RNA:n häiriö

RNA-häiriö ( eng.  RNA interference, RNAi ) on prosessi, jossa geenin ilmentymistä estetään mRNA :n transkription , translaation , deadenylaation tai hajoamisen vaiheessa käyttämällä pieniä RNA-molekyylejä.

RNA:n häiriöprosesseja on löydetty monien eukaryoottien soluista : eläimistä , kasveista ja sienistä . RNA-interferenssijärjestelmällä on tärkeä rooli solujen suojaamisessa viruksilta , loisgeeneiltä (  transposoneilta ) ja organismin geenien kehityksen , erilaistumisen ja ilmentymisen säätelyssä .

RNA-interferenssiprosessi alkaa Dicer - entsyymin vaikutuksesta , joka leikkaa pitkät kaksijuosteiset RNA-molekyylit (dsRNA) lyhyiksi 21–25 nukleotidin fragmenteiksi, joita kutsutaan siRNA :ksi . Toista kunkin fragmentin kahdesta juosteesta kutsutaan "oppaaksi", tämä yksijuosteinen RNA sisältyy edelleen RNA-proteiinikompleksiin RISC . RISC-aktiivisuuden seurauksena yksijuosteinen RNA-fragmentti sitoutuu mRNA-molekyylin komplementaariseen sekvenssiin ja saa Argonaute - proteiinin leikkaamaan mRNA:ta tai inhiboimaan translaatiota ja/tai mRNA:n deadenylaatiota. Nämä tapahtumat johtavat vastaavan geenin ilmentymisen suppressioon (hiljentymiseen), jonka tehokkuutta rajoittavat pienten RNA-molekyylien - siRNA:n ja mikroRNA :n - pitoisuudet .

RNA:n häiriön selektiivinen vaikutus geenien ilmentymiseen tekee RNAi:sta hyödyllisen työkalun soluviljelmiä ja eläviä organismeja käyttäviin tutkimuksiin, koska soluihin tuodut synteettiset kaksijuosteiset RNA:t aiheuttavat tiettyjen geenien suppressiota . RNAi:ta käytetään laajamittaiseen molekyylibiologian , biokemian , bioteknologian ja lääketieteen tutkimukseen . Esimerkiksi RNA-interferenssiä käytetään järjestelmällisesti "sammuttamaan" geenit soluista ja määrittämään geenien toiminnot solunjakautumisen tutkimuksessa .

Historiallisesti RNA-interferenssi on tunnettu post-transkriptionaalisena geenin hiljentämisenä . Vasta kun näitä oletettavasti toisiinsa liittymättömiä prosesseja tutkittiin, kävi selväksi, että ne kaikki kuvasivat RNAi:n ilmentymiä. Vuonna 2006 amerikkalaiset tiedemiehet Andrew Fire ja Craig Mello saivat Nobelin fysiologian tai lääketieteen palkinnon vuonna 1998 julkaistusta työstään RNA-häiriöiden tutkimiseksi Caenorhabditis elegansissa [1 ] .

Historia

Ennen RNA:n häiriön havaitsemista kasveissa kuvattiin antisense-RNA :iden transkription esto [4] . Petunian ( Petunia hybrida ) kukkien värin muuttamiseksi kasveihin tuotiin vuonna 1990 lisäkopioita vaaleanpunaisten ja violettien pigmenttien synteesiin välttämättömän kalkonisyntaasin geenistä. Syntaasigeenin lisääntynyt ilmentyminen ei kuitenkaan johtanut perianthin tummempaan väriin , päinvastoin, kukat muuttuivat vaaleammiksi ja jopa osittain valkoisiksi. Saadut tulokset osoittivat, että entsyymin aktiivisuus ei lisääntynyt, vaan väheni. Kalkonisyntaasigeenit ilmentyivät alemmalla tasolla kuin ennen siirtogeenin käyttöönottoa . [5] [6] Jonkin aikaa myöhemmin "geenin hiljentäminen" kuvattiin sienessä Neurospora crassa , mutta tätä prosessia ei ole korreloitu kasveille kuvattujen prosessien kanssa [7] . Lisätutkimukset ovat osoittaneet, että mRNA:n hajoaminen kasveissa johtaa geeniaktiivisuuden vähenemiseen transkription jälkeisen eston mekanismin kautta [8] . Tätä ilmiötä kutsuttiin "geeniekspression kosuppressioksi", mutta tämän prosessin mekanismia ei tunnettu [9] .

Samanlainen odottamaton vaikutus on kuvattu yritettäessä lisätä kasvien vastustuskykyä viruksille . Tiedettiin, että virusproteiineja ilmentävillä kasveilla on lisääntynyt vastustuskyky virusinfektiota vastaan, mutta lisätutkimukset ovat osoittaneet, että vastustuskyky muiden virusten infektiolle saadaan aikaan vain lyhyellä ei-koodaavalla virus-RNA:lla. Tutkijat uskoivat myös, että siirtogeeniset virus-RNA:t voivat myös estää viruksen replikaatiota [10] . Käänteinen koe, jossa lyhyitä kasvigeenisekvenssejä vietiin viruksen genomiin , osoitti, että kohdegeenit tukahdutettiin tartunnan saaneissa kasveissa. Tätä ilmiötä on kutsuttu " viruksen aiheuttamaksi geenin vaimentamiseksi, VIGS ", ja tällaisten ilmiöiden yhdistelmää on kutsuttu post-transkriptionaaliseksi geenin vaimentamiseksi ( eng  . post transkriptionaalinen geenin hiljentäminen ) [11] .  

Kasveista tehtyjen havaintojen jälkeen monet laboratoriot ympäri maailmaa ovat yrittäneet havaita samanlaisen ilmiön muissa organismeissa [12] [13] . Craig Mello ja Andrew Fire kuvasivat vuoden 1998 Nature - paperissa geenin vaimentamisen vaikutuksen sen jälkeen, kun kaksijuosteista RNA:ta oli viety sukkulamadon Caenorhabditis elegansin kehoon [2] . Lihasproteiinisynteesin säätelyä koskevissa tutkimuksissa Mello ja Fire osoittivat, että mRNA:n tai antisense-RNA:iden antaminen ei vaikuttanut proteiinisynteesiin , kun taas kaksijuosteisten RNA:iden antaminen onnistui vähentämään kohdegeenin ilmentymistä. Näiden töiden tuloksena syntyi termi RNA-häiriö . Firen ja Mellon tutkimukset ovat huomionarvoisia siinä mielessä, että heidän työssään paljastettiin transkription jälkeisen geenin vaimentamisen järjestelmän aktiivinen periaate. Vuonna 2006 Fire ja Mello saivat fysiologian tai lääketieteen Nobelin tutkimuksestaan ​​RNA-häiriöiden alalla [1] .

Komponentit

RNA-interferenssijärjestelmän ribonukleiinikomponenttia voivat edustaa kahden tyyppiset endogeeniset ja eksogeeniset kaksijuosteiset oligonukleotidit - mikroRNA ja pieni häiritsevä RNA ( siRNA ) . 

Pienet häiritsevät RNA:t

Pienet häiritsevät RNA:t ovat kaksijuosteisia RNA:ita, jotka ovat 21-25 nukleotidia pitkiä ja joissa on kaksi paritonta ulkonevaa nukleotidia 3'-päissä. Jokaisessa nukleotidiketjussa on fosfaattiryhmä 5'-päässä ja hydroksyyliryhmä 3'-päässä. Tämä siRNA-rakenne muodostuu Dicer -entsyymin aktiivisuudesta , jonka substraatti on pitkiä kaksijuosteisia RNA:ita tai lyhyitä hiusneulaa sisältäviä RNA:ita . [14] Pienten häiritsevien RNA:iden dupleksit siirtyvät sitten RISC - katalyyttiseen kompleksiin , jossa dupleksi kiertyy argonaute-proteiinin mukana ja muodostuu komplementaarinen kompleksi lyhyestä antisense-RNA:sta, jolla on spesifinen sekvenssi mRNA:ta koodaavalla alueella. mikä johtaa jälkimmäisen huononemiseen entisestään. Toisin kuin miRNA:t, pienet häiritsevät RNA:t pariutuvat yleensä tarkasti kohteen kanssa ja johtavat yksittäisen spesifisen mRNA:n endonukleolyyttiseen pilkkoutumiseen [15]

microRNA

MikroRNA :t ( eng.  MicroRNA, miRNA ) ovat 21-22 nukleotidin pituisia ei-koodaavia RNA:ita , jotka osallistuvat geeniekspression säätelyyn . MikroRNA:t sitoutuvat spesifisiin mRNA -sekvensseihin 3'-transloitumattomalla alueella ja aiheuttavat joko translaation eston tai poly(A) hännän deleetion . MikroRNA-molekyylit ilmentyvät mikroRNA-prekursoreita koodaavien pitkien geenien ( pri -miRNA, primordial miRNA ) primäärisinä transkripteina , ja solun tumassa prosessoinnin jälkeen ne ovat noin 70 nukleotidin pituisia pre-miRNA-varsi-silmukkarakenteita . Pri-miRNA-pre-miRNA-prosessointikompleksi sisältää RNaasi III -entsyymin nimeltä Drosha ja kaksijuosteisen RNA:ta sitovan proteiinin Pasha . Pre-miRNA:n kaksijuosteinen osa sitoutuu ja katkaisee Dicer-proteiinin ( Drosophila melanogasterissa miRNA:ita ja pieniä häiritseviä RNA:ita prosessoivat Dicer -entsyymin eri isoformit [16] ); tässä tapauksessa muodostuu kypsä mikroRNA-molekyyli, joka voi sitten päästä RISC :hen [17] [18] [19] . MiRNA:n muodostumiselle on myös Diceristä riippumaton reitti. MikroRNA-prekursorin prosessoinnin suorittaa tässä tapauksessa Argonaute 2 -proteiini [20] [21] .  

Eläimillä miRNA:t eivät tyypillisesti täsmää kohde-mRNA:n kanssa ja voivat estää monien samanlaisilla sekvensseillä varustettujen mRNA:iden translaation. Kasveissa parittelu voi monissa tapauksissa olla täydellinen.

RISC

RISC :n ( RNA - indusoitu vaimennuskompleksi ) katalyyttinen osa on Argonaute -perheen endonukleaasiproteiineja , jotka leikkaavat mRNA:ta komplementaarisesti siihen liittyvän pienen häiritsevän RNA:n kanssa [1] . Koska Dicer -proteiinilla leikkaamisen jälkeen muodostuneet fragmentit ovat kaksijuosteisia, jokainen säikeistä voi mahdollisesti olla pieni häiritsevä RNA ( eng. siRNA ). Kuitenkin vain toinen kahdesta juosteesta, jota kutsutaan ohjausjuosteeksi , sitoutuu Argonaute-proteiiniin ja tukahduttaa geenin ilmentymisen . Toinen säie, nimeltään matkustajajuoste , anti-guide-juoste , hajoaa RISC-aktivoinnin aikana [22] . Vaikka aiemmin uskottiin, että ATP - riippuvainen helikaasi erottaa ketjut [23] , nyt on osoitettu, että tämä prosessi on ATP:stä riippumaton ja sen toteuttavat suoraan RISC:n muodostavat proteiinit [24] [25 ] ] . Ohjausjuosteen valinta on riippumaton suunnasta, jossa Dicer katkaisee kaksijuosteisen RNA:n ennen RISC:hen menemistä [26] [27] . R2D2-proteiini voi olla tekijä, joka erottaa kumppaniketjun vakaamman 5'-pään sitoutumisen aikana [28] .     

RNA-molekyylien sitoutumista Argonaute-perheen proteiinin RNA:ta sitovaan domeeniin tutkittiin käyttämällä röntgendiffraktioanalyysiä . Tässä tapauksessa yksijuosteisen RNA:n fosforyloitu 5'-pää menee proteiinin konservatiiviseen taskuun, jossa 5'-pään fosfaatti säilyy koordinaatiosidoksilla Mg 2+ -ionin ja adeniinitähteen osallistuessa. tulee pinoamisvuorovaikutukseen konservatiivisen tyrosiinijäännöksen kanssa . Tämä proteiinin alue ilmeisesti stimuloi pienten häiritsevien RNA:iden sitoutumista kohde-mRNA:han [29] .

Tähän mennessä mekanismia, jolla RISC löytää komplementaarisen mRNA:n solun sisältä, ei tunneta hyvin. On osoitettu, että translaatiota ei vaadita onnistuneeseen mRNA:n hajotukseen siRISC-kompleksin vaikutuksesta [30] . Lisäksi on osoitettu, että RNA-interferenssireitti voi olla tehokkaampi kohde-mRNA:ita vastaan, joita ei tällä hetkellä transloida [31] . Argonaute-perheen proteiinit ovat RISC:n katalyyttinen komponentti, ja niitä löytyy sytoplasman tietyiltä alueilta, jotka tunnetaan P -kappaleina [32 ] ; On osoitettu, että pienten häiritsevien RNA:iden aktiivisuus ja mRNA:n hajoaminen ovat maksimaalisia juuri P-kappaleissa [33] . P-kappaleet ovat tärkeä osa RNA-interferenssijärjestelmää. Niiden tuhoutuminen johtaa tämän prosessin tehokkuuden laskuun. [34] .  

