Ebolavirus | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ||||||||
tieteellinen luokittelu | ||||||||
Ryhmä:Virukset [1]Valtakunta:RiboviriaKuningaskunta:OrthornaviraeTyyppi:NegarnaviricotaAlatyyppi:HaploviricotinaLuokka:MonjiviricetesTilaus:MononegaviralesPerhe:filoviruksetSuku:Ebola virus | ||||||||
Kansainvälinen tieteellinen nimi | ||||||||
Ebolavirus | ||||||||
Erilaisia | ||||||||
|
||||||||
Baltimore Group | ||||||||
V: (-)ssRNA-virukset | ||||||||
|
Ebolavirus ( ebolavirus , Ebola virus tai Ebola virus ) on filovirusheimon ( Filoviridae ) virussuku , joka aiheuttaa Ebola-hemorragista kuumetta korkeammilla kädellisillä . Ebolavirusten morfologiset ominaisuudet ovat samankaltaisia kuin Marburg-virus , joka myös kuuluu filovirusperheeseen ja aiheuttaa samanlaisen taudin . Suvun lisäksi tiettyä suvun edustajaa voidaan kutsua Ebola-virukseksi - useimmiten Zairen ebolavirukseksi , joka oli ensimmäinen suvusta, joka eristettiin vuonna 1976 Ebola - joen valuma-alueelta Zairessa , josta nimi muodostettiin . Ebolavirukset, erityisesti Zairen ebolaviruslajit , ovat aiheuttaneet useita paljon julkisuutta saaneita vakavia epidemioita .
Ebola-viruksen taksonomia on muuttunut useita kertoja. Ensimmäinen virustyyppi eristettiin vuonna 1976 (nykyään Zairen ebolavirus ), jota alun perin kutsuttiin Ebola-virukseksi Kongon demokraattisessa tasavallassa virtaavasta Ebola-joesta , jossa epidemia puhkesi vuonna 1976. Pian löydettiin muita samanlaisia viruksia, jotka alun perin nimettiin Ebola-viruksen alalajiksi , ja tämä käytäntö on edelleen virologien keskuudessa; kuitenkin, jos mitään tiettyä lajia ei ole määritelty, Zairen ebolavirus viittaa yleensä ; Ebola-viruksen (erikseen, isolla kirjaimella) kirjoittamisen lisäksi löytyy myös fuusioitunut - ebolavirus ( fuusioitu, pienellä kirjaimella). Vuonna 1998 nämä lajit erotettiin omaksi suvuksi, jonka alkuperäinen nimi oli Ebola-like virukset ( Ebola -like viruses ), ja vuonna 2002 nimettiin uudelleen ebolavirukseksi (jatkuva oikeinkirjoitus) [2] . Toukokuusta 2016 alkaen ICTV on hyväksynyt seuraavan nimikkeistön [3] : Ebolavirus-suku , Bundibugyo ebolavirus , Reston ebolavirus , Sudan ebolavirus , Taï Forest ebolavirus ja Zaire ebolavirus -tyyppilajit .
Kysymys siitä, mihin viruksen venäjänkielisen nimen painoarvo laitetaan - toiselle tavulle ( "Ebola-virus" ) tai ensimmäiselle ( "Ebola-virus" ) on edelleen avoin [4] : jotkut lähteet, mukaan lukien lääketieteelliset terminologiset sanakirjat , kiinnitä korostus toiseen tavuun [5] , toiset lähteet viittaavat ensimmäisen tavun korostukseen [6] . Myös oikeinkirjoitusebolavirusta käytetään , erityisesti Venäjän federaation Rospotrebnadzor käyttää sitä [7] .
Ebolavirus -suku on jaettu kuuteen lajiin [8] . Vain 4 lajia vaikuttaa ihmisiin. Restonin ebolavirus on yleensä oireeton, kun se tarttuu ihmisiin . Vuonna 2018 Pohjois-Sierra Leonesta löydettiin uusi tähän sukuun kuuluva virus, Bombali ebolavirus [9] , jonka patogeenisyydestä ihmisille ei ole vielä tietoa.
