Pseudomonas fluorescens

Kokeneet kirjoittajat eivät ole vielä tarkistaneet sivun nykyistä versiota, ja se voi poiketa merkittävästi 17.5.2022 tarkistetusta versiosta . tarkastukset vaativat 2 muokkausta .
Pseudomonas fluorescens

Fluoresoiva Pseudomonas; pesäkkeen siirrostus tryptonihiivauutteeseen (valkoinen taustavalo)
tieteellinen luokittelu
Verkkotunnus:bakteeritTyyppi:ProteobakteeritLuokka:Gamma proteobakteeritTilaus:PseudomonadalesPerhe:PseudomonadaceaeSuku:PseudomonasNäytä:Pseudomonas fluorescens
Kansainvälinen tieteellinen nimi
Pseudomonas fluorescens Migula 1895
Synonyymit
  • Bacillus fluorescens liquefaciens Flugge 1886
  • Bacillus fluorescens Trevisan 1889
  • Bacterium fluorescens (Trevisan 1889) Lehmann ja Neumann 1896
  • Liquidomonas fluorescens (Trevisan 1889) Orla-Jensen 1909
  • Liquidomonas fluorescens (Lasseur) Rotu 1948
  • Pseudomonas schuylkilliensis Chester 1952
  • Pseudomonas washingtoniae (mänty) Elliott

Fluoresoiva Pseudomonas [1] ( lat.  Pseudomonas fluorescens ) on gram-negatiivisen liikkuvan sauvan muotoisen bakteerin tyyppi, jossa on useita (2-4) siimoja [2] . Kuuluu pseudomonads -sukuun . 16S-rRNA :n nukleotidisekvenssitutkimukset sijoittavat P. fluorescensin intrageneeriseen ryhmään fluorescens .

Etymologia

Sana "pseudomonas" tarkoittaa "väärä elementtiä" ja on johdettu kreikan sanasta ψευδο ("pseudo") ja latinan sanasta monas (tai kreikkalainen μονάς/μονάδα ). Molemmissa tapauksissa tarkoittaa "yksi jakamaton elementti". Sanaa käytettiin aiemmin mikrobiologiassa viittaamaan mikro -organismeihin .

Sana "fluorescens" tarkoittaa, että mikro-organismit erittävät liukoista fluoresoivaa pigmenttiä nimeltä pyoverdin , joka kuuluu sideroforityyppiin .

Bakteriologiset perusominaisuudet

Lajin jäsenillä on erittäin joustava aineenvaihdunta . Ne voivat elää vedessä ja maaperässä. Ne ovat pakollisia aerobeja . Jotkut kannat pystyvät käyttämään nitraattia hapen sijasta lopullisena vastaanottajana soluhengitysprosessissa . Optimaalinen lämpötila P. fluorescensin kasvulle on 25-30 °C. Antaa positiivisia tuloksia oksidaasitestissä . Se on myös ei-sakkarolyyttinen bakteeri.

P. fluorescens - bakteeri ja muut vastaavat pseudomonadit tuottavat lämpöstabiileja lipaaseja ja proteaaseja . Nämä entsyymit aiheuttavat maidon pilaantumista, antavat sille katkeruutta, hajottavat kaseiinit ja aiheuttavat edelleen polysakkaridijuosteiden ilmaantumista siihen , mikä johtuu liman muodostumisesta ja proteiinien hyytymisestä .

Aineenvaihdunta

P. fluorescens tuottaa floroglusinolia , floroglusinolikarboksyylihappoa ja _

Biologinen hajoaminen

P. fluorescensissä entsyymi 4 - hydroksiasetofenonimono-oksigenaasi , joka muuttaa Piceol ruenin -hydroksifenyylietikkahapoksi .

Genomin sekvensointi

Seuraavat F. pseudomonas -kannat on sekvensoitu : SBW25 [3] , Pf-5 [4] , PfO-1 [5] .

Organismien lukumäärän biologinen säätely

Joillakin P. fluorescens -kannoilla (kuten CHA0 tai Pf-5) on biotorjuntakyky, joka suojaa joidenkin kasvilajien juuria loissieniltä, ​​kuten Fusarium tai Pythium root rot , ja myös eräiltä kasvinsyöjiltä sukkulamadoilta .

Ei ole täysin selvää, kuinka F. pseudomonadilla on kasvien kasvua aktivoivia ominaisuuksia. Tästä on useita versioita:

Tarkemmin sanottuna tietyt P. pseudomonas -isolaatit tuottavat 2,4-diasetyyliphloroglucinol (jäljempänä 2,4-DAPG) sekundaarisia metaboliitteja , joiden koostumuksen uskotaan olevan vastuussa näiden kantojen fytopatogeenisyydestä ja biokontrollista. Floroglusinoligeeniklusteri on vastuussa 2,4- DAPG -geenitekijästä biosynteesin, säätelyn, ulosvirtauksen ja hajoamisen suhteen. Kahdeksan floroglusinoligeeniä (HGFACBDE) on merkitty tässä klusterissa, ja ne on organisatorisesti osoitettu F. pseudomonad -kantojen 2,4-DAPG:n tuotantoon. Näistä geeneistä D-geeni on vastuussa tyypin III polyketidisyntaasista , mikä tarjoaa keskeisen biosynteettisen tekijän 2,4-DAPG:n tuotannossa. D - geeni on samankaltainen kalkonisyntaasin kanssa , ja se on teoriassa peräisin horisontaalisesta geeninsiirrosta . Fylogeneettiset ja genomiset analyysit ovat kuitenkin osoittaneet, että koko floroglusinoligeeniklusteri on F. pseudomonas -bakteerin jälkeläinen, ja monet kannat ovat menettäneet tuottavuuttaan, mitä esiintyy kantojen eri genomialueilla.

