Opas RNA
Ohjaus-RNA, gRNA , ovat RNA:ita, jotka välittävät uridiininukleotidien liittämistä trypanosomien mRNA : han RNA:n muokkausprosessin aikana . [1] [2] [3] gRNA:ita koodaavat kinetoplastin genomin erilliset alueet . [neljä]
Toimintamekanismi
gRNA:n 5'-pää hybridisoituu editoimattoman pre-mRNA:n lyhyeen alueeseen, jota kutsutaan ankkurisekvenssiksi, kun taas tällaisten RNA:iden 3'-pää on editointitemplaatti. Monet gRNA:t eivät hybridisoitu primaarisen transkriptin ankkurisekvenssiin, vaan hybridisoituvat osittain muokattuun transkriptiin. Siksi trypanosomin esi-mRNA-muokkaus alkaa yleensä lähellä 3'-päätä ja etenee 5'-päähän iteratiivisessa prosessissa, joka vaatii useita erilaisia gRNA:ita, jotka sitoutuvat peräkkäin osittain muokattujen alueiden ankkurisekvenssiin. Ei ole täysin selvää, miksi trypanosomikinetoplastit käyttävät niin monimutkaista mekanismia mRNA :n muodostukseen . Monien gRNA:iden toimintoja ei ole tutkittu. [5]
Muistiinpanot
- ↑ Stuart KD, Schnaufer A, Ernst NL, Panigrahi AK. Monimutkainen hallinta: RNA-muokkaus trypanosomeissa // Trends Biochem Sci. - 2005. - T. 30 , nro 2 . - S. 97-105 .
- ↑ Madison-Antenucci S, Grams J, Hajduk SL. Editointikoneet: trypanosomin RNA-muokkauksen monimutkaisuus // Solu. - 2002. - T. 108 , nro 4 . - S. 435-438 .
- ↑ Stuart K, Allen TE, Kable ML, Lawson S. Kinetoplastidin RNA-editointi: kompleksit ja katalyytit // Curr Opin Chem Biol. - 1997. - T. 1 , nro 3 . - S. 340-346 .
- ↑ Uliel S, Liang XH, Unger R, Michaeli S. Pienet nukleolaariset RNA:t, jotka ohjaavat modifikaatiota trypanosomatideissa: ohjelmisto, kohteet, genomin järjestäminen ja ainutlaatuiset toiminnot // Int J Parasitol. - 2004. - T. 34 , nro 4 . - S. 445-454 .
- ↑ Stuart K, Panigrahi AK. RNA-muokkaus: monimutkaisuus ja komplikaatiot // Mol Microbiol. - 2002. - T. 45 , nro 3 . - S. 591-596 .
Kirjallisuus
- Gurbachan S. Miglani. RNA:t: niiden käsittely ja toiminta // Advanced Genetics . - CRC Press, 2002. - S. 257-259. — 665 s. — ISBN 0849324254 .
- Bruce Alberts. RNA-muokkaus voi muuttaa RNA-viestin merkitystä // Molecular Biology of the Cell . - Garland Science, 2007. - S. 483-484. — 1601 s. — ISBN 0815341113 .
- Simpson L, Thiemann OH, Savill NJ, Alfonzo JD, Maslov DA. RNA-muokkauksen evoluutio trypanosomimitokondrioissa // Proc Natl Acad Sci US A. - 2000. - V. 97 , No. 13 . - S. 6986-6993 . — Katsausartikkeli RNA-muokkauksen kehityksestä Trypanosissa englanniksi, vapaasti saatavilla
Katso myös
RNA-muokkaus