Papilloomavirukset

Papilloomavirukset
Ihmisen papilloomavirus (HPV)
tieteellinen luokittelu
Ryhmä:Virukset [1]Valtakunta:MonodnaviriaKuningaskunta:ShotokuviraeTyyppi:cossaviricotaLuokka:PapovaviricetesTilaus:ZurhausenviralesPerhe:Papilloomavirukset
Kansainvälinen tieteellinen nimi
Papillomaviridae
Alaperheet
Firstpapillomavirinae Toinen papillooma virinae
Baltimore Group
I: dsDNA-virukset
Systematiikka Wikispeciesissä Kuvat Wikimedia Commonsissa NCBI   151340 EOL   8038

Papilloomavirukset [2] ( lat.  Papillomaviridae ) on virusperhe , joka kuului aiemmin papovavirusten sukuun . Se kuuluu Baltimoren virusluokituksen ryhmään I.

Virionin koko on noin 55 nm. Lisääntyy isäntäsolujen tumassa.

Useimmilla edustajilla on onkogeenisiä ominaisuuksia ja ne aiheuttavat hyvänlaatuisia kasvaimia ( papilloomeja ) ihmisissä, kaneissa , lehmissä, peuroissa, koirissa ja kissoissa, hevosissa, lampaissa ja rotissa. Papilloomaviruksen etiologinen rooli laajalle levinneen sukupuoliteitse tarttuvan kohdunkaulasyövän kehittymisessä on osoitettu [3] .

Papilloomaviruksilla on lajispesifisiä ja joitakin tyyppispesifisiä antigeenejä . Ei viljelty solujärjestelmissä. Ihmisen papilloomavirus havaitaan keratosyyteissä episomina , 50-200 kopiota tartunnan saaneesta solusta. Tuottavaa infektiota ja integraatiota ei havaita.

Papilloomavirus löydettiin Pohjois-Amerikassa 27 tuhatta vuotta sitten eläneen tuuheahäntäisen metsähamsterin ( en: Neotoma cinerea ) jäännöksistä. n. [neljä]

Luokitus

Aluksi Papilloomavirus -suvun lajit nimettiin eläinten mukaan, joissa ne voivat aiheuttaa sairauksia, esimerkiksi vuonna 2002 sukuun kuului vain 7 lajia [5] :

• Naudan papilloomavirus (BPV)
• Koiran suun papilloomavirus (COPV)
• Cottontail kanin papilloomavirus (CRPV)
• Deer papilloomavirus (DPV) tai Deer fibroma virus
• Euroopan hirven papilloomavirus (EEPV)
• Ihmisen papilloomavirus (HPV) - Ihmisen papilloomavirus
• Lampaan papilloomavirus (OPV)

Vuonna 2003 sukua tarkistettiin ja nämä 7 lajia jaettiin 16 sukuun, joissa oli 43 lajia. Sen jälkeen kunkin suvun nimi koostuu kahdesta osasta: kreikkalaisen (tai muun) aakkoston latinalaisesta kirjaimesta ja yhteisestä osasta -papilloomavirus [6] . Vuonna 2010 sukuun kuuluvat lajit nimettiin uudelleen: nyt niiden tieteellinen nimi koostuu suvun nimestä ja sarjanumerosta, joka ei vastaa aiemmin hyväksyttyä lajinumerointia. Sukujen ja lajien määrää lisättiin, ja koska sukujen lukumäärä ylitti kreikkalaisten aakkosten kirjainten lukumäärän, lisättiin 25. suvusta alkaen etuliite dyo- [7] ja sitten etuliite treis- . Vuonna 2017 perhe jaettiin kahteen alaheimoon: Firstpapillomavirinae , joka sisälsi kaikki vanhat ja 3 uutta sukua, ja Secondpapillomavirinae , jossa oli yksi uusi Alefpapillomavirus- suvun suvut [8] .

Huhtikuussa 2018 Firstpapillomavirinae -alaheimoon kuuluu 52 sukua [9] :

• 24 sukua ilman etuliitteitä nimessä: Alphapapillomavirus - Omegapapillomavirus
• 21 sukupuolta etuliitteellä dyo- :

dyochipapilloomavirus Dyodeltapapilloomavirus Dyoepsilon papilloomavirus Dyoetapapilloomavirus Dyoiotapapilloomavirus Dyokappapapilloomavirus Dyolambdapapilloomavirus Dyomupapilloomavirus Dyonupapilloomavirus Dyomegapapilloomavirus Dyoomikronpapilloomavirus Dyophipapilloomavirus Dyopipapilloomavirus dyopsipapilloomavirus Dyorhopapilloomavirus Dyosigmapapilloomavirus Dyotaupapilloomavirus Dyothetapapilloomavirus Dyoupsilonpapilloomavirus Dyoksipapilloomavirus Dyozetapapilloomavirus

• 7 sukua etuliitteellä treis- :

Treisdeltapapilloomavirus Treisepsilonpapilloomavirus Treisetapapilloomavirus Treisiotapapilloomavirus Treiskappapapilloomavirus Treistetapapilloomavirus Treiszetapapilloomavirus

Laajin on suvu Gammapapillomavirus , johon kuuluu 27 lajia: Gammapapillomavirus 1-27 . Monet suvut ovat monotyyppisiä [9] .

