Ei-homologinen loppuliitos

Non -homologous end joining [1] tai ei- homologinen pään liitos [2] ( englanniksi  non-homologous end joining, NHEJ ) on yksi tavoista korjata kaksisäikeiset katkeamat DNA :ssa . Tätä prosessia kutsutaan ei-homologiseksi, koska ketjun vaurioituneet päät yhdistetään ligaasilla suoraan, ilman homologisen templaatin tarvetta, toisin kuin homologisen rekombinaatioprosessin [3] [4] [5] [6] . NHEJ on huomattavasti vähemmän tarkka kuin homologinen rekombinaatio ja johtaa usein nukleotidien menetykseen , translokaatioihintai telomeerien fuusio , kun taas kaksi viimeistä voivat olla merkkejä kasvainsolusta [7] . NHEJ :tä löytyy kaikkien luonnonvaltakuntien edustajista , lisäksi nisäkässoluissa se toimii pääasiallisena tapana korjata kaksisäikeisten katkeamisia [8] .

Prokaryooteissa

Monilla bakteerilajilla , mukaan lukien Escherichia colilla , ei ole NHEJ:tä, ja siksi niiden on turvauduttava vain homologiseen rekombinaatioon, jos bakteerin DNA vahingoittuu . NHEJ:hen osallistuvia proteiineja on kuitenkin löydetty joistakin bakteereista, kuten Bacillus subtilis , Mycobacterium tuberculosis ja Mycobacterium smegmatis [9] [10] . Bakteerit käyttävät erittäin kompaktia versiota NHEJ:stä, jossa kaikki tarvittavat toiminnot suorittaa vain kaksi proteiinia: Ku - proteiinin heterodimeeri ja monifunktionaalinen ligaasi / polymeraasi / nukleaasi LigD [11] . Mykobakteereissa NHEJ on paljon alttiimpi virheille kuin hiivassa [10] . Monet bakteerit, joilla on NHEJ-proteiineja, viettävät merkittävän osan elinkaarestaan ​​stationäärisessä haploidisessa tilassa, jolloin rekombinaatiomallia ei ole saatavilla ja homologinen rekombinaatio on mahdotonta [9] . On mahdollista, että näissä bakteereissa NHEJ auttaa korjaamaan kuivauksen aikana tapahtuvia kaksisäikeisten katkeamista [12] . Corndog ja Omega, kaksi sukua Mycobacterium smegmatis -bakteerin bakteriofagia , käyttävät myös NHEJ:tä avaamaan genominsa infektion aikana [13] .

NHEJ on myös yksi keino korjata kaksisäikeiset katkokset arkeissa . Arkeassa NHEJ sisältää myös Ku-proteiinien katkeamien päiden sitomisen ja säilyttämisen, mitä seuraa aukkojen täyttö. Arkeassa Ku sitoo eksonukleaasin lyhentämät päät siten, että muodostuu esiin työntyvä 3'-pää, jota voidaan pidentää DNA-juosteen synteesillä siten, että vanha juoste korvataan DNA-polymeraasilla [14] .

Eukaryooteissa

Toisin kuin bakteerit, eukaryoottinen NHEJ käyttää laajaa valikoimaa proteiineja, jotka osallistuvat seuraaviin vaiheisiin [15] :

Kun NHEJ-mekanismi on epäaktiivinen, kaksisäikeiset katkokset voidaan korjata vaihtoehtoisella, virhealttiimmalla tavalla, mikrohomologiavälitteisellä pääteliitännällä ( MMEJ ) .  Tällä tavalla katkon molemmille puolille muodostuu ensin lyhyet homologiset sekvenssit (mikrohomologiat), jotka sitten leikataan korjauksen aikana [16] .

Sidonta ja päiden kiinnitys

Hiivassa MRX -kompleksi, joka koostuu Mre11-, Rad50- ja Xrs2-proteiineista, värvätään korjausprosessiin varhaisessa vaiheessa, ja sen uskotaan auttavan DNA-päiden ketjuttamista [17] . Vastaava kompleksi nisäkkäissä, joka tunnetaan nimellä ( MRN ) -kompleksi, koostuu Mre11-, Rad50- ja Nbs1- proteiineista ja on myös osallisena NHEJ:ssä, mutta se voi toimia myös prosessin muissa vaiheissa sen lisäksi, että se pitää katkaisupäät lähettyvillä. toisiaan [18] .

Eukaryoottinen Ku-proteiini on Ku70 :n ja Ku80 :n heterodimeeri, joka muodostaa kompleksin DNA-riippuvaisen proteiinikinaasin kanssa, jota esiintyy nisäkkäissä, mutta jota ei ole hiivassa. Ku-proteiini on korin muotoinen ja "liuku" pitkin DNA-juostetta. Itse asiassa se toimii sensorina, joka havaitsee DNA-vaurion [1] . Se voi toimia myös muiden NHEJ:hen osallistuvien molekyylien telakointipaikkana , ja se on myös vuorovaikutuksessa DNA-ligaasi IV -kompleksin ja XLF -proteiinin kanssa [19] [20] .

