Faustovirus

Faustovirus

Faustoviruksen virionin rekonstruktio kryoelektronimikroskoopilla _
tieteellinen luokittelu
Ryhmä:Virukset [2]Valtakunta:incertae sedis [1]Näytä:Faustovirus
Kansainvälinen tieteellinen nimi
Faustovirus
Baltimore Group
I: dsDNA-virukset

Faustovirus  (latinaksi) on jättiläinen virus , joka on morfologisesti ja geneettisesti lähellä kahta muuta jättiläisvirusta, Pacmanvirusta ja Kaumoebavirusta , sekä Asfarviridae - heimon viruksia . Faustovirus eristettiin vuonna 2015 protiista Vermamoeba vermiformiksesta [3] .

Marraskuusta 2018 lähtien Faustovirus- sukua ei ole rekisteröity ICTV: n ( International Committee on Taxonomy of Viruses ) tietokantaan [4] .

Kuvaus

Faustoviruksella on noin 200 nm kooltaan ikosaedriset virionit [3] . Vuonna 2016 Faustoviruksen virioneja tutkittiin yksityiskohtaisesti kryoelektronimikroskoopilla . Tämän viruksen ulkokuoren pääkapsidiproteiini (MCP) muodostaa trimeereitä [ en ] , joista kukin koostuu kahdesta peräkkäin sijoittuvasta hyytelörullan [ rakennemotiivista . Yksi hyytelörulla-aihe sisältää 8 beta-arkkia . Samanlainen kapsidin pääproteiinin järjestäytyminen löytyy monista viruksista. Kapsomeeriä edustaa MCP- heksameeri , ja sen halkaisija on noin 75 Å . Toisin kuin useimmat muut jättiläisvirukset, Faustoviruksella on myös toinen, sisäinen kapsidikerros, jonka myös muodostavat proteiiniheksameerit [5] .  

Genomi

Faustoviruksen genomia edustaa pyöreä kaksijuosteinen DNA - molekyyli , jossa on 466 265 emäsparia (bp). Genomin GC-koostumus on 36 %. Genomissa on 451 proteiinia koodaavaa geeniä , joiden tuotteiden pituudet ovat välillä 47-2980 aminohappotähdettä (a.a.). Faustoviruksen genomista ei ole tunnistettu tRNA :ta koodaavia geenejä . Vain 31 % Faustoviruksen proteiineista löysi homologeja tietokannoista . Useimmat Faustovirus- proteiinit ovat homologisia Asfarviridae- proteiinien kanssa ; on myös proteiineja, jotka liittyvät sukujen Phycodnaviridae , Mimiviridae , Marseilleviridae ja Ascoviridae virusten proteiineihin . Jotkut proteiinit ovat sukua bakteriofagiproteiineille , lisäksi useilla proteiineilla on sukulaisia ​​vain solueliöiden joukossa : eukaryootit , bakteerit ja arkeat . Kapsidiproteiineja koodaavista geeneistä on tunnistettu monia introneja [5] , mukaan lukien kuusi itsesilmukoituvaa ryhmän I intronia - erittäin epätyypillinen tapaus viruksille [3] .

Elinkaari

Vermamoeba vermiformis -solujen infektio alkaa protistin suorittamalla viruspartikkelien fagosytoosilla . 2-4 tuntia tartunnan jälkeen virionit havaitaan fagosomien sisällä , joista osa saattaa jopa sijaita lähellä solutumaa , vaikka viruspartikkelien vuorovaikutusta ytimen kanssa ei havaittu. Seuraavaksi fagosomit vapauttavat sisältönsä isäntäsolun sytoplasmaan : viruksen sisäkalvo fuusioituu fagosomin kalvon kanssa ja virionin sisältö tulee ulos, samalla tavalla kuin mimiviruksessa . Sen jälkeen osa virioneista lakkaa olemasta näkyvissä. Faustoviruksen proteiinien ja DNA :n vapautuminen soluun tapahtuu 4-6 tunnin kuluttua tartunnasta. Kummallista kyllä, rinnakkain isäntäsolun ydin käy läpi jonkin verran uudelleenjärjestelyä, nimittäin se menettää pallomaisen muotonsa. 8-10 tuntia tartunnan jälkeen solu pyöristyy ja menettää kosketuksen substraatin kanssa, ja sytoplasmassa tulee selvästi näkyviin virustehdas, joka sisältää vasta muodostuneita viruspartikkeleita ja jota ympäröivät mitokondriot . Joillakin soluilla on vain tyhjiä kapsideja virustehtaissaan. 12–14 tuntia tartunnan jälkeen virustehdas vie lähes kaiken vapaan tilan solussa, ja 18–20 tunnin kuluttua useimmat solut hajoavat ja uusia virioneja vapautuu [3] .

Fylogenia ja suhteet

DNA - polymeraasi B -perheen geenisekvenssin perusteella rakennetun fylogeneettisen puun mukaan , Kaumoebavirus , Faustovirus ja Asfarviridae muodostavat monofyleettisen kladin . Ilmeisesti näillä viruksilla oli yhteinen esi -isä . Pääkapsidiproteiinia koodaavan lokuksen sekvenssi tuo Pacmanvirusta lähemmäksi Asfarviridaea , mutta virionin arkkitehtuuri on lähempänä Faustovirusta [ 6] .  

Muistiinpanot

  1. ↑ Kansainvälinen virustaksonomiakomitea (ICTV) ei ole tunnustanut taksonia.
  2. ↑ Virusten taksonomia  Kansainvälisen virustaksonomian komitean (ICTV) verkkosivustolla .
  3. ↑ 1 2 3 4 Reteno DG , Benamar S. , Khalil JB , Andreani J. , Armstrong N. , Klose T. , Rossmann M. , Colson P. , Raoult D. , La Scola B. Faustovirus, asfarvirukseen liittyvä uusi ameebaa tartuttavien jättiläisten virusten linja.  (Englanti)  // Journal Of Virology. - 2015. - heinäkuu ( osa 89 , nro 13 ). - P. 6585-6594 ​​. - doi : 10.1128/JVI.00115-15 . — PMID 25878099 .
  4. ↑ Etsi Faustovirus ICTV-tietokannasta (downlink) . Haettu 11. marraskuuta 2018. Arkistoitu alkuperäisestä 4. lokakuuta 2013. 
  5. ↑ 1 2 Klose T. , Reteno DG , Benamar S. , Hollerbach A. , Colson P. , La Scola B. , Rossmann MG Faustovirus, a large dsDNA virus, rakenne.  (englanniksi)  // Amerikan yhdysvaltojen kansallisen tiedeakatemian julkaisut. - 2016. - 31. toukokuuta ( nide 113 , nro 22 ). - P. 6206-6211 . - doi : 10.1073/pnas.1523999113 . — PMID 27185929 .
  6. ↑ Andreani J. , Khalil JYB , Sevvana M. , Benamar S. , Di Pinto F. , Bitam I. , Colson P. , Klose T. , Rossmann MG , Raoult D. , La Scola B. Pacmanvirus, a New Giant Icosahedral Virus Asfarviridaen ja Faustovirusten risteyksessä.  (Englanti)  // Journal Of Virology. - 2017. - 15. heinäkuuta ( osa 91 , nro 14 ). - doi : 10.1128/JVI.00212-17 . — PMID 28446673 .