Koodaamaton RNA

Ei-koodaava RNA (non-coding RNA, ncRNA) - RNA -molekyylejä , joita ei muunneta proteiineihin . Aikaisemmin käytetty synonyymi  - "pieni RNA" (smRNA, pieni RNA) - on jäänyt pois käytöstä, koska jotkut ei-koodaavat RNA:t voivat olla hyvin suuria, esimerkiksi Xist .

DNA-sekvenssiä , johon ei-koodaavat RNA:t transkriptoidaan, kutsutaan usein RNA -geeniksi .

Ei-koodaavia RNA:ita ovat [1] :

• siirtää RNA:ta (tRNA),
• ribosomin RNA (rRNA),
• pieni tuma-RNA (snRNA, snRNA),
• pieni nukleolaarinen RNA (snoRNA, snoRNA),
• antisense-RNA (aRNA),
• mikroRNA (miRNA),
• pieni häiritsevä RNA (siRNA),
• piRNA (piwiRNA, piRNA),
• pitkä ei-koodaava RNA  (lncRNA) - Xist , Evf , Air , CTN , PINK , TUG1 .

Viimeaikaiset transkriptitekniikat ( RNA-sekvensointi ) ja DNA-mikrosirutekniikat ovat tunnistaneet yli 30 000 pitkää ei-koodaavaa RNA:ta ( pitkä ncRNA  ) . Oletetaan, että ne "hallitsevat" polykombirepressorikompleksien selektiivistä laskeutumista tietyille kromatiinialueille , samoin kuin suoraan DNA:n metyylitransferaaseja ja mahdollisesti säätelevät selektiivistä DNA-metylaatiota [2] [3] [4] [5] . Lisäksi, kuten kävi ilmi, muodostavat merkittävän osan (~20 % pitkien ei-koodaavien RNA:iden kokonaismäärästä nisäkäsgenomeissa ), niin sanotut divergentit dsnRNA:t, jotka transkriptoituvat päinvastaiseen suuntaan kuin viereiset proteiinia koodaavat geenit . , säätelevät näiden vierekkäisten vierekkäisten geenien transkriptiota [6] .

Muistiinpanot

1. ↑ Lee T.I. , Young RA Transkription säätely ja sen väärinsääntely sairaudessa.  (englanniksi)  // Solu. - 2013. - Vol. 152, nro 6 . - s. 1237-1251. - doi : 10.1016/j.cell.2013.02.014 . — PMID 23498934 .
2. ↑ Merry, CR, Forrest, ME, Sabres, JN, Beard, L., Gao, XH, Hatzoglou, M., ... & Khalil, AM DNMT1:een liittyvät pitkät ei-koodaavat RNA:t säätelevät globaalia geeniekspressiota ja DNA:n metylaatiota paksusuolen syöpä // Ihmisen molekyyligenetiikka. - 2015. - T. 24 , nro 21 . - S. 6240-6253 . doi : 10.1093 / hmg/ddv343 .
3. ↑ Metyloinnin hallinta . Haettu 19. heinäkuuta 2022. Arkistoitu alkuperäisestä 28. marraskuuta 2016. (määrätön)
4. ↑ Daniel Holoch & Danesh Moazed. Geeniekspression RNA-välitteinen epigeneettinen säätely // Luontokatsaukset. genetiikka. - 2015. - T. 16 , nro 2 . — s. 71–84 . - doi : 10.1038/nrg3863 . — PMID 25554358 .
5. ↑ Jeffrey J. Quinn ja Howard Y. Chang. Pitkän ei-koodaavan RNA:n biogeneesin ja toiminnan ainutlaatuiset piirteet // Luontoarvostelut. genetiikka. - 2015. - T. 17 , nro 1 . — s. 47–62 . - doi : 10.1038/nrg.2015.10 . — PMID 26666209 .
6. ↑ Sai Luo, J. Yuyang Lu, Lichao Liu et ai. ja Xiaohua Shen. Erilaiset lncRNA:t säätelevät geenien ilmentymistä ja linjan erilaistumista pluripotenteissa soluissa // Solun kantasolu. - 2016. - doi : 10.1016/j.stem.2016.01.024 .

Linkit

• Ishitani R, Yokoyama S, Nureki O. RNA-muokkausentsyymien rakenne, dynamiikka ja toiminta // Curr Opin Struct Biol. - 2008. - T. 18 , nro 3 . - S. 330-339 .
• Yeung ML, Benkirane M, Jang KT. Pienet ei-koodaavat RNA:t, nisäkässolut ja virukset: säätelyvuorovaikutuksia?  // Retrovirologia. - 2007. - T. 4 . - S. 74 .

Katso myös

• RNA-sekvensointi
• DNA:n ultrakonservatiiviset elementit
• Pitkät ja lyhyet ei-koodaavat RNA:t (lncRNA ja miRNA) , jotka ovat vuorovaikutuksessa polykombirepressorikompleksien kanssa.