Histonideasetylaasi 2

Kokeneet kirjoittajat eivät ole vielä tarkistaneet sivun nykyistä versiota, ja se voi poiketa merkittävästi 3. kesäkuuta 2015 tarkistetusta versiosta . tarkastukset vaativat 6 muokkausta .
Histonideasetylaasi 2
Käytettävissä olevat rakenteet
ATE Ortologinen haku: PDBe , RCSB
Tunnisteet
SymboliHDAC2  ; HD2; RPD3; YAF1
Ulkoiset tunnuksetOMIM:  605164 MGI :  1097691 Homologeeni :  68187 ChEMBL : 1937 GeneCards : HDAC2 Gene
EY-numero3.5.1.98
RNA-ekspressioprofiili
Lisää tietoa
ortologit
NäytäIhmisenHiiri
Entrez306615182
YhtyeENSG00000196591ENSMUSG00000019777
UniProtQ92769P70288
RefSeq (mRNA)NM_001527NM_008229
RefSeq (proteiini)NP_001518NP_032255
Locus (UCSC)Chr 6:
114,25 – 114,33 Mb
Chr 10:
36,97 - 37 Mb
Hae PubMedistä[yksi][2]

Histonideasetylaasi 2  on entsyymi histonideasetylaasiperheestä , jota HDAC2 -geeni koodaa ihmisissä . [yksi]

Toiminto

HDAC2 -geenituote kuuluu histonideasetylaasien perheeseen . Histonideasetylaasit toimivat osana suuria moniproteiinikomplekseja ja ovat vastuussa lysiinitähteiden deasetyloinnista ydinhistonien (H2A, H2B, H3 ja H4) N-pään alueella. Tämä proteiini muodostaa myös transkription repressorikomplekseja sitoutumalla erilaisiin proteiineihin, mukaan lukien YY1, yksi nisäkkään transkriptiotekijöistä . Histonideasetylaasi 2:lla on tärkeä rooli transkription , solusyklin ja kehityksen säätelyssä. [2]

Vuorovaikutuksia

Histonideasetylaasi 2 on vuorovaikutuksessa seuraavien kanssa:

Muistiinpanot

  1. Betz R., Gray SG, Ekström C., Larsson C., Ekström TJ Ihmisen histonideasetylaasi 2, HDAC2 (Human RPD3), on lokalisoitu 6q21:een säteilyhybridikartoituksen avulla  // Genomics  :  Journal. - Academic Press , 1998. - Joulukuu ( nide 52 , nro 2 ). - s. 245-246 . doi : 10.1006 / geno.1998.5435 . — PMID 9782097 .
  2. Entrez-geeni: HDAC2-histonideasetylaasi 2 .
  3. 1 2 Schmidt DR, Schreiber SL Molekyyliassosiaatio ATR:n ja nukleosomiremodeling- ja deasetylointikompleksin kahden komponentin, HDAC2:n ja CHD4  :n välillä //  Biochemistry : Journal. — Voi. 38 , ei. 44 . - P. 14711-14717 . - doi : 10.1021/bi991614n . — PMID 10545197 .
  4. 1 2 3 4 Yoon YM, Baek KH, Jeong SJ, Shin HJ, Ha GH, Jeon AH, Hwang SG, Chun JS, Lee CW WD toistoa sisältävät mitoottiset tarkistuspisteproteiinit toimivat transkription repressoreina   interfaasin aikana // FEBS Lett. : päiväkirja. — Voi. 575 , no. 1-3 . - s. 23-9 . - doi : 10.1016/j.febslet.2004.07.089 . — PMID 15388328 .
  5. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Hakimi MA, Dong Y., Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R. Ehdokas X-kytketty henkinen hidastumisgeeni on osa uutta histonideasetylaasia sisältävien kompleksien  perhettä. )  // J. Biol. Chem.  : päiväkirja. — Voi. 278 , nro. 9 . - P. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
  6. 1 2 3 4 5 Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, Kingston RE, Schreiber SL Kromatiinin deasetylaatio ATP-riippuvaisella nukleosomiremodeling-kompleksilla  //  Nature : Journal. — Voi. 395 , no. 6705 . - s. 917-921 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
  7. 1 2 Hakimi MA, Bochar DA, Schmiesing JA, Dong Y., Barak OG, Speicher DW, Yokomori K., Shiekhattar R. Kromatiinin remodeling-kompleksi, joka lataa kohesiinia ihmisen kromosomeihin  //  Nature : Journal. — Voi. 418 , no. 6901 . - s. 994-998 . - doi : 10.1038/luonto01024 . — PMID 12198550 .
  8. Rountree MR, Bachman KE, Baylin SB DNMT1 sitoo HDAC2:n ja uuden rinnakkaisrepressorin, DMAP1:n, muodostaen kompleksin replikaatiokeskuksissa   // Nat . Genet.  : päiväkirja. — Voi. 25 , ei. 3 . - s. 269-277 . - doi : 10.1038/77023 . — PMID 10888872 .
  9. 1 2 3 van der Vlag J., Otte AP Ihmisen polykombiryhmän proteiinin EED välittämä transkription repressio sisältää histonin deasetylaation   // Nat . Genet.  : päiväkirja. — Voi. 23 , ei. 4 . - s. 474-478 . - doi : 10.1038/70602 . — PMID 10581039 .
  10. Yang WM, Yao YL, Seto E. FK506:ta sitova proteiini 25 assosioituu toiminnallisesti histonideasetylaasien ja transkriptiotekijän YY1 kanssa  // EMBO  J. : päiväkirja. — Voi. 20 , ei. 17 . - P. 4814-4825 . - doi : 10.1093/emboj/20.17.4814 . — PMID 11532945 .
  11. Sikiön sydän-solujen lisääntymisen kolmisuuntainen hallinta voisi auttaa uusiutumaan sydänsoluissa  (7. lokakuuta 2010). Arkistoitu alkuperäisestä 3. tammikuuta 2012. Haettu 9. huhtikuuta 2015.
  12. Wen YD, Cress WD, Roy AL, Seto E. Histonideasetylaasi 3 sitoutuu monitoimiseen transkriptiotekijään TFII-I ja säätelee sitä  //  J. Biol. Chem.  : päiväkirja. — Voi. 278 , nro. 3 . - P. 1841-1847 . - doi : 10.1074/jbc.M206528200 . — PMID 12393887 .
  13. 1 2 Fischer DD, Cai R., Bhatia U., Asselbergs FA, Song C., Terry R., Trogani N., Widmer R., Atadja P., Cohen D. Uuden luokan II histonideasetylaasin eristäminen ja karakterisointi , HDAC10  (englanti)  // J. Biol. Chem.  : päiväkirja. — Voi. 277 , no. 8 . - P. 6656-6666 . - doi : 10.1074/jbc.M108055200 . — PMID 11739383 .