DNA-riippuvainen proteiinikinaasi DNA-PK

Eukaryooteissa DNA-riippuvaisella proteiinikinaasilla DNA-PK, joka koostuu DNA-PKcs-katalyyttisestä alayksiköstä fuusioituna Ku80 -proteiinin C-päähän, on keskeinen rooli NHEJ:n korjauksessa ja vasteessa DNA-vaurioille . DNA-PKcs rekrytoidaan Ku80-proteiinin C-päähän Ku70/Ku80-kompleksin muodostumisen jälkeen DNA:n kaksoisjuostekatkon päissä. DNA-PKcs autofosforyloi ja fosforyloi sitten useita proteiineja, jotka osallistuvat DNA-vauriovasteeseen, mukaan lukien Artemis [21] proteiini . DNA-riippuvaisten proteiinikinaasien uskotaan myös osallistuvan päiden yhdistämiseen NHEJ:n aikana [22] .

Käsittelytauko päättyy

Loppukäsittely sisältää muutaman nukleotidin poistamisen ulokkeista nukleaasilla ja kaksijuosteisen rakenteen korjaamisen DNA-polymeraasilla . Tämä vaihe ei ole välttämätön, jos päät ovat jo yhteensopivia, ts. niissä on vapaa 3'- hydroksyyli- ja 5' -fosfaattiryhmä . Esimerkiksi DNA-riippuvaisen proteiinikinaasin aktivoima Artemis -proteiini voi toimia sekä endonukleaasina että eksonukleaasina V(D)J-rekombinaation aikana . Mre11:llä on nukleaasiaktiivisuutta, mutta se näyttää osallistuvan homologiseen rekombinaatioon NHEJ:n sijaan. Seuraavaksi DNA-polymeraasit λ ja μ (Pol4 hiivassa) palauttavat kaksijuosteisen DNA-rakenteen esiin työntyvien yksijuosteisten päiden tilalle. Siten katkoksen päät tehdään tylsiksi [5] [23] [24] [1] .

Ligaatio

DNA-ligaasi IV -kompleksi, joka koostuu DNA-ligaasi IV:n katalyyttisestä alayksiköstä [ ja kofaktorista XRCC4 (Dnl4 ja Lif1 hiivassa), suorittaa ligoinnin NHEJ:n viimeisessä vaiheessa [25] . Se sisältää myös XLF -proteiinin (hiivassa Nej1) [26] [27] . XLF:n tarkkaa roolia ei tunneta, mutta sen tiedetään olevan vuorovaikutuksessa XRCC4/DNA-ligaasi IV -kompleksin kanssa ja todennäköisesti osallistuu ligaatioprosessiin [28] . Viimeaikaiset todisteet viittaavat siihen, että XLF edistää DNA-ligaasi IV:n readenylaatiota ligoinnin jälkeen "lataamalla" sen niin, että se voi katalysoida toisen ligaation [29] .

Asetus

Valinta DNA-vaurion homologisen ja ei-homologisen korjauksen välillä säädellään rekombinaation alkuvaiheessa, yksijuosteisten ulkonevien alueiden leikkaamisessa. Leikkaamattomat päät voidaan yhdistää NHEJ:llä, ja jopa muutaman nukleotidin poistaminen trimmausvaiheen aikana tukahduttaa NHEJ:n, ja korjaus suoritetaan homologisella rekombinaatiolla [24] . NHEJ voi esiintyä koko solusyklin ajan , mutta se on aktiivisin G1 - vaiheessa, kun homologiselle rekombinaatiolle ei ole saatavilla templaatteja. Tärkeä rooli NHEJ:n säätelyssä on sykliinistä riippuvaisella kinaasilla 1 (Cdk1; hiivassa cdc28), joka kytkeytyy pois päältä G1-vaiheessa ja ilmentyy S- ja G2 - vaiheissa. Cdk1 fosforyloi Sae2-nukleaasia, joka laukaisee pään trimmauksen [30] .

