Polycomb-ryhmän proteiinit

Kokeneet kirjoittajat eivät ole vielä tarkistaneet sivun nykyistä versiota, ja se voi poiketa merkittävästi 9. heinäkuuta 2020 tarkistetusta versiosta . tarkastukset vaativat 19 muokkausta .

Polykombiryhmän proteiinit ( PcG ) ovat proteiiniperhe , joka pystyy  muokkaamaan kromatiinia [1] . Nämä säätelyproteiinit kuvattiin ensimmäisen kerran Drosophilassa [1] , jossa ne tukahduttavat homeoottisia geenejä , jotka säätelevät yksittäisten segmenttien eroja kehittyvässä alkiossa [2] [3] [4] .

Polycomb group (PcG) -proteiinit ovat joukko epigeneettisiä säätelijöitä, jotka modifioimalla histoneita tukahduttavat useiden solujen erilaistumisesta vastuussa olevien geenien aktiivisuutta [5] [6] [7] . Istumalla kromatiinilla aiheuttaen paikallisia ja globaaleja muutoksia kromosomaalisessa konformaatiossa, polykombiproteiinit säätelevät kohdegeeniensä järjestäytymistä kolmiulotteisessa ydinavaruudessa. Ne vaikuttavat genomin 3D-arkkitehtuuriin ja osallistuvat solujen erilaistumisen säätelyyn ja solumuistin ylläpitoon [8] . Ne muuttavat kromatiinin rakennetta siten, että transkriptiotekijät eivät voi sitoutua promoottori - DNA-sekvensseihin [9] [10] .

Luokitus

Eläinorganismeissa (drosophila, nisäkkäät) ja kasveissa on tunnistettu vähintään viisi tyyppiä polykombiproteiineja sisältäviä komplekseja:

• inhiboiva kompleksi 1 (polykombi-repressiivinen kompleksi 1, PRC1 ) [11] ;
• estävä kompleksi 2 ( PRC2 ) [12] ;
• Pho - inhibiittorikompleksi (PhoRC), joka sisältää DNA:ta sitovia proteiineja Pho (Pleiohomeotic) ja dSfmbt (Scm-kaltainen neljällä mbt-domeenilla), sekä joidenkin raporttien mukaan histonideasetylaasi Rpd3, histonikaperoni NAP1, ei-histoniproteiini HP1b, kromatiinia sitova ja karakterisoimaton proteiini CG3363 [13] ;
• dRing (Drosophila Ring) sukulaistekijöiden kompleksi (dRAF), joka koostuu proteiineista dRing/Sce (Sex combs extra), Psc (Posterior sex combs) ja dKdm2 (Drosophila histoni lysiinidemetylaasi) [14] [15]
• de ubiquitinase -repressorikompleksi ( PR-DUB ) [16] .

Mammalian PcG

Nisäkkäillä löydettiin kaksi pääryhmää, jotka sisältävät polykombiryhmän proteiinien komplekseja - nämä ovat estäviä komplekseja 1 ja 2 (PRC1 ja PRC2), nisäkkäiden PRC1-geenit ovat merkittävästi samanlaisia ​​kuin vastaavat Drosophila-geenit. On osoitettu, että polykombiryhmän geenien ilmentymisellä on suuri merkitys alkion kehityksessä; hiiret kuolevat sikiövaiheessa molemmissa PRC2-geenikopioissa, kun taas PRC1-geenien poistuma on homeoottisia mutantteja ja kuolee syntymän jälkeen [12] . Polycomb-ryhmän proteiinien ilmentymistason nousu lisää invasiivisuutta ja korreloi syöpäkasvainten vakavamman kehittymisen kanssa. [17]

PRC1 kompleksi

PRC1-kompleksi koostuu useista alayksiköistä [18] [19] [20] :

• PHC1 ja PHC2 (polyhomeotic) - tarkka toiminto ei ole vielä selvillä.

• CBX - alayksiköiden perhe, joka osallistuu mekanismeihin, jotka ylläpitävät tasapainoa kantasolujen itsensä uusiutumisen ja erilaistumisen välillä: [21] (alayksiköt CBX2, CBX4 ja CBX8 sitoutuvat histoniin H3 K27me3 , estävät CBX7 -geenin ilmentymistä [ 21] 19] , joka on välttämätön solun pluripotentin tilan ylläpitämiseksi ja siten solujen erilaistumisen edistämiseksi [22] [23] , CBX7 puolestaan ​​estää erilaistumiseen tarvittavien CBX2-, CBX4- ja CBX8-alayksiköiden synteesiä ja ylläpitää siten pluripotenttia solun tila). CBX7-proteiini (ja sen kautta koko PRC1-kompleksi) sitoutuu nukleosomin histoniin H3K27me3 käyttämällä kromodomeeniaan. Trimetyylilysiiniä sisältäviä pieniä molekyylejä, jotka pystyvät estämään CBX7-H3K27me3-kompleksin muodostumisen, on kehitetty. [24] CBX7-alayksikön on havaittu olevan välttämätön lihasten ja elämän ylläpitämiseksi kehossa diapaussin aikana [25] .
• Bmi1 (B-lymfooma Mo-MLV:n insertioalueen 1 homologi) – välttämätön kantasolujen lisääntymiselle . [26] [27] Tämä johtuu siitä, että se suppressoi p16Ink4a- [28] - ja p19Arf-proteiinien ilmentymistä (molempia proteiineja koodaavat Ink4a/Arf-lokuksen, joka tunnetaan myös nimellä Cdkn2a, vaihtoehtoiset lukukehykset). estää uudelleenohjelmoinnin indusoiduiksi pluripotenteiksi kantasoluiksi ( iPSC ) . Lisäksi Bmi1 voi korvata transkriptiotekijät Sox2, Klf4 ja c-Myc ohjelmoitaessa fibroblasteja uudelleen iPSC:iksi. [29] Bmi1:n oletetaan säätelevän mitokondrioiden toimintaa ja reaktiivisten happilajien muodostumista niissä, mikä voi aiheuttaa DNA-vaurioita. [30] Bmi1:n määrää solussa säätelee mikroRNA-141, joka estää sen synteesiä sitoutumalla mRNA:hansa 3'-transloitumattomalla alueella. [31] Myc- , Myb- , Twist1- , SALL4- , E2F1- ja GLI1- perheiden transkriptiotekijät osallistuvatBmi1-tason säätelyyn solussa. [32] Koska Bmi1 on houkutteleva terapeuttinen kohde erilaisten ihmisen syöpien hoidossa ja sydänlihassolujen uudelleenohjelmoinnissa , pienen molekyylin PTC-209 havaittiin estävän spesifisesti Bmi1:tä. [32] [33] [34]
• PCGF1 (polycomb-ryhmän RING-sormiproteiini 1). PRC1:n kaltaisessa PCGF1-PRC1-kompleksissa PCGF1-alayksikköä vaaditaan käynnistämään Polycomb-ryhmävälitteinen geenirepressio erilaistumisen aikana, koska se säätelee RING1B-ubikitiiniligaasin aktiivisuutta, joka katalysoi Lys119:n ubikvitinoitumista H2A-histonissa, jota tarvitaan. rekrytoimaan PRC2:n CpG-saarille . [35] PCGF1-PRC1:n puuttuminen johtaa kohdegeenien poikkeavaan ilmentymiseen. [36]
• PCGF2 (polycomb group RING finger protein 2) Bmi1:n ortologi. Toiminnallisesti ei eroa Bmi1:stä. [37]
• PCGF6:ta on löydetty PRC1-komplekseista, joissa on H3K9-metyylitransferaasi ja niistä, joilla on H3K4-demetylaasiaktiivisuutta [38] . Pcgf6 tarvitaan ylläpitämään alkion kantasolujen (ESC) identiteettiä. Toisin kuin kanoninen PRC1, kompleksit Pcgf6:n kanssa toimivat positiivisena transkription säätelijänä ja sitoutuvat ensisijaisesti promoottoriin, joissa on aktiivisia kromatiinimerkkejä. Pcgf6-synteesin taso ESC:issä on yleensä korkea ja sitä tarvitaan estämään erilaistumista, koska Pcgf6:ta tarvitaan ylläpitämään transkriptiotekijöiden Oct-4 , Sox2 ja Nanog synteesiä [39] .
• RYBP tai sen homologi YAF2-alayksikkö vaihtoehtoisesta RYBP-PRC1-kompleksista [19] , joka sisältää RYBP:n, RING1B:n ja PCGF2/Bmi1:n eikä sisällä CBX-, PHC-, SCM-alayksiköitä. [40] RYBP:n aktivointi vaatii miRNA-125b:n "kypsymisen" tukahduttamista , mikä estää RYBP:tä. RYBP-aktivaatio johtaa RYBP-riippuvaiseen H2AK119:n ubikvitinaatioon ja erilaistumiseen tarvittavien geenien alasäätelyyn. Lisäksi RYBP tarvitaan, jotta OCT4 laskeutuisi Kdm2b - promoottoriin(histonidemetylaasigeeni), joka on välttämätön endogeenisten pluripotenssigeenien onnistuneelle aktivoitumiselle solujen uudelleenohjelmoinnin aikana iPSC :iksi . [41]
• RING1  on PRC1-kompleksin alayksikkö, joka monoubikvitinoi H2A-histonin muodostaen H2A K119ub:n. Ring1B-geenin deleetio johtaa useiden PRC1-proteiinien, mukaan lukien RYBP, Cbx4, PCGF2 ja Bmi1, häviämiseen [42] .
• SUV39H1 ( histoni-lysiini-N-metyylitransferaasi ) - tämä ydinproteiini siirtyy sentromeereihin mitoosin aikana. Sillä on tärkeä rooli kromatiinin organisoinnissa, kromosomien erottamisessa ja mitoosimekanismeissa, ja se toimii metyylitransferaasina, joka metyloi H3 -histonilysiini-9:n muodostaen H3K9me3:n, repressiomerkin [43] .
• L3mbtl2  on epätyypillisen PRC1-kompleksin jäsen. Se on välttämätöntä alkion varhaiselle kehitykselle. Edistää solujen lisääntymistä ja estää erilaistumista. Vuorovaikuttaa pluripotenssitekijöiden ja PRC1-analogin kanssa, joka sisältää G9A:n, Hdac1:n ja Ring1b:n. [44]

PRC1-kompleksi estää geenin ilmentymisen ja muuntaa kromatiinin kompaktiin muotoon [19] [45]  — heterokromatiiniksi . CBX-alayksikön avulla se sitoo "repression merkin" - histonin H3K27me3 osaksi nukleosomia. Lisäksi Bmi1-alayksikköä käyttämällä kompleksi sitoo nukleosomeja Runx1/CBFβ-transkriptiotekijäkompleksin kautta riippumatta H3K27me3-leimasta. Bmi1- tai RYBP-alayksikön stimuloiman RING1-alayksikön avulla PRC1 monoubikvitinoi H2A-histonia muodostaen H2A K119ub:n, mikä johtaa kromatiinin tiivistymiseen. Lisäksi se edistää CBX7-alayksikön avulla pitkän ei-koodaavan RNA:n (lncRNA) sitoutumista promoottorialueille, mikä johtaa vastaavien geenien estoon. [46] [47] Tässä tapauksessa CBX7:llä on "suojuksen" rooli, joka estää lncRNA:n hajoamisen ja myöhemmän "suunnitelmattoman" geeniaktivaation.

