ARNT
ARNT
|
---|
|
ATE | Ortologinen haku: PDBe RCSB |
4PKY , 1X0O , 2A24 , 2B02 , 2HV1 , 2K7S , 3F1N , 3F1O , 3F1P , 3H7W , 3H82 , 4EQ1 , 4GHI , 4GS , , X4HV1 , , 4HV1
| | |
|
Symbolit
| ARNT , HIF-1-beta, HIF-1beta, HIF1-beta, HIF1B, HIF1BETA, TANGO, bHLHe2, aryylihiilivetyreseptorin ydintranslokaattori, aryylihiilivetyreseptorin ydintranslokaattori |
---|
Ulkoiset tunnukset |
OMIM: 126110 MGI: 88071 Homologi: 1261 GeneCards: 405
|
---|
Toiminnot |
• sekvenssispesifinen DNA:n sitoutuminen • DNA:han sitoutuminen • proteiinin dimerisaatioaktiivisuus • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA:ta sitovan transkriptiotekijän aktiivisuus • GO: 0001105 :n transkription koaktivaattorin aktiivisuus • aryyli-hiilivetyreseptoria sitova vaikutus tekijä • GO:0001948, GO:0016582 sitoutuminen plasman proteiineihin • proteiinien heterodimerointiaktiivisuus • transkriptiotekijän aktiivisuus, RNA-polymeraasi II:n distaalisen tehostajan sekvenssispesifinen sitoutuminen • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA:ta sitova transkriptiotekijä RNA-polymeraasi II -spesifinen • proteiinin homodimeroituminen • sekvenssispesifinen kaksijuosteisen DNA:n sitoutuminen • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 tumareseptoriaktiivisuus
|
---|
solukomponentti |
• sytoplasma • transkriptiokompleksin säätelijä • nukleoplasma • RNA-polymeraasi II:n transkription säätelijäkompleksi • solun ydin • tumakappaleet
|
---|
biologinen prosessi |
• verisuonten endoteelin kasvutekijäreseptorin signaalireitin positiivinen säätely • Solujen erilaistuminen • vaste hypoksiaan • GO:0009373 DNA-riippuvainen transkription säätely • Endoteelisolujen lisääntymisen positiivinen säätely • RNA-polymeraasi II -promoottorin transkription säätely vasteena oksidatiiviselle stressille • erytrosyyttien erilaistumisen positiivinen säätely • alkion istukan kehitys • mRNA:n transkriptio RNA-polymeraasi II :lla • proteiinin sumoylaation positiivinen säätely • transkriptio, DNA-riippuvainen • GO:0060469, GO:0009371 transkription positiivinen säätely • solunsisäinen reseptorin signalointireitti • transkription säätely RNA-polymeraasi II -promoottori vasteena hypoksialle • vaskulaarisen endoteelin kasvutekijätuotannon positiivinen säätely • glykolyyttisen prosessin positiivinen säätely • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 RNA-polymeraasin positiivisella säätelyllä II promoottori • positiivinen sääntely hormonien biosynteettinen prosessi • ksenobioottinen aineenvaihduntaprosessi
|
---|
Lähteet: Amigo / QuickGO | |
|
Lisää tietoa
|
Erilaisia |
Ihmisen |
Hiiri |
---|
Entrez |
|
|
---|
Yhtye |
|
|
---|
UniProt |
|
|
---|
RefSeq (mRNA) |
| |
---|
RefSeq (proteiini) |
| |
---|
Locus (UCSC) |
Chr 1: 150,81 – 150,88 Mb
| Chr 3: 95,34 – 95,4 Mb
|
---|
PubMed- haku |
[yksi]
| [2] |
---|
Muokkaa (ihminen) | Muokkaa (hiiri) |
ARNT (lyhenne englanniksi. Aryl hiilivetyreseptori ydintranslocator ) - aromaattisen hiilivetyreseptorin (AHR) ydintranslokaattori (kantaja), on proteiini , joka muodostaa kompleksin ligandiin sitoutuneen AHR-reseptorin kanssa ja on välttämätön reseptorin toiminnalle. Sitä koodaa samanniminen ARNT -geeni , joka sijaitsee 1-kromosomin lyhyessä haarassa (p-arm) [1] .