NHEJ-reitin laukeaminen alkaa 53BP1 -proteiinin kerääntymisestä vaurioituneelle alueelle , mikä edistää kaksijuosteisen katkeamisen korjaamista edelleen NHEJ-reittiä pitkin. Päiden leikkaamishetkeen asti siirtyminen homologiseen rekombinaatioon on mahdollista, mikä saavutetaan houkuttelemalla 53BP1-antagonistiproteiinia - BRCA1 vaurioituneelle alueelle . Jos BRCA1 syrjäyttää 53BP1:n, kaksisäikeinen katkeaminen korjataan homologisella rekombinaatiolla [31] . 53BP1:n ja BRCA1:n lisäksi RIF1- proteiinit ja CtIP, nukleaasi , joka osallistuu homologisen rekombinaation ensimmäisissä vaiheissa lopettamiseen, ovat mukana valittaessa polkua kaksijuosteisen katkeamisen korjaamiseksi. Siten 53BP1 ja RIF1 ohjaavat pelkistystä pitkin ei-homologisen pään liittymisreittiä, kun taas BRCA1 ja CtIP ohjaavat pelkistystä pitkin homologista rekombinaatioreittiä [32] .

Homologista rekombinaatiota kaksoisjuostekatkojen korjaamiseksi voidaan käyttää vain S- ja G2-vaiheissa , kun DNA:n kaksinkertaitumisen seurauksena ilmaantuu templaatti korjausta varten (täten koko solusyklin ajan aktiivinen NHEJ on tärkein mekanismi kaksisäikeisten katkeamien korjaamiseksi nisäkässoluissa). Poikkeuksia ovat genomin alueet, jotka sisältävät toistoja, kuten rRNA :ta (rDNA) koodaavien geenien toistot. rDNA:ssa malli, jolla korjataan toiston kaksijuosteinen katkeaminen, on käytettävissä koko solusyklin ajan ; se voi olla mikä tahansa muu toisto. rDNA:n tapauksessa NHEJ eliminoi pienet leesiot nopeasti tuman sisällä ( NHEJ -virtausaika on noin 30 minuuttia ja homologinen rekombinaatio noin 7 tuntia), kun taas suuret ja monimutkaiset leesiot liikkuvat säiekeskusten proteiinien mukana. tiheä fibrillaarikomponentti reunalle muodostaen ns. nukleolaarisen korkin. Nukleolaarisessa korkissa esiintyy kaikki paitsi aivan ensimmäiset homologisen rekombinaation vaiheet, jolloin rDNA-toistot lähestyvät, mikä edistää rekombinaatiota. NHEJ:tä ei esiinny nukleolaarisissa korkissa [33] . Kaksisäikeisen katkoksen korjauspolun valintaan vaikuttaa myös vaurion monimutkaisuus. NHEJ:tä käytetään tyypillisesti pienten leesioiden korjaamiseen [34] .

V(D)J-rekombinaatio

NHEJ:llä on tärkeä rooli V(D)J-rekombinaatiossa  , prosessissa, jolla luodaan erilaisia ​​B -solu- ja T- solureseptoreita selkärankaisten immuunijärjestelmässä [35] . Prosessin alussa RAG1/RAG2- nukleaasit luovat hiusneulasuojattuja kaksisäikeisiä katkoksia tiettyjen signaalisekvenssien alueelle [36]. Seuraavaksi Artemis-nukleaasi leikkaa hiusneulat, ja tuloksena olevat päät liitetään NHEJ:llä [ 36]. 37] . Erikoistunut DNA-polymeraasi, nimeltään terminaalinen deoksinukleotiditransferaasi , joka toimii vain imukudoksissa, lisää ei-templaattinukleotidejä ketjun päihin ennen kuin viimeksi mainitut yhdistetään. Tämä prosessi järjestää uudelleen ja yhdistää V (muuttuva), D (diversiteetti) ja J (liittyvät) alueet, joista sitten luetaan T-solu- ja B-solureseptorien vaihteleva alue. Toisin kuin tyypillinen NHEJ, jossa tarkka korjaus on edullisin tulos, V(D)J-rekombinaation kannalta on hyödyllisempää, että NHEJ toimii virheiden kanssa, koska tämä lisää geeniä koodaavien sekvenssien monimuotoisuutta [ 38] [39] .

Telomeereissä

Telomeerit on yleensä suojattu erityisellä proteiinin "korkilla", joten niitä ei tunnisteta kaksisäikeisiksi katkeiksi. Korkin menetys aiheuttaa telomeerien lyhenemisen ja niiden yhteyden NHEJ:n kautta, mikä johtaa kaksikeskisen kromosomin muodostumiseen, joka katkeaa mitoosin aikana . Kummallista kyllä, jotkut NHEJ-proteiinit osallistuvat telomeerikorkin muodostumiseen. Esimerkiksi telomeereissä sijaitsevan Ku:n poisto johtaa niiden lyhentymiseen [40] .