Mekanismi

RNA-häiriö on RNA-riippuvainen geenin vaimennusprosessi , jota RISC hallitsee. RISC aktivoituu solun sytoplasmassa , jossa lyhyet kaksijuosteiset RNA-molekyylit ovat vuorovaikutuksessa RISC:n katalyyttisen komponentin, Argonaute -proteiinin kanssa [1] . Siinä tapauksessa, että kaksijuosteinen RNA on eksogeeninen (ilmenee laboratoriokäsittelyn tai RNA:ta sisältävän viruksen aiheuttaman infektion seurauksena), RNA on suoraan sytoplasmassa, jossa Dicer -proteiini leikkaa sen lyhyiksi fragmenteiksi (siRNA) , ja tuloksena olevaa siRNA:ta sisältävää toiminnallista kompleksia kutsutaan siRISC:ksi. Ei -koodaavista RNA -geeneistä ekspressoitujen pre-miRNA:iden tapauksessa endogeeninen kaksijuosteinen RNA laukaisee RNAi:n. Tällaisten geenien primääriset transkriptit prosessoidaan ensin ytimessä muodostamaan pre - miRNA :ita , jotka sisältävät spesifisiä kantasilmukkarakenteita. Pre - miRNA: t viedään sitten sytoplasmaan ja pilkkoutuvat Dicer-proteiinilla, jolloin muodostuu miRNA:ita, jotka liitetään mikroRNA:ta sisältävään kompleksiin nimeltä miRISC. Siten RISC on paikka, jossa kaksi eksogeenisten ja endogeenisten kaksijuosteisten RNA:iden indusoimaa RNA-häiriöreittiä risteävät [36] .

Kaksijuosteisen RNA:n leikkaaminen

Eksogeeninen kaksijuosteinen RNA laukaisee RNA-interferenssijärjestelmän aktivoimalla ribonukleaasientsyymiä Dicer [ 14] , joka sitoo ja katkaisee RNA-duplekseja, jolloin muodostuu kaksijuosteisia siRNA-fragmentteja, joiden pituus on 21–25 emäsparia, joissa molemmissa päissä on useita parittomia emäksiä . [38] [39] [40] [41] . Monien organismien genomien bioinformaattinen analyysi viittaa siihen, että tällainen siRNA:n pituus lisää niiden spesifisyyttä kohdegeenille ja vähentää epäspesifisen sitoutumisen todennäköisyyttä [42] . Lisäksi siRNA:t on jaettu erillisiin ketjuihin ja mukana RISC : ssä (siRISC). Kun siRNA:t on integroitu RISC:hen, ne sitoutuvat komplementaarisesti kohde-mRNA:han ja saavat mRNA :n katkeamaan , mikä estää sen translaation [43] .

Eksogeenisen kaksijuosteisen RNA:n tunnistavat ja sitovat erityiset efektoriproteiinit (esimerkiksi RDE-4 Caenorhabditis elegansissa ja R2D2 Drosophilassa ), jotka lisäävät Dicer-proteiinin aktiivisuutta [44] . Nämä efektoriproteiinit sitoutuvat vain pitkiin kaksijuosteisiin RNA:ihin, mutta affiniteettimekanismia tällaisiin substraatteihin ei tunneta [44] . Tällaiset RNA:ta sitovat proteiinit helpottavat leikattujen siRNA :iden siirtymistä RISC -kompleksiin [45] .

Caenorhabditis elegansissa RNA - häiriön aloitusreitti solussa voi vahvistua "toissijaisten" siRNA :iden synteesin seurauksena "primääristen" pienten häiritsevien RNA:iden templaatissa [46] . "Toissijaiset" siRNA:t eroavat rakenteeltaan niistä, jotka muodostuvat Dicer-proteiinin aktiivisuuden seurauksena, ja ilmeisesti niitä syntetisoi RNA-riippuvainen RNA-polymeraasi ( RNA -  riippuvainen RNA-polymeraasi, RdRP ) [47] [48] .

Transkription vaimennus

Monet eukaryootit käyttävät RNA-interferenssijärjestelmää ylläpitääkseen genomirakennetta . Histonien kemiallinen modifikaatio ja vastaavien kromosomien osien siirtyminen heterokromatiinin tilaan johtaa vastaavien geenien transkription vähenemiseen [49] ; tämä prosessi viittaa RNA - indusoituun transkription vaimentamiseen (RITS ) ja sen suorittaa monimutkainen proteiinisarja .  Fissiohiivassa tämä kompleksi sisältää Argonautea , proteiinia, jolla on Chp1- kromodomaiini , ja Tas3-nimisen proteiinin, jonka toiminto on tuntematon [50] . Tämän seurauksena heterokromatiinialueiden induktio ja laajentaminen edellyttää Argonaute-proteiinien ja RNA-riippuvaisen RNA-polymeraasin läsnäoloa [51] . Itse asiassa näiden geenien deleetio fissiohiivassa Schizosaccharomyces pombessa heikentää histonien metylaatiota ja sentromeerin muodostumista [52] ja aiheuttaa anafaasin hidastumisen tai pysähtymisen solunjakautumisen aikana [53] . Joissakin tapauksissa tällaiset prosessit liittyvät histonien modifikaatioon ja niiden on osoitettu lisäävän vastaavien geenien transkriptiota [54] .

Mekanismia, jolla RITS-kompleksi indusoi heterokromatiinin muodostumista, ei täysin ymmärretä. Merkittävä osa tutkimuksesta on suunnattu parittelutyyppistä aluetta säätelevän hiivan genomin alueen tutkimiseen , mutta tämä alue ei välttämättä ole edustava muiden organismien genomien kohdalla. Olemassa olevien heterokromatiinin alueiden säilyttämiseksi RITS muodostaa komplekseja pienten häiritsevien RNA:iden kanssa, jotka ovat komplementaarisia vastaaville geeneille ja sitoutuvat voimakkaasti metyloituihin histoneihin. RITS toimii sitten transkription aikana hajottaen kaikki RNA-polymeraasin syntetisoimat pre-mRNA:t. Tällaisten heterokromatiinialueiden muodostuminen vaatii Dicer-entsyymiä, joka syntetisoi primäärisiä komplementaarisia siRNA:ita, jotka osallistuvat transkriptin hajoamiseen [55] . Kromosomialueiden säilyttäminen heterokromatiinitilassa näyttää olevan esimerkki positiivisesta palautteesta , koska pieniä häiritseviä RNA:ita, jotka ovat osa RITS:ää, muodostuu RNA-riippuvaisen RNA-polymeraasin syntetisoimista satunnaisista transkripteistä [56] . Hiivan kromosomien sentromeerialueiden tutkimuksessa saatuja tietoja ei todennäköisesti voida laajentaa koskemaan nisäkkäitä , koska jälkimmäisissä heterokromatiinialueiden ylläpito ei aina riipu RNA-interferenssijärjestelmästä [57] .  

Linkki RNA-editointiin

Yleisin RNA-muokkausmuoto korkeammissa eukaryooteissa on adenosiinin muuntaminen inosiiniksi kaksijuosteisessa RNA :ssa , jonka suorittaa adenosiinideaminaasientsyymi [58] . Vuonna 2000 ehdotettiin, että RNA-interferenssireitti ja A→I-RNA:n muokkausreitti voisivat kilpailla yhteisestä kaksijuosteisesta RNA-substraatista [59] . Todellakin, jotkut pienet häiritsevät RNA-prekursorit voidaan altistaa A→I-muokkaukselle [60] [61] , ja tämä mekanismi voi säädellä kypsien pienten häiritsevien RNA-molekyylien prosessointia ja ilmentymistä [ 61] [62] . Sukulamadon Caenorhabditis elegans linjoista tehdyt tutkimukset, joista puuttuu A→I RNA-muokkausentsyymi, ovat osoittaneet, että RNA-muokkaus voi estää endogeenisten geenien ja siirtogeenien hiljentymisen RNA-interferenssireitin kautta [63] .

Organismien väliset erot

Organismit eroavat kyvystään havaita vierasta kaksijuosteista RNA:ta ja käyttää niitä RNA-interferenssiprosessissa. RNAi:n vaikutukset kasveissa ja Caenorhabditis elegansissa (mutta ei Drosophilassa ja nisäkkäissä ) voivat olla perinnöllisiä tai systeemisiä. Kasveissa RNA-interferenssijärjestelmä voi levittää pieniä häiritseviä RNA:ita pitkin plasmodesmataa (kanavia soluseinissä , jotka suorittavat viestintää ja kuljetusta) [23] . Periytys varmistetaan promoottorien metylaatiolla , muuttunut metylaatiomalli siirtyy jakautumisen seurauksena tytärsoluihin [65] . Merkittävät erot pienten häiritsevien RNA:iden kohteissa kasvien ja eläinten välillä johtuvat siitä, että kasveissa mikroRNA :t ovat erittäin komplementaarisia ribonukleiinikohteiden kanssa ja aiheuttavat mRNA:n hajoamista RISC:ssä, kun taas eläimissä pienet häiritsevät RNA:t eroavat voimakkaasti nukleotidisekvenssiltään ja aiheuttavat repressiota . käännös [64] . MikroRNA:t voivat vaikuttaa translaation aloitukseen olemalla vuorovaikutuksessa translaation aloitustekijöiden ja mRNA- poly(A) -kanavan kanssa [66] .

Joillakin alkueläimillä, kuten Leishmania major ja Trypanosoma cruzi , ei ole mitään RNA-interferenssireitin komponentteja [67] [68] . Suurin osa RNA-interferenssijärjestelmän komponenteista puuttuu myös joistakin sienistä, esimerkiksi malliorganismista Saccharomyces cerevisiae [69] . RNA-interferenssijärjestelmän komponenttien läsnäolo muissa fissiohiivoissa, kuten Saccharomyces castellii ja Candida albicans , on osoitettu . Kahden RNA-interferenssijärjestelmän proteiinin induktio Saccharomyces castelliista helpottaa tätä prosessia Saccharomyces cerevisiaessa [70] . Se tosiasia, että joillakin askomykeeteillä ja basidiomykeeteillä ei ole RNA-interferenssireittiä, osoittaa, että tähän prosessiin tarvittavia proteiineja koodaavat geenit ovat itsenäisesti kadonneet monista sienilinjoista, mikä johtuu luultavasti uuden samankaltaisten toimintojen omaavan reitin kehittymisestä tai mukautuvan edun menetys näissä ekologisissa markkinarakoissa [71] .

RNAi-analogit prokaryooteissa

Geeniekspressiota prokaryooteissa säätelee RNA-pohjainen järjestelmä, joka on joissain suhteissa samanlainen kuin RNA-interferenssijärjestelmä. Prokaryooteissa on kuvattu geenejä, jotka koodaavat erityisiä RNA:ita, jotka säätelevät mRNA:n leviämistä ja translaatiota pariutumalla komplementaaristen sekvenssien kanssa. Nämä säätely-RNA:t eivät kuitenkaan ole täydellisiä pienten häiritsevien RNA:iden analogeja , koska Dicer -entsyymi ei ole mukana tässä prosessissa [72] . On osoitettu, että prokaryooteissa säännöllisesti ryhmiin järjestettyjen lyhyiden palindromisten toistojen järjestelmä ( CRISPR ) on samanlainen kuin eukaryoottien RNA-interferenssijärjestelmä, vaikka homologisia eukaryoottiproteiineja ei tunneta minkään prokaryoottijärjestelmän komponentin osalta [73] . .

Biologiset toiminnot

Immuniteetti

RNA-interferenssijärjestelmä on tärkeä osa immuunivastetta viruksia ja muuta vierasta geneettistä materiaalia vastaan. Kasveissa RNA-interferenssijärjestelmä estää transposonien leviämisen [74] . Kasveilla on useita Dicer - proteiinin homologeja , jotka on suunnattu erityyppisiä viruksia vastaan ​​[75] . On osoitettu, että indusoitu geenin vaimentaminen kasveissa voi siirtyä perusrungosta oksastettuun kasviin [76] . Tämä kasvien mukautuvan immuunijärjestelmän ominaisuus mahdollistaa viruksen alkuperäisen paikallisen tunkeutumisen jälkeen reagoinnin viruksen toistuviin tunkeutumiseen koko kehoon [77] . Vasteena monet virukset kehittyivät hankkimaan mekanismeja, jotka tukahduttavat RNA-interferenssijärjestelmää kasvisoluissa [78] . On kuvattu virusproteiineja, jotka sitovat lyhyitä kaksijuosteisia RNA-fragmentteja yksijuosteisilla ulkonemilla, jotka johtuvat Dicer-proteiinin aktiivisuudesta [79] . Jotkut kasvit ilmentävät endogeenisiä pieniä häiritseviä RNA :ita vasteena tiettyjen bakteerien aiheuttamalle infektiolle [80] . Nämä vaikutukset voivat olla osa yleistä vastetta taudinaiheuttajia vastaan, jolloin monet isännässä tapahtuvat aineenvaihduntaprosessit vähenevät vasteena infektiolle [81] .