PRC2-kompleksi

PRC2-kompleksi indusoi transkription repressiota metyloimalla histonit ja ei-histoniproteiinit. Sen laskeutumiseen kohdegeeniin tarvitaan aktiivinen kromatiinimerkki H3K4me3 (jonka muodostumisessa Trithorax-ryhmän proteiineilla on tärkeä rooli ) ja erityinen ei-koodaava RNA, joka sitoo SUZ12-alayksikköä. [12] PRC2:ta on kaksi eri muotoa, jotka EZH1/2:sta, SUZ12:sta, EED:stä sekä ( RBBP4 /7) [48] koostuvan ytimen lisäksi sisältävät kofaktoreita [49] , nämä ovat: PRC2. 1 (sisältää yhden polycomin kaltaisista proteiineista PALI1/2) ja PRC2.2 (sisältää AEBP2:n ja JARID2:n). PRC2-kompleksilla on monimutkainen molekyyliarkkitehtuuri [50] ja se koostuu useista alayksiköistä:

• Ezh1 auttaa säilyttämään PRC2:n niiden lepotilassa olevien solujen kromatiinissa, joissa Jarid2:ta ei syntetisoidu [51] .
• EZH2 (Enhancer of Zester Homolog 2) on histonien ja ei-histoniproteiinien metyylitransferaasi. Ezh2 on yleensä läsnä soluissa, jotka ovat huonosti erilaistuneet ja jakautuvat aktiivisesti [51] . EZH2 on välttämätön kudosten korjaukselle ja edistää progenitorisolujen regeneratiivista lisääntymistä. EZH2:n menetys johtaa heikentyneeseen regeneraatioon, kun taas EZH2-metyylitransferaasin liiallinen synteesi johtaa solun neoplastiseen transformaatioon, ja mutaatiot sen katalyyttisessä domeenissa johtavat lymfoomaan . GSK126, joka estää erittäin selektiivisesti EZH2:ta kilpailemalla S-adenosyylimetioniinin (SAM) kanssa, voi auttaa torjumaan näitä sairauksia, mikä johtaa metyloidun H3K27:n tason laskuun ja PRC2:n tukahduttamien kohdegeenien aktivoitumiseen. [52] [53] [54] Histoni H3:lla on useita isoformeja, joista yksi on histoni H3.3 (sisältää treoniinia aminohapposekvenssin kohdassa 31) on läsnä vain niissä paikoissa, joissa geenit ovat aktiivisia, kun taas H3 .1-isoformia (sisältää kohdassa 31 alaniinia) löytyy pääasiassa genomin osista, joissa ei ole aktiivisia geenejä. Tämä selittyy sillä, että metyylitransferaasi ATXR5 (Arabidopsis Trithorax-sukuinen proteiini 5), joka metyloi histonin H3:n (H3K27) lysiini-27:n, omaa domeenin, joka on "lukenut" treoniini-31:n (alaniini-31:n sijaan) histoni H3, estää metyylittransferaasiaktiivisuutta ATXR5. Siksi H3.3-isoformia ei voida muokata H3K27me1-tunnisteella. Siten geenialueet, jotka sisältävät suuren määrän H3.3-histoneja, ovat suojattuja heterokromatisoitumiselta ja aktiivisuuden suppressiolta DNA:n replikaation aikana [55]
• EED ( embryonic ectoderm development ) on  PRC2-kompleksin alayksikkö, jonka toimintaa ei vielä täysin ymmärretä. Oletetaan, että sillä on kyky sitoutua sekä PRC2-kompleksin proteiineihin että PRC1-kompleksin proteiineihin. Siten EED konsolidoi PRC2-kompleksin proteiineja ja helpottaa PRC1-kompleksin myöhempää laskeutumista kohdegeenin kolminkertaisesti metyloituun H3K27-lokukseen ja lisää myös PRC1:n ubikvitiiniligaasiaktiivisuutta [56] .
• SUZ12 ( Zeste  12 :n suppressori ) on alayksikkö, joka sitoo lyhyitä 50-200 nukleotidin pituisia ei-koodaavia RNA:ita, jotka ilmentyvät polykombikohdegeenien 5'-päästä primaarisissa T-lymfosyyteissä ja ituradan kantasoluissa [57]
• AEBP2 (Adipocyte Enhancer-Binding Protein) - tämä proteiini on PRC2.2:n [58] RBBP4 /7-sitoutuva kofaktori, jota säätelee retrotransposonissa sijaitseva promoottori , jolla on epätavallinen DNA-metylaatiokuvio [59] . Oletetaan, että se johtuu AEBP2-alayksikön säätelystä, että PRC2 sitoo ensisijaisesti metyloitua DNA:ta samalla kun se suppressoi transkriptiota kromatiinilla [60] . Tämä alayksikkö vähentää metylaatioaktiivisuutta ja vastaavasti histonin H3K27me3 tasoa [61]
• Jarid2 ( jumonji  , AT rich interactive domain 2 ) on histonidemetylaasi, yksi tärkeimmistä kehitysprosessien epigeneettisistä säätelijöistä. Jarid2, kuten Ezh2, esiintyy yleensä soluissa, jotka ovat huonosti erilaistuneet ja jakautuvat aktiivisesti [51] ja toimii kohdegeenien transkription repressorina. On ehdotettu, että JARID2 on vuorovaikutuksessa ei-koodaavien RNA:iden (lncRNA) ja PRC2-kompleksin kanssa ja säätelee siten PRC2:n sitoutumista kromatiiniin [62] [63] . Jarid2-synteesi lisääntyy merkittävästi ESC:issä verrattuna erilaistuneisiin soluihin. Tämän alayksikön tuhoutuminen johtaa solujen erilaistumiseen liittyvien geenien aktivoitumiseen ja vähentää merkittävästi mahdollisuutta fibroblastien uudelleenohjelmointiin iPSC:iksi. [64]
• Mtf2 ( metallivasteelementtejä sitova transkriptiotekijä 2 ) tunnetaan myös nimellä PCL2 ( polycomb -like 2 ) .  Tämän alayksikön geenin tuhoutuminen johtaa solujen erilaistumiseen liittyvien geenien aktivoitumiseen ja vähentää merkittävästi mahdollisuutta fibroblastien uudelleenohjelmointiin iPSC:iksi [65] . 
• esPRC2p48  ekspressoituu hiiren alkion kantasoluissa korkeammalla tasolla kuin erilaistuneissa soluissa. JARID2-, MTF2- ja esPRC2p48-geenien yhteisilmentyminen tehostaa hiiren alkion fibroblastien Oct4/Sox2/Klf4-välitteistä uudelleenohjelmointia indusoiduiksi pluripotenteiksi kantasoluiksi.
• Mdm2 ( Mouse  double minute 2 -homologi ), sitoutuu fyysisesti EZH2:een kromatiinissa, tukee polykombivälitteistä useiden geenien repressiota edistäen histoni 3:n trimetylaation lisääntymistä lysiinissä 27 ja histoni 2A:n ubikvitinaatiota lysiinissä 119 (H2AK119). MDM2:n deleetio tai inaktivointi samanaikaisesti H2AK119 E3-ligaasin Ring1B/ RNF2 kanssa pysäyttää solujen lisääntymisen p53 :sta riippumatta [66] MDM2:n mitogeeninen rooli on välttämätön haavan paranemiselle kudosvaurioissa. Samaan aikaan MDM2 edistää kudostulehdusta [67] .
• PALI1 ja PALI2, joita kutsutaan vastaavasti PRC2:een assosioituneiksi LCOR 1:ksi ja PRC2 :een assosioituneiksi LCORL 2:ksi,  ovat proteiineja, joita esiintyy vain selkärankaisissa ja joita ei löydy selkärangattomista tai kasveista. Ne puuttuvat myös AEBP2:ta sisältävistä PRC2-komplekseista. Lisää metylaation aktiivisuutta ja histonin H3K27me3 tasoa [61] 
• ASXL1 ( englanniksi:  Addition of sex combs-like 1 ), on fyysisessä vuorovaikutuksessa PRC2:n jäsenten kanssa ja tarvitaan sen laskeutumiseen kromatiini-DNA:han. ASXL1:n häviäminen tai mutaatio hematopoieettisissa soluissa liittyy H3K27me3:n maailmanlaajuiseen häviämiseen koko genomissa ja erityisesti HOXA- lokuksessa , mikä johtaa mutanttikloonien leviämiseen ja edistää myös transformaatiota myeloidisoluiksi . [68] [69]

Pitkät ja lyhyet ei-koodaavat RNA:t (lncRNA ja miRNA)

Pitkät ei-koodaavat RNA:t ( lncRNA ) ovat vuorovaikutuksessa kromatiinin kanssa ja estävät vastaavien geenien transkription, auttavat PRC2- ja PRC1-komplekseja valitsemaan kohdegeenin [70] [71] [72] [73] . Havaittiin, että kudosspesifisyys on paljon selvempi lncRNA:lle verrattuna koodaaviin RNA:ihin, mikä tekee niistä houkuttelevia diagnostisia markkereita [74] .

• Kcnq1ot1  - on vuorovaikutuksessa PRC2:n ja PRC1:n kanssa, estää Kcnq1-klusterin. [75]
• Xist  on vuorovaikutuksessa PRC2:n kanssa, osallistuu X-kromosomien histonien modifiointiin [76] [77] X-kromosomin inaktivoinnin aikana Xist-tuote jakautuu eukromaattisille alueille lähellä X-kromosomin telomeereja niiden kolmiulotteisen rakenteen mukaan, mutta ei nukleotidisekvenssi [78] [79] [80] . Jotta Xist voisi olla vuorovaikutuksessa PRC2:n kanssa ja sijoittaa sen X-kromosomiin, tarvitaan SHARP-proteiineja (SMRT- ja HDAC-assosioitunut repressoriproteiini), joka on vuorovaikutuksessa SMRT - corepressorin [81] ja HDAC3- histonideasetylaasi 3 :n [82] [83] kanssa .
• HOTAIR  on vuorovaikutuksessa PRC2:n kanssa ja estää HOX-lokusta [84] [85] .
• ANRIL (Antisense Non-Coding RNA in the INK4 Locus) - on vuorovaikutuksessa PRC1:n ja PRC2:n kanssa. Inhiboi PRC1-kompleksin INK4b/ARF/INK4a-lokusta, joka on vastuussa kasvaimen kasvun suppressiosta aktivoimalla solujen ikääntymistä [86]. Todettiin, että ANRIL nopeuttaa ateroskleroosin kehittymistä ja on siksi biomarkkeri ja sepelvaltimotaudin riskitekijä . [87]
• Gtl2 ( Meg3 ) on lncRNA, joka säätelee painamista Dlk1 -Dio3-lokuksessa . [88] Se sitoutuu suoraan PRC2:een. Gtl2 :n tuhoutuminen hiiren alkion kantasoluissa johtaa Ezh2-pitoisuuden vähenemiseen Dlk1-promoottorissa ja Dlk1-ekspression aktivoitumiseen [89] . iPSC :t , joissa Gtl2-synteesi on estetty, eivät pysty normaaliin erilaistumiseen, mikä on osoituksena niiden kyvyttömyydestä synnyttää kimeerisiä hiiriä ja hiiriä, jotka koostuvat vain iPSC:istä [90]
• Fendrrillä on tärkeä rooli säätelyverkostoissa, jotka ohjaavat mesodermien muodostumista . Se osallistuu geenipromoottorien epigeneettiseen modifiointiin . Sitoutumalla PRC2-kompleksiin se toimii kromatiinimodulaattorina, joka muuttaa vastaavien geenien aktiivisuutta. Alkioissa, joista puuttuu Fendrr, sydämen seinämien kehitys on häiriintynyt, mikä liittyy PRC2:n määrän voimakkaaseen laskuun ja H3K27-trimetylaation vähenemiseen promoottoripaikoissa. [91]
• Pint (p53-indusoitu ei-koodaava transkripti) on pitkä intergeeninen ei-koodaava RNA ( lincRNA ), jota säätelee p53 . Pint edistää solujen lisääntymistä ja eloonjäämistä säätelemällä geenin ilmentymistä TGF-beeta- , MAPK- ja p53-reiteillä. Pint on tuman lincRNA, joka on suoraan vuorovaikutuksessa PRC2:n kanssa ja jota tarvitaan PRC2:n kohdennettuun toimittamiseen spesifisiin geeneihin H3K27-trimetylaatiota varten, mikä aiheuttaa niiden tukahduttamista. Pint osallistuu p53-negatiiviseen autosäätelymekanismiin, jossa lincRNA yhdistää p53:n aktivaation PRC2:n aiheuttamaan epigeneettiseen repressioon [92] .
• lncRNA H19/miR-675 pystyy aktivoimaan solujen lisääntymisen estämällä RUNX1-transkriptiotekijän synteesiä [93] ja sitoutumalla EZH2-polykombipromoottoriin [94] . Lisäksi se sitoo microRNA lethal-7:n (let-7) [95] molekyylisienenä , jolla on tärkeä rooli EZH2:n synteesissä [15] ja vuorovaikutuksessa MBD1 :n (metyyli-CpG:tä sitovan domeenin proteiini 1 ) kanssa. ) -proteiini, osallistuu repressiivisten H3K9me3- histonimerkkien ylläpitoon, joita tarvitaan geenin painamisverkoston suppressoimiseen [96] , mikä puolestaan ​​on tarpeen kasvutekijöiden ilmentymisen tason säätelemiseksi alkioissa. H19 syntetisoituu runsaasti sikiön kudoksissa, mutta se vaimenee voimakkaasti syntymän jälkeen. Olennainen transkriptio säilyy vain luurankolihaksissa, missä sitä tarvitaan satelliittisolujen erilaistumiseen kypsiksi lihassoluiksi ja regeneraatioon [97] .
• lncRNA FAL1 (focally ampliified on kromosomin 1) on onkogeeninen RNA, joka säätelee Bmi1-stabiilisuutta, mikä johtaa muutoksiin useiden geenien transkriptiossa, mukaan lukien CDKN1A/p21- inhibitio . FAL1-synteesin tukahduttaminen estää kasvaimen kasvua, mutta aktivoi ikääntymistä [98]
• lncRNA MIR31HG on vuorovaikutuksessa Polycomb-ryhmän proteiinien kanssa ja osallistuu yhdessä niiden kanssa INK4A-lokuksen tukahduttamiseen mekanismissa, joka aktivoi ikääntymisen onkogeneesin aikana, mikä on tärkeä mekanismi tuumorin kasvun estämisessä [99] .
• TERRA - vuorovaikuttaa PRC2-kompleksin SUZ12:n kanssa telomeerikromatiinin muodostamiseksi ja ylläpitämiseksi heterokromatiinin muodossa [100] , [101] . Oletetaan, että polykombikompleksin TERRA-välitteistä sitoutumista pluripotenssi- ja erilaistumisgeeneihin säätelee shelteriinikompleksin TRF1-komponentti (Telomere Repeat Binding Factor 1) [ 102 ] .