Kliininen merkitys

Useat ihmisen sairaudet liittyvät NHEJ:n toimintahäiriöön [41] . Mutaatiot, jotka vaikuttavat LIG4:ään ja XLF:ään, ovat vastuussa LIG4-oireyhtymästä ja XLF:ään liittyvästä vakavasta yhdistetystä immuunikatotilasta (SCID). Näillä oireyhtymillä on monia tunnusomaisia ​​piirteitä, mukaan lukien solujen säteilyherkkyys, mikrokefalia ja SCID, jotka johtuvat V(D)J-rekombinaation puutteista. Artemiksen mutaatiot johtavat myös SCID:hen, mutta ne eivät kehitä neurologisia vikoja kuten LIG4- ja XLF-mutaatiot. Taudin vakavuuden ero voidaan selittää mutatoituneiden proteiinien roolilla: Artemis on nukleaasi, jota todennäköisesti tarvitaan vain vaurioituneiden päiden kaksisäikeisten katkeamien korjaamiseen, kun taas sekä DNA-ligaasi IV että XLF ovat mukana kaikissa NHEJ-muunnelmissa. NHEJ-proteiinien mutaatiot voivat myös johtaa ataksia-telangiektasiaan , Fanconi-anemiaan ja perinnölliseen rinta- ja munasarjasyöpään . XRCC4:n tai LIG4 :n aiheuttamat hiiret kuolivat alkionkehityksen aikana , joten NHEJ on elintärkeä prosessi nisäkkäille. Sitä vastoin hiiret, joista puuttui Ku- tai DNA-riippuvainen proteiinikinaasi, olivat elinkelpoisia, luultavasti siksi, että NHEJ voi edelleen esiintyä ilman näitä proteiineja, vaikkakin alhaisella tasolla [42] .

Vaikutukset ikääntymiseen

Kehitettiin järjestelmä mittaamaan NHEJ:n tehokkuutta hiiren soluissa [43] . Sen avulla voidaan verrata NHEJ:n tehokkuutta eri kudoksissa ja eri-ikäisillä hiirillä. NHEJ on aktiivisin ihosoluissa , keuhkojen ja munuaisten fibroblasteissa ja huomattavasti vähemmän sydämen fibroblasteissa ja aivojen astrosyyteissä . Lisäksi NHEJ:n tehokkuus laskee iän myötä 1,8-3,8 kertaa kudoksesta riippuen. NHEJ:n tehon heikkeneminen johtaa korjaamattomien tai huonosti korjattujen DNA-osien lisääntymiseen, mikä edistää merkittävästi ikääntymistä . On osoitettu, että Ku80 ekspressoituu merkittävästi eri tasoilla ihmisissä, lehmissä ja hiirissä, ja tämä taso liittyy elinikään [44] [45] .

Opiskeluhistoria

Ensimmäiset todisteet siitä, että Ku-proteiinit ovat vuorovaikutuksessa aukon sisältävien lineaaristen ja pyöreiden DNA-fragmenttien kanssa, saatiin 1980-1990-luvuilla. Vuonna 1986 Ku:n osoitettiin sitovan taukoja erittäin tehokkaasti: 40 femtomoolia Ku:ta sitoo 90 % DNA-päistä näytteessä, jonka DNA-pitoisuus on 25 femtomoolia. Samaan aikaan osoitettiin, että nippittömät pyöreät plasmidit eivät ole vuorovaikutuksessa Ku-proteiinien kanssa, vaan alkavat sitoa Ku:ta sen jälkeen, kun niitä on käsitelty restriktioendonukleaaseilla . Myöhemmin osoitettiin, että Ku-proteiinit sitovat nopeasti kaksijuosteisen katkeamisen päät ja pitävät niitä lähellä toisiaan, mikä mahdollistaa niiden yhdistymisen edelleen, eli katkoksen korjaamisen [46] . Vuonna 1996 J. K. Moore ja J. E. Haber loivat termin "ei-homologinen pään liitos" osoittamaan uutta reittiä kaksisäikeisen katkeamisen korjaamiseen [3] .