Zairen ebolaviruslajit (Zaire ebolavirus [7] , Ebola virus, Ebola virus , EBOV) rekisteröitiin ensimmäisen kerran Zairessa (silloinen Kongon demokraattinen tasavalta ), josta se sai nimensä. Zairin ebolavirusta pidetään suvun tyyppilajina [8] ja se on aiheuttanut eniten epidemioita [10] . Sen kuolleisuus on korkein, 90 prosenttia. Keskimääräinen kuolleisuus on noin 83 prosenttia. Vuoden 1976 taudinpurkauksen aikana kuolleisuus oli 88 %, vuonna 1994 - 60 %, vuonna 1995 - 81 %, vuonna 1996 - 73 %, vuosina 2001-2002 - 80 %, vuonna 2003 - 90 % [10] .
Ensimmäinen epidemia havaittiin 26. elokuuta 1976 Yambukun pikkukaupungissa . Ensimmäinen tapaus oli 44-vuotias koulun opettaja. Taudin oireet muistuttivat malarian oireita . Uskotaan, että viruksen alun leviämistä helpotti ruiskeneulojen toistuva käyttö ilman sterilointia.
Sudanin ebolaviruslaji (Sudan ebolavirus [7] , SUDV) rekisteröitiin lähes samanaikaisesti Zairin viruksen kanssa. Ensimmäisen taudinpurkauksen uskotaan saaneen alkunsa tehdastyöläisistä Nzaran pikkukaupungissa Sudanissa . Tämän viruksen kantajaa ei koskaan tunnistettu huolimatta siitä, että heti taudinpurkauksen jälkeen tutkijat testasivat viruksen esiintymistä useissa tämän kaupungin läheisyydessä elävissä eläimissä (mukaan lukien hyönteiset).
Viimeisin epidemia havaittiin Ugandassa marraskuun 2012 ja tammikuun 2013 välisenä aikana . Keskimääräiset kuolleisuusluvut olivat 54 prosenttia vuonna 1976, 68 prosenttia vuonna 1979 ja 53 prosenttia vuosina 2000 ja 2001 [10] .
Restonin ebolaviruslaji (Reston ebolavirus [7] , RESTV) on luokiteltu yhdeksi Ebola-viruslajeista. Toisin kuin muut, tämä laji on aasialaista alkuperää; sen kotimaa ja lähde on Filippiinit . Virus löydettiin apinahemorragisen kuumeviruksen (SHFV) puhkeamisen aikana vuonna 1989. On todettu, että viruksen lähde oli cynomolgus-makakit , jotka vietiin Filippiineiltä yhteen tutkimuslaboratorioista Restonissa , Virginiassa , Yhdysvalloissa [11] . Sen jälkeen epidemioita on raportoitu Filippiineillä, Italiassa ja Yhdysvalloissa [10] . Reston ebolavirus ei ole patogeeninen ihmisille, mutta se on vaarallinen apinoille ja sioille [11] .
Taï Forest ebolavirus ( Taï Forest ebolavirus [7] , TAFV, entinen Norsunluurannikon ebolavirus , CIEBOV) löydettiin ensimmäisen kerran simpansseista Taï - metsässä Norsunluurannikolla , Afrikassa. 1. marraskuuta 1994 löydettiin kahden simpanssin ruumiit . Ruumiinavaus osoitti, että joidenkin elinten onteloissa oli verta. Simpanssien kudoksia koskevat tutkimukset tuottivat samat tulokset kuin ebolaan vuonna 1976 Zairessa ja Sudanissa saaneiden ihmisten kudoksia koskevat tutkimukset.