Katso myös arvostelu [103]

Transkriptiotekijät

• REST - transkriptiotekijä , joka tunnetaan myös nimellä NRSF (neuroneja rajoittava vaimennustekijä), estää PRC1:n ja PRC2:n sitoutumisen kohtiin lähellä promoottoria ja sitoutumalla CBX-alayksikköön edistää PRC1:n H3K27me3-leimauksesta riippumatonta sitoutumista paikkoihin, jotka ovat kaukana promoottorista. promoottori [104] . REST korreloi voimakkaasti eliniän pidentymisen kanssa. REST-tasot olivat korkeimmat niiden ihmisten aivoissa, jotka elivät 90–100-vuotiaiksi ilman dementiaa [105] .
• Runx1 / CBFβ (runt-related transkriptiotekijä 1/Core-binding factor -alayksikkö beeta) voi olla vuorovaikutuksessa SUV39H1:n ja PRC1-kompleksin Bmi1-alayksikön kanssa. [106] Runx1 on transkriptiotekijä, joka säätelee hematopoieettisten kantasolujen erilaistumista kypsiksi verisoluiksi. Runx-proteiinit muodostavat heterodimeerisen kompleksin CBFβ:n kanssa, mikä lisää sen DNA-sidoksen stabiilisuutta.
• Transkriptiotekijä YY1 (Yin ja Yang 1) [107]  – yhdessä Id1: n kanssa estää p16 -proteiinin synteesiä , mikä estää solujen ikääntymistä. [108] Sitä tarvitaan RYBP-PRC1:n laskemiseksi promoottoriin.

PRC2- ja PRC1-kompleksien epigeneettisen säätelyn kaavio

Jotta PRC2-kompleksi osuisi tarkasti kohdegeenin vaadittuun kohtaan, sen täytyy sitoutua lyhyeen ei-koodaavaan RNA:han, joka transkriptoidaan repressoitavan kohdegeenin 5'-päästä. RNA:ta sitova proteiini RBFox2 ilmeisesti auttaa myös PRC2-kompleksin laskeutumisessa repressiolle alttiisiin paikkoihin, koska sen inaktivoituminen johtaa geenin derepressioon [109] . Tämän RNA:n transkriptoi RNA-polymeraasi II-S5p H3K4me3-tagilla aktivoimasta geenipromoottorista. Vasta sen jälkeen, kun PRC2 on sitoutunut tähän RNA:han SUZ12-alayksikkönsä kautta, se pystyy metyloimaan histoni H3 lysiini 27 nukleosomissa, joka ohjaa kohdegeeniä. Tätä varten lysiini 27 on kuitenkin ensin deasetyloitava NuRD-kompleksilla [110] [111] . Kun PRC2 kolmoismetyloi histonin H3 alayksikkönsä EZH2 avulla muodostaen H3K27me3:n, PRC1 alkaa toimia, joka sitoutuu nukleosomiin joko "repressiomerkin" - H3K27me3 kautta, jonka sen CBX-alayksikkö tunnistaa, tai yhden kautta. transkriptiotekijöistä (REST, YY1 tai Runx1/CBFp). [112] Seuraavaksi PRC1 vahvistaa geenin estoa sitomalla ubikvitiinia histonilysiiniin 119 H2A (H2A K119ub).

Se tosiasia, että H3K27me3-merkintä tapahtuu tavallisesti solusyklissä ennen DNA:n replikaatiota, viittaa siihen, että polycomb-proteiinien histonimuunnoksilla on tärkeä rooli epigeneettisen muistin ylläpitämisessä solun jakautumisen aikana [113] [114] [115] .

On osoitettu, että muutokset transkriptioaktiivisuudessa itsessään voivat säädellä H3K27me3-histonien modifikaatiota. Transkription aloituskohdan deleetion aiheuttama transkription poistaminen on riittävä aiheuttamaan H3K27me3:n kertymistä. Toisaalta transkription pakotettu aktivointi keinotekoisella d - Cas9 -aktivaattorilla riittää poistamaan H3K27me3-leiman [116] .

Histonissa H3:ssa olevan lysiini 27:n PRC2-kompleksivälitteinen trimetylaatio ja siihen liittyvä useiden geenien esto ovat välttämättömiä edellytyksiä somaattisten solujen ohjelmoimiseksi uudelleen iPSC :iksi [6] [117] [118]

Kromatiinin kaksiarvoiset alueet

Monien tutkijoiden huomion herättävät bivalentteiksi kutsutut geenit, koska niissä on sekä repressiomarkkereita (H3K27me3) että aktivaatiomarkkereita (H3K4me3) [119] [120] , jotka toimivat allosteerisinä säätelijöinä [121] . Entsyymi, joka katalysoi H3K4-trimetylaatiota kehitysgeenien kaksiarvoisissa promoottoreissa, kuten alkion kantasoluista peräisin olevissa Hox-geeneissä , kuuluu COMPASS -perheeseen nimeltä Mll2 (KMT2b). [122] H3K4me3-markkeri tarvitaan S5p-RNA-polymeraasi II:n transkriptioaktiivisuuteen, joka syntetisoi lyhyen ei-koodaavan RNA:n, jota tarvitaan PRC2:n sitoutumiseen, kun taas H3K27me3:a tarvitaan PRC1-kompleksin CBX-proteiinien sitomiseen. Kaksiarvoisia kromatiinin alueita on alkioissa 8-soluvaiheesta blastokystivaiheeseen, jossa solut jakautuvat kahteen populaatioon: sisäsoluihin, joista alkion kantasoluja muodostuu, ja alkion pintakerrokseen ( trofoblasti ). ). Pintakerroksen solugeenisarja sisältää edelleen kaksiarvoisia geenejä, mutta PRC1:tä ei enää ole näillä alueilla, vaikka PRC2 on edelleen läsnä. Avainrooli näissä soluissa on jo Suv39h1 :llä , joka bivalenttisissa geeneissä katalysoi lysiini 9:n trimetylaatiota histonissa H3 (H3K9me3) [123] ja G9a/GLP-kompleksissa, joka suorittaa samaa tehtävää, mutta PRC2:n osallistuessa. kompleksi [124] . H3K9me3-leima estää somaattisten solujen uudelleenohjelmoinnin indusoiduiksi kantasoluiksi , koska se häiritsee proteiinien uudelleenohjelmoivien pluripotenssitekijöiden (Oct4, Sox2, Klf4 ja c-Myc) sitoutumista kohdegeeneihin. Tämän leiman aiheuttavien entsyymien inaktivointi lisää huomattavasti uudelleenohjelmointinopeutta. [125] Kahden tyyppisten repressiomarkkerien, modifikaatioiden H3K9me2 ja H3K27me3, havaittiin sulkevan toisensa pois. [126] Alkion kantasolujen erilaistumisen aikana kaksiarvoiset geenit häviävät, [127] jääden vain vähemmän erilaistuneisiin soluihin, kuten aikuisten kantasoluihin, hematopoieettisiin (hematopoieettisiin) soluihin ja kehon satelliittisoluihin (progenitorisoluihin). Niitä esiintyy kuitenkin solujen lisääntymisen aikana regeneraation tai kasvaimen kasvun vuoksi. [128] [129] [130] Kun somaattiset solut ohjelmoidaan uudelleen iPSC :iksi, Ink4a/Arf-lokus muuttuu epigeneettisesti "hiljaiseksi" bivalenttiseksi muodoksi markkereineen H3K27me3 ja H3K4me3, mikä johtaa Ink4a/Arf-lokuksen tukahduttamiseen. koodaa sellaisia ​​solusyklikinaasi-inhibiittoreita (CDK), kuten p16INK4A ja p19Arf [131] . Päinvastainen prosessi havaitaan RAF1:n aiheuttaman ikääntymisen aikana, kun MSK1 (mitogeenin ja stressin aktivoima kinaasi 1) fosforyloi seriinin 28 H3K27me3-histonissa, mikä aiheuttaa PRC1/2-repressorikompleksien poistumisen ja aktivoi Ink4ab/Arf:n ilmentymisen. locus, joka johtaa solujen ikääntymiseen [132] .

Rooli painamisessa

Genominen imprinting on epigeneettinen ilmiö, jossa jälkeläisten geenit ilmentyvät monoalleelisesti riippuen siitä, mihin vanhemmista (isä tai äiti) he kuuluivat ennen hedelmöitystä. PRC2-kompleksin kiinnittämällä H3K27me3-etiketillä on todettu olevan tärkeä rooli painamisen mekanismeissa [133] [134]. Erityisesti H3K27me3-välitteisen painamisen häviäminen vähentää eläinten kloonauksen tehokkuutta ja myötävaikuttaa kehitysvirheisiin. havaittu kloonatuissa alkioissa [134] [135] . Siksi H3K27me3-välitteisen painamisen kiinnittäminen voi parantaa merkittävästi kloonaustehokkuutta [136] .

Polykombirepressorikompleksien rooli kehityksessä ja ikääntymisessä

Kuten kävi ilmi, SUZ12- ja EED-proteiinien (jotka ovat osa PRC2-repressiivistä kompleksia) kohdepaikat ja kaksiarvoiset kromatiinidomeenit, jotka säätelevät tällaisten homeoottisten geenien , kuten HOX ja PAX sekä muiden selkärankaisten ontogeneettisten geenien ilmentymistä, sisältävät geenejä. sisältää hypermetyloituja ikään liittyviä CpG-kohtia . Siksi sekä H3K27me3:n modifikaatio nukleosomeissa [137] että geenien metylaation säätely kehitykseen ja ikääntymiseen liittyvissä promoottoreissa voivat edustaa yhtä avainmekanismia kasvulle ja ikääntymiselle , mikä näkyy universaalin epigeneettisen kellon kaavoissa biologisen iän laskemiseksi. . [138]