Muistiinpanot

  1. ↑ 1 2 3 Krebs, Goldstein, Kilpatrick, 2017 , s. 406.
  2. ↑ Proshkina, Yuraneva, Moskalev, 2018 , s. 22.
  3. ↑ 1 2 Moore JK , Haber JE Saccharomyces cerevisiaen kaksoisjuostekatkojen ei-homologisen päiden yhdistämisen kahden polun solusykli ja geneettiset vaatimukset.  (englanniksi)  // Molecular and Cellular Biology. - 1996. - toukokuu ( osa 16 , nro 5 ). - s. 2164-2173 . — PMID 8628283 .
  4. ↑ Boulton SJ , Jackson SP Saccharomyces cerevisiae Ku70 tehostaa laittoman DNA:n kaksijuosteisen katkeamisen korjausta ja toimii esteenä virhealttiille DNA-korjausreiteille.  (englanniksi)  // The EMBO Journal. - 1996. - 16. syyskuuta ( osa 15 , nro 18 ). - P. 5093-5103 . — PMID 8890183 .
  5. ↑ 1 2 Wilson TE , Lieber MR Tehokas DNA-päiden prosessointi hiivan ei-homologisen päiden liittämisen aikana. Todisteita DNA-polymeraasi beeta (Pol4) -riippuvaisesta reitistä.  (englanniksi)  // The Journal Of Biological Chemistry. - 1999. - 13. elokuuta ( nide 274 , nro 33 ). - P. 23599-23609 . — PMID 10438542 .
  6. ↑ Budman J. , Chu G. DNA:n prosessointi ei-homologiseen pään liittämiseen soluttomalla uutteella.  (englanniksi)  // The EMBO Journal. - 2005. - 23. helmikuuta ( osa 24 , nro 4 ). - s. 849-860 . - doi : 10.1038/sj.emboj.7600563 . — PMID 15692565 .
  7. ↑ Espejel S. , Franco S. , Rodríguez-Perales S. , Bouffler SD , ​​Cigudosa JC , Blasco MA Mammalian Ku86 välittää kriittisen lyhyiden telomeerien aiheuttamia kromosomifuusioita ja apoptoosia.  (englanniksi)  // The EMBO Journal. - 2002. - 1. toukokuuta ( nide 21 , nro 9 ). - P. 2207-2219 . - doi : 10.1093/emboj/21.9.2207 . — PMID 11980718 .
  8. ↑ Guirouilh-Barbat J. , Huck S. , Bertrand P. , Pirzio L. , Desmaze C. , Sabatier L. , Lopez BS KU80-reitin vaikutus NHEJ-indusoituihin genomin uudelleenjärjestelyihin nisäkässoluissa.  (englanniksi)  // Molecular Cell. - 2004. - 4. kesäkuuta ( nide 14 , nro 5 ). - s. 611-623 . - doi : 10.1016/j.molcel.2004.05.008 . — PMID 15175156 .
  9. ↑ 1 2 Weller GR , Kysela B. , Roy R. , Tonkin LM , Scanlan E. , Della M. , Devine SK , Day JP , Wilkinson A. , d'Adda di Fagagna F. , Devine KM , Bowater RP , Jeggo PA , Jackson SP , Doherty AJ DNA:n ei-homologisen loppuliitoskompleksin tunnistaminen bakteereissa.  (englanti)  // Tiede (New York, NY). - 2002. - 6. syyskuuta ( nide 297 , nro 5587 ). - s. 1686-1689 . - doi : 10.1126/tiede.1074584 . — PMID 12215643 .
  10. ↑ 1 2 Gong C. , Bongiorno P. , Martins A. , Stephanou NC , Zhu H. , Shuman S. , Glickman MS Mykobakteerien epähomologisen pään liittämisen mekanismi: Ku:n, ligaasi D:n ja ligase C.  (englanti)  // Nature Structural & Molecular Biology. - 2005. - huhtikuu ( osa 12 , nro 4 ). - s. 304-312 . doi : 10.1038 / nsmb915 . — PMID 15778718 .
  11. ↑ Della M. , Palmbos PL , Tseng HM , Tonkin LM , Daley JM , Topper LM , Pitcher RS , Tomkinson AE , Wilson TE , Doherty AJ Mycobacterial Ku ja ligaasiproteiinit muodostavat kaksikomponenttisen NHEJ-korjauskoneen.  (englanti)  // Tiede (New York, NY). - 2004. - 22. lokakuuta ( nide 306 , nro 5696 ). - s. 683-685 . - doi : 10.1126/tiede.1099824 . — PMID 15499016 .
  12. ↑ Kannu RS , Green AJ , Brzostek A. , Korycka-Machala M. , Dziadek J. , Doherty AJ NHEJ suojaa mykobakteereja stationäärivaiheessa kuivumisen haitallisilta vaikutuksilta.  (englanniksi)  // DNA Repair. - 2007. - 1. syyskuuta ( osa 6 , nro 9 ). - s. 1271-1276 . - doi : 10.1016/j.dnarep.2007.02.009 . — PMID 17360246 .