Myöhemmin, samassa vuonna 1994, löydettiin muita simpanssien ruumiita, joista löydettiin sama Ebola-viruksen alatyyppi. Yksi kuolleiden apinoiden ruumiinavauksen suorittaneista tutkijoista sairastui ebolaan. Taudin oireet ilmenivät viikko simpanssin ruumiin ruumiinavauksen jälkeen. Välittömästi tämän jälkeen potilas vietiin Sveitsiin hoitoon, joka päättyi täydelliseen toipumiseen kuuden viikon kuluttua tartunnasta [10] .
Ugandan terveysministeriö ilmoitti 24. marraskuuta 2007 Ebola-epidemian puhkeamisesta Bundibugyossa . Viruksen eristämisen ja Yhdysvalloissa tehdyn analyysin jälkeen Maailman terveysjärjestö vahvisti uudentyyppisen ebolaviruksen - Bundibugyo ebolaviruksen (Bundibugo ebolavirus [7] , BDBV) - olemassaolon. Ugandan terveysministeriö ilmoitti 20. helmikuuta 2008 virallisesti epidemian päättymisestä Bundibugyossa. Kaikkiaan tämän uudentyyppisen ebolatartuntatapauksia kirjattiin 149, joista 37 oli kuolemaan johtanut . Viimeisin taudinpurkaus oli vuonna 2012 Kongon demokraattisessa tasavallassa , ja kuolleisuus oli 36 % [10] .
Vuonna 2018 Pohjois- Sierra Leonesta Bombalin alueelta löydettiin uusi Ebolavirus -suvun laji , joka sai nimekseen Bombali ebolavirus [9] . Virus on havaittu kahdesta hyönteissyöjälepakkolajista, Angolan taittuneesta huulesta Mops condylurus -huulista ja vähemmän poimutetusta huulesta Chaerephon pumilus . Myöhemmin Bombali-virus löydettiin Angolan poimutettujen huulten sisäelinten kudoksista Mops condylurus Keniassa ja Guineassa [12] [13] . Nämä tulokset viittaavat siihen, että pienemmät ja Angolan poimutetut huulet ovat Bombali-viruksen säiliöisäntiä. Molemmat lepakkolajit ovat laajalle levinneitä Afrikassa, joten Bombali-viruksella voi myös olla laajempi levinneisyys.
Bombali-viruksen patogeenisyys ihmisille on edelleen epäselvä. Kokeellisissa olosuhteissa virus pystyy infektoimaan ihmissoluja in vitro [14] , mutta yhtäkään vahvistettua tapausta viruksen havaitsemisesta ihmisissä ei ole. Epäsuora vahvistus hypoteesille Bombali-viruksen ei-patogeenisuudesta on sen havaitseminen lepakoissa, jotka elävät siirtokunnissa siirtokuntien sisällä - lattojen, asuinrakennusten ja hallintorakennusten ullakoilla [13] .
Ebolaviruksen virionit ovat muodoltaan pitkänomaisia ja saavuttavat 1400 nm (1,4 μm) pituuden ja noin 80 nm leveyden (vertailun vuoksi: HIV- tai influenssavirionin halkaisija on 100–120 nm, yksittäisen bakteerisolun pituus Escherichia coli on 1–3 μm; filovirukset ovat yleensä suurimpia viruksia, ja virionit ovat kooltaan vain mimivirusten ja megavirusten jälkeen .