Muistiinpanot

1. ↑ 1 2 Lanzuolo C. , Orlando V. Muistoja polykombiryhmän proteiineista.  (englanti)  // Genetiikan vuosikatsaus. - 2012. - Vol. 46. ​​- s. 561-589. - doi : 10.1146/annurev-genet-110711-155603 . — PMID 22994356 .
2. ↑ Mallo M. , Alonso CR Hox-geenin ilmentymisen säätely eläinten kehityksen aikana.  (Englanti)  // Kehitys (Cambridge, Englanti). - 2013. - Vol. 140, ei. 19 . - P. 3951-3963. - doi : 10.1242/dev.068346 . — PMID 24046316 .
3. ↑ Lewis EB Geenikompleksi, joka kontrolloi segmentaatiota Drosophilassa.  (englanniksi)  // Luonto. - 1978. - Voi. 276, nro 5688 . - s. 565-570. — PMID 103000 .
4. ↑ Pirrotta V. Genomin moniyhdistelmä: PcG, trxG ja kromatiinihiljentäminen.  (englanniksi)  // Solu. - 1998. - Voi. 93, nro. 3 . - s. 333-336. — PMID 9590168 .
5. ↑ Huang C. , Xu M. , Zhu B. Histonin lysiinin metylaation välittämä epigeneettinen perintö: transkriptiotilojen ylläpitäminen ilman merkkien tarkkaa palauttamista?  (englanti)  // Lontoon kuninkaallisen seuran filosofiset liiketoimet. Sarja B, Biologiatieteet. - 2013. - Vol. 368, nro 1609 . - P. 20110332. - doi : 10.1098/rstb.2011.0332 . — PMID 23166395 .
6. ↑ 1 2 Fragola G. , Germain PL , Laise P. , Cuomo A. , Blasimme A. , Gross F. , Signaroldi E. , Bucci G. , Sommer C. , Pruneri G. , Mazzarol G. , Bonaldi T. , Mostoslavsky G. , Casola S. , Testa G. Solujen uudelleenohjelmointi edellyttää polycomb-kohteiden ydinosajoukon hiljentämistä.  (englanti)  // PLoS-genetiikka. - 2013. - Vol. 9, ei. 2 . — P. e1003292. - doi : 10.1371/journal.pgen.1003292 . — PMID 23468641 .
7. ↑ Aloia L. , Di Stefano B. , Di Croce L. Polycomb-kompleksit kantasoluissa ja alkionkehityksessä.  (Englanti)  // Kehitys (Cambridge, Englanti). - 2013. - Vol. 140, ei. 12 . - P. 2525-2534. - doi : 10.1242/dev.091553 . — PMID 23715546 .
8. ↑ Entrevan M. , Schuettengruber B. , Cavalli G. Genome Architecture and Function by Polycomb Proteins.  (englanti)  // Solubiologian suuntaukset. - 2016. - doi : 10.1016/j.tcb.2016.04.009 . — PMID 27198635 .
9. ↑ Kirmizis A. , Bartley SM , Kuzmichev A. , Margueron R. , Reinberg D. , Green R. , Farnham PJ Ihmisen polykombin kohdegeenien vaimentaminen liittyy histonin H3 Lys 27 metylaatioon.  //  Genes & development. - 2004. - Voi. 18, ei. 13 . - s. 1592-1605. - doi : 10.1101/gad.1200204 . — PMID 15231737 .
10. ↑ Portoso M ja Cavalli G. RNAi:n ja koodaamattomien RNA:iden rooli polycomb-välitteisessä geeniekspression ja genomisen ohjelmoinnin ohjauksessa // RNA ja  geenien ilmentymisen säätely: monimutkaisuuden piilokerros . – Caister Academic Press, 2008.
11. ↑ Molitor A. , ​​Shen WH Polykombikompleksi PRC1: koostumus ja toiminta kasveissa.  (englanniksi)  // Genetics and genomics -lehti = Yi chuan xue bao. - 2013. - Vol. 40, ei. 5 . - s. 231-238. - doi : 10.1016/j.jgg.2012.12.005 . — PMID 23706298 .
12. ↑ 1 2 3 Margueron R. , Reinberg D. Polycomb-kompleksi PRC2 ja sen jälki elämässä.  (englanniksi)  // Luonto. - 2011. - Voi. 469, nro 7330 . - s. 343-349. - doi : 10.1038/luonto09784 . — PMID 21248841 .
13. ↑ Grimm C. , Matos R. , Ly-Hartig N. , Steuerwald U. , Lindner D. , Rybin V. , Müller J. , Müller CW Histonin lysiinin metylaation molekyylitunnistus Polycomb-ryhmän repressorilla dSfmbt.  (englanniksi)  // EMBO-lehti. - 2009. - Vol. 28, nro. 13 . - P. 1965-1977. - doi : 10.1038/emboj.2009.147 . — PMID 19494831 .
14. ↑ Lagarou A. , Mohd-Sarip A. , Moshkin YM , Chalkley GE , Bezstarosti K. , Demmers JA , Verrijzer CP dKDM2 yhdistää histoni H2A ubikvitalaation histoni H3 demetylaatioon Polycomb-ryhmän hiljentämisen aikana.  (englanti)  // Geenit ja kehitys. - 2008. - Voi. 22, ei. 20 . - P. 2799-2810. - doi : 10.1101/gad.484208 . — PMID 18923078 .
15. ↑ 1 2 Tzatsos A. , Paskaleva P. , Lymperi S. , Contino G. , Stoykova S. , Chen Z. , Wong KK , Bardeesy N. Lysiinispesifinen demetylaasi 2B (KDM2B)-let-7-Zester-homologin tehostaja 2 (EZH2) -reitti säätelee solusyklin etenemistä ja vanhenemista primäärisoluissa.  (englanti)  // The Journal of Biological Chemistry. - 2011. - Voi. 286, nro. 38 . - P. 33061-33069. - doi : 10.1074/jbc.M111.257667 . — PMID 21757686 .
16. ↑ Scheuermann JC , de Ayala Alonso AG , Oktaba K. , Ly-Hartig N. , McGinty RK , Fraterman S. , Wilm M. , Muir TW , Müller J. Polycomb-DUB-repressiivisen kompleksin histonin H2A-deubikvitinaasiaktiivisuus.  (englanniksi)  // Luonto. - 2010. - Vol. 465, nro 7295 . - s. 243-247. - doi : 10.1038/luonto08966 . — PMID 20436459 .
17. ↑ Piunti, A., & Shilatifard, A. (2021). Polycomb-repressiivisten kompleksien roolit nisäkkäiden kehityksessä ja syövässä. Nature Reviews Molecular Cell Biology, 22(5):326-345 PMID 33723438 doi : 10.1038/s41580-021-00341-1
18. ↑ Gil J. , O'Loghlen A. PRC1-kompleksin monimuotoisuus: mihin se meidät vie?  (englanti)  // Solubiologian suuntaukset. - 2014. - Vol. 24, nro. 11 . - s. 632-641. - doi : 10.1016/j.tcb.2014.06.005 . — PMID 25065329 .
19. ↑ 1 2 3 4 Morey L. , Aloia L. , Cozzuto L. , Benitah SA , Di Croce L. RYBP ja Cbx7 määrittelevät polykombikompleksien erityiset biologiset toiminnot hiiren alkion kantasoluissa.  (englanti)  // Soluraportit. - 2013. - Vol. 3, ei. 1 . - s. 60-69. - doi : 10.1016/j.celrep.2012.11.026 . — PMID 23273917 .
20. ↑ Turner SA , Bracken AP "Monimutkainen" ongelma: muunnelman PRC1 roolin tulkitseminen ESC:issä.  (eng.)  // Solun kantasolu. - 2013. - Vol. 12, ei. 2 . - s. 145-146. - doi : 10.1016/j.stem.2013.01.014 . — PMID 23395440 .
21. ↑ Camahort R. , Cowan CA Cbx-proteiinit auttavat ESC:itä kulkemaan rajaa itsensä uudistumisen ja erilaistumisen välillä.  (eng.)  // Solun kantasolu. - 2012. - Vol. 10, ei. 1 . - s. 4-6. - doi : 10.1016/j.stem.2011.12.011 . — PMID 22226347 .
22. ↑ Morey L. , Pascual G. , Cozzuto L. , Roma G. , Wutz A. , Benitah SA , Di Croce L. Polycomb-ryhmän Cbx-proteiiniperheen nonoverlapping-funktiot alkion kantasoluissa.  (eng.)  // Solun kantasolu. - 2012. - Vol. 10, ei. 1 . - s. 47-62. - doi : 10.1016/j.stem.2011.12.006 . — PMID 22226355 .
23. ↑ O'Loghlen A. , Muñoz-Cabello AM , Gaspar-Maia A. , Wu HA , Banito A. , Kunowska N. , Racek T. , Pemberton HN , Beolchi P. , Lavial F. , Masui O. , Vermeulen M. , Carroll T. , Graumann J. , Heard E. , Dillon N. , Azuara V. , Snijders AP , Peters G. , Bernstein E. , Gil J. Cbx7:n mikroRNA- säätely välittää Polycomb-ortologien vaihtoa ESC:n erilaistumisen aikana.  (eng.)  // Solun kantasolu. - 2012. - Vol. 10, ei. 1 . - s. 33-46. - doi : 10.1016/j.stem.2011.12.004 . — PMID 22226354 .
24. ↑ Simhadri C. , Daze KD , Douglas SF , Quon TT , Dev A. , Gignac MC , Peng F. , Heller M. , Boulanger MJ , Wulff JE , Hof F. Kromodomeeniantagonistit, jotka kohdistuvat polycomb-ryhmän metyylilysiinilukijaproteiiniin homologi 7 (CBX7).  (Englanti)  // Lääkekemian lehti. - 2014. - Vol. 57, nro. 7 . - s. 2874-2883. - doi : 10.1021/jm401487x . — PMID 24625057 .
25. ↑ Chi-Kuo Hu, Wei Wang, Julie Brind'Amour ym., (2020). Selkärankaisten diapause säilyttää organismeja pitkällä aikavälillä Polycomb-kompleksin jäsenten kautta. Arkistoitu 22. helmikuuta 2020 Wayback Machinessa . Tiede. 367(6480), 870-874 doi : 10.1126/science.aaw2601
26. ↑ George Wendt, Shunsuke Nakamura, Atsushi Iwama. Polycomb-ryhmän geenituotteen BMI-1 ratkaiseva rooli itsestään uusiutuvien hematopoieettisten kantasolujen ylläpidossa // Kantasolut ja syövän kantasolut. - 2013. - T. 9. - S. 143-153. - doi : 10.1007/978-94-007-5645-8_14 .
27. ↑ Molofsky AV , Pardal R. , Iwashita T. , Park IK , Clarke MF , Morrison SJ Bmi-1-riippuvuus erottaa hermoston kantasolujen itsensä uusiutumisen progenitorien lisääntymisestä.  (englanniksi)  // Luonto. - 2003. - Voi. 425, nro 6961 . - s. 962-967. - doi : 10.1038/luonto02060 . — PMID 14574365 .
28. ↑ Wang Y. , Zang X. , Wang Y. , Chen P. p16INK4a:n korkea ekspressio ja alhainen Bmi1:n ekspressio liittyvät endoteelisolujen vanhenemiseen ihmisen sarveiskalvossa.  (englanniksi)  // Molecular vision. - 2012. - Vol. 18. - P. 803-815. — PMID 22509111 .
29. ↑ Moon JH , Heo JS , Kim JS , Jun EK , Lee JH , Kim A. , Kim J. , Whang KY , Kang YK , Yeo S. , Lim HJ , Han DW , Kim DW , Oh S. , Yoon BS , Schöler HR , You S. Fibroblastien uudelleenohjelmointi indusoiduiksi pluripotenteiksi kantasoluiksi Bmi1:llä.  (englanti)  // Solututkimus. - 2011. - Voi. 21, ei. 9 . - s. 1305-1315. - doi : 10.1038/cr.2011.107 . — PMID 21709693 .
30. ↑ Liu J. , Cao L. , Chen J. , Song S. , Lee IH , Quijano C. , Liu H. , Keyvanfar K. , Chen H. , Cao LY , Ahn BH , Kumar NG , Rovira II , Xu XL , van Lohuizen M. , Motoyama N. , Deng CX , Finkel T. Bmi1 säätelee mitokondrioiden toimintaa ja DNA-vauriovasteen reittiä.  (englanniksi)  // Luonto. - 2009. - Vol. 459, nro 7245 . - s. 387-392. - doi : 10.1038/luonto08040 . — PMID 19404261 .
31. ↑ Dimri M. , Carroll JD , Cho JH , Dimri GP microRNA -141 säätelee BMI1:n ilmentymistä ja indusoi vanhenemista ihmisen diploidisissa fibroblasteissa.  (englanti)  // Solukierto (Georgetown, Tex.). - 2013. - Vol. 12, ei. 22 . - P. 3537-3546. - doi : 10.4161/cc.26592 . — PMID 24091627 .
32. ↑ 1 2 Zhou, M., Xu, Q., Huang, D., & Luo, L. (2021). B-lymfooman Mo-MLV:n insertioalueen 1 homologin geenitranskription säätely. Biomedical Reports, 14(6), 1-8. PMID 33884195 PMC 8056379 doi : 10.3892/br.2021.1428
33. ↑ Yang, D., Liu, HQ, Yang, Z., Fan, D., & Tang, QZ (2021). BMI1 sydämessä: Uudet toiminnot tuumorigeneesin ulkopuolella. EBioMedicine, 63, 103193. PMID 33421944 PMC 7804972 doi : 10.1016/j.ebiom.2020.103193
34. ↑ Testa, G., Russo, M., Di Benedetto, G., Barbato, M., Parisi, S., Pirozzi, F., ... & Passaro, F. (2020). Bmi1-estäjä PTC-209 edistää sydämen fibroblastien kemiallisesti indusoitua suoraa sydämen uudelleenohjelmointia sydänlihassoluiksi. Tieteelliset raportit, 10(1), 1-16. PMID 32346096 PMC 7189257 doi : 10.1038/s41598-020-63992-8
35. ↑ Riising, E.M., Comet, I., Leblanc, B., Wu, X., Johansen, J.V., & Helin, K. (2014). Geenien hiljentäminen laukaisee polykombin repressiivisen kompleksin 2 värväyksen CpG-saarten genomin laajuisesti. Molecular cell, 55(3), 347-360. PMID 24999238 doi : 10.1016/j.molcel.2014.06.005
36. ↑ Sugishita H, Kondo T, Ito S, et ai. (2021). "Variantti PCGF1-PRC1 yhdistää PRC2:n rekrytoinnin erilaistumiseen liittyvään transkription inaktivaatioon kohdegeeneissä." NatCommun . 12 (5341). DOI : 10.1038/s41467-021-24894-z .
