ARNT

ARNT
Käytettävissä olevat rakenteet
ATEOrtologinen haku: PDBe RCSB
Tunnisteet
Symbolit ARNT , HIF-1-beta, HIF-1beta, HIF1-beta, HIF1B, HIF1BETA, TANGO, bHLHe2, aryylihiilivetyreseptorin ydintranslokaattori, aryylihiilivetyreseptorin ydintranslokaattori
Ulkoiset tunnukset OMIM: 126110 MGI: 88071 Homologi: 1261 GeneCards: 405
RNA-ekspressioprofiili




Lisää tietoa
ortologit
Erilaisia Ihmisen Hiiri
Entrez
Yhtye
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001037737
NM_009709

RefSeq (proteiini)

NP_001032826
NP_033839

Locus (UCSC) Chr 1: 150,81 – 150,88 Mb Chr 3: 95,34 – 95,4 Mb
PubMed- haku [yksi] [2]
Muokkaa (ihminen)Muokkaa (hiiri)

ARNT (lyhenne englanniksi.  Aryl hiilivetyreseptori ydintranslocator ) - aromaattisen hiilivetyreseptorin (AHR) ydintranslokaattori (kantaja), on proteiini , joka muodostaa kompleksin ligandiin sitoutuneen AHR-reseptorin kanssa ja on välttämätön reseptorin toiminnalle. Sitä koodaa samanniminen ARNT -geeni , joka sijaitsee 1-kromosomin lyhyessä haarassa (p-arm) [1] .

Koodattu proteiini on myös tunnistettu heterodimeerisen transkriptiotekijän , hypoksian indusoivan tekijän (HIF1β) beeta-alayksiköksi. Translokaatio t(1; 12) (q21; p13), joka johtaa adheesioon TEL-ARNT-proteiiniin, liittyy akuuttiin myeloblastiseen leukemiaan. Tälle geenille on kuvattu kolme vaihtoehtoista silmukoitua varianttia, jotka koodaavat erilaisia ​​isoformeja.

Aromaattinen hiilivetyreseptori (AHR) osallistuu useiden ksenobioottien metaboliaan osallistuvien entsyymien induktioon . Aromaattisen hiilivetyreseptorin ligandi-sytosolinen muoto on yhdistetty kompleksisesti lämpöshokkiproteiiniin (Hsp90). Ligandien sitoutuminen, mukaan lukien dioksiinit ( TCDD ) ja polysykliset aromaattiset hiilivedyt (PAH), johtaa ligandia sitovan alayksikön translokaatioon (liikkumiseen) vain [2] solun ytimessä . Ksenobioottien metaboliaan osallistuvien entsyymien induktio johtuu ligandiin sitoutuneen AhR:n sitoutumisesta ksenobioottiherkkiin elementteihin näiden entsyymien geenien promoottorialueilla.

Vuorovaikutuksia muiden proteiinien kanssa

ARNT on vuorovaikutuksessa seuraavien proteiinien kanssa:

Muistiinpanot

  1. HUGO-geeninimikkeistökomitea, HGNC:  700 . Haettu 21. syyskuuta 2017. Arkistoitu alkuperäisestä 21. syyskuuta 2017.
  2. Hughes D. , Guttenplan JB , Marcus CB , Subbaramaiah K. , Dannenberg AJ Heat Shock Protein 90 -estäjät suppressoivat aryylihiilivetyreseptorivälitteistä CYP1A1- ja CYP1B1-transkription ja DNA-adduktien ennaltaehkäisytutkimuksen aktivaatiota  //  . - 2008. - 1. marraskuuta ( osa 1 , nro 6 ). - s. 485-493 . — ISSN 1940-6207 . - doi : 10.1158/1940-6207.CAPR-08-0149 .
  3. Carver LA, Bradfield CA Aryylihiilivetyreseptorin ligandiriippuvainen vuorovaikutus uuden immunofiliinihomologin kanssa in vivo  //  Journal of Biological Chemistry  : Journal. - 1997. - huhtikuu ( nide 272 , nro 17 ). - P. 11452-11456 . doi : 10.1074 / jbc.272.17.11452 . — PMID 9111057 .
  4. Kazlauskas A., Sundström S., Poellinger L., Pongratz I.  Hsp90 -chaperonikompleksi säätelee dioksiinireseptorin solunsisäistä lokalisaatiota  // Molecular and Cellular Biology : päiväkirja. - 2001. - huhtikuu ( osa 21 , nro 7 ) . - P. 2594-2607 . - doi : 10.1128/MCB.21.7.2594-2607.2001 . — PMID 11259606 .
  5. Lindebro MC, Poellinger L., Whitelaw ML Proteiinin ja proteiinin vuorovaikutus PAS-domeenien kautta: PAS-domeenin rooli bHLH/PAS-dioksiinireseptori-Arnt-transkriptiotekijäkompleksin positiivisessa ja negatiivisessa säätelyssä  //  The EMBO Journal : päiväkirja. - 1995. - heinäkuu ( osa 14 , nro 14 ). - P. 3528-3539 . — PMID 7628454 .
  6. Whitelaw M., Pongratz I., Wilhelmsson A., Gustafsson JA, Poellinger L. Ligandista riippuvainen Arnt-koregulaattorin värvääminen määrittää DNA:n tunnistamisen dioksiinireseptorilla   // Molecular and Cellular Biology : päiväkirja. - 1993. - huhtikuu ( osa 13 , nro 4 ) . - P. 2504-2514 . — PMID 8384309 .
  7. Yamaguchi Y., Kuo MT Funktionaalinen analyysi aryylihiilivetyreseptorin ydintranslokaattorin vuorovaikutuksista aryylihiilivetyreseptorin kanssa hiivan kaksihybridijärjestelmässä  //  Biokemiallinen farmakologia : päiväkirja. - 1995. - lokakuu ( osa 50 , nro 8 ). - s. 1295-1302 . - doi : 10.1016/0006-2952(95)02016-6 . — PMID 7488247 .
  8. Mimura J., Ema M., Sogawa K., Fujii-Kuriyama Y. Ah (dioksiini) -reseptorin toiminnan uuden säätelymekanismin tunnistaminen  (englanniksi)  // Genes & Development  : Journal. - 1999. - tammikuu ( osa 13 , nro 1 ) . - s. 20-5 . - doi : 10.1101/gad.13.1.20 . — PMID 9887096 .
  9. 1 2 Hogenesch JB, Chan WK, Jackiw VH, Brown RC, Gu YZ, Pray-Grant M., Perdew GH, Bradfield CA Perus-helix-loop-helix-PAS-superperheen osajoukon karakterisointi, joka on vuorovaikutuksessa dioksiinin signalointireitti  (englanniksi)  // Journal of Biological Chemistry  : Journal. - 1997. - maaliskuu ( nide 272 , nro 13 ). - P. 8581-8593 . doi : 10.1074 / jbc.272.13.8581 . — PMID 9079689 .
  10. 1 2 3 Woods SL, Whitelaw ML Hiiren yksimielisten 1:n (SIM1) ja SIM2:n erilaiset aktiviteetit hypoksisessa vasteelementissä. Ristipuhelu perushelix-loop-helix/per-Arnt-Sim homologian transkriptiotekijöiden välillä  (englanniksi)  // Journal of Biological Chemistry  : Journal. - 2002. - maaliskuu ( nide 277 , nro 12 ). - P. 10236-10243 . - doi : 10.1074/jbc.M110752200 . — PMID 11782478 .
  11. 1 2 Beischlag TV, Wang S., Rose DW, Torchia J., Reisz-Porszasz S., Muhammad K., Nelson WE, Probst MR, Rosenfeld MG, Hankinson O. NCoA/SRC-1/p160-perheen rekrytointi aryylihiilivetyreseptorin/aryylihiilivetyreseptorin ydintranslokaattorikompleksin transkription koaktivaattorit   // Molecular and Cellular Biology : päiväkirja. - 2002. - Kesäkuu ( osa 22 , nro 12 ) . - P. 4319-4333 . - doi : 10.1128/mcb.22.12.4319-4333.2002 . — PMID 12024042 .
  12. 1 2 Probst MR, Fan CM, Tessier-Lavigne M., Hankinson O. Drosophilan yksimielisen proteiinin kaksi hiiren homologia, jotka ovat vuorovaikutuksessa hiiren aryylihiilivetyreseptorin ydintranslokaattoriproteiinin kanssa  (englanniksi)  // Journal of Biological Chemistry  : Journal . - 1997. - Helmikuu ( nide 272 , nro 7 ). - P. 4451-4457 . doi : 10.1074 / jbc.272.7.4451 . — PMID 9020169 .
  13. Ooe N., Saito K., Mikami N., Nakatuka I., Kaneko H. Uuden perushelix -loop-helix-PAS-tekijän, NXF:n tunnistaminen paljastaa Sim2:n kilpailevan, positiivisen säätelyn roolin dendriitti-sytoskeleton modulaattorin drebriinissä geeniekspressio  (englanniksi)  // Molecular and Cellular Biology : päiväkirja. - 2004. - tammikuu ( osa 24 , nro 2 ) . - s. 608-616 . - doi : 10.1128/mcb.24.2.608-616.2004 . — PMID 14701734 .
  14. Moffett P., Reece M., Pelletier J.  Hiiren Sim-2-geenituote estää transkriptiota aktiivisella repressiolla ja toiminnallisilla häiriöillä  // Molecular and Cellular Biology : päiväkirja. - 1997. - syyskuu ( osa 17 , nro 9 ). - P. 4933-4947 . - doi : 10.1128/mcb.17.9.4933 . — PMID 9271372 .