Shikimatkinaasi

Shikimatkinaasi ( EC-koodi 2.7.1.71 ) on entsyymi, joka katalysoi ATP - riippuvaista shikimaatin fosforylaatiota muodostamalla shikimaatti-3-fosfaattia [1] . Tämä reaktio on viides vaihe shikimaattireitissä [2] , jota kasvit ja bakteerit käyttävät syntetisoimaan yhteistä aromaattista aminohappoprekursoria ja sekundaarisia metaboliitteja. Tämän entsyymiluokan systemaattinen nimi on ATP: shikimate-3-phosphotransferase . Muita yleisesti käytettyjä nimiä ovat shikimaattikinaasi (fosforylaatio) ja shikimate kinase II .

Yleinen kuvaus

Shikimaattireitti koostuu seitsemästä entsymaattisesta reaktiosta, joissa fosfoenolipyruvaatti ja erytroosi-4-fosfaatti muunnetaan chorismaatiksi , aromaattisten aminohappojen fenyylialaniinin , tyrosiinin ja tryptofaanin yleiseksi esiasteeksi . Aromaattisia aminohappoja käytetään proteiinisynteesissä ja kasveissa, sienissä ja bakteereissa syntyy useita muita erikoistuneita metaboliitteja, kuten fenyylipropanoideja ja alkaloideja . Horismat ja useat muut tämän reitin välituotteet toimivat monien muiden metaboliittien, kuten folaattien, kinaattien ja kinonien, esiasteina. Neljä entsyymiä, jotka edeltävät shikimaattikinaasia tässä reitissä, ovat DAHP-syntaasi, 3-dehydrokinaattisyntaasi, 3-dehydrokinaattidehydrataasi ja shikimaattidehydrogenaasi, ja kaksi sitä seuraavat ovat EPSP-syntaasi ja korismaattisyntaasi. Sienissä ja alkueläimissä se on osa AROM-kompleksia, joka kolokalisoi shikimate-reitin viisi keskeistä vaihetta [3] . Reittiä ei löydy ihmisistä ja muista eläimistä, joiden on saatava aromaattiset aminohapot ruoasta.

Aktiviteetti

Shikimaattikinaasin katalysoima reaktio on esitetty alla:

Tämä reaktio sisältää fosfaattiryhmän siirron ATP:stä shikimaatin 3-hydroksyyliryhmään. Siten shikimaattikinaasissa on kaksi substraattia , shikimaatti ja ATP , ja kaksi tuotetta, shikimaatti-3-fosfaatti ja ADP [4] .

Esimerkkejä

Tämän domeenin sisältäviä ihmisen proteiineja ovat: MAPK7 ja THNSL1.

Viitteet

1. ↑ "Shikimate-kinaasi-isoentsyymit Salmonella typhimuriumissa". The Journal of Biological Chemistry . 243 (3): 676-7. helmikuuta 1968. PMID  4866525 .
2. ↑ "The Shikimate Pathway". Kasvifysiologian ja kasvimolekyylibiologian vuosikatsaus . 50 : 473-503. Kesäkuu 1999. doi : 10.1146/annurev.arplant.50.1.473 . PMID  15012217 .
3. ↑ "Pentafunktionaalisen AROM-kompleksin arkkitehtuuri ja toiminnallinen dynamiikka". Luonnon kemiallinen biologia . 16 (9): 973-978. Heinäkuu 2020. doi : 10.1038/ s41589-020-0587-9 . PMID 32632294 . 
4. ↑ "Mycobacterium tuberculosis -bakteerin shikimaattikinaasin katalysoima fosforyylin siirtomekanismi". Journal of Molecular Biology . 364 (3): 411-23. Joulukuu 2006. doi : 10.1016/j.jmb.2006.09.001 . PMID  17020768 .