Arenavirukset
Arenavirukset [2] ( lat. Arenaviridae , muusta kreikasta arenosa - sandy) ovat RNA - virusten perhe . Suvun nimi annettiin virionin rakenteen mukaan - joka on ikään kuin sirotellaan hiekalla. Tropiikan virukset , kuolleisuus tartunnan jälkeen - yli 20%.
Perinteisesti arenavirukset luokitellaan uuden maailman ja vanhan maailman viruksiin . Vanhan maailman neljän viruksen joukossa erotetaan jyrsijöistä ympäri maailmaa löydetty lymfosyyttinen koriomeningiittivirus sekä Lassa -kuumevirus - jopa 15 000 tapausta Länsi- Afrikassa , kuolleisuus jopa 30%. Uuden maailman viruksia löytyy rotista Etelä-Amerikassa .
Virion
Virioni on peitetty kalvolla, joka sisältää lipidejä , ja sen pinnalla on suuria piikkejä. Sisältää kaksi nukleokapsidia . Virionien morfologia on moninkertainen, halkaisija on noin 62-200 nm, keskimäärin noin 110 nm.
Genomi
Genominen yksijuosteinen (-)RNA sisältää kaksi avointa lukukehystä:
- (S) - 3336-3535 nukleotidia, koodaa kahta polypeptidiä, kahta lukukehystä - NP - nukleokapsidia; GPC - leikattu GP1:ksi, GP2 - kahdeksi glykoproteiiniksi
- (L) - 7200 nukleotidia, koodaa kahta proteiinia - RNA-polymeraasia ja Z-proteiinia, joka sisältää Zn-sitovan sormen
Replikointi
Genominen (-)RNA replikoituu (+)antigenomiseen mRNA:han, joka transloituu.
Diagnostiikka
- ELISA IgG:tä, mukaan lukien IgM, vastaan ja akuutissa vaiheessa.
- PCR - infektion aikana, luotettavin menetelmä.
Luokitus
Vuonna 2014 arenavirusten perheeseen liitettiin uusi Reptarenavirus -suku [3] , ja siellä sijaitseva Arenavirus -suku nimettiin uudelleen Mammarenavirus -suvuksi kaikkien lajiensa kanssa [4] . Kansainvälisen virustaksonomian komitean (ICTV) mukaan perheeseen kuuluu maaliskuusta 2017 alkaen 2 sukua [5] :
- Mammarenavirus (33 lajia)
- Reptarenavirus (3 lajia)
Muistiinpanot
- ↑ Virusten taksonomia Kansainvälisen virustaksonomian komitean (ICTV) verkkosivustolla .
- ↑ 1 2 3 4 5 6 7 Atlas of Medical Microbiology, Virology and Immunology: Oppikirja lääketieteen opiskelijoille / Toim. A. A. Vorobieva , A. S. Bykova . - M . : Medical Information Agency, 2003. - S. 131-132. — ISBN 5-89481-136-8 .
- ↑ Luo uusi suku, Reptarenavirus , joka koostuu kolmesta uudesta lajista Arenaviridae -heimossa : [ fin. ] // ICTVonline. — Annettu koodi: 2014.011a-dV. - 2014. - 12 s.
- ↑ Nimeä uudelleen yksi (1) suku ja kaksikymmentäviisi (25) lajia Arenaviridae -heimossa : [ eng. ] // ICTVonline. — Annettu koodi: 2014.012aV. - 2014. - 6 s.
- ↑ Virusten taksonomia Kansainvälisen virustaksonomian komitean (ICTV) verkkosivustolla . (Käytetty: 26. maaliskuuta 2017) .