Muistiinpanot

1. ↑ Virusten taksonomia  Kansainvälisen virustaksonomian komitean (ICTV) verkkosivustolla .
2. ↑ Lääketieteellisen mikrobiologian, virologian ja immunologian atlas: Oppikirja lääketieteen opiskelijoille / Toim. A. A. Vorobieva , A. S. Bykova . - M .  : Medical Information Agency, 2003. - S. 113. - ISBN 5-89481-136-8 .
3. ↑ Marx JL Ihmisen papilloomavirus ja kohdunkaulan syöpä  (englanniksi)  // Tiede. - 1986. - Voi. 231 , iss. 4741 . - s. 920 .
4. ↑ Muinainen DNA tarjoaa todisteita 27 000 vuotta vanhasta papilloomavirusinfektiosta ja pitkäaikaisesta yhteishajoamisesta jyrsijöiden kanssa . Haettu 16. joulukuuta 2018. Arkistoitu alkuperäisestä 16. joulukuuta 2018. (määrätön)
5. ↑ Taksonomiajulkaisuhistoria arkistoitu 2. toukokuuta 2020 Wayback Machinessa  ICTV-verkkosivustolla  . (Käytetty: 11. toukokuuta 2018) .
6. ↑ Määrittää Papillomaviridae-heimon lajiksi & Luo suvuksi suvuksi  : [ fin. ] // ICTV. — Annettu koodi: 2003.224 ja 252V. – 2003.
7. ↑ Papillomaviridae -heimon järkeistäminen ja laajentaminen  : [ eng. ] // ICTV. — Annettu koodi: 2010.001a-kkkV. - 2010. - 39 s.
8. ↑ 17 uuden lajin, 4 uuden suvun ja 2 alaheimon luominen Papillomaviridae -heimoon  : [ eng. ] // ICTV. — Annettu koodi: 2017.010D. – 2017.
9. ↑ 1 2 Taxonomy of Viruses  (englanniksi) Kansainvälisen virustaksonomian komitean (ICTV) verkkosivuilla . (Käytetty: 11. toukokuuta 2018) .

Sanakirjat ja tietosanakirjat	Iso venäläinen
Taksonomia	EOL GBIF iNaturalist NCBI IRMNG Matoja
Bibliografisissa luetteloissa	NKC : ph123944