Niissä on kalvovaippa, joka muodostuu tartunnan saaneen solun kalvosta. Kypsän viruspartikkelin erottaminen kaappaa myös osan isäntäsolun kalvoproteiineista (esimerkiksi tärkeimmän histokompatibiliteettikompleksin komponentit tai pintareseptorit), jotka jäävät viruksen vaippaan ja voivat vaikuttaa viruksen tarttuvuuteen. Viruspartikkelien sieppaamien ihmisen solukalvoproteiinien laadullinen ja kvantitatiivinen koostumus ei ole vakio. Ebola-viruksen pääasiallista pintaproteiinia (glykoproteiinia) koodaa virusgeeni gp ja se on välttämätön partikkelin sisällön tunkeutumiseen soluun. Se muistuttaa rakenteeltaan ja toiminnaltaan immuunikatoviruksen ja influenssaviruksen hemagglutiniinin koodaamaa GP-pintaproteiinia: se muodostaa myös trimeerejä, joiden jokaisella monomeerilla on transmembraani- ja pintaalayksikkö. Virusten pinnan glykoproteiini indusoi endoteelisolujen tuhoutumista ja välittää pääsyä isäntäsoluun. Suoraan viruskalvon alla on matriisi, jolla on todennäköisimmin kierteinen rakenne ja jonka muodostaa pääasiassa VP40-proteiini. VP40-proteiinit ovat vuorovaikutuksessa sekä viruspartikkelin kalvon että toistensa kanssa. Pieni C-terminaalinen domeeni vastaa vuorovaikutuksesta kalvon kanssa, kun taas suhteellisen suuri N-terminaalinen domeeni osallistuu proteiinien vuorovaikutukseen keskenään. VP40-proteiinit muodostavat dimeerejä, jotka myöhemmin oligomeroituvat muodostaen rengasrakenteita, jotka voivat sisältää eri määrän dimeerejä. VP40 on myös pääproteiini, joka vastaa kypsän viruspartikkelin erottamisesta infektoituneesta solusta. Virionin keskellä on nukleokapsidi. Se on myös kierteinen rakenne, jonka muodostaa pääasiassa suuri NP-proteiini, jonka kanssa viruksen RNA on vuorovaikutuksessa. Heliksin halkaisija on noin 50 nm, kun taas sisällä voimme erottaa kanavan, jonka halkaisija on noin 20 nm. Virusten nukleokapsidi muistuttaa rakenteeltaan ihmisen hengityselinten synsyyttiviruksen hyvin tutkittua nukleokapsidia . Nukleokapsidi sisältää myös VP24-proteiinin, jonka rooli ei ole täysin selvä, vaikka on näyttöä siitä, että rakennekomponentin lisäksi tämä proteiini voi olla interferoniantagonisti . On osoitettu, että VP24-proteiinigeenin mutaatiot liittyvät virusten sopeutumiseen eri isäntiin (mukaan lukien ei-kädelliset nisäkkäät).
Ihmisillä NP ja VP40 saavat aikaan voimakkaan immuunivasteen (indusoimalla spesifisten luokan G immunoglobuliinien muodostumista ).
Virionin sisällä on myös RNA-riippuvaista RNA-polymeraasia (proteiini L) ja vähäisiä proteiineja VP30 ja VP35. Kertyneet tiedot osoittavat, että ne kaikki sijaitsevat lähempänä yhtä viruspartikkelin päistä. Niillä ei ole rakenteellista tehtävää. Polymeraasi on vastuussa viruksen RNA:n synteesistä. Tämä on suurin virusgenomin koodaama proteiini (L tarkoittaa suurta). Proteiinit VP30 ja VP35 ovat transkriptiotekijöitä ja interferonivasteen antagonisteja. VP35:llä on myös viruksen polymeraasikofaktorin rooli.
Silmumisen seurauksena virionin sisällä olevaan tilaan pääsee myös erilaisia soluproteiineja, joista pääasiassa ovat edustettuina infektoituneiden solujen sytoskeleton komponentteja. Sytoplasman määrä, jonka virionit ottavat kypsymisen ja solusta erottumisen aikana, voi vaihdella. Tämä vaikuttaa sekä siihen, mitä soluproteiineja löytyy virioneista, että viruspartikkelin morfologiaan, joka toisinaan saa mailan kaltaisen muodon.