  13. ↑ Pitcher RS , Tonkin LM , Daley JM , Palmbos PL , Green AJ , Velting TL , Brzostek A. , Korycka-Machala M. , Cresawn S. , Dziadek J. , Hatfull GF , Wilson TE , Doherty AJ exploitbacteriophage helpottaa genomin kiertoa.  (englanniksi)  // Molecular Cell. - 2006. - 1. syyskuuta ( osa 23 , nro 5 ). - s. 743-748 . - doi : 10.1016/j.molcel.2006.07.009 . — PMID 16949369 .
  14. ↑ Marshall Craig J. , Santangelo Thomas J. Archaeal DNA Repair Mechanisms   // Biomolecules . - 2020. - 23. lokakuuta ( osa 10 , nro 11 ). - s. 1472 . — ISSN 2218-273X . - doi : 10.3390/biom10111472 .
  15. ↑ Davis Anthony J. , Chen Benjamin PC , Chen David J. DNA-PK: Dynaaminen entsyymi monipuolisessa DSB-korjausreitissä  //  DNA Repair. - 2014. - toukokuu ( osa 17 ). - s. 21-29 . — ISSN 1568-7864 . - doi : 10.1016/j.dnarep.2014.02.020 .
  16. ↑ McVey M. , Lee SE MMEJ kaksisäikeisten katkosten korjaus (ohjaajan leikkaus): poistetut sekvenssit ja vaihtoehtoiset päätteet.  (englanniksi)  // Trends In Genetics : TIG. - 2008. - marraskuu ( osa 24 , nro 11 ). - s. 529-538 . - doi : 10.1016/j.tig.2008.08.007 . — PMID 18809224 .
  17. ↑ Chen L. , Trujillo K. , Ramos W. , Sung P. , Tomkinson AE Dnl4-katalysoidun DNA-pään yhdistämisen edistäminen Rad50/Mre11/Xrs2- ja Hdf1/Hdf2-kompleksien avulla.  (englanniksi)  // Molecular Cell. - 2001. - marraskuu ( osa 8 , nro 5 ). - s. 1105-1115 . — PMID 11741545 .
  18. ↑ Zha S. , Boboila C. , Alt FW Mre11: roolit DNA:n korjauksessa homologisen rekombinaation ulkopuolella.  (englanti)  // Nature Structural & Molecular Biology. - 2009. - elokuu ( osa 16 , nro 8 ) — s. 798-800 . - doi : 10.1038/nsmb0809-798 . — PMID 19654615 .
  19. ↑ Palmbos PL , Wu D. , Daley JM , Wilson TE Saccharomyces cerevisiae Dnl4-Lif1 -kompleksin rekrytointi kaksijuosteiseen katkaisuun vaatii vuorovaikutusta Yku80:n ja Xrs2 FHA -domeenin kanssa.  (englanniksi)  // Genetiikka. - 2008. - Joulukuu ( osa 180 , nro 4 ). - P. 1809-1819 . - doi : 10.1534/genetics.108.095539 . — PMID 18832348 .
  20. ↑ Yano K. , Morotomi-Yano K. , Wang SY , Uematsu N. , Lee KJ , Asaithamby A. , Weterings E. , Chen DJ Ku värvää XLF:n DNA:n kaksisäikeisiin katkoksiin.  (englanniksi)  // EMBO Reports. - 2008. - tammikuu ( osa 9 , nro 1 ) - s. 91-96 . - doi : 10.1038/sj.embor.7401137 . — PMID 18064046 .
  21. ↑ Chirgadze DY et ai. DNA-PKcs, allosteria ja DNA:n kaksoisjuostekatkon korjaus: rakenteen määrittely ja vaiheen asettaminen  //  Methods in Enzymology. - 2017. - Vol. 592 . - s. 145-157 . - doi : 10.1016/bs.mie.2017.04.001 .
  22. ↑ DeFazio LG , Stansel RM , Griffith JD , Chu G. DNA:n synapsis päättyy DNA-riippuvaisen proteiinikinaasin toimesta.  (englanniksi)  // The EMBO Journal. - 2002. - 17. kesäkuuta ( nide 21 , nro 12 ). - s. 3192-3200 . - doi : 10.1093/emboj/cdf299 . — PMID 12065431 .
  23. ↑ Nick McElhinny SA , Ramsden DA Sisarusten välinen kilpailu: Pol X -perheen jäsenten välinen kilpailu V(D)J-rekombinaatiossa ja yleisessä kaksisäikeisen katkeamisen korjauksessa.  (englanniksi)  // Immunological Reviews. - 2004. - elokuu ( nide 200 ). - s. 156-164 . - doi : 10.1111/j.0105-2896.2004.00160.x . — PMID 15242403 .
  24. ↑ 1 2 Daley JM , Laan RL , Suresh A. , Wilson TE Pol X -perheen polymeraasitoiminnan DNA-nivelriippuvuus ei-homologisessa pään liittämisessä.  (englanniksi)  // The Journal Of Biological Chemistry. - 2005. - 12. elokuuta ( nide 280 , nro 32 ). - P. 29030-29037 . - doi : 10.1074/jbc.M505277200 . — PMID 15964833 .