37. ↑ Ishida A. , Asano H. , Hasegawa M. , Koseki H. , Ono T. , Yoshida MC , Taniguchi M. , Kanno M. DNA:ta sitovaa proteiinia koodaavan ihmisen Mel-18-geenin kloonaus ja kromosomikartoitus uusi "SORMUSormi"-aihe.  (englanniksi)  // Gene. - 1993. - Voi. 129, nro. 2 . - s. 249-255. — PMID 8325509 .
38. ↑ Gao Z. , Zhang J. , Bonasio R. , Strino F. , Sawai A. , Parisi F. , Kluger Y. , Reinberg D. PCGF-homologit, CBX-proteiinit ja RYBP määrittelevät toiminnallisesti erilliset PRC1-perhekompleksit.  (englanti)  // Molecular cell. - 2012. - Vol. 45, nro. 3 . - s. 344-356. - doi : 10.1016/j.molcel.2012.01.002 . — PMID 22325352 .
39. ↑ Yang CS , Chang KY , Dang J. , Rana TM Polycomb Group Protein Pcgf6 toimii pääsäätelijänä, joka ylläpitää alkion kantasoluiden identiteettiä.  (englanti)  // Tieteelliset raportit. - 2016. - Vol. 6. - P. 26899. - doi : 10.1038/srep26899 . — PMID 27247273 .
40. ↑ Gao Z. , Zhang J. , Bonasio R. , Strino F. , Sawai A. , Parisi F. , Kluger Y. , Reinberg D. PCGF-homologit, CBX-proteiinit ja RYBP määrittelevät toiminnallisesti erilliset PRC1-perhekompleksit.  (englanti)  // Molecular cell. - 2012. - Vol. 45, nro. 3 . - s. 344-356. - doi : 10.1016/j.molcel.2012.01.002 . — PMID 22325352 .
41. ↑ Huanhuan Li, Ping Lai, Jinping Jia et ai., (2017). RNA helikaasi DDX5 estää uudelleenohjelmoinnin pluripotenssiin miRNA-pohjaisella RYBP:n ja sen PRC1-riippuvaisten ja riippumattomien toimintojen tukahduttamisella . Arkistoitu 7. huhtikuuta 2020 Wayback Machinessa . Solun kantasolujen doi : 10.1016/j.stem.2016.12.002
42. ↑ Hanson IM , Poustka A. , Trowsdale J. Uudet geenit ihmisen suuren histokompatibiliteettikompleksin luokan II alueella.  (englanniksi)  // Genomiikka. - 1991. - Voi. 10, ei. 2 . - s. 417-424. — PMID 1906426 .
43. ↑ Aagaard L. , Laible G. , Selenko P. , Schmid M. , Dorn R. , Schotta G. , Kuhfittig S. , Wolf A. , Lebersorger A. , ​​Singh PB , Reuter G. , Jenuwein T. Funktionaaliset nisäkäshomologit Drosophilan PEV-modifikaattori Su(var)3-9 koodaa sentromeeriin liittyviä proteiineja, jotka kompleksoituvat heterokromatiinikomponentin M31 kanssa.  (englanniksi)  // EMBO-lehti. - 1999. - Voi. 18, ei. 7 . - P. 1923-1938. - doi : 10.1093/emboj/18.7.1923 . — PMID 10202156 .
44. ↑ Qin J. , Whyte WA , Anderssen E. , Apostolou E. , Chen HH , Akbarian S. , Bronson RT , Hochedlinger K. , Ramaswamy S. , Young RA , Hock H. Polykombiryhmän proteiini L3mbtl2 kokoaa epätyypillisen PRC1- perhekompleksi, joka on välttämätön pluripotenteissa kantasoluissa ja varhaisessa kehityksessä.  (eng.)  // Solun kantasolu. - 2012. - Vol. 11, ei. 3 . - s. 319-332. - doi : 10.1016/j.stem.2012.06.002 . — PMID 22770845 .
45. ↑ Luis NM , Morey L. , Di Croce L. , Benitah SA Polycomb kantasoluissa: PRC1 haarautuu.  (eng.)  // Solun kantasolu. - 2012. - Vol. 11, ei. 1 . - s. 16-21. - doi : 10.1016/j.stem.2012.06.005 . — PMID 22770239 .
46. ↑ Nakama M. , Kawakami K. , Kajitani T. , Urano T. , Murakami Y. DNA-RNA-hybridin muodostuminen välittää RNAi-ohjattua heterokromatiinin muodostumista.  (eng.)  // Geenit soluille: omistettu molekyyli- ja solumekanismeille. - 2012. - Vol. 17, ei. 3 . - s. 218-233. - doi : 10.1111/j.1365-2443.2012.01583.x . — PMID 22280061 .
47. ↑ Saxena A. , Carninci P. Pitkä ei-koodaava RNA modifioi kromatiinia: pitkien ei-koodaavien RNA:iden epigeneettinen hiljentäminen.  (englanniksi)  // BioEssays : uutisia ja arvosteluja molekyyli-, solu- ja kehitysbiologiasta. - 2011. - Voi. 33, ei. 11 . - s. 830-839. - doi : 10.1002/bies.201100084 . — PMID 21915889 .
48. ↑ Kasinath, V., Faini, M., Poepsel, S., Reif, D., Feng, XA, Stjepanovic, G., ... & Nogales, E. (2018). Ihmisen PRC2:n rakenteet kofaktoreineen AEBP2 ja JARID2. Science, 359(6378), 940-944 doi : 10.1126/science.aar5700
49. ↑ Moritz, LE ja Trievel, RC (2017). Rakenne, mekanismi ja säätely polycomb repressiivinen kompleksi 2. Journal of Biological Chemistry, jbc-R117. doi : 10.1074/jbc.R117.800367jbc.R117.800367
50. ↑ Ciferri C. , Lander GC , Maiolica A. , Herzog F. , Aebersold R. , Nogales E. Ihmisen polykombin repressiivisen kompleksin molekyyliarkkitehtuuri 2.  //  eLife. - 2012. - Vol. 1. - P. e00005. - doi : 10.7554/eLife.00005 . — PMID 23110252 .
51. ↑ 1 2 3 Son J. , Shen SS , Margueron R. , Reinberg D. Nukleosomeja sitovat toimet JARID2:ssa ja EZH1:ssä säätelevät PRC2:n toimintaa kromatiinissa.  (englanti)  // Geenit ja kehitys. - 2013. - Vol. 27, nro. 24 . - P. 2663-2677. doi : 10.1101 / gad.225888.113 . — PMID 24352422 .
52. ↑ McCabe MT , Ott HM , Ganji G. , Korenchuk S. , Thompson C. , Van Aller GS , Liu Y. , Graves AP , Della Pietra A. 3. , Diaz E. , LaFrance LV , Mellinger M. , Duquenné C. , Tian X. , Kruger RG , McHugh CF , Brandt M. , Miller WH , Dhanak D. , Verma SK , Tummino PJ , Creasy CL EZH2:n esto terapeuttisena strategiana lymfoomaan, jossa on EZH2:ta aktivoivia mutaatioita.  (englanniksi)  // Luonto. - 2012. - Vol. 492, nro 7427 . - s. 108-112. - doi : 10.1038/luonto11606 . — PMID 23051747 .
53. ↑ Cavalli G. Molekyylibiologia. EZH2 menee yksin.  (englanti)  // Tiede (New York, NY). - 2012. - Vol. 338, nro 6113 . - s. 1430-1431. - doi : 10.1126/tiede.1232332 . — PMID 23239724 .
54. ↑ Melnick A. Epigeneettinen terapia etenee EZH2:n spesifisellä kohdistamisella.  (englanniksi)  // Syöpäsolu. - 2012. - Vol. 22, ei. 5 . - s. 569-570. - doi : 10.1016/j.ccr.2012.10.016 . — PMID 23153531 .
55. ↑ Jacob Y. , Bergamin E. , Donoghue MT , Mongeon V. , LeBlanc C. , Voigt P. , Underwood CJ , Brunzelle JS , Michaels SD , ​​Reinberg D. , Couture JF , Martienssen RA Histonin H3 variantin selektiivinen metylaatio H3.1 säätelee heterokromatiinin replikaatiota.  (englanti)  // Tiede (New York, NY). - 2014. - Vol. 343, nro 6176 . - s. 1249-1253. - doi : 10.1126/tiede.1248357 . — PMID 24626927 .
56. ↑ Cao Q. , Wang X. , Zhao M. , Yang R. , Malik R. , Qiao Y. , Poliakov A. , Yocum AK , Li Y. , Chen W. , Cao X. , Jiang X. , Dahiya A. . , Harris C. , Feng FY , Kalantry S. , Qin ZS , Dhanasekaran SM , Chinnaiyan AM EED:n keskeinen rooli polycomb-ryhmäkompleksien orkestroinnissa.  (englanti)  // Luontoviestintä. - 2014. - Vol. 5. - P. 3127. - doi : 10.1038/ncomms4127 . — PMID 24457600 .
57. ↑ Kanhere A. , Viiri K. , Araújo CC , Rasaiyaah J. , Bouwman RD , Whyte WA , Pereira CF , Brookes E. , Walker K. , Bell GW , Pombo A. , Fisher AG , Young RA , Jenner RG Short RNAs ne transkriptoidaan repressoiduista polykombikohdegeeneistä ja ovat vuorovaikutuksessa polykombin repressiivisen kompleksi-2:n kanssa.  (englanti)  // Molecular cell. - 2010. - Vol. 38, nro. 5 . - s. 675-688. - doi : 10.1016/j.molcel.2010.03.019 . — PMID 20542000 .
58. ↑ Sun, A., Li, F., Liu, Z., Jiang, Y., Zhang, J., Wu, J., & Shi, Y. (2017). Rakenteelliset ja biokemialliset näkemykset ihmisen sinkkisormiproteiinista AEBP2 paljastavat vuorovaikutuksia RBBP4:n kanssa Arkistoitu 11. huhtikuuta 2018 Wayback Machinessa . Proteiini ja solu, 1-5. {{doi:10.1007/s13238-017-0483-6}}
59. ↑ Kim, H., Bakshi, A. ja Kim, J. (2015). Retrotransposonista peräisin oleva nisäkäsaebp2:n promoottori. PloS one, 10(4), e0126966. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0126966
60. ↑ Wang, X., Paucek, RD, Gooding, AR, Brown, ZZ, Eva, JG, Muir, TW ja Cech, TR (2017). Molekyylianalyysi PRC2:n rekrytoitumisesta DNA:han kromatiinissa ja sen esto RNA:lla. Nature Structural and Molecular Biology, 24(12), 1028-1038. doi : 10.1038/nsmb.3487
61. ↑ 1 2 Conway, E., Jerman, E., Healy, E., Ito, S., Holoch, D., Oliviero, G., .. & Watson, A. (2018). LCOR/LCORL-geenien koodaama selkärankaisille spesifisten polykombien perhe, joka tasapainottaa PRC2-alatyypin toimintaa . Molekyylisolu. doi|10.1016/j.molcel.2018.03.005
62. ↑ Kaneko S. , Bonasio R. , Saldaña-Meyer R. , Yoshida T. , Son J. , Nishino K. , Umezawa A. , Reinberg D. JARID2:n ja ei-koodaavien RNA:iden väliset vuorovaikutukset estävät PRC2:n värväämistä kromatiiniin.  (englanti)  // Molecular cell. - 2014. - Vol. 53, nro. 2 . - s. 290-300. - doi : 10.1016/j.molcel.2013.11.012 . — PMID 24374312 .
63. ↑ Sanulli S. , Justin N. , Teissandier A. , ​​Ancelin K. , Portoso M. , Caron M. , Michaud A. , Lombard B. , da Rocha ST , Offer J. , Loew D. , palvelija N. , Wassef M. , Burlina F. , Gamblin SJ , Heard E. , Margueron R. Jarid2-metylaatio PRC2-kompleksin kautta säätelee H3K27me3:n laskeutumista solujen erilaistumisen aikana.  (englanti)  // Molecular cell. - 2015. - Vol. 57, nro. 5 . - s. 769-783. - doi : 10.1016/j.molcel.2014.12.020 . — PMID 25620564 .
64. ↑ Zhang Z. , Jones A. , Sun CW , Li C. , Chang CW , Joo HY , Dai Q. , Mysliwiec MR , Wu LC , Guo Y. , Yang W. , Liu K. , Pawlik KM , Erdjument-Bromage H. , Tempst P. , Lee Y. , Min J. , Townes TM , Wang H. PRC2 kompleksoi JARID2:n, MTF2:n ja esPRC2p48:n kanssa ES-soluissa ES-solujen pluripotenssin ja somaattisten solujen uudelleenohjelmoinnin moduloimiseksi.  (englanti)  // Kantasolut (Dayton, Ohio). - 2011. - Voi. 29, ei. 2 . - s. 229-240. doi : 10.1002 / varsi.578 . — PMID 21732481 .
65. ↑ Jones A. , Wang H. Polycomb repressiivinen kompleksi 2 alkion kantasoluissa: yleiskatsaus.  (englanniksi)  // Proteiini ja solu. - 2010. - Vol. 1, ei. 12 . - s. 1056-1062. - doi : 10.1007/s13238-010-0142-7 . — PMID 21213100 .
66. ↑ Wienken Magdalena , Dickmanns Antje , Nemajerova Alice , Kramer Daniela , Najafova Zeynab , Weiss Miriam , Karpiuk Oleksandra , Kassem Moustapha , Zhang Yanping , Lozano Guillermina , Johnsen Steven A. , Moll Zhang Xin M. MDM2 liittyy Polycomb Repressor Complex 2:een ja tehostaa kantaa edistäviä kromatiinimodifikaatioita, jotka ovat riippumattomia p53:sta  // Molecular Cell. - 2016. - tammikuu ( osa 61 , nro 1 ). - S. 68-83 . — ISSN 1097-2765 . - doi : 10.1016/j.molcel.2015.12.008 .
67. ↑ Ebrahim M. , Mulay SR , Anders HJ , Thomasova D. MDM2 syövän lisäksi: podoptoosi, kehitys, tulehdus ja kudosten uusiutuminen.  (englanti)  // Histologia ja histopatologia. - 2015. - Vol. 30, ei. 11 . - s. 1271-1282. - doi : 10.14670/HH-11-636 . — PMID 26062755 .
68. ↑ Abdel-Wahab, O., Adli, M., LaFave, LM, Gao, J., Hricik, T., Shih, AH, ... & Levine, RL (2012). ASXL1-mutaatiot edistävät myeloidista transformaatiota menettämällä PRC2-välitteisen geenirepression. Cancer cell, 22(2), 180-193. PMID 22897849 PMC 3422511 doi : 10.1016/j.ccr.2012.06.032