Vaikka eläinsoluilla on taipumus ekspressoida vähemmän Dicer -entsyymin variantteja kuin kasveilla, RNA-interferenssijärjestelmä eläimissä on osallisena antiviraaliseen vasteeseen joissakin tapauksissa. Nuorten ja aikuisten Drosophilan RNA-interferenssillä on tärkeä rooli synnynnäisessä antiviraalisessa immuniteetissa ja se osallistuu puolustukseen patogeenejä, kuten Drosophila X -virusta vastaan.[82] [83] . Caenorhabditis elegansin RNA-interferenssijärjestelmällä on samanlainen rooli immuniteetissa : Argonaute - proteiinienlisääntyy virusinfektion aikana, kun taas madot, joissa RNA-interferenssireitin geenien ilmentyminen lisääntyy , tulee vastustuskykyisiksi virusinfektiolle [84] [85] .

RNA-interferenssijärjestelmän roolia nisäkkäiden synnynnäisessä immuniteetissa ei täysin ymmärretä. Kuitenkin se tosiasia, että jotkut virukset sisältävät geenejä, jotka vähentävät RNAi-järjestelmän vastetta nisäkässoluissa, osoittaa RNAi-järjestelmän aiheuttaman immuunivasteen [86] [87] . Hypoteesi RNA-interferenssijärjestelmän välittämästä immuniteetista nisäkkäissä ei kuitenkaan ole riittävän perusteltu [88] . Vaikka äskettäin Maillard et ai. [89] ja Lee et ai. [90] esitti uusia todisteita funktionaalisen antiviraalisen RNA:n häiriöreitin olemassaolosta nisäkässoluissa. Herpesviruksen ilmentämät pienet häiritsevät RNA :t voivat aiheuttaa heterokromatiinin muodostumisen ja johtaa viruksen siirtymiseen latenttiin tilaan [91] .

Osoitettiin, että yhden Dicer1-geenin kopion deleetio hiirissä johti useampaan kasvaimiin kuin kontrolliryhmässä, samoin kuin miRNA-tasojen ja eloonjäämisen alentumiseen. Dicer1-geenin täydellinen deleetio esti kasvaimen muodostumisen, luultavasti myös siksi, että jonkin verran Dicer1-geenituotteen ilmentymistä tarvitaan solujen kasvuun. [92]

Vuonna 2013 tehdyt työt osoittivat, että nisäkässoluilla on RNA-interferenssijärjestelmä, jolla on antiviraalista aktiivisuutta. [93] [94] Nisäkkään RNAi-järjestelmän muita toimintoja ovat herpes simplex -viruksen mikroRNA:t, jotka toimivat heterokromatiinin organisoijina ja johtavat viruksen latenssiin . [95]

Geenin ilmentyminen

Kun translaatiota tukahdutetaan [64] , elävien organismien joissakin kehitysvaiheissa , erityisesti morfogeneesin ja solujen erilaistumattomassa tilassa säilymisen vaiheessa (esimerkiksi kantasolujen tapauksessa), endogeenisesti ilmentyvät miRNA :t, jotka ovat introni- ja geenienvälisten alueiden tuotteet ovat erittäin tärkeitä [96] . Tällaisten endogeenisesti ilmentyneiden mikroRNA:iden rooli geeniekspression suppressiossa kuvattiin ensimmäisen kerran Caenorhabditis elegansissa vuonna 1993 [97] . Kasveissa tällainen miRNA -toiminto kuvattiin ensimmäisen kerran mallikasvissa Arabidopsis thaliana , jolle osoitettiin "JAW miRNA:n" vaikutus useiden ulkonäköä säätelevien geenien säätelyyn [98] . Kasveissa mikroRNA:n säätelemät geenit ovat yleensä transkriptiotekijöitä [99] , joten mikroRNA:t säätelevät kokonaisia ​​geeniverkkoja muuttamalla avaingeenien (mukaan lukien transkriptiotekijät ja F-box-proteiinit ) ilmentymistä alkionkehityksen aikana [100] . Monissa organismeissa, mukaan lukien ihmiset, mikroRNA:t osallistuvat kasvainten muodostumiseen ja solusyklin häiriöihin . Tässä tapauksessa miRNA:t voivat olla sekä onkogeenejä että kasvainsuppressoreita [101] .

Pienten häiritsevien RNA:iden ja miRNA:iden sekvenssit ovat komplementaarisia promoottorialueiden nukleotidisekvensseille. SiRNA:n ja miRNA:n sitoutuminen näihin alueisiin voi johtaa geenin transkription ja RNA:n aktivoitumisen lisääntymiseen . Näiden geenien ilmentyminen lisääntyy Dicer- ja Argonaute -proteiinien osallistuessa, ja tapahtuu myös histonien demetylaatiota [102] [103] .

Evoluutio

Laskennallisen fylogeneettisen analyysin menetelmät osoittavat, että kaikkien eukaryoottien viimeisimmällä yhteisellä esi-isällä oli RNA-häiriötä, kun taas RNA-häiriöjärjestelmän puuttuminen joissakin eukaryooteissa on hankittu ominaisuus [104] . Evoluutioteorian muinainen RNA-interferenssireitti näyttää sisältäneen entsyymejä, jotka ovat samanlaisia ​​kuin Dicer , Argonaute , PIWI , sekä RNA-riippuvainen RNA-polymeraasi. Luultavasti näillä entsyymeillä oli RNA-häiriön ohella myös muita rooleja solussa. Laajamittainen tutkimukset vertailevan genomiikan alalla osoittavat, että pienellä ryhmällä, josta tuli kaikkien eukaryoottien esi-isä, oli myös DNA:n hajoamisjärjestelmiin läheisesti liittyviä komponentteja, esimerkiksi samanlaisia ​​kuin eksosomaaliset kompleksit [105] . Argonaute-proteiiniperhe, joka on yhteinen monille eukaryooteille sekä arkeille ja joillekin bakteereille (esim . Aquifex aeolicus ), on homologisesti ja evolutionaarisesti johdettu translaation aloitusjärjestelmän komponenteista [ 105] .

RNA-interferenssijärjestelmän vanhinta toimintoa kutsutaan yleensä suojaksi eksogeenisiltä geneettisiltä elementeiltä - virusten ja transposonien genomeilta [104] [106] . Jotkut asiaan liittyvät toiminnot, kuten histonin modifikaatio , ovat saattaneet esiintyä nykyaikaisten eukaryoottien esivanhemmissa, kun taas toiset, kuten miRNA:iden kehityksen säätely, näyttävät ilmestyneen myöhemmin [104] .

Monien eukaryoottien RNA-interferenssijärjestelmän geenit ovat luonnollisen immuunijärjestelmän komponentteja, jotka vastustavat viruksia. Jotkut kasvivirukset ovat hankkineet mekanismeja tukahduttaakseen isäntäsolun RNA-interferenssijärjestelmän vasteen [78] . Drosophilan RNA-interferenssireitin geenien muutosnopeutta ohjaa positiivinen valinta . RNA-interferenssijärjestelmän geenit kehittyvät erittäin nopeasti verrattuna Drosophilan genomin muihin geeneihin [107] .

Sovellus

Geenien sammuttaminen

RNA-interferenssijärjestelmää käytetään usein kokeellisessa biologiassa geenien toiminnan tutkimiseen soluviljelmissä ja malliorganismeissa in vivo [1] . Tietylle geenille komplementaarinen synteettinen kaksijuosteinen RNA viedään soluun tai organismiin, jossa vieras RNA-molekyyli laukaisee RNA-interferenssijärjestelmän. Tämän menetelmän avulla tutkijat voivat merkittävästi vähentää vastaavan geenin ilmentymistasoa. Kiinnostuksen kohteena olevan geenin ilmentymisen vähenemisen seurausten tutkiminen mahdollistaa tämän kohdegeenin tuotteen fysiologisen roolin selvittämisen. Koska RNA-interferenssijärjestelmä ei voi täysin sammuttaa geenien ilmentymistä, tätä menetelmää kutsutaan " geenin knockdowniksi " - toisin kuin geenin täydellinen poistaminen, " geenin poisto " [108] .

Laskennallisen biologian merkittävät edistysaskeleet mahdollistavat kaksijuosteisten RNA:iden kehittämisen, jotka vähentävät mahdollisimman paljon kohdegeenin ilmentymistä ja joilla on minimaaliset sivuvaikutukset. Sivuvaikutuksia voi esiintyä, kun injektoidussa RNA-molekyylissä on sekvenssi, joka on komplementaarinen usealle geenille samanaikaisesti, mikä johtaa useiden geenien ilmentymisen riittämättömään vähenemiseen. Samanlaisia ​​vaikeuksia syntyy usein, kun kaksijuosteinen RNA sisältää toistuvia sekvenssejä. Homo sapiensin , Caenorhabditis elegansin ja Schizosaccharomyces pomben genomien tutkimukset ovat osoittaneet, että noin 10 % pienistä häiritsevistä RNA-molekyyleistä johtaa merkittäviin sivuvaikutuksiin [ 42 ] , mukaan lukien nisäkkäille [111] ja viruksille [112] spesifiset sivuvaikutukset . Ehdotettujen siRNA-sekvenssien ristiaktiivisuus tarkistetaan automaattisesti.

Organismista ja koejärjestelmästä riippuen eksogeeniset RNA:t voidaan suunnitella pitkiksi ja Dicer-proteiinin kohteiksi tai lyhyiksi ja olla pienten häiritsevien RNA:iden substraatteja. Useimmille nisäkässoluille lyhyemmät RNA:t ovat edullisia, koska pitkät kaksijuosteiset RNA:t nisäkkäissä saavat aikaan interferonivasteen , synnynnäisen immuniteetin muodon , epäspesifisen vasteen vieraalle geneettiselle materiaalille [113] . Hiiren oosyyteille , samoin kuin hiiren alkioiden soluille kehityksen varhaisessa vaiheessa, interferonivaste eksogeeniselle kaksijuosteiselle RNA:lle ei ole ominaista, joten nämä solut ovat kätevä järjestelmä geenin tuhoutumisen tutkimiseen nisäkkäillä [114] . RNA-interferenssijärjestelmän käyttämiseksi laboratoriossa on kehitetty erityisiä menetelmiä, jotka eivät vaadi pienten häiritsevien RNA:iden suoraa viemistä soluun, esimerkiksi transkriptoituja siRNA - sekvenssejä koodaavat plasmiditransfektiojärjestelmät [115] , lentivirusvektorit , jotka mahdollistavat indusoinnin tai inaktivoinnin . transkriptio, jota kutsutaan myös englanniksi.  ehdollinen RNAi [116] [117] .

Vaihtoehtoisen strategian keinotekoiseen geenisäätelyyn RNA-interferenssille tarjoaa CRISPRi- menetelmä, joka toimii transkription päälle/pois -tasolla [118] .

Funktionaalinen genomiikka

Funktionaalisia genomiikkamenetelmiä , joissa käytetään RNAi-järjestelmää, käytetään yleensä Caenorhabditis elegansissa [120] ja Drosophila melanogasterissa [121] , koska nämä eläimet ovat yleisimmin käytettyjä malleja ja RNAi-järjestelmä toimii tehokkaimmin näissä organismeissa. Caenorhabditis elegans on kätevä kohde RNA-interferenssitutkimuksille kahdesta syystä – ensinnäkin, geenin vaimentamisen vaikutukset sukkulamatossa ovat perinnöllisiä, ja toiseksi, koska kaksijuosteisen DNA:n toimittaminen sukkulamatolle on erittäin yksinkertaista. Sukkulamatoille voidaan ruokkia bakteerisoluja, kuten Escherichia colia , jotka sisältävät halutun kaksijuosteisen RNA:n, jotka sitten imeytyvät suoliston läpi. Tämä menetelmä RNA:n toimittamiseksi ruoan kanssa on tehokas geenien vaimentamisen tehokkuuden kannalta ja on samalla paljon halvempi, yksinkertaisempi ja nopeampi kuin matojen upottaminen kaksijuosteista RNA:ta sisältävään liuokseen tai kaksijuosteisen RNA:n lisääminen sukurauhaset [ 122] . Useimmissa muissa organismeissa kaksijuosteisen RNA:n kuljetus näyttää olevan paljon työläämpää, mutta nisäkässoluviljelmien laajamittaisia ​​genomitutkimuksia yritetään [123] .

Lähestymistavat RNA-interferenssikirjastojen luomiseen kokonaisia ​​genomeja varten ovat paljon monimutkaisempia kuin tietyn kokeen pienten häiritsevien RNA:iden tietyn sarjan tapauksessa. Keinotekoisia hermoverkkoja käytetään usein luomaan siRNA-kirjastoja sekä ennustamaan niiden tehokkuutta geenien tuhoamisessa [124] [125] . Massagenomiseulonnat ovat lupaavia tekniikoita genomin annotaatioon, mikä on johtanut DNA-mikrosiruteknologiaan perustuvien suuritehoisten seulontamenetelmien kehittämiseen [ 126] [127] . Mahdollisuus käyttää näitä menetelmiä muiden organismien, kuten loisten sukkulamatojen, tutkimiseen on edelleen kyseenalainen [128] [129] .

Funktionaalinen genomiikan tutkimus RNA-interferenssitekniikoilla on houkuttelevaa kasvien genomikartoituksessa ja geenimerkintöjen tekemisessä, koska monet kasvit ovat polyploideja , mikä vaikeuttaa perinteisten geenitekniikan menetelmien tutkimista . Esimerkiksi RNA-interferenssiä on käytetty menestyksekkäästi funktionaalisessa genomiikassa Triticum aestivumin (heksaploidin) [130] sekä muiden mallikasvien, Arabidopsis thalianan ja maissin tutkimiseen [131] .