Genomia edustaa yksijuosteinen RNA , se sisältää 7 geeniä (koodaa 7 rakenteellista ja yhtä ei-rakenneproteiinia) ja sen pituus on noin 19 000 nukleotidia . Geenien järjestys genomissa: 3'-pään johtoalue, nukleoproteiinigeeni (koko - 2167 nukleotidia), virusproteiinit VP35, VP40 (1069 nukleotidia), glykoproteiini (2174 nukleotidia), VP30, VP24 (853 nukleotidia), RNA -riippuvainen RNA-polymeraasi (L-proteiini), 5'-pää. Vaihtelevimpia (mutaatioille alttiita) ovat genomialueet, jotka vastaavat VP35-, VP24-proteiinigeenejä ja pääpinnan glykoproteiinigeenin keskiosaa (180 nukleotidin hypervariaabeli alue). Todennäköisesti näiden proteiinien geenien mutaatiot vaikuttavat saman viruslajin kantojen virulenssiin. Nukleoproteiinigeeni on stabiilin mutaatioiden esiintymisen suhteen, mikä tekee tästä proteiinista lupaavimman kohteen viruslääkkeiden luomisessa.
Yleisesti, toisin kuin suurille RNA-viruksille, ebolan aiheuttajalle on ominaista korkea geneettinen stabiilius, joka voi johtua neljästä päätekijästä: RNA-polymeraasin spesifisen vaikutuksen pieni virhe , melko hidas replikaatio luonnollisessa infektiovarastossa, rajoitettu alttiiden luonnollisten isäntien määrä ja heikko immuunipaine. Siitä huolimatta virusten genomien mutaatioiden määrät on luonnehdittu korkeiksi jo tallennettujen epidemioiden aikana . Ottaen huomioon, että ebolavirusten genomien mutaatioiden vaikutusten luonnetta niiden ominaisuuksiin (erityisesti virulenssiin ) ymmärretään huonosti, tämä edellyttää uusien ebolakuumeen epidemioiden nopeaa eliminointia [15] [16] .
Ebola-virus aiheuttaa vaarallisen taudin - Ebola-hemorragisen kuumeen [17] . Infektio tapahtuu kosketuksessa kehon nesteiden kautta [18] . Virus tarttuu ihmisiin tartunnan saaneista eläimistä, kun niitä syödään (huonolla lämpökäsittelyllä), leikattaessa niiden lihaa (kun pisaroita pääsee silmiin, nenään ja muihin limakalvoihin) hedelmien kautta, joita tartunnan saaneet eläimet söivät. Ihmisestä toiseen - tartunnan saaneen henkilön veren, muiden nesteiden ja kudosten kanssa se voi tarttua myös terveen henkilön limakalvojen kosketuksesta potilaan vaatteisiin ja liinavaatteisiin [19] [20] . Ennen kuin tartunnan saaneella henkilöllä on oireita, ne eivät ole tarttuvia [20] . Virus ei tartu ilmateitse [18] . Itämisaika on 2-21 päivää.
Ebolalle on ominaista äkillinen ruumiinlämmön nousu, vakava yleinen heikkous, lihas- ja päänsärky sekä kurkkukipu . Siihen liittyy usein oksentelua , ripulia , ihottumaa, munuaisten ja maksan toiminnan heikkenemistä ja joissakin tapauksissa sekä sisäistä että ulkoista verenvuotoa . Laboratoriokokeet paljastavat alhaiset valkosolujen ja verihiutaleiden tasot sekä kohonneet maksaentsyymitasot [19] .
Ebolavirukset, erityisesti Zairen ebolaviruslajit , ovat vuoden 1976 löytämisen jälkeen aiheuttaneet useita vakavia epidemioita. Yhdysvaltain tautientorjuntakeskusten mukaan yhdessä niistä sairastui 20. lokakuuta 2015 mennessä 30 939 ihmistä, joista 12 910 (42 %) kuoli [21] .
Vuonna 2016 suoritettiin kliiniset tutkimukset ensimmäisestä Kanadassa kehitetystä Ebola-rokotteesta, joka osoitti sen korkean tehokkuuden [22] [23] .
Sanakirjat ja tietosanakirjat | |
---|---|
Taksonomia | |
Bibliografisissa luetteloissa |