69. ↑ Fujino, T., Goyama, S., Sugiura, Y., Inoue, D., Asada, S., Yamasaki, S., ... & Kitamura, T. (2021). Mutantti ASXL1 indusoi ikään liittyvää fenotyyppisten hematopoieettisten kantasolujen laajenemista aktivoimalla Akt/mTOR-reittiä. Luontoviestintä, 12(1), 1-20. PMID 33758188 PMC 7988019 doi : 10.1038/s41467-021-22053-y
70. ↑ Quinodoz Sofia , Guttman Mitchell. Pitkät ei-koodaavat RNA:t: nouseva linkki geenisäätelyn ja ydinorganisaation välillä  // Trends in Cell Biology. - 2014. - marraskuu ( osa 24 , nro 11 ). - S. 651-663 . — ISSN 0962-8924 . - doi : 10.1016/j.tcb.2014.08.009 .
71. ↑ Lee JT Epigeneettinen säätely pitkillä ei-koodaavilla RNA:illa.  (englanti)  // Tiede (New York, NY). - 2012. - Vol. 338, nro 6113 . - s. 1435-1439. - doi : 10.1126/tiede.1231776 . — PMID 23239728 .
72. ↑ Kornienko AE , Guenzl PM , Barlow DP , Pauler FM Geenisäätely pitkän ei-koodaavan RNA:n transkription avulla.  (englanniksi)  // BMC-biologia. - 2013. - Vol. 11. - s. 59. - doi : 10.1186/1741-7007-11-59 . — PMID 23721193 .
73. ↑ Long, Y., Hwang, T., Gooding, A.R. et ai. RNA on välttämätön PRC2-kromatiinin miehitykselle ja toiminnalle ihmisen pluripotenteissa kantasoluissa. Nat Genet (2020). https://doi.org/10.1038/s41588-020-0662-x
74. ↑ Reis EM , Verjovski-Almeida S. Perspectives of Long Non-Coding RNAs in Cancer Diagnostics.  (englanti)  // Genetiikan rajat. - 2012. - Vol. 3. - s. 32. - doi : 10.3389/fgene.2012.00032 . — PMID 22408643 .
75. ↑ Kanduri C. Kcnq1ot1: kromatiinia säätelevä RNA.  (englanti)  // Solu- ja kehitysbiologian seminaarit. - 2011. - Voi. 22, ei. 4 . - s. 343-350. - doi : 10.1016/j.semcdb.2011.02.020 . — PMID 21345374 .
76. ↑ Wang XQ , Crutchley JL , Dostie J. Genomin muokkaaminen ei-koodaavilla RNA:illa.  (englanti)  // Nykyinen genomiikka. - 2011. - Voi. 12, ei. 5 . - s. 307-321. - doi : 10.2174/138920211796429772 . — PMID 21874119 .
77. ↑ Sado T. , Brockdorff N. Pitkän ei-koodaavan RNA:n Xistin aiheuttaman kromosomien hiljentymisen ymmärtäminen.  (englanti)  // Lontoon kuninkaallisen seuran filosofiset liiketoimet. Sarja B, Biologiatieteet. - 2013. - Vol. 368, nro 1609 . - P. 20110325. - doi : 10.1098/rstb.2011.0325 . — PMID 23166390 .
78. ↑ Engreitz JM , Pandya-Jones A. , McDonel P. , Shishkin A. , Sirokman K. , Surka C. , Kadri S. , Xing J. , Goren A. , Lander ES , Plath K. , Guttman M. The Xist lncRNA hyödyntää kolmiulotteista genomiarkkitehtuuria levittääkseen X-kromosomissa.  (englanti)  // Tiede (New York, NY). - 2013. - Vol. 341, nro 6147 . - P. 1237973. - doi : 10.1126/tiede.1237973 . — PMID 23828888 .
79. ↑ KOodaamaton RNA AUTTAA ETSIÄÄN SÄÄNTELYJÄ PROTEIINEJA VARTEN TARVITAVAT GEEENIT . Haettu 22. helmikuuta 2020. Arkistoitu alkuperäisestä 22. helmikuuta 2020. (määrätön)
80. ↑ Kochanova Natalya (2013). Koodaamattoman RNA:n salaperäinen matka X-kromosomia pitkin Arkistoitu 19. lokakuuta 2014.
81. ↑ Shi Y. , Downes M. , Xie W. , Kao HY , Ordentlich P. , Tsai CC , Hon M. , Evans RM Sharp, indusoituva kofaktori, joka integroi tumareseptorin repression ja aktivaation.  (englanti)  // Geenit ja kehitys. - 2001. - Voi. 15, ei. 9 . - s. 1140-1151. - doi : 10.1101/gad.871201 . — PMID 11331609 .
82. ↑ McHugh CA , Chen CK , Chow A. , Surka CF , Tran C. , McDonel P. , Pandya-Jones A. , Blanco M. , Burghard C. , Moradian A. , Sweredoski MJ , Shishkin AA , Su J .. Lander ES , Hess S. , Plath K. , Guttman M. Xist lncRNA on vuorovaikutuksessa suoraan SHARPin kanssa hiljentämään HDAC3:n kautta tapahtuvan transkription.  (englanniksi)  // Luonto. - 2015. - Vol. 521, nro 7551 . - s. 232-236. - doi : 10.1038/luonto14443 . — PMID 25915022 .
83. ↑ Kuinka RNA-geeni hiljentää koko kromosomin. Arkistoitu 29. huhtikuuta 2015 Wayback Machinessa . ScienceDaily, 27. huhtikuuta 2015
84. ↑ Wutz A. RNA-välitteiset vaimennusmekanismit nisäkässoluissa.  (Englanti)  // Molekyylibiologian ja translaatiotieteen edistyminen. - 2011. - Voi. 101. - s. 351-376. - doi : 10.1016/B978-0-12-387685-0.00011-1 . — PMID 21507358 .
85. ↑ Woo CJ , Kingston RE HOTAIR nostaa koodaamattomat RNA:t uudelle tasolle.  (englanniksi)  // Solu. - 2007. - Voi. 129, nro. 7 . - s. 1257-1259. - doi : 10.1016/j.cell.2007.06.014 . — PMID 17604716 .
86. ↑ Yap KL , Li S. , Muñoz-Cabello AM , Raguz S. , Zeng L. , Mujtaba S. , Gil J. , Walsh MJ , Zhou MM Koodaamattoman RNA ANRIL:n ja polycomb CBX7:n metyloidun histonin H3 lysiinin 27 molekyylinen vuorovaikutus INK4a:n transkription hiljentämisessä.  (englanti)  // Molecular cell. - 2010. - Vol. 38, nro. 5 . - s. 662-674. - doi : 10.1016/j.molcel.2010.03.021 . — PMID 20541999 .
87. ↑ Chen, L., Qu, H., Guo, M., Zhang, Y., Cui, Y., Yang, Q., ... & Shi, D. (2020). ANRIL ja ateroskleroosi Arkistoitu 14. kesäkuuta 2021 Wayback Machinessa . Journal of Kliinisen farmasian ja terapian, 45(2), 240-248. PMID 31703157 doi : 10.1111/jcpt.13060
88. ↑ Hung Ko-Hsuan , Wang Yang , Zhao Jing. Nisäkäsgeenin annostuksen säätely pitkillä ei-koodaavilla RNA:illa  // Biomolekyylit. - 2013. - 4. helmikuuta ( nide 3 , nro 4 ). - S. 124-142 . — ISSN 2218-273X . - doi : 10.3390/biom3010124 .
89. ↑ Zhao J. , Ohsumi TK , Kung JT , Ogawa Y. , Grau DJ , Sarma K. , Song JJ , Kingston RE , Borowsky M. , Lee JT Polykombiin liittyvien RNA:iden genominlaajuinen tunnistus RIP-seq.  (englanti)  // Molecular cell. - 2010. - Vol. 40, ei. 6 . - s. 939-953. - doi : 10.1016/j.molcel.2010.12.011 . — PMID 21172659 .
90. ↑ Stadtfeld M. , Apostolou E. , Akutsu H. , Fukuda A. , Follett P. , Natesan S. , Kono T. , Shioda T. , Hochedlinger K. Painettujen geenien poikkeava hiljentäminen kromosomissa 12qF1 hiiren indusoiduissa plurisemoluissa .  (englanniksi)  // Luonto. - 2010. - Vol. 465, nro 7295 . - s. 175-181. - doi : 10.1038/luonto09017 . — PMID 20418860 .
91. ↑ Grote P. , Wittler L. , Hendrix D. , Koch F. , Währisch S. , Beisaw A. , Macura K. , Bläss G. , Kellis M. , Werber M. , Herrmann BG Kudosspesifinen lncRNA Fendrr on keskeinen säätelijä sydämen ja kehon seinämien kehityksessä hiiressä.  (englanti)  // Kehityssolu. - 2013. - Vol. 24, nro. 2 . - s. 206-214. - doi : 10.1016/j.devcel.2012.12.012 . — PMID 23369715 .
92. ↑ Marín-Béjar O. , Marchese FP , Athie A. , Sánchez Y. , González J. , Segura V. , Huang L. , Moreno I. , Navarro A. , Monzó M. , García-Foncillas J. , Rinn JL . , Guo S. , Huarte M. Pint lincRNA yhdistää p53-polun epigeneettiseen hiljentämiseen Polycomb-repressiivisen kompleksin 2 avulla.  (englanniksi)  // Genome biology. - 2013. - Vol. 14, ei. 9 . - P. 104. - doi : 10.1186/gb-2013-14-9-r104 . — PMID 24070194 .
93. ↑ Zhuang M. , Gao W. , Xu J. , Wang P. , Shu Y. Pitkä ei-koodaava RNA H19:stä johdettu miR-675 moduloi ihmisen mahasyöpäsolujen lisääntymistä kohdistamalla tuumorisuppressoriin RUNX1.  (englanti)  // Biokemiallinen ja biofysikaalinen tutkimusviestintä. - 2014. - Vol. 448, nro 3 . - s. 315-322. - doi : 10.1016/j.bbrc.2013.12.126 . — PMID 24388988 .
94. ↑ Luo M. , Li Z. , Wang W. , Zeng Y. , Liu Z. , Qiu J. Pitkä ei-koodaava RNA H19 lisää virtsarakon syövän etäpesäkkeitä liittymällä EZH2:een ja inhiboimalla E-kadheriinin ilmentymistä.  (englanti)  // Syöpäkirjaimet. - 2013. - Vol. 333, nro 2 . - s. 213-221. - doi : 10.1016/j.canlet.2013.01.033 . — PMID 23354591 .
95. ↑ Kallen AN , Zhou XB , Xu J. , Qiao C. , Ma J. , Yan L. , Lu L. , Liu C. , Yi JS , Zhang H. , Min W. , Bennett AM , Gregory RI , Ding Y . , Huang Y. Painettu H19-lncRNA antagonisoi let-7-mikroRNA:ita.  (englanti)  // Molecular cell. - 2013. - Vol. 52, nro. 1 . - s. 101-112. - doi : 10.1016/j.molcel.2013.08.027 . — PMID 24055342 .
96. ↑ Monnier P. , Martinet C. , Pontis J. , Stancheva I. , Ait-Si-Ali S. , Dandolo L. H19 lncRNA ohjaa Imprinted Gene Networkin geeniekspressiota värväämällä MBD1:tä.  (englanti)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America. - 2013. - Vol. 110, ei. 51 . - P. 20693-20698. - doi : 10.1073/pnas.1310201110 . — PMID 24297921 .
97. ↑ Dey BK , Pfeifer K. , Dutta A. H19 pitkä ei-koodaava RNA synnyttää mikroRNA:t miR-675-3p ja miR-675-5p edistämään luustolihasten erilaistumista ja regeneraatiota.  (englanti)  // Geenit ja kehitys. - 2014. - Vol. 28, nro. 5 . - s. 491-501. - doi : 10.1101/gad.234419.113 . — PMID 24532688 .
98. ↑ Hu X. , Feng Y. , Zhang D. , Zhao SD , ​​Hu Z. , Greshock J. , Zhang Y. , Yang L. , Zhong X. , Wang LP , Jean S. , Li C. , Huang Q. , Katsaros D. , Montone KT , Tanyi JL , Lu Y. , Boyd J. , Nathanson KL , Li H. , Mills GB , Zhang L. Funktionaalinen genominen lähestymistapa tunnistaa FAL1:n onkogeeniseksi pitkäksi koodaamattomaksi RNA:ksi, joka liittyy BMI1:een ja tukahduttaa p21:n ilmentymisen syövässä.  (englanniksi)  // Syöpäsolu. - 2014. - Vol. 26, nro. 3 . - s. 344-357. - doi : 10.1016/j.ccr.2014.07.009 . — PMID 25203321 .
99. ↑ Montes Marta , Nielsen Morten M. , Maglieri Giulia , Jacobsen Anders , Højfeldt Jonas , Agrawal-Singh Shuchi , Hansen Klaus , Helin Kristian , van de Werken Harmen JG , Pedersen Jakob S. , Lund Anders M.press1 sumu moduloida vanhenemista  // Nature Communications. - 2015. - 24. huhtikuuta ( nide 6 , nro 1 ). — ISSN 2041-1723 . - doi : 10.1038/ncomms7967 .
100. ↑ Montero, JJ, López-Silanes, I., Megías, D., Fraga, MF, Castells-García, Á., & Blasco, MA (2018). TERRA-polykombin rekrytointi telomeereihin on välttämätöntä histonin trymetylaatiomerkeille telomeerisessa heterokromatiinissa. Nature communications, 9(1), 1548. https://doi.org/10.1038/s41467-018-03916-3
101. ↑ Bettin, N., Oss Pegorar, C., & Cusanelli, E. (2019). TERRAn nousevat roolit telomeerien ylläpidossa ja genomin vakaudessa. Cells, 8(3), 246; https://doi.org/10.3390/cells8030246
102. ↑ Marión RM et al., & Blasco MA (2019). TERRA säätelee pluripotenttien solujen transkriptiomaisemaa TRF1-riippuvaisen PRC2:n värväämisen kautta. eLife 2019;8:e44656 https://doi.org/10.7554/eLife.44656.001
103. ↑ Almeida, M., Bowness, JS, & Brockdorff, N. (2020). Polycomb-sääntelyn monet kasvot RNA:lla. Current Opinion in Genetics & Development, 61, 53-61. PMID 32403014 doi : 10.1016/j.gde.2020.02.023
104. ↑ Ren X. , Kerppola TK REST on vuorovaikutuksessa Cbx-proteiinien kanssa ja säätelee polykombin repressiivisen kompleksin 1 käyttöastetta RE1-elementeissä.  (englanti)  // Molekyyli- ja solubiologia. - 2011. - Voi. 31, ei. 10 . - P. 2100-2110. - doi : 10.1128/MCB.05088-11 . — PMID 21402785 .