Lääketiede

RNA-interferenssimenetelmiä on mahdollista käyttää terapiassa , erityisesti RNA-terapiassa . Vaikka pitkien kaksijuosteisten RNA:iden vieminen nisäkässoluihin on vaikeaa interferonivasteen vuoksi, molekyylejä, kuten pieniä häiritseviä RNA:ita, on käytetty menestyksekkäästi [132] . Verkkokalvon hajoamishoidosta ja hengitysteiden synsyyttiviruksen hoidosta RNA-interferenssillä [133] on tehty kliinisiä tutkimuksia , ja RNAi-järjestelmän tehokkuus maksavaurion hoidossa laboratoriohiirillä on myös osoitettu [134] .

Toinen mahdollinen RNA-häiriön kliininen sovellus on tyypin 2 herpes simplex -viruksen hoito (esimerkiksi Harvardin yliopiston lääketieteellisessä koulussa ) ja virusgeenin ilmentymisen estäminen kasvainsoluissa [135] , isännän HIV -reseptorien ja rinnakkaisreseptorien tuhoaminen [136 ]. ] , hepatiitti A -geenien [137] ja hepatiitti B [138] hiljentäminen, influenssaviruksen geenin hiljentäminen [139] , tuhkarokkoviruksen replikaation estäminen [140] . On myös mahdollista hoitaa neurodegeneratiivisia sairauksia, kuten Huntingtonin tautia [141] . RNA-interferenssiä pidetään usein myös lupaavana tapana hoitaa kasvaimia sulkemalla tuumorisoluissa yli-ilmennetyt geenit tai geenit, jotka osallistuvat solujen jakautumiseen [142] [143] . Tärkeä tutkimusalue RNA-häiriöiden alalla kliinisissä sovelluksissa on menetelmien kehittäminen pienten RNA:iden turvalliseen toimittamiseen, esimerkiksi vektorijärjestelmien valinta geeniterapiaa varten [144] [145] .

Huolimatta siitä, että soluviljelmistä on tehty uusia tutkimuksia, jotka vahvistavat RNA-häiriöjärjestelmän komponentteihin perustuvan lääkehoidon mahdollisen mahdollisuuden, tällaisten hoitojen turvallisuudesta on edelleen kysymyksiä, mukaan lukien samankaltaisten nukleotidien geenien repression sivuvaikutusten seuraukset. sekvenssit [146] . Laskennalliset genomiikan menetelmät osoittavat, että tällaiset virheelliset sivuvaikutukset ovat jopa 10 % [42] . Yksi suurista hiirillä suoritetuista maksasairaustutkimuksista osoitti koe-eläinten korkeamman kuolleisuuden, minkä tutkijat selittivät kaksijuosteisten RNA:iden ( miRNA , shRNA ) "ylikuormitukseksi" [147] , koska hiusneulan sisältävät pienet RNA:t ovat prosessoidaan tumassa ja viedään sytoplasmaan aktiivisen kuljetusmekanismin . Kaikkia yllä olevia seikkoja tutkitaan edelleen, mikä rajoittaa RNA-interferenssimenetelmien mahdollisia sovelluksia terapiassa.

Lisäksi merkittävä este RNA-interferenssihoitojen kehittämisessä on se, että pienten häiritsevien RNA:iden (siRNA:iden) jakelu on edelleen erittäin tehotonta ja erittäin suuria lääkeannoksia tarvitaan kohdegeenin minimaalisenkin merkittävän kaatumisen saavuttamiseksi. Äskettäin kehitetyt tekniikat antavat kuitenkin meille mahdollisuuden toivoa, että tämä hoitomenetelmä tulee pian kliiniseen käytäntöön. Esimerkiksi havaittiin, että kolesteroliin liittyvän siRNA:n (chol-siRNA) ja endosomolyyttisen polymeerin ARC-520 samanaikainen injektio mahdollisti yli 500-kertaisen tehokkuuden lisäyksen ja 90 %:n laskun kohdegeenin ilmentymisessä. hiirissä in vivo. [148] .

Menetelmiä kehitetään RNA-häiriöiden käyttämiseksi jatkuvan tyypin 1 HIV-infektion hoitoon. Virukset, kuten HIV-1, ovat vaikea kohde RNAi-järjestelmälle, koska ne vaativat useiden RNAi-reittien yhdistelmän. Mahdolliset tavat antiviraaliseen terapiaan RNAi-järjestelmän avulla vaikuttavat lupaavilta, mutta on myös erittäin tärkeää tehdä monia kontrollikokeita prekliinisissä kokeissa , jotta RNAi-järjestelmän sekvenssispesifinen vaikutus voidaan osoittaa yksiselitteisesti [149] .

Biotekniikka

RNA-interferenssiä käytetään biotekniikassa , erityisesti luotaessa kasveja, jotka syntetisoivat luonnollisia myrkyllisiä aineita pienempiä määriä. On kehitetty menetelmiä luoda kasveja, jotka ilmentävät stabiilisti RNA-interferenssijärjestelmän komponentteja, esimerkiksi puuvillansiemenet ovat normaalisti runsaasti ihmisravinnoksi sopivaa proteiinia, mutta sisältävät myrkyllistä terpenoidigossypolia . Menetelmät, jotka käyttävät RNA-interferenssiilmiötä, mahdollistavat puuvillalinjojen luomisen, joissa on alennettu gossypolisynteesin avainentsyymi, (+)-δ-kadinenisyntaasi. Samaan aikaan muut kasvin osat ilmentävät tätä entsyymiä tavanomaisella tasolla, koska gossypoli on tärkeä yhdiste, joka suojaa kasveja tuholaisilta [150] . Samanlaisia ​​yrityksiä yritetään vähentää syanidipitoisuutta luonnontuotteessa linamariinissa , joka on johdettu maniokista ( Manihot esculenta ) [151] .  

On kehitetty menetelmiä allergeenitasojen vähentämiseksi tomaattikasveissa [152] ja menetelmiä karsinogeenien esiasteiden vähentämiseksi tupakkakasveissa [ 153] . Muita esimerkkejä geneettisesti muokatuista muutoksista kasveissa ovat oopiumiunikon luominen, jonka huumausainepitoisuudet ovat vähentyneet [ 154 ] , kasvien vastustuskyvyn lisääntyminen viruksille [155] ja antioksidanttien lisääminen tomaatin hedelmiin [156] . Aikaisemmat kaupalliset geneettisesti muokatut kasvit, tomaatti ja papaija , kehitettiin käyttämällä antisense-RNA:ita, jotka ilmeisesti toimivat RNA:n häiriön avulla [157] [158] . Uzbekistanin tutkijat tukahduttivat fytokromi A -geenin toiminnan puuvillassa RNA-interferenssin avulla. Tuloksena saatiin puuvillalinjoja, joissa parannettiin samanaikaisesti useita tärkeitä ominaisuuksia: kuidun pituutta ja laatua, satoa, kypsymisaikaa, kestävyyttä veden puutteelle ja suolastressille. Saatujen puuvillalinjojen perusteella luotiin uusia korkealaatuisia Porlock-sarjan puuvillalajikkeita, joita tällä hetkellä kylvetään Uzbekistanin pelloilla. Näiden lajikkeiden kuituja myydään tavallista puuvillaa korkeammalla hinnalla, koska ne ovat laatuominaisuuksiltaan parempia kuin tavallisen puuvillan kuidut [159] .