  14. 1 2 3 Yao YL, Yang WM Metastaasiin liittyvät proteiinit 1 ja 2 muodostavat erillisiä proteiinikomplekseja histonideasetylaasiaktiivisuuden kanssa  //  J. Biol. Chem.  : päiväkirja. — Voi. 278 , nro. 43 . - P. 42560-42568 . - doi : 10.1074/jbc.M302955200 . — PMID 12920132 .
  15. 1 2 3 4 Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J., Lane WS, Mandel G., Shiekhattar R. Histonideasetylaasi sisältävä ydin-BRAF35-kompleksi välittää hermosoluspesifisten geenien repressiota  (englanti)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States  : Journal. — Voi. 99 , ei. 11 . - P. 7420-7425 . - doi : 10.1073/pnas.112008599 . — PMID 12032298 .
  16. 1 2 Johnson CA, White DA, Lavender JS, O'Neill LP, Turner BM Ihmisen luokan I histonideasetylaasikompleksit osoittavat parantunutta katalyyttista aktiivisuutta ATP:n läsnä ollessa ja yhteisimmunosaostuminen ATP-riippuvaisen chaperoniproteiinin  Hsp70 kanssa  // J. Biol. Chem.  : päiväkirja. — Voi. 277 , no. 11 . - P. 9590-9597 . - doi : 10.1074/jbc.M107942200 . — PMID 11777905 .
  17. Fischle W., Dequiedt F., Hendzel MJ, Guenther MG, Lazar MA, Voelter W., Verdin E. Luokan II HDAC:eihin liittyvä entsymaattinen aktiivisuus on riippuvainen moniproteiinikompleksista, joka sisältää HDAC3:n ja SMRT/N-  CoR :n  // Mol. solu : päiväkirja. — Voi. 9 , ei. 1 . - s. 45-57 . - doi : 10.1016/s1097-2765(01)00429-4 . — PMID 11804585 .
  18. Fischle W., Dequiedt F., Fillion M., Hendzel MJ, Voelter W., Verdin E. Ihmisen HDAC7-histonideasetylaasiaktiivisuus liittyy HDAC3:een in vivo  //  J. Biol. Chem.  : päiväkirja. — Voi. 276 , nro. 38 . - P. 35826-35835 . - doi : 10.1074/jbc.M104935200 . — PMID 11466315 .
  19. Ashburner BP, Westerheide SD, Baldwin AS NF-kappaB:n p65 (RelA) -alayksikkö on vuorovaikutuksessa histonideasetylaasi (HDAC) -corepressorien HDAC1 ja HDAC2 kanssa sääteleen negatiivisesti geenin ilmentymistä   // Mol . solu. Biol. : päiväkirja. — Voi. 21 , ei. 20 . - P. 7065-7077 . - doi : 10.1128/MCB.21.20.7065-7077.2001 . — PMID 11564889 .
  20. 1 2 3 4 Zhang Y., Ng HH, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. NuRD-alayksiköiden analyysi paljastaa histonideasetylaasiydinkompleksin ja yhteyden DNA:n metylaatioon   // Genes Dev .  : päiväkirja. — Voi. 13 , ei. 15 . - P. 1924-1935 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
  21. Hassig CA, Tong JK, Fleischer TC, Owa T., Grable PG, Ayer DE, Schreiber SL Histonideasetylaasiaktiivisuuden rooli HDAC1-välitteisessä transkription repressiossa  //  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America  : päiväkirja. — Voi. 95 , ei. 7 . - P. 3519-3524 . - doi : 10.1073/pnas.95.7.3519 . — PMID 9520398 .
  22. Zhang Y., Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Histonideasetylaasit ja SAP18, uusi polypeptidi, ovat ihmisen Sin3-kompleksin komponentteja  (englanniksi)  // Cell  : Journal. — Solu Paina . — Voi. 89 , ei. 3 . - s. 357-364 . - doi : 10.1016/s0092-8674(00)80216-0 . — PMID 9150135 .
  23. Wysocka J., Myers MP, Laherty CD, Eisenman RN, Herr W. Ihmisen Sin3-deasetylaasi ja tritoraksiin liittyvä Set1/Ash2-histoni H3-K4-metyylitransferaasi kytketään yhteen selektiivisesti solujen lisääntymistekijän HCF-   1 // Genes Dev.  : päiväkirja. — Voi. 17 , ei. 7 . - s. 896-911 . - doi : 10.1101/gad.252103 . — PMID 12670868 .
  24. Mazumdar A., ​​​​Wang RA, Mishra SK, Adam L., Bagheri-Yarmand R., Mandal M., Vadlamudi RK, Kumar R. Estrogeenireseptorin transkriptionaalinen repressio etäpesäkkeisiin liittyvällä proteiini 1   -korepressorilla // Nat. Cell biol.  : päiväkirja. — Voi. 3 , ei. 1 . - s. 30-7 . - doi : 10.1038/35050532 . — PMID 11146623 .