105. ↑ Lu T. , Aron L. , Zullo J. , Pan Y. , Kim H. , Chen Y. , Yang TH , Kim HM , Drake D. , Liu XS , Bennett DA , Colaiácovo MP , Yankner BA REST ja stressinkestävyys ikääntymisessä ja Alzheimerin taudissa.  (englanniksi)  // Luonto. - 2014. - Vol. 507, nro 7493 . - s. 448-454. - doi : 10.1038/luonto13163 . — PMID 24670762 .
106. ↑ Yu M. , Mazor T. , Huang H. , Huang HT , Kathrein KL , Woo AJ , Chouinard CR , Labadorf A. , Akie TE , Moran TB , Xie H. , Zacharek S. , Taniuchi I. , Roeder RG , Kim CF , Zon LI , Fraenkel E. , Cantor AB Polykombin repressiivisen kompleksin 1 suora värvääminen kromatiiniksi ydintä sitovien transkriptiotekijöiden avulla.  (englanti)  // Molecular cell. - 2012. - Vol. 45, nro. 3 . - s. 330-343. - doi : 10.1016/j.molcel.2011.11.032 . — PMID 22325351 .
107. ↑ Berk AJ Yin ja yang välittäjätoiminnon ihmismutantit paljastivat.  (englanti)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America. - 2012. - Vol. 109, nro. 48 . - P. 19519-19520. - doi : 10.1073/pnas.1217267109 . — PMID 23184968 .
108. ↑ Rayess H. , Wang MB , Srivatsan ES Solujen vanheneminen ja kasvaimen suppressorigeeni p16.  (Englanti)  // Kansainvälinen syövän aikakauslehti. - 2012. - Vol. 130, ei. 8 . - s. 1715-1725. - doi : 10.1002/ijc.27316 . — PMID 22025288 .
109. ↑ Wei C. , Xiao R. , Chen L. , Cui H. , Zhou Y. , Xue Y. , Hu J. , Zhou B. , Tsutsui T. , Qiu J. , Li H. , Tang L. , Fu XD RBFox2 sitoo syntymässä olevaa RNA:ta säätelemään maailmanlaajuisesti polycomb Complex 2 -kohdistusta nisäkäsgenomeissa.  (englanti)  // Molecular cell. - 2016. - Vol. 62, nro. 6 . - s. 875-889. - doi : 10.1016/j.molcel.2016.04.013 . — PMID 27211866 .
110. ↑ Hu G. , Wade PA NuRD ja pluripotenssi: monimutkainen tasapainotus.  (eng.)  // Solun kantasolu. - 2012. - Vol. 10, ei. 5 . - s. 497-503. - doi : 10.1016/j.stem.2012.04.011 . — PMID 22560073 .
111. ↑ Reynolds N., Salmon-Divon M., Dvinge H., Hynes-Allen A., Balasooriya G., Leaford D., Behrens A., Bertone P., Hendrich B. H3K27:n NuRD-välitteinen deasetylaatio helpottaa Polycombin rekrytointia Repressiokompleksi 2 ohjaamaan geenien repressiota.  (englanniksi)  // EMBO-lehti. - 2012. - Vol. 31, ei. 3 . - s. 593-605. - doi : 10.1038/emboj.2011.431 . — PMID 22139358 .
112. ↑ Arnold P. , Schöler A. , ​​Pachkov M. , Balwierz PJ , Jørgensen H. , Stadler MB , van Nimwegen E. , Schübeler D. Epigenomidynamiikan mallinnus tunnistaa transkriptiotekijät, jotka välittävät Polycomb-kohdistamista.  (englanniksi)  // Genomitutkimus. - 2013. - Vol. 23, ei. 1 . - s. 60-73. - doi : 10.1101/gr.142661.112 . — PMID 22964890 .
113. ↑ Lanzuolo C. , Lo Sardo F. , Diamantini A. , Orlando V. PcG-kompleksit asettivat vaiheen geenin vaimentamisen epigeneettiselle periytymiselle varhaisessa S-vaiheessa ennen replikaatiota.  (englanti)  // PLoS-genetiikka. - 2011. - Voi. 7, ei. 11 . — P. e1002370. - doi : 10.1371/journal.pgen.1002370 . — PMID 22072989 .
114. ↑ Petruk S. , Sedkov Y. , Johnston DM , Hodgson JW , Black KL , Kovermann SK , Beck S. , Canaani E. , Brock HW , Mazo A. TrxG- ja PcG-proteiinit, mutta eivät metyloidut histonit, pysyvät DNA:han yhteydessä replikaation kautta.  (englanniksi)  // Solu. - 2012. - Vol. 150, ei. 5 . - s. 922-933. - doi : 10.1016/j.cell.2012.06.046 . — PMID 22921915 .
115. ↑ Abmayr SM , Workman JL Pysyminen DNA:n replikaation kautta: histonimuunnos vai modifikaattori?  (englanniksi)  // Solu. - 2012. - Vol. 150, ei. 5 . - s. 875-877. - doi : 10.1016/j.cell.2012.08.006 . — PMID 22939615 .
116. ↑ Hosogane M. , Funayama R. , Shirota M. , Nakayama K. Transkription puute laukaisee H3K27me3:n kerääntymisen geenikehoon.  (englanti)  // Soluraportit. - 2016. - doi : 10.1016/j.celrep.2016.06.034 . — PMID 27396330 .
117. ↑ Luo M., Ling T., Xie W., Sun H., Zhou Y., Zhu Q., Shen M., Zong L., Lyu G., Zhao Y., Ye T., Gu J., Tao W., Lu Z., Grummt I. NuRD estää hiiren somaattisten solujen uudelleenohjelmoinnin pluripotenteiksi kantasoluiksi.  (englanti)  // Kantasolut (Dayton, Ohio). - 2013. - Vol. 31, ei. 7 . - s. 1278-1286. doi : 10.1002 / varsi.1374 . — PMID 23533168 .
118. ↑ Rais Y., Zviran A., Geula S., Gafni O., Chomsky E., Viukov S., Mansour A. A., Caspi I., Krupalnik V., Zerbib M., Maza I., Mor N., Baran D ., Weinberger L., Jaitin D. A., Lara-Astiaso D., Blecher-Gonen R., Shipony Z., Mukamel Z., Hagai T., Gilad S., Amann-Zalcenstein D., Tanay A., Amit I. , Novershtern N., Hanna J. H. Somaattisten solujen deterministinen suora uudelleenohjelmointi pluripotenssiin.  (englanniksi)  // Luonto. - 2013. - Vol. 502, nro 7469 . - s. 65-70. - doi : 10.1038/luonto12587 . — PMID 24048479 .
119. ↑ Voigt P. , Tee W.W. , Reinberg D. Kaksoisnäkemys bivalenttisista promoottoreista.  (englanti)  // Geenit ja kehitys. - 2013. - Vol. 27, nro. 12 . - s. 1318-1338. - doi : 10.1101/gad.219626.113 . — PMID 23788621 .
120. ↑ De Gobbi M. , Garrick D. , Lynch M. , Vernimmen D. , Hughes JR , Goardon N. , Luc S. , Lower KM , Sloane-Stanley JA , Pina C. , Soneji S. , Renella R. , Enver T. , Taylor S. , Jacobsen SE , Vyas P. , Gibbons RJ , Higgs DR . Bivalenttien kromatiinidomeenien luominen solujen kohtalopäätösten aikana.  (englanti)  // Epigenetics & chromatin. - 2011. - Voi. 4, ei. 1 . - P. 9. - doi : 10.1186/1756-8935-4-9 . — PMID 21645363 .
121. ↑ Lu C. , Ward A. , Bettridge J. , Liu Y. , Desiderio S. Autoregulatory mekanismi asettaa allosteerisen kontrollin V(D)J-rekombinaasille histoni-H3-metylaatiolla.  (englanti)  // Soluraportit. - 2015. - Vol. 10, ei. 1 . - s. 29-38. - doi : 10.1016/j.celrep.2014.12.001 . — PMID 25543141 .
122. ↑ Hu D. , Garruss AS , Gao X. , Morgan MA , Cook M. , Smith ER , Shilatifard A. COMPASS-perheen Mll2-haara säätelee kaksiarvoisia promoottoreita hiiren alkion kantasoluissa.  (englanti)  // Luonnon rakenne- ja molekyylibiologia. - 2013. - Vol. 20, ei. 9 . - s. 1093-1097. doi : 10.1038 / nsmb.2653 . — PMID 23934151 .
123. ↑ Alder O. , Lavial F. , Helness A. , Brookes E. , Pinho S. , Chandrashekran A. , Arnaud P. , Pombo A. , O'Neill L. , Azuara V. Ring1B ja Suv39h1 kuvaavat erilaisia ​​kromatiinitiloja osoitteessa bivalenttiset geenit varhaisen hiiren linjan sitoutumisen aikana.  (Englanti)  // Kehitys (Cambridge, Englanti). - 2010. - Vol. 137, nro 15 . - P. 2483-2492. - doi : 10.1242/dev.048363 . — PMID 20573702 .
124. ↑ Mozzetta C. , Pontis J. , Fritsch L. , Robin P. , Portoso M. , Proux C. , Margueron R. , Ait-Si-Ali S. Histoni H3 lysiini 9 metyylitransferaasit G9a ja GLP säätelevät polycomb repressiivistä kompleksia 2 -välitteinen geenin hiljentäminen.  (englanti)  // Molecular cell. - 2014. - Vol. 53, nro. 2 . - s. 277-289. - doi : 10.1016/j.molcel.2013.12.005 . — PMID 24389103 .
125. ↑ Soufi A. , Donahue G. , Zaret KS Pluripotenssin uudelleenohjelmointitekijöiden alkuperäisen sitoutumisen genomiin fasilitaattorit ja esteet.  (englanniksi)  // Solu. - 2012. - Vol. 151, nro. 5 . - s. 994-1004. - doi : 10.1016/j.cell.2012.09.045 . — PMID 23159369 .
126. ↑ Lienert F. , Mohn F. , Tiwari VK , Baubec T. , Roloff TC , Gaidatzis D. , Stadler MB , Schübeler D. Heterokromaattisen H3K9me2 :n genominen esiintyvyys ja transkriptio eivät erota erilaisia ​​pluripotentteja soluja terminaalisesti.  (englanti)  // PLoS-genetiikka. - 2011. - Voi. 7, ei. 6 . - P. e1002090. - doi : 10.1371/journal.pgen.1002090 . — PMID 21655081 .
127. ↑ Aldiri I. , Vetter ML PRC2 selkärankaisten organogeneesin aikana: monimutkainen siirtymävaiheessa.  (englanniksi)  // Kehitysbiologia. - 2012. - Vol. 367, nro 2 . - s. 91-99. - doi : 10.1016/j.ydbio.2012.04.030 . — PMID 22565092 .
128. ↑ Mallen-St Clair J. , Soydaner-Azeloglu R. , Lee KE , Taylor L. , Livanos A. , Pylayeva-Gupta Y. , Miller G. , Margueron R. , Reinberg D. , Bar-Sagi D. EZH2 parit haiman regeneraatio neoplastiseen etenemiseen.  (englanti)  // Geenit ja kehitys. - 2012. - Vol. 26, nro. 5 . - s. 439-444. - doi : 10.1101/gad.181800.111 . — PMID 22391448 .
129. ↑ Richly H , Aloia L , Di Croce L. Polycomb-ryhmän proteiinien roolit kantasoluissa ja syövässä  // Cell Death & Disease. - 2011. - syyskuu ( osa 2 , nro 9 ). - S. e204-e204 . — ISSN 2041-4889 . - doi : 10.1038/cddis.2011.84 .
130. ↑ Zheng Y. , He L. , Wan Y. , Song J. p16INK4a-geenin H3K9me-tehostettu DNA-hypermetylaatio: epigeneettinen allekirjoitus rotan mesenkymaalisten kantasolujen spontaanille transformaatiolle.  (englanti)  // Kantasolut ja kehitys. - 2013. - Vol. 22, ei. 2 . - s. 256-267. - doi : 10.1089/scd.2012.0172 . — PMID 22873822 .
131. ↑ Ding X. , Wang X. , Sontag S. , Qin J. , Wanek P. , Lin Q. , Zenke M. Polykombiproteiini Ezh2 vaikuttaa indusoituun pluripotenttien kantasolujen muodostumiseen.  (englanti)  // Kantasolut ja kehitys. - 2014. - Vol. 23, ei. 9 . - s. 931-940. - doi : 10.1089/scd.2013.0267 . — PMID 24325319 .
132. ↑ Culerrier R. , Carraz M. , Mann C. , Djabali M. MSK1 laukaisee INK4AB/ARF-lokuksen ilmentymisen onkogeenin aiheuttamassa vanhenemisessa.  (englanniksi)  // Solun molekyylibiologia. - 2016. - Vol. 27, nro. 17 . - P. 2726-2734. - doi : 10.1091/mbc.E15-11-0772 . — PMID 27385346 .
133. ↑ Chen, Z., Yin, Q., Inoue, A., Zhang, C. ja Zhang, Y. (2019). Alleelinen H3K27me3 ja alleelinen DNA:n metylaatiokytkin ylläpitää ei-kanonista painamista alkionulkoisissa soluissa. Science Advances, 5(12), eaay7246. doi : 10.1126/sciadv.aay7246 PMC 6989337
134. ↑ 1 2 Chen, Z. ja Zhang, Y. (2020). Äidin H3K27me3-riippuvainen autosomaalinen ja X-kromosomipainatus. Nature Reviews Genetics, 1-17. doi : 10.1038/s41576-020-0245-9 PMID 32514155
135. ↑ Matoba, S., Wang, H., Jiang, L., Lu, F., Iwabuchi, KA, Wu, X., ... & Ogura, A. (2018). H3K27me3:n painamisen menetys somaattisten solujen tumansiirtoalkioissa häiritsee implantaation jälkeistä kehitystä. Cell stem cell, 23(3), 343-354. doi : 10.1016/j.stem.2018.06.008 PMC 6326833
136. ↑ Genomisen painamisen esteen voittaminen parantaa nisäkkäiden kloonausta . Haettu 20. kesäkuuta 2020. Arkistoitu alkuperäisestä 20. kesäkuuta 2020. (määrätön)
137. ↑ Das, P., & Taube, JH (2020). Metylaation säätely H3K27:ssä: temppu tai hoitokeino syöpäsolujen plastisuudelle. Cancers, 12(10), 2792. PMID 33003334 PMC 7600873 doi : 10.3390/cancers12102792
138. ↑ Ake T. Lu, Zhe Fei, Amin Haghani, Todd R. Robeck ym. ja Steve Horvath (2021). Universaali DNA-metylaatioikä nisäkäskudoksissa Arkistoitu 21. tammikuuta 2021 Wayback Machinessa . biorxiv.org doi : 10.1101/2021.01.18.426733