  25. ↑ Wilson TE , Grawunder U. , Lieber MR Hiivan DNA-ligaasi IV välittää ei-homologisen DNA-pään liittymistä.  (englanniksi)  // Luonto. - 1997. - 31. heinäkuuta ( nide 388 , nro 6641 ). - s. 495-498 . - doi : 10.1038/41365 . — PMID 9242411 .
  26. ↑ Ahnesorg P. , Smith P. , Jackson SP XLF on vuorovaikutuksessa XRCC4-DNA-ligaasi IV -kompleksin kanssa edistääkseen DNA:n ei-homologista pääteyhdistystä.  (englanniksi)  // Solu. - 2006. - 27. tammikuuta ( nide 124 , nro 2 ). - s. 301-313 . - doi : 10.1016/j.cell.2005.12.031 . — PMID 16439205 .
  27. ↑ Buck D. , Malivert L. , de Chasseval R. , Barraud A. , Fondanèche MC , Sanal O. , Plebani A. , Stéphan JL , Hufnagel M. , le Deist F. , Fischer A. , ​​Durandy A. , de Villartay JP , Revy P. Cernunnos, uusi ei-homologinen pään yhdistävä tekijä, on mutatoitunut ihmisen immuunipuutoksessa mikrokefalian kanssa.  (englanniksi)  // Solu. - 2006. - 27. tammikuuta ( nide 124 , nro 2 ). - s. 287-299 . - doi : 10.1016/j.cell.2005.12.030 . — PMID 16439204 .
  28. ↑ Callebaut I. , Malivert L. , Fischer A. , ​​Mornon JP , Revy P. , de Villartay JP Cernunnos on vuorovaikutuksessa XRCC4 x DNA-ligaasi IV -kompleksin kanssa ja on homologinen hiivan ei-homologiselle päänliitostekijälle Nej1.  (englanniksi)  // The Journal Of Biological Chemistry. - 2006. - 19. toukokuuta ( nide 281 , nro 20 ). - P. 13857-13860 . - doi : 10.1074/jbc.C500473200 . — PMID 16571728 .
  29. ↑ Riballo E. , Woodbine L. , Stiff T. , Walker SA , Goodarzi AA , Jeggo PA XLF-Cernunnos edistää DNA-ligaasin IV-XRCC4 uudelleenadenylaatiota ligaation jälkeen.  (englanniksi)  // Nucleic Acids Research. - 2009. - Helmikuu ( osa 37 , nro 2 ) - s. 482-492 . doi : 10.1093 / nar/gkn957 . — PMID 19056826 .
  30. ↑ Mimitou EP , Symington LS DNA:n loppuresektio: monet nukleaasit tekevät kevyen työn.  (englanniksi)  // DNA-korjaus. - 2009. - Vol. 8, ei. 9 . - s. 983-995. - doi : 10.1016/j.dnarep.2009.04.017 . — PMID 19473888 .
  31. ↑ Ragu Sandrine , Matos-Rodrigues Gabriel , Thomas Melissa , Lopez Bernard S. Homologinen rekombinaatio nisäkässoluissa: Molekyylimekanismeista patologiaan  //  Genome Stability. - 2021. - S. 367-392 . - doi : 10.1016/B978-0-323-85679-9.00020-9 .
  32. ↑ Decottignies A. Vaihtoehtoiset päiden yhdistämismekanismit: historiallinen näkökulma.  (englanniksi)  // Genetiikan rajat. - 2013. - Vol. 4 . - s. 48-48 . - doi : 10.3389/fgene.2013.00048 . — PMID 23565119 .
  33. ↑ Blokhina Yana P. , Buchwalter Abigail. Liikkuvat nopeasti ja rikkoutuvat asiat: DNA-vaurioiden esiintyminen ja korjaaminen ribosomaalisissa DNA-toistoissa  //  Mutaatiotutkimus / Mutageneesin perus- ja molekyylimekanismit. - 2020. - toukokuu ( osa 821 ). — P. 111715 . — ISSN 0027-5107 . - doi : 10.1016/j.mrfmmm.2020.111715 .
  34. ↑ Shibata A. , Conrad S. , Birraux J. , Geuting V. , Barton O. , Ismail A. , Kakarougkas A. , Meek K. , Taucher-Scholz G. , Löbrich M. , Jeggo PA Tekijät, jotka määrittävät DNA:n kaksois- säikeen katkeamisen korjausreitin valinta G2-vaiheessa.  (englanniksi)  // The EMBO Journal. - 2011. - 16. maaliskuuta ( nide 30 , nro 6 ). - s. 1079-1092 . - doi : 10.1038/emboj.2011.27 . — PMID 21317870 .
  35. ↑ Jung D. , Alt FW Unraveling V(D)J rekombinaatio; näkemyksiä geenisäätelystä.  (englanniksi)  // Solu. - 2004. - 23. tammikuuta ( nide 116 , nro 2 ). - s. 299-311 . — PMID 14744439 .