- ↑ 1 2 3 4 5 6 7 Luettelo vientivalvontaan kuuluvista mikro-organismeista, toksiineista, laitteista ja teknologioista : [hyväksytty. Venäjän federaation presidentin asetus 20. elokuuta 2007 nro 1083]: virallinen. teksti: katsottu 1.6.2016
Virusten luokitus Baltimoren mukaan |
---|
DNA | I: virukset |
---|
Adnaviria | |
---|
Duplodnaviria | |
---|
Monodnaviria | |
---|
Varidnaviria | Bamfordvirae_ | Nucleocytoviricota | Pokkesviricetes | |
---|
Megaviricetes | Algavirales |
|
---|
Imitervirales |
|
---|
Pimascovirales |
|
---|
|
---|
|
---|
Preplasmiviricota | |
---|
|
---|
Helvetiavirae_ | Dividoviricota | Laserviricetes | Halopanivirales |
- Matshushitaviridae_
- Simuloviridae_
- Sphaerolipoviridae_
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Luokittelematon | Naldaviricetes | Lefavirales |
|
---|
Luokittelematon |
|
---|
|
---|
Luokittelematon |
- perhe : Ampullaviridae
- Bicaudaviridae_
- Clavaviridae_
- Fuselloviridae_
- Globuloviridae_
- Guttaviridae_
- Halspiviridae_
- Ovaliviridae_
- Plasmaviridae_
- Polydnaviridae_
- Portogloboviridae_
- Thaspiviridae_
- Suku : Dinodnavirus
- Rhizidiovirus
|
---|
|
---|
|
| II: DNA-virukset |
---|
Monodnaviria | Loebvirae | Hofneiviricota | Faserviricetes | Tubulavirales |
- Inoviridae_
- Paulinoviridae
- Plectroviridae }
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Sangervirae_ | |
---|
Shotokuvirae | Cossaviricota | |
---|
Cressdnaviricota | Arfiviricetes | Baphyvirales |
|
---|
Cirlivirales |
|
---|
Cremevirales |
|
---|
Mulpavirales |
- Metaxiviridae
- Nanoviridae_
|
---|
Recrevirales |
|
---|
|
---|
Repensiviricetes | Geplafuvirales |
- Geminiviridae_
- Genomoviridae_
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Trapavirae_ | |
---|
|
---|
Luokittelematon |
|
---|
|
|
|
---|
RNA | | IV: (+) RNA-virukset |
---|
Riboviria | Orthornavirae | Kitrinoviricota | Alsuviricetes | Hepelivirales |
- Alphatetraviridae_
- Benyviridae
- Hepeviridae_
- Matonaviridae_
|
---|
Martellivirales |
|
---|
Tymovirales |
- Alphaflexiviridae_
- Betaflexiviridae_
- Deltaflexiviridae
- Gammaflexiviridae_
- Tymoviridae_
|
---|
|
---|
Flasuviricetes | |
---|
Magsaviricetes | Nodamuvirales |
- Nodaviridae_
- Sinhaliviridae
|
---|
|
---|
Tolukavirukset | Tolivirales_ |
- Carmotetraviridae_
- Luteoviridae_
- Tombusviridae_
|
---|
|
---|
|
---|
Lenarviricota | Leviviricetes | Norzivirales |
- Atkinsviridae_
- Duinviridae_
- Fiersviridae_
- Solspiviridae_
|
---|
Timlovirales_ |
- Blumeviridae_
- Steitzviridae_
|
---|
|
---|
Amabiliviricetes | |
---|
Howeltoviricetes | |
---|
miaviricetes | |
---|
|
---|
Pisuviricota | Pisoniviricetes | Nidovirales |
- Abyssoviridae_
- Arteriviridae_
- Cremegaviridae
- Coronaviridae
- Euroniviridae
- Gresnaviridae
- Medioniviridae
- Mesoniviridae_
- Mononiviridae_
- Nanghoshaviridae
- Nanhypoviridae
- Olifoviridae
- Roniviridae_
- Tobaniviridae_
|
---|
Picornavirales |
- Picornaviridae
- Marnaviridae_
- Solinviviridae
- Caliciviridae_
- Flaviridae_
- Secoviridae_
- Dicistroviridae_
- Polycipiviridae
|
---|
Sobelivirales |
- Alvernaviridae_
- Barnaviridae_
- Solemoviridae_
|
---|
|
---|
Stelpaviricetes | |
---|
|
---|
Luokittelematon |
- Heimot : Permutotetraviridae
- Sarthroviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
| |
|
---|
FROM | |
---|