  25. 1 2 Laherty CD, Yang WM, Sun JM, Davie JR, Seto E., Eisenman RN Histonideasetylaasit, jotka liittyvät mSin3-corepressoriin, välittävät hullua transkription repressiota  (englanniksi)  // Cell  : Journal. — Solu Paina . — Voi. 89 , ei. 3 . - s. 349-356 . - doi : 10.1016/s0092-8674(00)80215-9 . — PMID 9150134 .
  26. Spronk CA, Tessari M., Kaan AM, Jansen JF, Vermeulen M., Stunnenberg HG, Vuister GW Mad1-Sin3B-vuorovaikutukseen sisältyy uusi kierukkapoimu   // Nat . Rakenne. Biol.  : päiväkirja. — Voi. 7 , ei. 12 . - s. 1100-1104 . - doi : 10.1038/81944 . — PMID 11101889 .
  27. Brackertz M., Boeke J., Zhang R., Renkawitz R. Kaksi hyvin samankaltaista p66-proteiinia käsittävät uuden perheen voimakkaita transkriptiorepressoreita, jotka ovat vuorovaikutuksessa MBD2:n ja MBD3:n kanssa  //  J. Biol. Chem.  : päiväkirja. — Voi. 277 , no. 43 . - P. 40958-40966 . - doi : 10.1074/jbc.M207467200 . — PMID 12183469 .
  28. Ng HH, Zhang Y., Hendrich B., Johnson CA, Turner BM, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D., Bird A. MBD2 on transkriptionaalinen repressori, joka kuuluu MeCP1-histonideasetylaasikompleksiin  . )  / / Nat. Genet.  : päiväkirja. — Voi. 23 , ei. 1 . - s. 58-61 . - doi : 10.1038/12659 . — PMID 10471499 .
  29. Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. BHC80:n karakterisointi BRAF-HDAC-kompleksissa, mukana hermosoluspesifisessä geenirepressiossa   // Biochem . Biophys. Res. commun. : päiväkirja. — Voi. 322 , no. 2 . - s. 601-608 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .
  30. Jin Q., van Eynde A., Beullens M., Roy N., Thiel G., Stalmans W., Bollen M. Proteiinifosfataasi-1 (PP1) -säätelijä, PP1:n (NIPP1) tuman estäjä, on vuorovaikutuksessa polycomb-ryhmän proteiini, embryonaalinen ektodermakehitys (EED) ja toimii transkription repressorina  //  J. Biol. Chem.  : päiväkirja. — Voi. 278 , nro. 33 . - P. 30677-30685 . - doi : 10.1074/jbc.M302273200 . — PMID 12788942 .
  31. 1 2 Zhang Y., Dufau ML Luteinisoivan hormonin reseptorigeenin transkription kaksoismekanismit tuman orporeseptoreiden ja histonideasetylaasikompleksien säätelyssä  (englanniksi)  // J. Steroid Biochem. Mol. Biol. : päiväkirja. — Voi. 85 , no. 2-5 . - s. 401-414 . - doi : 10.1016/s0960-0760(03)00230-9 . — PMID 12943729 .
  32. 1 2 3 Zhang Y., Dufau ML Ihmisen luteinisoivan hormonin reseptorigeenin transkription vaimentaminen histonideasetylaasi-mSin3A-kompleksilla  //  J. Biol. Chem.  : päiväkirja. — Voi. 277 , no. 36 . - P. 33431-33438 . - doi : 10.1074/jbc.M204417200 . — PMID 12091390 .
  33. Sinä A., Tong JK, Grozinger CM, Schreiber SL. CoREST on olennainen osa CoREST-ihmisen histonideasetylaasikompleksia  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America  : Journal  . — Voi. 98 , ei. 4 . - s. 1454-1458 . - doi : 10.1073/pnas.98.4.1454 . — PMID 11171972 .
  34. Kiernan R., Brès V., Ng RW, Coudart MP, El Messaoudi S., Sardet C., Jin DY, Emiliani S., Benkirane M. NF-kappa B -riippuvaisen transkription aktivoinnin jälkeinen sammutus on säädelty asetyloimalla p65  (englanniksi)  // J. Biol. Chem.  : päiväkirja. — Voi. 278 , nro. 4 . - P. 2758-2766 . - doi : 10.1074/jbc.M209572200 . — PMID 12419806 .
  35. Yu Z., Zhang W., Kone BC Histonideasetylaasit lisäävät iNOS-geenin sytokiinien induktiota  //  J. Am. soc. Nephrol. : päiväkirja. — Voi. 13 , ei. 8 . - s. 2009-2017 . - doi : 10.1097/01.asn.0000024253.59665.f1 . — PMID 12138131 .
  36. Lai A., Lee JM, Yang WM, DeCaprio JA, Kaelin WG, Seto E., Branton PE RBP1 rekrytoi sekä histonideasetylaasiriippuvaisia ​​että -riippumattomia repressioaktiviteetteja retinoblastoomaperheen proteiineihin   // Mol . solu. Biol. : päiväkirja. — Voi. 19 , ei. 10 . - P. 6632-6641 . — PMID 10490602 .
