja. – YHDYSVALLAT, 2000 . - Syyskuu ( osa 275 , nro 37 ) - P. 28349-28352 . — ISSN 0021-9258 . doi : 10.1074/ jbc.C000289200 . — PMID 10880505 .
  13. ↑ Adam, L; Bandyopadhyay D., Kumar R. Interferoni-alfa-signalointi edistää p95Vav:n ytimestä sytoplasmaan uudelleenjakautumista ja monialayksikkökompleksin muodostumista, joihin osallistuvat Vav, Ku80 ja Tyk2   // Biochem . Biophys. Res. commun. : päiväkirja. – YHDYSVALLAT, 2000 . tammikuuta ( nide 267 , nro 3 ). - s. 692-696 . — ISSN 0006-291X . - doi : 10.1006/bbrc.1999.1978 . — PMID 10673353 .
  14. ↑ Jin, S; Kharbanda S., Mayer B., Kufe D., Weaver D. T. Ku:n ja c-Abl:n sitoutuminen DNA-riippuvaisen proteiinikinaasin katalyyttisen alayksikön kinaasihomologia-alueelle  //  J. Biol. Chem.  : päiväkirja. – YHDYSVALLAT, 1997 . — lokakuu ( osa 272 , nro 40 ). - P. 24763-24766 . — ISSN 0021-9258 . — PMID 9312071 .
  15. ↑ 1 2 3 Matheos, Diamanto; Ruiz Marcia T., Price Gerald B., Zannis-Hadjopoulos Maria. Ku-antigeeni, alkuperäspesifinen sitoutumisproteiini, joka liittyy replikaatioproteiineihin, tarvitaan nisäkkään DNA:n replikaatioon   // Biochim . Biophys. Acta : päiväkirja. – Alankomaat, 2002 . - Lokakuu ( nide 1578 , nro 1-3 ). - s. 59-72 . — ISSN 0006-3002 . — PMID 12393188 .
  16. ↑ O'Connor, Matthew S; Safari Amin, Liu Dan, Qin Jun, Songyang Zhou. Ihmisen Rap1-proteiinikompleksi ja telomeerin pituuden modulaatio  //  J. Biol. Chem.  : päiväkirja. – Yhdysvallat, 2004 . heinäkuuta ( nide 279 , nro 27 ). - P. 28585-28591 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M312913200 . — PMID 15100233 .
  17. ↑ Chai, Weihang; Ford Lance P., Lenertz Lisa, Wright Woodring E., Shay Jerry W. Ihmisen Ku70/80 assosioituu fyysisesti telomeraasin kanssa vuorovaikutuksessa hTERT:n kanssa  //  J. Biol. Chem.  : päiväkirja. – Yhdysvallat, 2002 . —Joulukuu ( osa 277 , nro 49 ). - P. 47242-47247 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M208542200 . — PMID 12377759 .
  18. ↑ Schild-Poulter, C; Pope L., Giffin W., Kochan J C., Ngsee J K., Traykova-Andonova M., Haché R J. Ku-antigeenin sitoutuminen homeodomeeniproteiineihin edistää niiden fosforylaatiota DNA-riippuvaisella  proteiinikinaasilla  / J. Biol. Chem.  : päiväkirja. – Yhdysvallat, 2001 . - Toukokuu ( osa 276 , nro 20 ) - P. 16848-16856 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M100768200 . — PMID 11279128 .
  19. ↑ Ohta, Satoshi; Shiomi Yasushi, Sugimoto Katsunori, Obuse Chikashi, Tsurimoto Toshiki. Proteominen lähestymistapa proliferoituvien solujen ydinantigeeniä (PCNA) sitovien proteiinien tunnistamiseksi ihmisen solulysaateista. Ihmisen CHL12/RFCs2-5-kompleksin tunnistaminen uutena PCNA:ta sitovana proteiinina  (englanniksi)  // J. Biol. Chem.  : päiväkirja. – Yhdysvallat, 2002 . — lokakuu ( osa 277 , nro 43 ). - P. 40362-40367 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M206194200 . — PMID 12171929 .
  20. ↑ Balajee, AS; Geard CR . DNA-vaurion laukaiseman kromatiinin sitoutuneen PCNA-kompleksin muodostuminen tapahtuu riippumatta ATM-geenituotteesta ihmissoluissa  // Nucleic Acids Res  . : päiväkirja. – Englanti, 2001 . maaliskuu ( osa 29 , nro 6 ) . - s. 1341-1351 . — PMID 11239001 .

Kirjallisuus