Autonominen replikoituva sekvenssi

Autonomisesti replikoituva sekvenssi ( ARS ) on hiivan genomin DNA -  sekvenssi , joka sisältää replikaation aloituskohdan (ori) ja on vastuussa replikaation aloituksesta .

Toiminta ja rakenne

Aluksi ARS-sekvenssejä kuvattiin orastavassa hiivassa Saccharomyces cerevisiae kromosomaalisen DNA:n fragmentteina, jotka lisäävät transformaatiotaajuutta ja varmistavat plasmidien stabiilisuuden . Siten niitä sisältävät plasmidit transformoivat hiivasoluja suurella taajuudella [1] . Myöhemmin samanlaisia ​​alkuaineita löydettiin hiivasta Schizosaccharomyces pombe [2] .

Lisätutkimuksessa kävi ilmi, että ARS sisältää replikaation aloituskohdan, eli ne ovat elementtejä, jotka ovat vastuussa replikaation käynnistämisestä - replikaattorit . 5 tuhatta emäsparia pitkällä DNA-osuudella. n. ARS:ssä on kolme erillistä elementtiä. Niiden alkaminen tapahtuu kerran kussakin solusyklin S-vaiheessa , vaikka tehokkuus ja aktivointiaika (S-vaiheen alussa tai lopussa) voivat vaihdella eri ARS-vaiheissa [3] .

S. cerevisiaessa ARS: n pituus on 100–200 nt. n. ARS sisältää seuraavat 2 pakollista elementtiä: domeeni A , joka sisältää konservatiivisen sekvenssin 11 n. n. - ACS, joka sitoutuu kuuden proteiinin kompleksiin - alkuperäntunnistuskompleksiin  (ORC ) ja suureen B-domeeniin , jossa on runsaasti A - T - pareja A-elementin vieressä, mutta niiden sekvenssien välillä ei ole samankaltaisuutta. ACS-sekvenssi on: jossa Y on pyrimidiini ja R on puriini . ORC:llä on homologeja muissa eukaryooteissa , kuten Drosophilassa , Xenopuksessa , hiirissä ja ihmisissä. S. cerevisiaessa aloitustekijöiden sitoutumista ORC:hen on tutkittu hyvin tähän mennessä [ 1] . 5'-T/ATTTAYRTTTT/A-3'

On huomattava, että huolimatta eukaryoottisten replikaatiomekanismien ja tähän osallistuvien proteiinien samankaltaisuudesta , niiden replikaation aloilla voi olla merkittäviä eroja. Esimerkiksi S. pombe -hiivassa , jolla on monia yhtäläisyyksiä korkeampien eukaryoottisten solujen kanssa, ARS on paljon pidempi kuin S. cerevisiaessa ja sisältää 600–1500 bp. n., ja niiden DNA-sekvenssien samankaltaisuus on vain A-T-rikkaiden alueiden läsnäolo molemmissa [1] .

On todettu, että mutaatiot domeenissa B vähentävät ARS-elementin aktiivisuutta, mutta kun domeeni A mutatoituu, koko elementti muuttuu täysin inaktiiviseksi.

Muistiinpanot

  1. 1 2 3 VINAY KUMAR SRIVASTAVA, DHARANI DHAR DUBEY. Kartoitetaan autonomisesti replikoituvia sekvenssielementtejä fissiohiivan, Schizosaccharomyces pombe, kromosomin II 73 kb:n alueella  // Journal of Genetics. - 2007. - T. 86 , nro 2 . - S. 139-148 .
  2. Clyne RK, Kelly TJ Autonomisesti replikoituvien sekvenssien (ARS) elementtien tunnistaminen eukaryoottisoluissa. // Menetelmät .. - 1997. - T. 13 , nro 3 . - S. 221-233 .
  3. Konichev, Sevastyanova, 2012 , s. 230.

Kirjallisuus