Tioredoksiininen muotoilu

Tioredoksiinilaskos  on proteiinilaskos , joka on yhteinen entsyymeille , jotka katalysoivat disulfidisidoksen muodostumista ja isomeroitumista . Taitos on nimetty tioredoksiinin kanonisen esimerkin mukaan, ja sitä löytyy sekä prokaryoottisista että eukaryoottisista proteiineista. Tämä on esimerkki alfa/beta-proteiinilaskostuksesta, jolla on oksidoreduktaasiaktiivisuutta . Taitteen spatiaalinen topologia koostuu nelisäikeisestä antirinnakkaisesta beetalevystä , joka on suljettu kolmen alfakierteen väliin .

Järjestys

Huolimatta sekvenssivaihteluista monilla laskostumisalueilla, tioredoksiiniproteiineilla on yhteinen aktiivinen kohtasekvenssi, jossa on kaksi reaktiivista kysteiinitähdettä : Cys-XY-Cys, joissa X ja Y ovat usein, mutta eivät välttämättä, hydrofobisia aminohappoja . Proteiinin pelkistetty muoto sisältää kaksi vapaata tioliryhmää kysteiinitähteissä, kun taas hapettunut muoto sisältää disulfidisidoksen niiden välillä.

Disulfidisidoksen muodostuminen

Tioredoksiinilaskoksen sisältävät erilaiset proteiinit eroavat suuresti reaktiivisuudeltaan ja vapaiden tioliensa pKa - arvoltaan, mikä johtuu proteiinin kokonaisrakenteen kyvystä stabiloida aktivoitunutta tiolaattia . Vaikka rakenne on varsin universaali tioredoksiinilaskoksen sisältävien proteiinien joukossa, pKa on erittäin herkkä pienille rakenteen muutoksille, erityisesti proteiinirungon atomien sijainnille ensimmäisen kysteiinin lähellä.

Esimerkkejä

Tämän domeenin sisältäviä ihmisen proteiineja ovat:

• DNAJC10
• ERP70
• GLRX3
• P4HB; P5; PDIA2; PDIA3; PDIA4; PDIA5; PDIA6; PDILT
• QSOX1; QSOX2
• STRF8
• TXN ; TXN2; TXNDC1; TXNDC10; TXNDC11; TXNDC13; TXNDC14; TXNDC15; TXNDC16; TXNDC2; TXNDC3; TXNDC4; TXNDC5; TXNDC6; TXNDC8; TXNL1; TXNL3

Muistiinpanot

• Proteiinin laskostuminen yhdistettynä disulfidisidoksen muodostumiseen. // Proteiinin laskostumisen mekanismit. – 2. – Oxford University Press, 2000.

Linkit

• Tioredoksiinien superperhe SCOP
• CATH:n topologia glutaredoksiinin kanssa