  36. ↑ Schatz DG , Baltimore D. Immunoglobuliinigeenin V(D)J-rekombinaasiaktiivisuuden vakaa ilmentyminen geeninsiirrolla 3T3-fibroblasteihin.  (englanniksi)  // Solu. - 1988. - 8. huhtikuuta ( nide 53 , nro 1 ). - s. 107-115 . — PMID 3349523 .
  37. ↑ Ma Y. , Pannicke U. , Schwarz K. , Lieber MR Hiusneulan avautumisen ja ylityksen käsittely Artemis/DNA-riippuvaisella proteiinikinaasikompleksilla ei-homologisessa pään liittämisessä ja V(D)J-rekombinaatiossa.  (englanniksi)  // Solu. - 2002. - 22. maaliskuuta ( nide 108 , nro 6 ). - s. 781-794 . — PMID 11955432 .
  38. ↑ Gilfillan S. , Dierich A. , Lemeur M. , Benoist C. , Mathis D. Hiiret, joista puuttuu TdT: kypsät eläimet, joilla on epäkypsä lymfosyyttivalikoima.  (englanti)  // Tiede (New York, NY). - 1993. - 27. elokuuta ( nide 261 , nro 5125 ). - s. 1175-1178 . — PMID 8356452 .
  39. ↑ Komori T. , Okada A. , Stewart V. , Alt F. W. N-alueiden puute TdT-puutteisten lymfosyyttien antigeenireseptorin vaihtelevan alueen geeneissä.  (englanti)  // Tiede (New York, NY). - 1993. - 27. elokuuta ( nide 261 , nro 5125 ). - s. 1171-1175 . — PMID 8356451 .
  40. ↑ Boulton SJ , Jackson SP Ku-riippuvaisen ei-homologisen päiden liitosreitin komponentit osallistuvat telomeerisen pituuden ylläpitoon ja telomeerien hiljentämiseen.  (englanniksi)  // The EMBO Journal. - 1998. - 16. maaliskuuta ( osa 17 , nro 6 ). - P. 1819-1828 . - doi : 10.1093/emboj/17.6.1819 . — PMID 9501103 .
  41. ↑ Kerzendorfer C. , O'Driscoll M. Ihmisen DNA-vauriovaste ja korjauspuutosoireyhtymät: genomisen epävakauden ja solusyklin tarkistuspisteiden pätevyyden yhdistäminen.  (englanniksi)  // DNA Repair. - 2009. - 2. syyskuuta ( osa 8 , nro 9 ) - s. 1139-1152 . - doi : 10.1016/j.dnarep.2009.04.018 . — PMID 19473885 .
  42. ↑ Lees D. , Lepage P. Korvaavatko robotit koskaan avustajia? Robottien nykyisten valmiuksien ja tulevaisuuden potentiaalin tutkiminen koulutuksessa ja kuntoutuksessa.  (englanniksi)  // International Journal Of Rehabilitation Research. Internationale Zeitschrift Fur Rehabilitationsforschung. Revue Internationale De Recherches De Readaptation. - 1994. - Joulukuu ( osa 17 , nro 4 ). - s. 285-304 . — PMID 7875923 .
  43. ↑ Vaidya A. , Mao Z. , Tian X. , Spencer B. , Seluanov A. , Gorbunova V. Knock-in reportterihiiret osoittavat, että DNA:n korjaus ei-homologisen pään liittämisellä heikkenee iän myötä.  (englanniksi)  // PLoS Genetics. - 2014. - Heinäkuu ( osa 10 , nro 7 ). - P. e1004511-1004511 . - doi : 10.1371/journal.pgen.1004511 . — PMID 25033455 .
  44. ↑ Gorbunova V. , Seluanov A. , Mao Z. , Hine C. DNA:n korjauksen muutokset ikääntymisen aikana  //  Nucleic Acids Research. - 2007. - 26. marraskuuta ( nide 35 , nro 22 ). - P. 7466-7474 . — ISSN 0305-1048 . - doi : 10.1093/nar/gkm756 .
  45. ↑ Lorenzini A. , Johnson FB , Oliver A. , ​​Tresini M. , Smith JS , Hdeib M. , Sell C. , Cristofalo VJ , Stamato TD Merkittävä korrelaatio lajien pitkäikäisyydessä DNA:n kaksoisjuosteen katkeamisen tunnistamisen kanssa, mutta ei telomeerin pituuden kanssa.  (englanniksi)  // Ikääntymisen ja kehityksen mekanismit. - 2009. - marraskuu ( osa 130 , nro 11-12 ). - s. 784-792 . - doi : 10.1016/j.mad.2009.10.004 . — PMID 19896964 .
  46. ↑ Yang Kai , Guo Rong , Xu Dongyi. Ei-homologinen loppuliitos: edistysaskel ja rajat  //  Acta Biochimica et Biophysica Sinica. - 2016. - 23. toukokuuta ( nide 48 , nro 7 ). - s. 632-640 . — ISSN 1672-9145 . - doi : 10.1093/abbs/gmw046 .

Kirjallisuus

 DNA:n korjaus
Leikkauskorjaus
Muut korvaustyypit
Muut proteiinit
Säätö