Koodattu proteiini on myös tunnistettu heterodimeerisen transkriptiotekijän , hypoksian indusoivan tekijän (HIF1β) beeta-alayksiköksi. Translokaatio t(1; 12) (q21; p13), joka johtaa adheesioon TEL-ARNT-proteiiniin, liittyy akuuttiin myeloblastiseen leukemiaan. Tälle geenille on kuvattu kolme vaihtoehtoista silmukoitua varianttia, jotka koodaavat erilaisia isoformeja.
Aromaattinen hiilivetyreseptori (AHR) osallistuu useiden ksenobioottien metaboliaan osallistuvien entsyymien induktioon . Aromaattisen hiilivetyreseptorin ligandi-sytosolinen muoto on yhdistetty kompleksisesti lämpöshokkiproteiiniin (Hsp90). Ligandien sitoutuminen, mukaan lukien dioksiinit ( TCDD ) ja polysykliset aromaattiset hiilivedyt (PAH), johtaa ligandia sitovan alayksikön translokaatioon (liikkumiseen) vain [2] solun ytimessä . Ksenobioottien metaboliaan osallistuvien entsyymien induktio johtuu ligandiin sitoutuneen AhR:n sitoutumisesta ksenobioottiherkkiin elementteihin näiden entsyymien geenien promoottorialueilla.
Vuorovaikutuksia muiden proteiinien kanssa
ARNT on vuorovaikutuksessa seuraavien proteiinien kanssa:
Muistiinpanot
- ↑ HUGO-geeninimikkeistökomitea, HGNC: 700 . Haettu 21. syyskuuta 2017. Arkistoitu alkuperäisestä 21. syyskuuta 2017.
- ↑ Hughes D. , Guttenplan JB , Marcus CB , Subbaramaiah K. , Dannenberg AJ Heat Shock Protein 90 -estäjät suppressoivat aryylihiilivetyreseptorivälitteistä CYP1A1- ja CYP1B1-transkription ja DNA-adduktien ennaltaehkäisytutkimuksen aktivaatiota // . - 2008. - 1. marraskuuta ( osa 1 , nro 6 ). - s. 485-493 . — ISSN 1940-6207 . - doi : 10.1158/1940-6207.CAPR-08-0149 .
- ↑ Carver LA, Bradfield CA Aryylihiilivetyreseptorin ligandiriippuvainen vuorovaikutus uuden immunofiliinihomologin kanssa in vivo // Journal of Biological Chemistry : Journal. - 1997. - huhtikuu ( nide 272 , nro 17 ). - P. 11452-11456 . doi : 10.1074 / jbc.272.17.11452 . — PMID 9111057 .
- ↑ Kazlauskas A., Sundström S., Poellinger L., Pongratz I. Hsp90 -chaperonikompleksi säätelee dioksiinireseptorin solunsisäistä lokalisaatiota // Molecular and Cellular Biology : päiväkirja. - 2001. - huhtikuu ( osa 21 , nro 7 ) . - P. 2594-2607 . - doi : 10.1128/MCB.21.7.2594-2607.2001 . — PMID 11259606 .
- ↑ Lindebro MC, Poellinger L., Whitelaw ML Proteiinin ja proteiinin vuorovaikutus PAS-domeenien kautta: PAS-domeenin rooli bHLH/PAS-dioksiinireseptori-Arnt-transkriptiotekijäkompleksin positiivisessa ja negatiivisessa säätelyssä // The EMBO Journal : päiväkirja. - 1995. - heinäkuu ( osa 14 , nro 14 ). - P. 3528-3539 . — PMID 7628454 .
- ↑ Whitelaw M., Pongratz I., Wilhelmsson A., Gustafsson JA, Poellinger L. Ligandista riippuvainen Arnt-koregulaattorin värvääminen määrittää DNA:n tunnistamisen dioksiinireseptorilla // Molecular and Cellular Biology : päiväkirja. - 1993. - huhtikuu ( osa 13 , nro 4 ) . - P. 2504-2514 . — PMID 8384309 .