Muistiinpanot

  1. ↑ 1 2 3 4 5 Daneholt, Bertil Lisätiedot: RNA-häiriö . Fysiologian tai lääketieteen Nobel-palkinto 2006 . Haettu 25. tammikuuta 2007. Arkistoitu alkuperäisestä 25. elokuuta 2011.
  2. ↑ 1 2 Fire A., Xu S., Montgomery M., Kostas S., Driver S., Mello C. Kaksijuosteisen RNA:n voimakas ja spesifinen geneettinen häiriö Caenorhabditis elegansissa  (englanniksi)  // Nature : Journal. - 1998. - Voi. 391 , no. 6669 . - s. 806-811 . - doi : 10.1038/35888 . — PMID 9486653 .
  3. ↑ Matzke MA, Matzke AJM. Planting the Seeds of a New Paradigm  (englanniksi)  // PLoS Biol  : Journal. - 2004. - Voi. 2 , ei. 5 . -P.e133 . _ - doi : 10.1371/journal.pbio.0020133 . — PMID 15138502 .
  4. ↑ Ecker JR, Davis RW Geeniekspression estäminen kasvisoluissa antisense-RNA:n ilmentämisellä  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America  : Journal  . - 1986. - Voi. 83 , no. 15 . - P. 5372-5376 . - doi : 10.1073/pnas.83.15.5372 . — PMID 16593734 .
  5. ↑ Napoli C., Lemieux C., Jorgensen R. Kimeerisen kalkonisyntaasigeenin lisääminen petuniaan johtaa homologisten geenien palautuvaan yhteissuppressioon trans  // Plant Cell  : Journal  . - 1990. - Voi. 2 , ei. 4 . - s. 279-289 . - doi : 10.1105/tpc.2.4.279 . — PMID 12354959 .
  6. ↑ {{{title}}} .
  7. ↑ Romano N., Macino G.  Quelling : geeniekspression ohimenevä inaktivaatio Neurospora crassassa transformoimalla homologisilla sekvensseillä  // Mikrobiologia : päiväkirja. — Mikrobiologian seura, 1992. - Voi. 6 , ei. 22 . - P. 3343-3353 . - doi : 10.1111/j.1365-2958.1992.tb02202.x . — PMID 1484489 .
  8. ↑ Van Blokland R., Van der Geest N., Mol JNM, Kooter JM -syntaasin ilmentyminen Petunia hybridassa johtuu RNA-vaihdon lisääntymisestä]  //  Plant J : päiväkirja. - 1994. - Voi. 6 . - s. 861-877 . - doi : 10.1046/j.1365-313X.1994.6060861.x/abs/ .  (linkki ei saatavilla)
  9. ↑ Mol JNM, van der Krol AR Antisense-nukleiinihapot ja -proteiinit: perusteet ja sovellukset  (neopr.) . — M. Dekker, 1991. - S.  4 , 136. - ISBN 0824785169 .
  10. ↑ Covey S., Al-Kaff N., Lángara A., Turner D. Kasvit taistelevat infektioita vastaan ​​geenien hiljentämisellä   // Nature . - 1997. - Voi. 385 . - s. 781-782 . - doi : 10.1038/385781a0 .
  11. ↑ Ratcliff F., Harrison B., Baulcombe D. Samankaltaisuus viruspuolustuksen ja geenien vaimentamisen välillä kasveissa  //  Science : Journal. - 1997. - Voi. 276 . - P. 1558-1560 . - doi : 10.1126/tiede.276.5318.1558 .
  12. ↑ Guo S., Kemphues K. par-1, geeni, jota tarvitaan polaarisuuden määrittämiseen C. elegansin alkioissa, koodaa oletettua Ser/Thr-kinaasia, joka on epäsymmetrisesti jakautunut  (englanniksi)  // Cell  : Journal. - Cell Press , 1995. - Voi. 81 , no. 4 . - s. 611-620 . - doi : 10.1016/0092-8674(95)90082-9 . — PMID 7758115 .
  13. ↑ Pal-Bhadra M., Bhadra U., Birchler J. Cosuppression in Drosophila: geenin hiljentäminen alkoholin dehydrogenaasin toimesta valkoisten Adh-siirtogeenien toimesta on polykombista riippuvainen  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 1997. - Voi. 90 , ei. 3 . - s. 479-490 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80508-5 . — PMID 9267028 .
  14. ↑ 1 2 Bernstein E., Caudy A., Hammond S., Hannon G. Role for a bidentate ribonuclease in the initiation step of RNA interference  //  Nature : Journal. - 2001. - Voi. 409 , no. 6818 . - s. 363-366 . - doi : 10.1038/35053110 . — PMID 11201747 .
  15. ↑ Pillai RS, Bhattacharyya SN, Filipowicz W. Proteiinisynteesin estäminen miRNA:illa: kuinka monta mekanismia? (eng.)  // Trends Cell Biol : päiväkirja. — PMID 17197185 .
  16. ↑ Lee Y., Nakahara K., Pham J., Kim K., He Z., Sontheimer E., Carthew R. Drosophila Dicer-1:n ja Dicer-2:n erilliset roolit siRNA / miRNA-hiljennysreiteissä   // Solu  : päiväkirja. - Cell Press , 2004. - Voi. 117 , nro. 1 . - s. 69-81 . - doi : 10.1016/S0092-8674(04)00261-2 . — PMID 15066283 .
  17. ↑ Gregory R., Chendrimada T., Shiekhattar R.  MikroRNA :n biogeneesi: mikroprosessorikompleksin eristäminen ja karakterisointi  // Methods Mol Biol : päiväkirja. - 2006. - Voi. 342 . - s. 33-47 . — PMID 16957365 .
  18. ↑ Wang QL, Li ZH MikroRNA:  iden toiminnot kasveissa  // Frontiers in Bioscience : päiväkirja. — Biotieteen rajat, 2007. - Voi. 12 . - s. 3975-3982 . — PMID 17485351 .
  19. ↑ Zhao Y., Srivastava D. Kehitysnäkymä mikroRNA:n toiminnasta  // Trends Biochem  . sci. : päiväkirja. - 2007. - Voi. 32 , ei. 4 . - s. 189-197 . - doi : 10.1016/j.tibs.2007.02.006 . — PMID 17350266 .
  20. ↑ Cifuentes D, Xue H, Taylor DW, Patnode H, Mishima Y, Cheloufi S, Ma E, Mane S, Hannon GJ, Lawson N, Wolfe S, Giraldez AJ. (2010) "Uusi diceristä riippumaton miRNA-käsittelypolku vaatii Argonaute2-katalyyttisen aktiivisuuden." Tiede (julkaistu verkossa 6. toukokuuta 2010) doi:10.1126/science.1190809
  21. ↑ Cheloufi S, Dos Santos CO, Chong MM, Hannon GJ. Dicer-riippumaton miRNA-biogeneesireitti, joka vaatii Ago-katalyysiä   // Luonto . - 2010. - Iss. doi:10.1038/nature09092 . — P. Julkaistu verkossa 27. huhtikuuta 2010 .
  22. ↑ Gregory R., Chendrimada T., Cooch N., Shiekhattar R. Ihmisen RISC yhdistää mikroRNA:n biogeneesin ja transkription jälkeisen geenin vaimentamisen  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 2005. - Voi. 123 , nro. 4 . - s. 631-640 . - doi : 10.1016/j.cell.2005.10.022 . — PMID 16271387 .
  23. ↑ 1 2 Lodish H., Berk A., Matsudaira P., Kaiser CA, Krieger M., Scott MP, Zipurksy SL, Darnell J. Molecular Cell Biology  (määrittelemätön) . – 5. — W. H. Freeman: New York, NY, 2004. — ISBN 978-0716743668 .
  24. ↑ Matranga C., Tomari Y., Shin C., Bartel D., Zamore P. Matkustajajuosteen pilkkominen helpottaa siRNA:n kokoamista Ago2:ta sisältäviksi RNAi-entsyymikomplekseiksi  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 2005. - Voi. 123 , nro. 4 . - s. 607-620 . - doi : 10.1016/j.cell.2005.08.044 . — PMID 16271386 .
  25. ↑ Leuschner P., Ameres S., Kueng S., Martinez J. SiRNA :n matkustajajuosteen pilkkominen RISC-kokoonpanon aikana ihmissoluissa  //  EMBO Rep : päiväkirja. - 2006. - Voi. 7 , ei. 3 . - s. 314-320 . - doi : 10.1038/sj.embor.7400637 . — PMID 16439995 .
  26. ↑ Schwarz DS, Hutvágner G., Du T., Xu Z., Aronin N., Zamore PD Epäsymmetria RNAi-entsyymikompleksin kokoonpanossa  // Cell  :  Journal. - Cell Press , 2003. - Voi. 115 , nro. 2 . - s. 199-208 . - doi : 10.1016/S0092-8674(03)00759-1 . — PMID 14567917 .
  27. ↑ Preall J., He Z., Gorra J., Sontheimer E. Lyhyen häiritsevän RNA-juosteen valinta on riippumaton dsRNA:n prosessoinnin polariteetista RNAi:n aikana Drosophilassa  // Curr Biol  : Journal  . - 2006. - Voi. 16 , ei. 5 . - s. 530-535 . - doi : 10.1016/j.cub.2006.01.061 . — PMID 16527750 .
  28. ↑ Tomari Y., Matranga C., Haley B., Martinez N., Zamore P. Proteiinisensori siRNA:n epäsymmetrialle   // Tiede . - 2004. - Voi. 306 , no. 5700 . - s. 1377-1380 . - doi : 10.1126/tiede.1102755 . — PMID 15550672 .
  29. ↑ Ma J., Yuan Y., Meister G., Pei Y., Tuschl T., Patel D. A.  fulgidus Piwi //-proteiinin - 2005. - Voi. 434 , no. 7033 . - s. 666-670 . - doi : 10.1038/luonto03514 . — PMID 15800629 .
  30. ↑ Sen G., Wehrman T., Blau H. mRNA:n translaatio ei ole edellytys pienelle häiritsevälle RNA-välitteiselle mRNA:n pilkkoutumiselle  //  Differentiation : Journal. - 2005. - Voi. 73 , no. 6 . - s. 287-293 . - doi : 10.1111/j.1432-0436.2005.00029.x . — PMID 16138829 .
  31. ↑ Gu S., Rossi J. RNAi:n irrottaminen aktiivisesta translaatiosta nisäkässoluissa  //  RNA: Journal. - 2005. - Voi. 11 , ei. 1 . - s. 38-44 . - doi : 10.1261/rna.7158605 . — PMID 15574516 .
  32. ↑ Sen G., Blau H. Argonaute 2/RISC sijaitsee nisäkkäiden mRNA:n hajoamispaikoissa, jotka tunnetaan sytoplasmisina kappaleina  // Nature Cell Biology  : Journal  . - 2005. - Voi. 7 , ei. 6 . - s. 633-636 . - doi : 10.1038/ncb1265 . — PMID 15908945 .
  33. ↑ Lian S., Jakymiw A., Eystathioy T., Hamel J., Fritzler M., Chan E. GW bodys, microRNAs and the cell cycle  //  Cell Cycle : päiväkirja. - 2006. - Voi. 5 , ei. 3 . - s. 242-245 . — PMID 16418578 .
  34. ↑ Jakymiw A., Lian S., Eystathioy T., Li S., Satoh M., Hamel J., Fritzler M., Chan E. P-kappaleiden häiriö heikentää nisäkkään RNA-häiriötä   :Nature Cell Biology// - 2005. - Voi. 7 , ei. 12 . - s. 1267-1274 . - doi : 10.1038/ncb1334 . — PMID 16284622 .
  35. ↑ Hammond S., Bernstein E., Beach D., Hannon G. RNA-ohjattu nukleaasi välittää transkription jälkeistä geenin hiljentämistä Drosophila-soluissa  // Nature  :  Journal. - 2000. - Voi. 404 , no. 6775 . - s. 293-296 . - doi : 10.1038/35005107 . — PMID 10749213 .
  36. ↑ Bagasra O., Prilliman KR RNA:n häiriö: molekulaarinen immuunijärjestelmä  (neopr.)  // J. Mol. Histol.. - 2004. - T. 35 , nro 6 . - S. 545-553 . - doi : 10.1007/s10735-004-2192-8 . — PMID 15614608 .
  37. ↑ Macrae I., Zhou K., Li F., Repic A., Brooks A., Cande W., Adams P., Doudna J. Kaksijuosteisen RNA:n käsittelyn rakenteellinen perusta dicerillä   // Science : Journal. - 2006. - Voi. 311 , no. 5758 . - s. 195-198 . - doi : 10.1126/tiede.1121638 . — PMID 16410517 .
  38. ↑ Siomi, Haruhiko; Siomi, Mikiko C. Tiellä RNA-häiriökoodin lukemiseen  (englanti)  // Nature  : Journal. - 2009. - 22. tammikuuta ( nide 457 , nro 7228 ). - s. 396-404 . - doi : 10.1038/luonto07754 . — PMID 19158785 .
  39. ↑ Zamore P., Tuschl T., Sharp P., Bartel D. RNAi: kaksijuosteinen RNA ohjaa mRNA:n ATP-riippuvaista pilkkoutumista 21-23 nukleotidin välein  // Cell  :  journal. - Cell Press , 2000. - Voi. 101 , ei. 1 . - s. 25-33 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80620-0 . — PMID 10778853 .
  40. ↑ Vermeulen A., Behlen L., Reynolds A., Wolfson A., Marshall W., Karpilow J., Khvorova A. dsRNA-rakenteen panokset dicer-spesifisyyteen ja tehokkuuteen  //  RNA : Journal. - 2005. - Voi. 11 , ei. 5 . - s. 674-682 . - doi : 10.1261/rna.7272305 . — PMID 15811921 .
  41. ↑ Castanotto, Daniela; Rossi, John J. RNA-häiriöihin perustuvien terapioiden lupaukset ja sudenkuopat  // Nature  :  Journal. - 2009. - 22. tammikuuta ( nide 457 , nro 7228 ). - s. 426-433 . - doi : 10.1038/luonto07758 . — PMID 19158789 .
  42. ↑ 1 2 3 Qiu S., Adema C., Lane T. Laskennallinen tutkimus RNA-häiriön kohteen ulkopuolisista vaikutuksista  //  Nucleic Acids Res : päiväkirja. - 2005. - Voi. 33 , ei. 6 . - P. 1834-1847 . doi : 10.1093 / nar/gki324 . — PMID 15800213 .
  43. ↑ Ahlquist P. RNA-riippuvaiset RNA-polymeraasit, virukset ja RNA:n hiljentäminen   // Tiede . - 2002. - Voi. 296 , nro. 5571 . - s. 1270-1273 . - doi : 10.1126/tiede.1069132 . — PMID 12016304 .