  37. Zhang Y., Sun ZW, Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Hampsey M., Reinberg D. SAP30, uusi proteiini, joka on säilynyt ihmisen ja hiivan välillä, on histonideasetylaasikompleksin  komponentti.)  // Mol. solu : päiväkirja. — Voi. 1 , ei. 7 . - s. 1021-1031 . - doi : 10.1016/s1097-2765(00)80102-1 . — PMID 9651585 .
  38. Kuzmichev A., Zhang Y., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Sin3-histoni-deasetylaasikompleksin rooli kasvun säätelyssä ehdokaskasvainsuppressorilla p33(ING1  )  // Mol. solu. Biol. : päiväkirja. — Voi. 22 , ei. 3 . - s. 835-848 . - doi : 10.1128/mcb.22.3.835-848.2002 . — PMID 11784859 .
  39. Fleischer TC, Yun UJ, Ayer DE Kolmen uuden mSin3A-corepressorikompleksin komponentin tunnistaminen ja karakterisointi   // Mol . solu. Biol. : päiväkirja. — Voi. 23 , ei. 10 . - P. 3456-3467 . - doi : 10.1128/mcb.23.10.3456-3467.2003 . — PMID 12724404 .
  40. Yang L., Mei Q., ​​Zielinska-Kwiatkowska A., Matsui Y., Blackburn ML, Benedetti D., Krumm AA, Taborsky GJ, Chansky HA ERG (ets-liittyvä geeni) -assosioitunut histonimetyylitransferaasi vuorovaikuttaa histonideasetylaasit 1/2 ja transkription rinnakkaisrepressorit mSin3A/B  (englanniksi)  // Biochem. J. : päiväkirja. — Voi. 369 , no. Pt 3 . - s. 651-657 . - doi : 10.1042/BJ20020854 . — PMID 12398767 .
  41. Zhou S., Fujimuro M., Hsieh JJ, Chen L., Hayward SD Rooli SKIP:lle CBF1-repressoitujen promoottorien EBNA2-aktivaatiossa  //  J. Virol. : päiväkirja. — Voi. 74 , no. 4 . - P. 1939-1947 . doi : 10.1128 / jvi.74.4.1939-1947.2000 . — PMID 10644367 .
  42. Vaute O., Nicolas E., Vandel L., Trouche D. Histonimetyylitransferaasin Suv39H1 ja histonideasetylaasien toiminnallinen ja fyysinen vuorovaikutus  // Nucleic Acids Res  . : päiväkirja. — Voi. 30 , ei. 2 . - s. 475-481 . doi : 10.1093 / nar/30.2.475 . — PMID 11788710 .
  43. 1 2 Won J., Yim J., Kim TK Sp1 ja Sp3 värväävät histonideasetylaasin repressoimaan ihmisen telomeraasikäänteiskopioijaentsyymin (hTERT) promoottorin transkriptiota normaaleissa ihmisen somaattisissa soluissa  (englanniksi)  // J. Biol. Chem.  : päiväkirja. — Voi. 277 , no. 41 . - P. 38230-38238 . - doi : 10.1074/jbc.M206064200 . — PMID 12151407 .
  44. 1 2 Sun JM, Chen HY, Moniwa M., Litchfield DW, Seto E., Davie JR Transkriptionaalinen repressori Sp3 liittyy CK2-fosforyloituun histonideasetylaasiin 2  //  J. Biol. Chem.  : päiväkirja. — Voi. 277 , no. 39 . - P. 35783-35786 . - doi : 10.1074/jbc.C200378200 . — PMID 12176973 .
  45. Tsai SC, Valkov N., Yang WM, Gump J., Sullivan D., Seto E. Histonideasetylaasi on vuorovaikutuksessa suoraan DNA topoisomerase II:n kanssa   // Nat . Genet.  : päiväkirja. — Voi. 26 , nro. 3 . - s. 349-353 . - doi : 10.1038/81671 . — PMID 11062478 .
  46. Yang WM, Yao YL, Sun JM, Davie JR, Seto E. Ihmisen histonideasetylaasigeeniperheen lisäjäsentä vastaavien cDNA:iden eristäminen ja karakterisointi  //  J. Biol. Chem.  : päiväkirja. — Voi. 272 , nro. 44 . - P. 28001-28007 . doi : 10.1074 / jbc.272.44.28001 . — PMID 9346952 .
  47. Yao YL, Yang WM, Seto E. Transkriptiotekijän YY1 säätely asetyloimalla ja deasetyloimalla   // Mol . solu. Biol. : päiväkirja. — Voi. 21 , ei. 17 . - P. 5979-5991 . - doi : 10.1128/mcb.21.17.5979-5991.2001 . — PMID 11486036 .
  48. Kalenik JL, Chen D., Bradley ME, Chen SJ, Lee TC Hiiva-kaksihybridikloonaus uudesta sinkkisormiproteiinista, joka on vuorovaikutuksessa monifunktionaalisen transkriptiotekijän YY1 kanssa  // Nucleic Acids Res  . : päiväkirja. — Voi. 25 , ei. 4 . - s. 843-849 . doi : 10.1093 / nar/25.4.843 . — PMID 9016636 .

Kirjallisuus