- ↑ Yamaguchi Y., Kuo MT Funktionaalinen analyysi aryylihiilivetyreseptorin ydintranslokaattorin vuorovaikutuksista aryylihiilivetyreseptorin kanssa hiivan kaksihybridijärjestelmässä // Biokemiallinen farmakologia : päiväkirja. - 1995. - lokakuu ( osa 50 , nro 8 ). - s. 1295-1302 . - doi : 10.1016/0006-2952(95)02016-6 . — PMID 7488247 .
- ↑ Mimura J., Ema M., Sogawa K., Fujii-Kuriyama Y. Ah (dioksiini) -reseptorin toiminnan uuden säätelymekanismin tunnistaminen (englanniksi) // Genes & Development : Journal. - 1999. - tammikuu ( osa 13 , nro 1 ) . - s. 20-5 . - doi : 10.1101/gad.13.1.20 . — PMID 9887096 .
- ↑ 1 2 Hogenesch JB, Chan WK, Jackiw VH, Brown RC, Gu YZ, Pray-Grant M., Perdew GH, Bradfield CA Perus-helix-loop-helix-PAS-superperheen osajoukon karakterisointi, joka on vuorovaikutuksessa dioksiinin signalointireitti (englanniksi) // Journal of Biological Chemistry : Journal. - 1997. - maaliskuu ( nide 272 , nro 13 ). - P. 8581-8593 . doi : 10.1074 / jbc.272.13.8581 . — PMID 9079689 .
- ↑ 1 2 3 Woods SL, Whitelaw ML Hiiren yksimielisten 1:n (SIM1) ja SIM2:n erilaiset aktiviteetit hypoksisessa vasteelementissä. Ristipuhelu perushelix-loop-helix/per-Arnt-Sim homologian transkriptiotekijöiden välillä (englanniksi) // Journal of Biological Chemistry : Journal. - 2002. - maaliskuu ( nide 277 , nro 12 ). - P. 10236-10243 . - doi : 10.1074/jbc.M110752200 . — PMID 11782478 .
- ↑ 1 2 Beischlag TV, Wang S., Rose DW, Torchia J., Reisz-Porszasz S., Muhammad K., Nelson WE, Probst MR, Rosenfeld MG, Hankinson O. NCoA/SRC-1/p160-perheen rekrytointi aryylihiilivetyreseptorin/aryylihiilivetyreseptorin ydintranslokaattorikompleksin transkription koaktivaattorit // Molecular and Cellular Biology : päiväkirja. - 2002. - Kesäkuu ( osa 22 , nro 12 ) . - P. 4319-4333 . - doi : 10.1128/mcb.22.12.4319-4333.2002 . — PMID 12024042 .
- ↑ 1 2 Probst MR, Fan CM, Tessier-Lavigne M., Hankinson O. Drosophilan yksimielisen proteiinin kaksi hiiren homologia, jotka ovat vuorovaikutuksessa hiiren aryylihiilivetyreseptorin ydintranslokaattoriproteiinin kanssa (englanniksi) // Journal of Biological Chemistry : Journal . - 1997. - Helmikuu ( nide 272 , nro 7 ). - P. 4451-4457 . doi : 10.1074 / jbc.272.7.4451 . — PMID 9020169 .
- ↑ Ooe N., Saito K., Mikami N., Nakatuka I., Kaneko H. Uuden perushelix -loop-helix-PAS-tekijän, NXF:n tunnistaminen paljastaa Sim2:n kilpailevan, positiivisen säätelyn roolin dendriitti-sytoskeleton modulaattorin drebriinissä geeniekspressio (englanniksi) // Molecular and Cellular Biology : päiväkirja. - 2004. - tammikuu ( osa 24 , nro 2 ) . - s. 608-616 . - doi : 10.1128/mcb.24.2.608-616.2004 . — PMID 14701734 .
- ↑ Moffett P., Reece M., Pelletier J. Hiiren Sim-2-geenituote estää transkriptiota aktiivisella repressiolla ja toiminnallisilla häiriöillä // Molecular and Cellular Biology : päiväkirja. - 1997. - syyskuu ( osa 17 , nro 9 ). - P. 4933-4947 . - doi : 10.1128/mcb.17.9.4933 . — PMID 9271372 .