  44. ↑ 1 2 Parker G., Eckert D., Bass B. RDE-4 sitoo ensisijaisesti pitkää dsRNA:ta ja sen dimerisaatio on tarpeen dsRNA:n pilkkomiseksi siRNA  :ksi //  RNA : journal. - 2006. - Voi. 12 , ei. 5 . - s. 807-818 . - doi : 10.1261/rna.2338706 . — PMID 16603715 .
  45. ↑ Liu Q., Rand T., Kalidas S., Du F., Kim H., Smith D., Wang X. R2D2, silta Drosophila RNAi -reitin aloitus- ja efektorivaiheiden välillä  //  Science : Journal. - 2003. - Voi. 301 , no. 5641 . - P. 1921-1925 . - doi : 10.1126/tiede.1088710 . — PMID 14512631 .
  46. ↑ Baulcombe D. Molekyylibiologia. Vahvistettu vaimennus  (englanniksi)  // Tiede. - 2007. - Voi. 315 , nro. 5809 . - s. 199-200 . - doi : 10.1126/tiede.1138030 . — PMID 17218517 .
  47. ↑ Pak J., Fire A. Primaaristen ja sekundaaristen efektorien erilliset populaatiot RNAi:n aikana C. elegansissa  //  Science : Journal. - 2007. - Voi. 315 , nro. 5809 . - s. 241-244 . - doi : 10.1126/tiede.1132839 . — PMID 17124291 .
  48. ↑ Sijen T., Steiner F., Thijssen K., Plasterk R. Toissijaiset siRNA:t syntetisoivat alustamattomasta RNA-synteesistä ja muodostavat erillisen luokan  //  Science : Journal. - 2007. - Voi. 315 , nro. 5809 . - s. 244-247 . - doi : 10.1126/tiede.1136699 . — PMID 17158288 .
  49. ↑ Holmquist G., Ashley T. Kromosomiorganisaatio ja kromatiinin modifikaatio: vaikutus genomin toimintaan ja evoluutioon  //  Sytogenetic and Genome Research : päiväkirja. — Karger Publishers, 2006. - Voi. 114 , nro. 2 . - s. 96-125 . - doi : 10.1159/000093326 . — PMID 16825762 .
  50. ↑ Verdel A., Jia S., Gerber S., Sugiyama T., Gygi S., Grewal S., Moazed D. RNAi-välitteinen heterokromatiinin kohdentaminen RITS-kompleksin avulla  //  Science : Journal. - 2004. - Voi. 303 , no. 5658 . - s. 672-676 . - doi : 10.1126/tiede.1093686 . — PMID 14704433 .
  51. ↑ Irvine D., Zaratiegui M., Tolia N., Goto D., Chitwood D., Vaughn M., Joshua-Tor L., Martienssen R. Argonaute slicing is required for heterochromatic silening and spreading  //  Science : Journal. - 2006. - Voi. 313 , nro. 5790 . - s. 1134-1137 . - doi : 10.1126/tiede.1128813 . — PMID 16931764 .
  52. ↑ Volpe T., Kidner C., Hall I., Teng G., Grewal S., Martienssen R. Heterokromaattisen hiljentämisen ja histoni H3 lysiini-9 metylaation säätely RNAi  :lla //  Science : Journal. - 2002. - Voi. 297 , no. 5588 . - P. 1833-1837 . - doi : 10.1126/tiede.1074973 . — PMID 12193640 .
  53. ↑ Volpe T., Schramke V., Hamilton G., White S., Teng G., Martienssen R., Allshire R. RNA-häiriötä tarvitaan normaaliin sentromeeritoimintoon  fissiohiivassa //  Chromosome Res : journal. - 2003. - Voi. 11 , ei. 2 . - s. 137-146 . - doi : 10.1023/A:1022815931524 . — PMID 12733640 .
  54. ↑ Li LC, Okino ST, Zhao H, Pookot D, Place RF, Urakami S, Enokida H, Dahiya R. (2006). Pienet dsRNA:t indusoivat transkription aktivaation ihmissoluissa. Proc Natl Acad Sci USA 103(46):17337–42. PMID 17085592
  55. ↑ Noma K., Sugiyama T., Cam H., Verdel A., Zofall M., Jia S., Moazed D., Grewal S. RITS toimii cis:ssä edistäen RNA-interferenssivälitteistä transkription ja transkription jälkeistä  hiljentämistä.)  // Nature Genetics  : Journal. - 2004. - Voi. 36 , ei. 11 . - s. 1174-1180 . - doi : 10.1038/ng1452 . — PMID 15475954 .
  56. ↑ Sugiyama T., Cam H., Verdel A., Moazed D., Grewal S. RNA-riippuvainen RNA-polymeraasi on olennainen osa heterokromatiinia itseään sitovassa silmukassa siRNA-tuotantoon   // Proceedings of the National Academy of Sciences Amerikan yhdysvalloista  : Journal. - 2005. - Voi. 102 , no. 1 . - s. 152-157 . - doi : 10.1073/pnas.0407641102 . — PMID 15615848 .
  57. ↑ Wang F., Koyama N., Nishida H., Haraguchi T., Reith W., Tsukamoto T.  Siirtogeenisten toistojen aloittaman heterokromatiinin kokoaminen ja ylläpito ovat riippumattomia RNA-häiriöreitistä nisäkässoluissa  // Mol Cell Biol : päiväkirja. - 2006. - Voi. 26 , nro. 11 . - P. 4028-4040 . - doi : 10.1128/MCB.02189-05 . — PMID 16705157 .
  58. ↑ Bass B. RNA:n muokkaaminen RNA:han vaikuttavien adenosiinideaminaasien toimesta  //  Annu Rev Biochem : päiväkirja. - 2002. - Voi. 71 . - s. 817-846 . - doi : 10.1146/annurev.biochem.71.110601.135501 . — PMID 12045112 .
  59. ↑ Bass B. Kaksijuosteinen RNA mallina geenien vaimentamiseen  // Solu  :  päiväkirja. - Cell Press , 2000. - Voi. 101 , ei. 3 . - s. 235-238 . - doi : 10.1016/S0092-8674(02)71133-1 . — PMID 10847677 .
  60. ↑ Luciano D., Mirsky H., Vendetti N., Maas S. MiRNA -prekursorin RNA-editointi  (neopr.)  // RNA. - 2004. - T. 10 , nro 8 . - S. 1174-1177 . - doi : 10.1261/rna.7350304 . — PMID 15272117 .
  61. ↑ 1 2 Yang W., Chendrimada T., Wang Q., Higuchi M., Seeburg P., Shiekhattar R., Nishikura K. MikroRNA:n prosessoinnin ja ilmentymisen modulointi ADAR-deaminaasien RNA-muokkauksen kautta   // Nature Structural & Molecular Biology  : päiväkirja. - 2006. - Voi. 13 , ei. 1 . - s. 13-21 . doi : 10.1038 / nsmb1041 . — PMID 16369484 .
  62. ↑ Yang W., Wang Q., Howell K., Lee J., Cho D., Murray J., Nishikura K. ADAR1 RNA-deaminaasi rajoittaa lyhyttä häiritsevän RNA:n tehokkuutta nisäkässoluissa  // J Biol Chem  :  Journal. - 2005. - Voi. 280 , no. 5 . - P. 3946-3953 . - doi : 10.1074/jbc.M407876200 . — PMID 15556947 .
  63. ↑ Nishikura K. Toimittaja kohtaa äänenvaimentimen: RNA-muokkauksen ja RNA-häiriön välinen ylikuuluminen  // Nature Reviews Molecular Cell Biology  : Journal  . - 2006. - Voi. 7 , ei. 12 . - s. 919-931 . - doi : 10.1038/nrm2061 . — PMID 17139332 .
  64. ↑ 1 2 3 Saumet A., Lecellier CH Antiviraalinen RNA:n hiljentäminen: näytämmekö kasveilta? (englanniksi)  // BioMed Central. - 2006. - Voi. 3 , ei. 3 . - s. 3 . - doi : 10.1186/1742-4690-3-3 . — PMID 16409629 .
  65. ↑ Jones L., Ratcliff F., Baulcombe DC RNA-ohjattu transkriptionaalinen geenin hiljentäminen kasveissa voi periytyä RNA-laukaisimesta riippumatta ja vaatii Met1:n ylläpitoon  // Current Biology  : Journal  . - Cell Press , 2001. - Voi. 11 , ei. 10 . - s. 747-757 . - doi : 10.1016/S0960-9822(01)00226-3 .
  66. ↑ Humphreys DT, Westman BJ, Martin DI, Preiss T. MikroRNA:t kontrolloivat translaation aloitusta estämällä eukaryoottisen aloitustekijän 4E/cap ja poly(A) hännän toimintaa  //  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America  : Journal. - 2005. - Voi. 102 . - P. 16961-16966 . - doi : 10.1073/pnas.0506482102 . — PMID 16287976 .
  67. ↑ DaRocha W., Otsu K., Teixeira S., Donelson J. Sytoplasmisen RNA-häiriön (RNAi) testit ja tetrasykliinillä indusoitavan T7-promoottorijärjestelmän rakentaminen Trypanosoma cruzissa  //  Mol Biochem Parasitol : Journal. - 2004. - Voi. 133 , nro. 2 . - s. 175-186 . - doi : 10.1016/j.molbiopara.2003.10.005 . — PMID 14698430 .
  68. ↑ Robinson K., Beverley S. Transfektion tehokkuuden parannukset ja RNA-häiriöiden (RNAi) lähestymistapojen testaus Leishmania-alkueläinparasiitissa  //  Mol Biochem Parasitol : Journal. - 2003. - Voi. 128 , nro. 2 . - s. 217-228 . - doi : 10.1016/S0166-6851(03)00079-3 . — PMID 12742588 .
  69. ↑ L. Aravind, Hidemi Watanabe, David J. Lipman ja Eugene V. Koonin. Sukulinjaspesifinen menetys ja funktionaalisesti kytkettyjen geenien eroavaisuus eukaryooteissa  (englanniksi)  // Proceedings of the National Academy of Sciences  : Journal. - 2000. - Voi. 97 , no. 21 . - P. 11319-11324 . - doi : 10.1073/pnas.200346997 . — PMID 11016957 .
  70. ↑ Drinnenberg IA, Weinberg DE, Xie KT, Nower JP, Wolfe KH, Fink GR, Bartel DP RNAi in Budding Yeast   // Tiede . - 2009. - doi : 10.1126/tiede.1176945 . — PMID 19745116 .
  71. ↑  Nakayashiki H., Kadotani N., Mayama S. RNA:ta vaimentavien proteiinien evoluutio ja monipuolistaminen sienissä  // J Mol Evol : päiväkirja. - 2006. - Voi. 63 , no. 1 . - s. 127-135 . - doi : 10.1007/s00239-005-0257-2 . — PMID 16786437 .
  72. ↑ Morita T., Mochizuki Y., Aiba H. Translaatiorepressio riittää geenien hiljentämiseen bakteerien pienillä ei-koodaavilla RNA:illa ilman mRNA:n tuhoutumista  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of  America  : - 2006. - Voi. 103 , no. 13 . - P. 4858-4863 . - doi : 10.1073/pnas.0509638103 . — PMID 16549791 .
  73. ↑ Makarova K., Grishin N., Shabalina S., Wolf Y., Koonin E. Oletettu RNA-häiriöihin perustuva immuunijärjestelmä prokaryooteissa: ennustetun entsymaattisen koneiston laskennallinen analyysi, toiminnalliset analogiat eukaryoottisen RNAi:n kanssa ja hypoteettiset mekanismit toiminta  //  Biol Direct : päiväkirja. - 2006. - Voi. 1 . — s. 7 . - doi : 10.1186/1745-6150-1-7 . — PMID 16545108 .
  74. ↑ Stram Y., Kuzntzova L. Virusten esto RNA-interferenssillä  (määrittämätön)  // Virus Genes. - 2006. - T. 32 , nro 3 . - S. 299-306 . - doi : 10.1007/s11262-005-6914-0 . — PMID 16732482 .
  75. ↑ Blevins T., Rajeswaran R., Shivaprasad P., Beknazariants D., Si-Ammour A., ​​​​Park H., Vazquez F., Robertson D., Meins F., Hohn T., Pooggin M. Neljä kasvia Dicers välittää viruksen pienen RNA:n biogeneesiä ja DNA-viruksen aiheuttamaa hiljentämistä  //  Nucleic Acids Res : päiväkirja. - 2006. - Voi. 34 , no. 21 . - P. 6233-6246 . - doi : 10.1093/nar/gkl886 . — PMID 17090584 .
  76. ↑ Palauqui J., Elmayan T., Pollien J., Vaucheret H. Systeeminen hankittu hiljentäminen: siirtogeenispesifinen transkription jälkeinen hiljentäminen välittyy siirtämällä hiljennetyistä kannoista ei-hiljennetyille poikkileikkauksille   // EMBO J : päiväkirja. - 1997. - Voi. 16 , ei. 15 . - P. 4738-4745 . - doi : 10.1093/emboj/16.15.4738 . — PMID 9303318 .
  77. ↑ Voinnet O. RNA:n hiljentäminen kasvin immuunijärjestelmänä viruksia vastaan  ​​(fr.)  // Trends Genet :lehti. - 2001. - Voi. 17 , nro 8 . _ - s. 449-459 . - doi : 10.1016/S0168-9525(01)02367-8 . — PMID 11485817 .
  78. ↑ 1 2 Lucy A., Guo H., Li W., Li W., Ding S. Transkription jälkeisen geenin vaimentamisen estäminen tumassa lokalisoidulla kasvivirusproteiinilla  //  EMBO J : päiväkirja. - 2000. - Voi. 19 , ei. 7 . - s. 1672-1680 . - doi : 10.1093/emboj/19.7.1672 . — PMID 10747034 .
  79. ↑ Mérai Z., Kerényi Z., Kertész S., Magna M., Lakatos L., Silhavy D. Kaksijuosteisen RNA:n sitoutuminen voi olla yleinen kasvi-RNA-virusstrategia RNA:n hiljentämisen suppressoimiseksi  // J  Virol : päiväkirja. - 2006. - Voi. 80 , ei. 12 . - P. 5747-5756 . - doi : 10.1128/JVI.01963-05 . — PMID 16731914 .
  80. ↑ Katiyar-Agarwal S., Morgan R., Dahlbeck D., Borsani O., Villegas A., Zhu J., Staskawicz B., Jin H.  Patogeenin indusoituva endogeeninen siRNA kasvien immuniteetissa  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States  : Journal. - 2006. - Voi. 103 , no. 47 . - P. 18002-18007 . - doi : 10.1073/pnas.0608258103 . — PMID 17071740 .