On olemassa kokeellisia todisteita näiden teorioiden tukemiseksi tietyissä olosuhteissa. Haas ja Defago antavat yleiskatsauksen tästä aiheesta [6] .

Useat F. pseudomonas -kannat, kuten Pf-5 ja JL3985, ovat kehittäneet luonnollisen resistenssin ampisilliinille ja streptomysiinille .

Näitä antibiootteja käytetään säännöllisesti biologisessa tutkimuksessa selektiivisenä painevälineenä plasmidin transkription ja translaation indusoimiseksi .

Pf-CL145A:ksi kutsuttu kanta on osoittautunut lupaavaksi ratkaisuksi seeprasimpukkapopulaation hallintaan . Tämä ympäristöstä eristetty bakteerikanta voi tappaa yli 90 % seeprasimpukoista myrkytyksen kautta (eli ei-tarttuvana). Tämä tapahtuu niiden solukalvoihin kuuluvan luonnollisen aineen (aineiden) toiminnan seurauksena. Kuolleilla Pf-145A-soluilla seeprasinisimpukat kuolevat samalla tavalla kuin elävät. Bakteerisolujen seuraavan nielemisen yhteydessä seeprasimpukat kuolevat ruoansulatusrauhasen myöhemmän hajoamisen ja nekroosin sekä mahalaukun epiteelin nekroottisten massojen hylkäämisen vuoksi. Toistaiseksi tutkimukset osoittavat, että simpukoiden spesifisyys on erittäin korkea, ja altistumisen riski on alhainen. Pf-CL145A-kanta on tällä hetkellä kaupallistettu tuotenimellä "Zequanox", joka sisältää sen kuolleet bakteerisolut vaikuttavana aineena.

Sovellus

P. fluorescensin viljely tuottaa antibioottia mupirosiinia , jota käytetään silmä-, korva- ja ihosairauksien hoidossa. Tällä hetkellä vapaata mupirosiinihappoa, sen suoloja ja estereitä käytetään voiteissa, voiteissa, suihkeissa metisilliiniresistenttien Staphylococcus aureus -infektion hoitona .

P. fluorescensiä käytetään meijeriteollisuudessa jogurtin valmistukseen [7] .

Ilmaantuvuus

P. fluorescens on hemolyyttisesti aktiivinen, ja sen seurauksena sen on tiedetty tartuttaneen luovutettua verta [8] .

Pseudomonas aiheuttaa harvoin sairauksia ihmisillä, ja se vaikuttaa yleensä potilaisiin, joiden immuunijärjestelmä on heikentynyt (esim. syöpähoitoa saaviin potilaisiin). Yhdysvalloissa rekisteröitiin vuosina 2004–2006 F. Pseudomonas -taudin puhkeaminen, joka todettiin 80 ihmiseltä 6 osavaltiossa. Infektion lähde oli kontaminoitunut suolaliuos , jota käytettiin hoitoon.

Muistiinpanot

  1. ↑ Pseudomonas (pääsemätön linkki) .  (venäjä) microbiologya.ru. Haettu 3. lokakuuta 2015. Arkistoitu alkuperäisestä 4. lokakuuta 2015. 
  2. ↑ A.A. Fedorov. Kasvielämä. 6 osassa .  (Venäjä) Moskova. Enlightenment (1974). Käyttöpäivä: 30. syyskuuta 2015. Arkistoitu alkuperäisestä 2. lokakuuta 2015.
  3. ↑ Luota Sanger Instituteen. SBW25-kannan sekvensointi .  (englanniksi) sanger.ac.uk (11/11/2014). Haettu 30. syyskuuta 2015. Arkistoitu alkuperäisestä 1. lokakuuta 2015.
  4. ↑ J. Craig Venter Institute. Pf-5-kannan sekvensointi (ei käytettävissä oleva linkki) .  (englanniksi) jcvi.org (06/01/2005). Haettu 30. syyskuuta 2015. Arkistoitu alkuperäisestä 9. syyskuuta 2015. 
  5. ↑ Nature Publishing Group. PfO-1-kannan sekvensointi .  (englanniksi) nature.com (31.8.2000). Käyttöpäivä: 30. syyskuuta 2015. Arkistoitu alkuperäisestä 2. lokakuuta 2015.
  6. ↑ Dieter Haas ja Genevieve Defago. Maaperässä olevien patogeenien biologinen torjunta fluoresoivilla pseudomonadeilla .  (englanniksi) nature.com (04/2005). Käyttöpäivä: 31. syyskuuta 2015. Arkistoitu alkuperäisestä 2. lokakuuta 2009.
  7. ↑ Morgan Boresi. Pseudomonas fluorescens (linkki ei saatavilla) .  (englanniksi) web.mst.edu (2009). Haettu 30. syyskuuta 2015. Arkistoitu alkuperäisestä 15. helmikuuta 2014. 
  8. ↑ A. P. Gibb, K. M. Martin, G. A. Davidson, B. Walker, W. G. Murphy. Pseudomonas fluorescens -bakteerin kasvunopeus luovutetussa veressä. .  (englanniksi) ncbi.nlm.nih.gov (08/1995). Haettu: 30. syyskuuta 2015.