Kirjallisuus

• Guido van Mierlo, Gert Jan C. Veenstra, Michiel Vermeulen, Hendrik Marks (2019). PRC2-alikompleksien monimutkaisuus. Trends in Cell Biology, DOI: https://doi.org/10.1016/j.tcb.2019.05.004
• Laugesen A., Højfeldt JW, Helin K. (2019). Molekyylimekanismit, jotka ohjaavat PRC2:n rekrytointia ja H3K27-metylointia . Molecular Cell, 74(1), 8-18, DOI: https://doi.org/10.1016/j.molcel.2019.03.011
• Vidal, M. (2014). Polycomb-kompleksit: solujen monimuotoisuuden ja kudosten homeostaasin edellyttämät kromatiininsäätelijät. Teoksessa Transkription ja epigeneettiset mekanismit, jotka säätelevät normaalia ja poikkeavaa verisolujen kehitystä (s. 95–139). Springer Berlin Heidelberg. doi : 10.1007/978-3-642-45198-0_5 Online ISBN 978-3-642-45198-0
• Marianne Entrevan, Bernd Schuettengruber, Giacomo Cavalli (2016). Genomiarkkitehtuurin ja toiminnan säätely polycomb-proteiinien toimesta . Trends in Cell Biology, 26(7), 511–525 doi : 10.1016/j.tcb.2016.04.009
• Comet, I., & Helin, K. (2014). Vallankumous Polycomb-hierarkiassa . Nature rakenne- ja molekyylibiologia, 21(7), 573-575. doi : 10.1038/nsmb.2848
• Schwartz, YB ja Pirrotta, V. (2014). Hallitsee Ubiquitylation: A New Order for Polycomb Recruitment . Cell reports, 8(2), 321-325. doi : 10.1016/j.celrep.2014.07.001
• Nathan R. Rose, Robert J. Klose, (2014). DNA-metylaation ja histonin lysiinin metylaation välisen suhteen ymmärtäminen . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Geenisäätelymekanismit doi : 10.1016/j.bbagrm.2014.02.007
• Gozani, O. ja Shi, Y. (2014). Histonimetylaatio kromatiinisignaalissa. Julkaisussa: Fundamentals of Chromatin (s. 213–256). Springer New York. doi : 10.1007/978-1-4614-8624-4_5
• Jeffrey A. Simon, Robert E. Kingston (2013) Occupying Chromatin: Polycomb Mechanisms for Getting to Genomic Targets, stopping Transkription Traffic ja Staying Pain. Molecular Cell, 49(5), 808-824 https://dx.doi.org/10.1016/j.molcel.2013.02.013
• Bernd Schuettengruber, Henri-Marc Bourbon, Luciano Di Croce, Giacomo Cavalli (2017). Polycombin ja Trithoraxin genomin säätely: 70 vuotta ja määrä . Cell, 171(1), 34–57, DOI: https://dx.doi.org/10.1016/j.cell.2017.08.002
• Di Croce, L., & Helin, K. (2013) Polycomb-ryhmän proteiinien transkription säätely . Nature rakenne- ja molekyylibiologia, 20(10), 1147-1155. doi: 10.1038/nsmb.2669
• Olsen, JB, Greenblatt, J. ja Emili, A. (2014). Histonimetyylitransferaasikompleksit transkriptiossa, kehityksessä ja syövässä. Teoksessa Kromatiiniin liittyvien proteiinikompleksien järjestelmäanalyysi syövässä (s. 33–47). Springer New York. doi : 10.1007/978-1-4614-7931-4_2
• Shahram Golbabapour, Nazia Abdul Majid, Pouya Hassandarvish, Maryam Hajrezaie, Mahmood Ameen Abdulla ja A. Hamid A. Hadi. (Kesäkuu 2013). Geenien vaimentaminen ja polykombiryhmän proteiinit: yleiskatsaus niiden rakenteeseen, mekanismeihin ja fylogenetiikkaan . OMICS: A Journal of Integrative Biology, 17(6): 283-296. doi : 10.1089/omi.2012.0105
• Anne Laugesen, Kristian Helin (kesäkuu 2014). Kromatiinirepressiiviset kompleksit kantasoluissa, kehityksessä ja syövässä. Cell Stem Cell, 14(6), 735-751 doi : 10.1016/j.stem.2014.05.006
• Jesús Gi, Ana O'Loghlenemai (2014). PRC1-kompleksi monimuotoisuus: mihin se meidät vie? doi : 10.1016/j.tcb.2014.06.005
• John W Whitaker, Zhao Chen ja Wei Wang (2014). Ihmisen epigenomin ennustaminen DNA-motiiveista . Nature Methods doi : 10.1038/nmeth.3065
• Beatrice Bodega, Chiara Lanzuolo (2016). Polycomb Group Proteins: menetelmät ja protokollat ​​Yksityiskohtaiset, helposti toistettavat laboratorioprotokollat ​​sekä vinkkejä tunnettujen virheiden välttämiseen.
• Filippo Ciabrelli, Federico Comoglio, Simon Fellous, Boyan Bonev, Maria Ninova, Quentin Szabo, Anne Xuéreb, Christophe Klopp, Aleksei Aravin, Renato Paro, Frédéric Bantignies, Giacomo Cavalli (2017). Stabiili polykombista riippuvainen kromatiinitilojen sukupolvien välinen perintö Drosophilassa . Luonnon genetiikka; doi : 10.1038/ng.3848
• Takahiro Ito, Yee Voan Teo, Shane A. Evans, Nicola Neretti, John M. Sedivy (2018). Solujen vanhenemisen säätely polykombikromatiinimodifioijilla erillisten DNA-vaurioiden ja histonien metylaatiosta riippuvien reittien avulla Cell Reports, 22(13), 3480–3492 doi : 10.1016/j.celrep.2018.03.002
• Skourti-Stathaki, K., Triglia, E.T., Warburton, M., Voigt, P., Bird, A. ja Pombo, A. (2019). R-silmukat tehostavat polycomb-repressiota kehityssäätelygeenien osajoukossa . molekyylisolu. 73(5), 930-945.E4
• Ren, X., Hu, B., Song, M., Ding, Z., Dang, Y., Liu, Z., ... & Chan, P. (2019). Nukleolaarisen homeostaasin ylläpito CBX4:llä lievittää vanhenemista ja nivelrikkoa. Cell reports, 26(13), 3643-3656. doi : 10.1016/j.celrep.2019.02.088
• Zhou, C., Wang, Y., Zhang, J., Su, J., An, Q., Liu, X., ... & Zhang, Y. (2019). H3K27me3 on epigeneettinen este, kun taas KDM6A:n yli-ilmentyminen parantaa tuman uudelleenohjelmoinnin tehokkuutta. FASEB Journal, 33(3), 4638-4652. PMID 30673507 doi : 10.1096/fj.201801887R
• Lee, S., Lee, C., Hwang, CY, Kim, D., Han, Y., Hong, SN, ... & Cho, KH (2020). Verkkopäätelmäanalyysi identifioi SETDB1:n keskeiseksi säätelijäksi kolorektaalisen syöpäsolujen muuttamisessa erilaistuneiksi normaalin kaltaisiksi soluiksi. Molecular Cancer Research, 18(1), 118-129. PMID 31896605 doi : 10.1158/1541-7786.MCR-19-0450
• Fukuda, K., & Shinkai, Y. (2020). SETDB1 - Retroelementtien välitetty vaimennus. Virukset, 12(6), 596. PMID 32486217 PMC 7354471 doi : 10.3390/v12060596
• Strepkos, D., Markouli, M., Klonou, A., Papavassiliou, A.G., & Piperi, C. (2021). Histonimetyylitransferaasi SETDB1: Tuumorigeneesin yhteinen nimittäjä, jolla on terapeuttista potentiaalia. Cancer Research, 81(3), 525-534. PMID 33115801 doi : 10.1158/0008-5472.CAN-20-2906
• Kalashnikova, DA, Maksimov, DA, Romanov, SE, Laktionov, PP ja Koryakov, DE (2021). SetDB1 ja Su (var) 3-9 näyttelevät ei-päällekkäisiä rooleja Drosophila melanogasterin somaattisten solujen kromosomeissa. Journal of Cell Science, 134(2), jcs253096. PMID 33288549 doi : 10.1242/jcs.253096

Eukromatiiniproteiinin histoni H3-lysiini-9-spesifinen metyylitransferaasi SetDB1 sitoutuu kromatiiniin domeenien ulkopuolella H3K27me3-modifikaatiolla, se puuttuu toistuvista DNA-osastoista ja edistää genomin stabiilisuutta estämällä retroelementtien aktiivisuutta . SetDB1 on läsnä monien ekspressoituneiden geenien transkription aloituskohdissa ja transloimattomissa 5'-alueilla. SETDB1:n ehtyminen muuntaa tehokkaasti kolorektaalisyövän kantasolut postmitoottisiksi soluiksi ja palauttaa potilaasta peräisin olevien paksusuolensyövän organoidien normaalin morfologian.

• Collier, AJ, Bendall, A., Fabian, C., et ai., & Rugg-Gunn, PJ (2022). Genominlaajuinen seulonta tunnistaa Polycomb repressiivisen kompleksin 1.3:n olennaiseksi säätelijäksi ihmisen naiivien pluripotenttien solujen uudelleenohjelmoinnissa. Science Advances, 8(12), eabk0013. PMID 35333572 doi : 10.1126/sciadv.abk0013
• Zhu, Y., Dong, L., Wang, C., Hao, K., Wang, J., Zhao, L., ... & Qin, J. (2022). Polycomb-kompleksien toiminnallinen redundanssi alkion kantasolujen pluripotentin tilan ylläpitämisessä. Kantasoluraportit. https://doi.org/10.1016/j.stemcr.2022.02.020

Katso myös

• epigenetiikka
• Histonit