  81. ↑ Fritz J., Girardin S., Philpott D. Synnynnäinen immuunipuolustus RNA-interferenssin kautta  // Sci  STKE : päiväkirja. - 2006. - Voi. 2006 , no. 339 . — P. pe27 . - doi : 10.1126/stke.3392006pe27 . — PMID 16772641 .
  82. ↑ Zambon R., Vakharia V., Wu L. RNAi on antiviraalinen immuunivaste dsRNA-virusta vastaan ​​Drosophila melanogasterissa  (neopr.)  // Cell Microbiol. - 2006. - T. 8 , nro 5 . - S. 880-889 . - doi : 10.1111/j.1462-5822.2006.00688.x . — PMID 16611236 .
  83. ↑ Wang X., Aliyari R., Li W., Li H., Kim K., Carthew R., Atkinson P., Ding S. RNA-häiriö ohjaa synnynnäistä immuniteettia viruksia vastaan ​​aikuisessa Drosophilassa  //  Science : Journal. - 2006. - Voi. 312 , nro. 5772 . - s. 452-454 . - doi : 10.1126/tiede.1125694 . — PMID 16556799 .
  84. ↑ Lu R., Maduro M., Li F., Li H., Broitman-Maduro G., Li W., Ding S. Animal virus replikation and RNAi-mediated antiviral silenceing in Caenorhabditis elegans  //  Nature : Journal. - 2005. - Voi. 436 , no. 7053 . - s. 1040-1043 . - doi : 10.1038/luonto03870 . — PMID 16107851 .
  85. ↑ Wilkins C., Dishongh R., Moore S., Whitt M., Chow M., Machaca K. RNA-häiriö on antiviraalinen puolustusmekanismi Caenorhabditis elegansissa  //  Nature: Journal. - 2005. - Voi. 436 , no. 7053 . - s. 1044-1047 . - doi : 10.1038/luonto03957 . — PMID 16107852 .
  86. ↑ Berkhout B., Haasnoot J. Vuorovaikutus virusinfektion ja solujen RNA-häiriökoneiston välillä  //  FEBS Lett : päiväkirja. - 2006. - Voi. 580 , no. 12 . - P. 2896-2902 . - doi : 10.1016/j.febslet.2006.02.070 . — PMID 16563388 .
  87. ↑ Schütz S., Sarnow P. Virusten vuorovaikutus nisäkkään RNA-häiriöreitin kanssa  (englanniksi)  // Virology : Journal. - 2006. - Voi. 344 , no. 1 . - s. 151-157 . - doi : 10.1016/j.virol.2005.09.034 . — PMID 16364746 .
  88. ↑ Cullen B. Liittyykö RNA-häiriö nisäkkäiden luontaiseen antiviraaliseen immuniteettiin? (englanniksi)  // Nature Immunology  : Journal. - 2006. - Voi. 7 , ei. 6 . - s. 563-567 . - doi : 10.1038/ni1352 . — PMID 16715068 .
  89. ↑ PV Maillard, C. Ciaudo, A. Marchais, Y. Li, F. Jay, SW Ding ja Olivier Voinnet (2013) Antiviral RNA Interference in Mammalian Cells. Science, 342(6155), 235-238 DOI: 10.1126/science.1241930
  90. ↑ Yang Li, Jinfeng Lu, Yanhong Han, Xiaoxu Fan ja Shou-Wei Ding (2013) RNA Interference Functions as a Antiviral Immunity Mechanism in Mammals. Science, 342(6155), 231-234 DOI: 10.1126/science.1241911
  91. ↑ Li H., Ding S. Antiviral silenceing in animals  //  FEBS Lett : päiväkirja. - 2005. - Voi. 579 , no. 26 . - P. 5965-5973 . - doi : 10.1016/j.febslet.2005.08.034 . — PMID 16154568 .
  92. ↑ Madhu S. Kumar, Ryan E. Pester, Cindy Y. Chen, Keara Lane, Christine Chin, Jun Lu, David G. Kirsch, Todd R. Golub, Tyler Jacks. Dicer1 toimii haploinsufficient-kasvainsuppressorina  // Genes & Dev. - 2009. - T. 23 . - S. 2700-2704 .
  93. ↑ PV Maillard, C. Ciaudo, A. Marchais, Y. Li, F. Jay, SW Ding ja Olivier Voinnet (2013) Antiviral RNA Interference in Mammalian Cells. Science, 342(6155), 235-238 doi : 10.1126/science.1241930
  94. ↑ Yang Li, Jinfeng Lu, Yanhong Han, Xiaoxu Fan ja Shou-Wei Ding (2013) RNA Interference Functions as a Antiviral Immunity Mechanism in Mammals" Science 342 (6155), 231-234 doi : 10.112124191212/s
  95. ↑ Li H., Ding S. Antiviral silenceing in animals  //  FEBS Lett : päiväkirja. - 2005. - Voi. 579 , no. 26 . - P. 5965-5973 . - doi : 10.1016/j.febslet.2005.08.034 . — PMID 16154568 .
  96. ↑ Carrington J., Ambros V. MikroRNA:iden rooli kasvien ja eläinten kehityksessä   // Tiede . - 2003. - Voi. 301 , no. 5631 . - s. 336-338 . - doi : 10.1126/tiede.1085242 . — PMID 12869753 .
  97. ↑ Lee R., Feinbaum R., Ambros V. C. elegansin heterokrooninen geeni lin-4 koodaa pieniä RNA:ita, joilla on antisense-komplementaarisuus lin-14  :lle // Cell  :  journal. - Cell Press , 1993. - Voi. 75 , no. 5 . - s. 843-854 . - doi : 10.1016/0092-8674(93)90529-Y . — PMID 8252621 .
  98. ↑ Palatnik J., Allen E., Wu X., Schommer C., Schwab R., Carrington J., Weigel D. Control of leaf morphogenesis by microRNAs   // Nature . - 2003. - Voi. 425 , no. 6955 . - s. 257-263 . - doi : 10.1038/luonto01958 . — PMID 12931144 .
  99. ↑ Zhang B., Pan X., Cobb G., Anderson T. Kasvien mikroRNA: pieni säätelymolekyyli, jolla on suuri vaikutus  //  Dev Biol : päiväkirja. - 2006. - Voi. 289 , no. 1 . - s. 3-16 . - doi : 10.1016/j.ydbio.2005.10.036 . — PMID 16325172 .
  100. ↑ Jones-Rhoades M., Bartel D., Bartel B. MicroRNAS ja niiden sääntelyroolit kasveissa  // Annu Rev Plant Biol  : Journal  . - 2006. - Voi. 57 . - s. 19-53 . - doi : 10.1146/annurev.arplant.57.032905.105218 . — PMID 16669754 .
  101. ↑ Zhang B., Pan X., Cobb G., Anderson T. mikroRNA:t onkogeeneinä ja kasvainsuppressoreina  //  Dev Biol : päiväkirja. - 2007. - Voi. 302 , no. 1 . - s. 1-12 . - doi : 10.1016/j.ydbio.2006.08.028 . — PMID 16989803 .
  102. ↑ Tarkista E. RNA-häiriöt: päällekytkimen painaminen   // Luonto . - 2007. - Voi. 448 , no. 7156 . - s. 855-858 . - doi : 10.1038/448855a . — PMID 17713502 .
  103. ↑ Li LC, Okino ST, Zhao H. et ai. Pienet dsRNA:t indusoivat transkription aktivaation ihmissoluissa  (englanniksi)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America  : Journal. - 2006. - Voi. 103 , no. 46 . - P. 17337-17342 . - doi : 10.1073/pnas.0607015103 . — PMID 17085592 .
  104. ↑ 1 2 3 Cerutti H., Casas-Mollano J. RNA-välitteisen hiljentämisen alkuperästä ja toiminnoista: protisteista ihmiseen  //  Curr Genet : Journal. - 2006. - Voi. 50 , ei. 2 . - s. 81-99 . - doi : 10.1007/s00294-006-0078-x . — PMID 16691418 .
  105. ↑ 1 2 Anantharaman V., Koonin E., Aravind L. RNA-metaboliaan osallistuvien proteiinien vertaileva genomiikka ja evoluutio  //  Nucleic Acids Res : päiväkirja. - 2002. - Voi. 30 , ei. 7 . - s. 1427-1464 . doi : 10.1093 / nar/30.7.1427 . — PMID 11917006 .
  106. ↑ Buchon N., Vaury C. RNAi: puolustava RNA-hiljennys viruksia ja transposoituvia elementtejä vastaan  ​​(fr.)  // Perinnöllisyys : aikakauslehti. - 2006. - Voi. 96 , nro 2 . _ - s. 195-202 . - doi : 10.1038/sj.hdy.6800789 . — PMID 16369574 .
  107. ↑ Obbard D., Jiggins F., Halligan D., Little T. Luonnonvalinta ajaa erittäin nopeaa kehitystä antiviraalisissa RNAi-geeneissä  // Curr Biol  : Journal  . - 2006. - Voi. 16 , ei. 6 . - s. 580-585 . - doi : 10.1016/j.cub.2006.01.065 . — PMID 16546082 .
  108. ↑ Voorhoeve PM, Agami R. Knockdown nousee ylös  // Trends Biotechnol  . : päiväkirja. - 2003. - Voi. 21 , ei. 1 . - s. 2-4 . - doi : 10.1016/S0167-7799(02)00002-1 . — PMID 12480342 .
  109. ↑ Naito Y., Yamada T., Matsumiya T., Ui-Tei K., Saigo K., Morishita S.  dsCheck : erittäin herkkä kohteen ulkopuolinen hakuohjelmisto kaksijuosteisille RNA-välitteisille RNA-häiriöille  // Nucleic Acids Res : päiväkirja. - 2005. - Voi. 33 , ei. Verkkopalvelimen ongelma . —P.W589-91 . _ doi : 10.1093 / nar/gki419 . — PMID 15980542 .
  110. ↑ Henschel A., Buchholz F., Habermann B. DEQOR: verkkopohjainen työkalu siRNA:iden suunnitteluun ja laadunvalvontaan   // Nucleic Acids Res : päiväkirja. - 2004. - Voi. 32 , ei. Verkkopalvelimen ongelma . —P.W113—20 . _ doi : 10.1093 / nar/gkh408 . — PMID 15215362 .
  111. ↑ Naito Y., Yamada T., Ui-Tei K., Morishita S., Saigo K. siDirect: erittäin tehokas, kohdespesifinen siRNA-suunnitteluohjelmisto nisäkkäiden RNA-häiriöihin  //  Nucleic Acids Res : päiväkirja. - 2004. - Voi. 32 , ei. Verkkopalvelimen ongelma . —P.W124—9 . _ doi : 10.1093 / nar/gkh442 . — PMID 15215364 .
  112. ↑ Naito Y., Ui-Tei K., Nishikawa T., Takebe Y., Saigo K. siVirus: verkkopohjainen antiviraalinen siRNA-suunnitteluohjelmisto erittäin erilaisille virussekvensseille  //  Nucleic Acids Res : päiväkirja. - 2006. - Voi. 34 , no. Verkkopalvelimen ongelma . —P.W448-50 . _ doi : 10.1093 / nar/gkl214 . — PMID 16845046 .
  113. ↑ Reynolds A., Anderson E., Vermeulen A., Fedorov Y., Robinson K., Leake D., Karpilow J., Marshall W., Khvorova A. Interferonivasteen induktio siRNA:lla on solutyyppi- ja dupleksipituus -riippuvainen  (englanniksi)  // RNA : päiväkirja. - 2006. - Voi. 12 , ei. 6 . - P. 988-993 . - doi : 10.1261/rna.2340906 . — PMID 16611941 .
  114. ↑ Stein P., Zeng F., Pan H., Schultz R. Pitkän kaksijuosteisen RNA:n laukaiseman RNA-häiriön epäspesifisten vaikutusten puuttuminen hiiren munasoluissa  //  Dev Biol : päiväkirja. - 2005. - Voi. 286 , nro. 2 . - s. 464-471 . - doi : 10.1016/j.ydbio.2005.08.015 . — PMID 16154556 .
  115. ↑ Brummelkamp T., Bernards R., Agami R. Järjestelmä lyhyiden häiritsevien RNA:iden vakaalle ilmentymiselle nisäkässoluissa  //  Science : Journal. - 2002. - Voi. 296 , nro. 5567 . - s. 550-553 . - doi : 10.1126/tiede.1068999 . — PMID 11910072 .
  116. ↑ Tiscornia G., Tergaonkar V., Galimi F., Verma I.  CRE-rekombinaasilla indusoitava RNA-häiriö lentivirusvektoreiden välittämänä  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America  : Journal. - 2004. - Voi. 101 , ei. 19 . - P. 7347-7351 . - doi : 10.1073/pnas.0402107101 . — PMID 15123829 .
  117. ↑ Ventura A., Meissner A., ​​Dillon C., McManus M., Sharp P., Van Parijs L., Jaenisch R , Jacks T. Cre-lox-regulated ehdollinen RNA-häiriö siirtogeeneistä  //  Proceedings of the National Amerikan yhdysvaltojen tiedeakatemia  : aikakauslehti. - 2004. - Voi. 101 , ei. 28 . - P. 10380-10385 . - doi : 10.1073/pnas.0403954101 . — PMID 15240889 .
  118. ↑ Gilbert, LA, Larson, MH, Morsut, L., et ai. & Qi, LS (2013) CRISPR-välitteinen modulaarinen RNA-ohjattu transkription säätely eukaryooteissa . Cell, 154(2), 442-451 doi: 10.1016/j.cell.2013.06.044
  119. ↑ Brock T., Browse J., Watts J. Tyydyttymättömien rasvahappojen geneettinen säätely C. elegansissa  //  PLoS Genet : päiväkirja. - 2006. - Voi. 2 , ei. 7 . — P.e108 . - doi : 10.1371/journal.pgen.0020108 . — PMID 16839188 . Arkistoitu alkuperäisestä 22. helmikuuta 2008.
  120. ↑ Kamath R., Ahringer J. Genominlaajuinen RNAi-seulonta Caenorhabditis elegansissa  (neopr.)  // Methods. - 2003. - T. 30 , nro 4 . - S. 313-321 . - doi : 10.1016/S1046-2023(03)00050-1 . — PMID 12828945 .
  121. ↑ Boutros M., Kiger A., ​​Armknecht S., Kerr K., Hild M., Koch B., Haas S., Paro R., Perrimon N. Genominlaajuinen RNAi- analyysi kasvusta ja elinkelpoisuudesta Drosophila-soluissa  .)  // Tiede: lehti. - 2004. - Voi. 303 , no. 5659 . - s. 832-835 . - doi : 10.1126/tiede.1091266 . — PMID 14764878 .
  122. ↑ Fortunato A., Fraser A. Selvitä geneettisiä vuorovaikutuksia Caenorhabditis elegansissa RNA-interferenssin avulla  //  Biosci Rep: Journal. - 2005. - Voi. 25 , ei. 5-6 . - s. 299-307 . - doi : 10.1007/s10540-005-2892-7 . — PMID 16307378 .