Virusten luokitus Baltimoren mukaan
DNA	I: dsDNA- virukset Adnaviria Zilligvirae Taleaviricota Tokiviricetes Ligamenvirales Lipothrixviridae_ Rudiviridae_ Primavirales Tristromaviridae_ Duplodnaviria Heunggongvirae Peploviricota Herviviricetes herpesvirukset Alloherpesviridae_ herpesviridae Malacoherpesviridae_ Uroviricota Caudoviricetes Caudovirales Ackermannviridae_ Autographiviridae Chaseviridae Demerecviridae Drexlerviridae Guelinviridae Herelleviridae_ Myoviridae Podoviridae_ Rountreeviridae Salasmaviridae Schitoviridae Siphoviridae_ Zobellviridae Monodnaviria Shotokuvirae Cossaviricota Papovaviricetes Sepolyvirales Polyomaviridae Zurhausenvirales Papillomaviridae Varidnaviria Bamfordvirae_ Nucleocytoviricota Pokkesviricetes Asfuvirales Asfarviridae Chitovirales Poxviridae Megaviricetes Algavirales Phycodnaviridae_ Imitervirales Mimiviridae_ Pimascovirales Ascoviridae_ Iridoviridae Marseilleviridae_ Preplasmiviricota Maveriviricetes Priklausovirales Lavidaviridae Polintoviricetes Orthopolintovirales Adintoviridae_ Tectiliviricetes Belfryrirales Turriviridae_ Kalamavirales Tectiviridae_ Rowavirales Adenoviridae Vinavirales Corticoviridae_ Helvetiavirae_ Dividoviricota Laserviricetes Halopanivirales Matshushitaviridae_ Simuloviridae_ Sphaerolipoviridae_ Luokittelematon Naldaviricetes Lefavirales Baculoviridae Hytrosaviridae_ Nudiviridae_ Luokittelematon Nimaviridae_ Luokittelematon perhe : Ampullaviridae Bicaudaviridae_ Clavaviridae_ Fuselloviridae_ Globuloviridae_ Guttaviridae_ Halspiviridae_ Ovaliviridae_ Plasmaviridae_ Polydnaviridae_ Portogloboviridae_ Thaspiviridae_ Suku : Dinodnavirus Rhizidiovirus II: oc DNA-virukset Monodnaviria Loebvirae Hofneiviricota Faserviricetes Tubulavirales Inoviridae_ Paulinoviridae Plectroviridae } Sangervirae_ Phixviricota Malgrandaviricetes Petitvirales Microviridae_ Shotokuvirae Cossaviricota Mouviricetes Polivirales Bidnaviridae_ Quintoviricetes Piccovirales Parvoviridae Cressdnaviricota Arfiviricetes Baphyvirales Bacilladnaviridae_ Cirlivirales Circoviridae_ Cremevirales Smacoviridae_ Mulpavirales Metaxiviridae Nanoviridae_ Recrevirales Redondoviridae_ Repensiviricetes Geplafuvirales Geminiviridae_ Genomoviridae_ Trapavirae_ Saleviricota Huolimaviricetes Haloruvirales_ Pleolipoviridae_ Luokittelematon Heimot : Anelloviridae Finnlakeviridae Spiraviridae_
RNA	III: dsRNA- virukset Riboviria Orthornavirae Duplornaviricota Chrymotiviricetes Ghabrivirales Chrysoviridae_ Megabirnaviridae_ Quadriviridae_ Totiviridae Resentoviricetes Reovirales Reoviridae Vidaverviricetes Mindivirales Cystoviridae_ Pisuviricota Duplopiviricetes Durnavirales Amalgaviridae_ Curvulaviridae Hypoviridae_ Picobirnaviridae_ Partitiviridae_ Luokittelematon Perheet : Birnaviridae Polymycoviridae Suku : Botybirnavirus IV: (+) ss- RNA-virukset Riboviria Orthornavirae Kitrinoviricota Alsuviricetes Hepelivirales Alphatetraviridae_ Benyviridae Hepeviridae_ Matonaviridae_ Martellivirales Bromoviridae_ Closteroviridae_ Endornaviridae_ Kitaviridae Mayoviridae Togaviridae Virgaviridae Tymovirales Alphaflexiviridae_ Betaflexiviridae_ Deltaflexiviridae Gammaflexiviridae_ Tymoviridae_ Flasuviricetes Amarillovirales Flaviviridae Magsaviricetes Nodamuvirales Nodaviridae_ Sinhaliviridae Tolukavirukset Tolivirales_ Carmotetraviridae_ Luteoviridae_ Tombusviridae_ Lenarviricota Leviviricetes Norzivirales Atkinsviridae_ Duinviridae_ Fiersviridae_ Solspiviridae_ Timlovirales_ Blumeviridae_ Steitzviridae_ Amabiliviricetes wolframvirales_ Narnaviridae_ Howeltoviricetes Cryppavirales Mitoviridae_ miaviricetes Ourlivirales Botourmiaviridae_ Pisuviricota Pisoniviricetes Nidovirales Abyssoviridae_ Arteriviridae_ Cremegaviridae Coronaviridae Euroniviridae Gresnaviridae Medioniviridae Mesoniviridae_ Mononiviridae_ Nanghoshaviridae Nanhypoviridae Olifoviridae Roniviridae_ Tobaniviridae_ Picornavirales Picornaviridae Marnaviridae_ Solinviviridae Caliciviridae_ Flaviridae_ Secoviridae_ Dicistroviridae_ Polycipiviridae Sobelivirales Alvernaviridae_ Barnaviridae_ Solemoviridae_ Stelpaviricetes Patatavirales Potyviridae_ Stellavirales Astroviridae Luokittelematon Heimot : Permutotetraviridae Sarthroviridae V: (-) ss RNA -virukset Riboviria Orthornavirae Negarnaviricota Chunqiuviricetes Muvirales Qinviridae_ Ellioviricetes Bunyavirales Cruliviridae_ Arenaviridae Fimoviridae_ Hantaviridae_ Leishbuviridae Mypoviridae Nairoviridae_ Peribunyaviridae_ Phasmaviridae_ Phenuiviridae_ Tospoviridae_ Wupedeviridae Insthoviricetes Articulavirales Amnoonviridae_ Orthomyxoviridae Milneviricetes Serpentovirales_ Aspiviridae_ Monjiviricetes Jingchuvirales Aliusviridae Chuviridae_ Crepuscuviridae Myriaviridae Natareviridae Mononegavirales Artoviridae_ Bornaviridae Filoviridae Lispiviridae Mymonaviridae_ Nyamiviridae_ Paramyxoviridae Pneumoviridae_ Rhabdoviridae Sunviridae_ Xinmoviridae Yunchangviricetes Goujianvirales Yueviridae_
FROM	VI: ssRNA -RT-virukset Riboviria Paranavirae Artverviricota Revtraviricetes Ortervirales Belpaoviridae Metaviridae Pseudoviridae Retroviridae VII: dsDNA -RT-virukset Riboviria Paranavirae Artverviricota Revtraviricetes Blubervirales Hepadnaviridae Ortervirales Caulimoviridae