  123. ↑ Cullen L., Arndt G. Genominlaajuinen geenitoiminnan seulonta käyttämällä RNAi:ta nisäkässoluissa  //  Immunol Cell Biol : päiväkirja. - 2005. - Voi. 83 , no. 3 . - s. 217-223 . - doi : 10.1111/j.1440-1711.2005.01332.x . — PMID 15877598 .
  124. ↑ Huesken D., Lange J., Mickanin C., Weiler J., Asselbergs F., Warner J., Meloon B., Engel S., Rosenberg A., Cohen D., Labow M., Reinhardt M., Natt F., Hall J. Genominlaajuisen siRNA-kirjaston suunnittelu keinotekoista hermoverkkoa käyttäen  // Nature Biotechnology  : Journal  . - Nature Publishing Group , 2005. - Voi. 23 , ei. 8 . - s. 995-1001 . - doi : 10.1038/nbt1118 . — PMID 16025102 .
  125. ↑ Ge G., Wong G., Luo B. SiRNA:n knockdown-tehokkuuden ennustaminen keinotekoisten hermoverkkomallien avulla  // Biochem  Biophys Res Commun : päiväkirja. - 2005. - Voi. 336 , nro. 2 . - s. 723-728 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2005.08.147 . — PMID 16153609 .
  126. ↑ Janitz M., Vanhecke D., Lehrach H. High-throughput RNA interference infunctional genomics  //  Handb Exp Pharmacol : Journal. - 2006. - Voi. 173 . - s. 97-104 . - doi : 10.1007/3-540-27262-3_5 . — PMID 16594612 .
  127. ↑ Vanhecke D., Janitz M. Funktionaalinen genomiikka korkean suorituskyvyn RNA-häiriöillä  // Drug Discov  Today : päiväkirja. - 2005. - Voi. 10 , ei. 3 . - s. 205-212 . - doi : 10.1016/S1359-6446(04)03352-5 . — PMID 15708535 .
  128. ↑ Geldhof P., Murray L., Couthier A., ​​Gilleard J., McLauchlan G., Knox D., Britton C. RNA-häiriöiden tehokkuuden testaus Haemonchus contortusissa  // International  Journal for Parasitology : päiväkirja. - Elsevier , 2006. - Voi. 36 , ei. 7 . - s. 801-810 . - doi : 10.1016/j.ijpara.2005.12.004 . — PMID 16469321 .
  129. ↑ Geldhof P., Visser A., ​​​​Clark D., Saunders G., Britton C., Gilleard J., Berriman M., Knox D. RNA-häiriö loishelminteissä: nykyinen tilanne , mahdolliset sudenkuopat ja tulevaisuuden näkymät   // Parasitologia: päiväkirja. - 2007. - Voi. 134 . - s. 1-11 . - doi : 10.1017/S0031182006002071 . — PMID 17201997 .
  130. ↑ Travella S., Klimm T., Keller B. RNA-häiriöihin perustuva geenin hiljentäminen tehokkaana työkaluna toiminnalliseen genomiikkaan heksaploidisessa leipävehnässä  // Plant Physiology  : Journal  . - American Society of Plant Biologists , 2006. - Voi. 142 , nro. 1 . - s. 6-20 . - doi : 10.1104/pp.106.084517 . — PMID 16861570 .
  131. ↑ McGinnis K., Chandler V., Cone K., Kaeppler H., Kaeppler S., Kerschen A., Pikaard C., Richards E., Sidorenko L., Smith T., Springer N., Wulan T. Transgene- indusoitu RNA-häiriö työkaluna kasvien toiminnalliseen genomiikkaan  // Methods Enzymol  :  Journal. - 2005. - Voi. 392 . - s. 1-24 . - doi : 10.1016/S0076-6879(04)92001-0 . — PMID 15644172 .
  132. ↑ Paddison P., Caudy A., Hannon G. RNAi:n geeniekspression vakaa suppressio nisäkässoluissa  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America  : Journal  . - 2002. - Voi. 99 , ei. 3 . - s. 1443-1448 . - doi : 10.1073/pnas.032652399 . — PMID 11818553 .
  133. ↑ Sah D. RNA:n häiriön terapeuttinen potentiaali neurologisille häiriöille  // Life  Sci : päiväkirja. - 2006. - Voi. 79 , ei. 19 . - s. 1773-1780 . - doi : 10.1016/j.lfs.2006.06.011 . — PMID 16815477 .
  134. ↑ Zender L., Hutker S., Liedtke C., Tillmann H., Zender S., Mundt B., Waltemathe M., Gosling T., Flemming P., Malek N., Trautwein C., Manns M., Kuhnel F., Kubicka S. Kaspaasi 8:n pieni häiritsevä RNA estää akuutin maksan vajaatoiminnan hiirillä  (englanniksi)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America  : Journal. - 2003. - Voi. 100 , ei. 13 . - P. 7797-7802 . - doi : 10.1073/pnas.1330920100 . — PMID 12810955 .
  135. ↑ Jiang M., Milner J. Virusgeenin ilmentymisen selektiivinen hiljentäminen HPV-positiivisissa ihmisen kohdunkaulan karsinoomasoluissa, joita on käsitelty siRNA:lla, RNA-  häiriön alukkeella //  Onkogeeni : päiväkirja. - 2002. - Voi. 21 , ei. 39 . - P. 6041-6048 . - doi : 10.1038/sj.onc.1205878 . — PMID 12203116 .
  136. ↑ Crowe S. Kemokiinireseptorin ilmentymisen suppressio RNA-interferenssillä mahdollistaa HIV-1:n replikaation estämisen, Martínez et al  //  AIDS : Journal. - 2003. - Voi. 17 Supple 4 . - P.S103-5 . — PMID 15080188 .
  137. ↑ Kusov Y., Kanda T., Palmenberg A., Sgro J., Gauss-Müller V. Hepatiitti A -virusinfektion vaimentaminen pienten häiritsevien RNA:iden avulla  // J  Virol : päiväkirja. - 2006. - Voi. 80 , ei. 11 . - P. 5599-5610 . - doi : 10.1128/JVI.01773-05 . — PMID 16699041 .
  138. ↑ Jia F., Zhang Y., Liu C. Retroviruspohjainen järjestelmä hepatiitti B -viruksen geenien vakaaseen hiljentämiseen RNA-interferenssin avulla  // Biotechnol  Lett : päiväkirja. - 2006. - Voi. 28 , ei. 20 . - s. 1679-1685 . - doi : 10.1007/s10529-006-9138-z . — PMID 16900331 .
  139. ↑ Li Y., Kong L., Cheng B., Li K. Influenssaviruksen siRNA-ekspressiovektorien rakentaminen ja niiden estovaikutukset influenssaviruksen lisääntymiseen  //  Avian Dis : päiväkirja. - 2005. - Voi. 49 , ei. 4 . - s. 562-573 . - doi : 10.1637/7365-041205R2.1 . — PMID 16405000 .
  140. ↑ Hu L., Wang Z., Hu C., Liu X., Yao L., Li W., Qi Y. Tuhkarokkoviruksen lisääntymisen estäminen soluviljelmässä RNA-häiriöillä  //  Acta Virol : Journal. - 2005. - Voi. 49 , ei. 4 . - s. 227-234 . — PMID 16402679 .
  141. ↑ Raoul C., Barker S., Aebischer P. Viruspohjainen mallinnus ja neurodegeneratiivisten sairauksien korjaus RNA-häiriöillä  //  Gene Ther : Journal. - 2006. - Voi. 13 , ei. 6 . - s. 487-495 . - doi : 10.1038/sj.gt.3302690 . — PMID 16319945 .
  142. ↑ Putral L., Gu W., McMillan N. RNA-häiriöt syövän hoitoon  (neopr.)  // Drug News Perspect. - 2006. - T. 19 , nro 6 . - S. 317-324 . - doi : 10.1358/dnp.2006.19.6.985937 . — PMID 16971967 .
  143. ↑ Izquierdo M. Lyhyet häiritsevät RNA:t syövän geeniterapian työkaluna  //  Cancer Gene Ther : Journal. - 2005. - Voi. 12 , ei. 3 . - s. 217-227 . - doi : 10.1038/sj.cgt.7700791 . — PMID 15550938 .
  144. ↑ Li C., Parker A., ​​​​Menocal E., Xiang S., Borodyansky L., Fruehauf J. RNA-häiriöiden   toimittaminen // Cell Cycle : päiväkirja. - 2006. - Voi. 5 , ei. 18 . - s. 2103-2109 . — PMID 16940756 .
  145. ↑ Takeshita F., Ochiya T. RNA:n häiriön terapeuttinen potentiaali syöpää vastaan  ​​//  Cancer Sci : päiväkirja. - 2006. - Voi. 97 , no. 8 . - s. 689-696 . - doi : 10.1111/j.1349-7006.2006.00234.x . — PMID 16863503 .
  146. ↑ Tong A., Zhang Y., Nemunaitis J. Pieni häiritsevä RNA kokeelliseen syövän hoitoon  (englanniksi)  // Current Opinion in Molecular Therapeutics  : Journal. - 2005. - Voi. 7 , ei. 2 . - s. 114-124 . — PMID 15844618 .
  147. ↑ Grimm D., Streetz K., Jopling C., Storm T., Pandey K., Davis C., Marion P., Salazar F., Kay M. Kuolema hiirillä solun mikroRNA:n/lyhyiden hiusneula-RNA-reittien ylikyllästymisestä  (englanti)  // Luonto  : päiväkirja. - 2006. - Voi. 441 , no. 7092 . - s. 537-541 . - doi : 10.1038/luonto04791 . — PMID 16724069 .
  148. ↑ Joten C. Wong, Jason J. Klein, Holly L. Hamilton et ai. ja David L. Lewis (2012) Kohdennetun, palautuvasti peitetyn endosomolyyttisen polymeerin yhteisinjektio parantaa dramaattisesti kolesterolikonjugoitujen pienten häiritsevien RNA:iden tehokkuutta in vivo. Nucleic Acid Therapeutics., 22(6): 380-390. doi:10.1089/nat.2012.0389
  149. ↑ Berkhout, B; ter Brake, O. RNAi-geeniterapia HIV-1-infektion hallitsemiseksi // RNA-häiriöt ja virukset : Nykyiset innovaatiot ja tulevaisuuden trendit  . – Caister Academic Press, 2010. - ISBN 978-1-904455-56-1 .
  150. ↑ Sunilkumar G., Campbell L., Puckhaber L., Stipanovic R., Rathore K. Puuvillansiementen suunnittelu ihmisravinnoksi vähentämällä toksisen gossypolin kudosspesifistä määrää   // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America  : päiväkirja. - 2006. - Voi. 103 , no. 48 . - P. 18054-18059 . - doi : 10.1073/pnas.0605389103 . — PMID 17110445 .
  151. ↑ Siritunga D., Sayre R. Syaanittoman siirtogeenisen maniokin  (neopr.) syntyminen  // Planta. - 2003. - T. 217 , nro 3 . - S. 367-373 . - doi : 10.1007/s00425-003-1005-8 . — PMID 14520563 .
  152. ↑ Le L., Lorenz Y., Scheurer S., Fötisch K., Enrique E., Bartra J., Biemelt S., Vieths S., Sonnewald U. Design of Tomaattihedelmät, joilla on vähentynyt allergeenisuus by dsRNAi-mediated inhibition of ns -LTP (Lyc e 3) -ilmaisu  (englanniksi)  // Plant Biotechnol J : päiväkirja. - 2006. - Voi. 4 , ei. 2 . - s. 231-242 . - doi : 10.1111/j.1467-7652.2005.00175.x . — PMID 17177799 .
  153. ↑ Gavilano L., Coleman N., Burnley L., Bowman M., Kalengamaliro N., Hayes A., Bush L., Siminszky B. Nicotiana tabacumin geenitekniikka vähennetyn nornikotiinipitoisuuden vuoksi  // J Agric  Food : päiväkirja. - 2006. - Voi. 54 , nro. 24 . - P. 9071-9078 . - doi : 10.1021/jf0610458 . — PMID 17117792 .
  154. ↑ Allen R., Millgate A., Chitty J., Thisleton J., Miller J., Fist A., Gerlach W., Larkin P. RNAi-välitteinen morfiinin korvaaminen ei - narkoottisella alkaloidilla retikuliinilla oopiumiunikossa   // Nature Biotechnology  : päiväkirja. - Nature Publishing Group , 2004. - Voi. 22 , ei. 12 . - P. 1559-1566 . - doi : 10.1038/nbt1033 . — PMID 15543134 .
  155. ↑ Zadeh A., Foster G. Siirtogeeninen vastustuskyky tupakkarengaspilkkuvirukselle  (neopr.)  // Acta Virol. - 2004. - T. 48 , nro 3 . - S. 145-152 . — PMID 15595207 .
  156. ↑ Niggeweg R., Michael A., Martin C. Suunniteltu kasveja, joissa on lisääntynyt antioksidanttikloorigeenihappojen taso  // Nature Biotechnology  : Journal  . - Nature Publishing Group , 2004. - Voi. 22 , ei. 6 . - s. 746-754 . - doi : 10.1038/nbt966 . — PMID 15107863 .
  157. ↑ Sanders R., Hiatt W. Tomaatin siirtogeenirakenne ja hiljentäminen  // Nature Biotechnology  : Journal  . - Nature Publishing Group , 2005. - Voi. 23 , ei. 3 . - s. 287-289 . - doi : 10.1038/nbt0305-287b . — PMID 15765076 .
  158. ↑ Chiang C., Wang J., Jan F., Yeh S., Gonsalves D. Rekombinanttipapaijan rengastäplävirusten vertailureaktiot kimeeristen kuoriproteiini (CP) -geenien ja villityypin virusten kanssa CP-siirtogeenisessä   papaijassa // Journal of General Virologia : päiväkirja. — Mikrobiologian seura, 2001. - Voi. 82 , nro. Pt 11 . - P. 2827-2836 . — PMID 11602796 .
  159. ↑ Abdurakhmonov IY, Buriev ZT, Saha S, Jenkins JN, Abdukarimov A, Pepper AE. 2014. Puuvilla PHYA1 RNAi parantaa puuvillan (Gossypium hirsutum L) kuitujen laatua ja agronomisia ominaisuuksia. Nature Communications 4:3062; DOI: 10. 1038/ncomms4062

Kirjallisuus

Linkit

  Siirry Wikidata-kohteeseen  Sanakirjat ja tietosanakirjat
Bibliografisissa luetteloissa