Alkalinen fosfataasi, istukka

Alkalinen fosfataasi, istukan tyyppi , joka tunnetaan myös nimellä istukan alkalinen fosfataasi ( PLAP ), on allosteerinen entsyymi , jota ihmisissä koodaa ALPP -geeni [1] [2] [3] , joka sijaitsee ihmisellä kromosomin 2 [4] lyhyessä haarassa . Proteiinipolypeptidiketjun pituus on 535 aminohappoa ja molekyylipaino 57 954 [5] .

Genomin koodaama proteiini luokitellaan toiminnan mukaan hydrolaasiksi . Mukana sellaisessa biologisessa prosessissa kuin polymorfismi. Proteiinilla on sitoutumiskohta metalli-ioneille, sinkki -ioneille , magnesium -ioneille . Lokalisoituu solukalvoon .

Gene

On olemassa ainakin neljä erillistä, mutta toisiinsa liittyvää alkalista fosfataasia: suoliston ( ALPI ), istukan (tämä entsyymi), istukan kaltainen ( ALPPL2 ) ja kudos-epäspesifinen (maksa/luu/munuainen) ( ALPL ). Kolme ensimmäistä sijaitsevat yhdessä kromosomissa 2, kun taas kudosspesifinen muoto sijaitsee kromosomissa 1. Tämän alkalisen fosfataasin muodon koodaava sekvenssi on ainutlaatuinen siinä mielessä, että 3'-transloitumaton alue sisältää useita kopioita Alu-perheen toistosta. Lisäksi tämä geeni on polymorfinen ja kolme yleistä alleelia (tyyppi 1, tyyppi 2 ja tyyppi 3) tälle alkalisen fosfataasin muodolle ovat hyvin karakterisoituja [3] .

Toiminto

Istukan tyyppinen alkalinen fosfataasi on kalvoon sitoutunut glykosyloitunut dimeerinen entsyymi, jota kutsutaan myös lämmönkestäväksi muodoksi ja joka ilmentyy ensisijaisesti istukassa, vaikka se onkin läheistä sukua suoliston ja istukan kaltaiselle muodolle [3] .

Kliininen merkitys

PLAP on kasvainmerkki, erityisesti seminoomassa [6] [7] [8] ja munasarjasyövässä , kuten dysgerminoomassa ) [9] . PLAP on merkittävä vain tupakoimattomilla, koska tupakointi häiritsee PLAP-mittausta [10] , koska seerumin PLAP-pitoisuudet kasvavat jopa 10-kertaisiksi tupakoitsijoilla ja siksi sen mittauksella on vähän merkitystä tässä ryhmässä [11] .

Katso myös

• Alkalinen fosfataasi
• Hapan fosfataasi

Muistiinpanot

1. ↑ "Istukan alkalisen fosfataasin cDNA:n kloonaus, sekvensointi ja kromosomilokalisointi". Proc Natl Acad Sci USA . 82 (24): 8715-9. Helmikuu 1986. doi : 10.1073/ pnas.82.24.8715 . PMID 3001717 . 
2. ↑ "Kahden yhteisen alleelin tuotteet ihmisen istukan alkalisen fosfataasin lokuksessa eroavat seitsemällä aminohapolla". Proc Natl Acad Sci USA . 83 (15): 5597-601. Syyskuu 1986. doi : 10.1073/pnas.83.15.5597 . PMID  3461452 .
3. ↑ 1 2 3 Entrez-geeni: ALPP-alkalinen fosfataasi, istukka (Regan-isotsyymi) . (määrätön)
4. ↑ HUGO-geeninimikkeistökomitea, HGNC:  439  ? . Haettu: 28. elokuuta 2017.  (määrätön)
5. ↑ UniProt  ,  P05187 . Haettu: 28. elokuuta 2017.  (määrätön)
6. ↑ Tuumorimarkkereita käsittelevä eurooppalainen ryhmä. Eurooppalainen kasvainmarkkereita käsittelevä asiantuntijaryhmä. sukusolusyöpä. . Arkistoitu alkuperäisestä 26. huhtikuuta 2012. (määrätön)
7. ↑ W. Albrecht (2004). "Kvestikulaariset kasvainmerkit: Kulmakivet pahanlaatuisten sukusolukasvainten hoidossa" (PDF) . J Lab Med . 28 (2): 109-115. DOI : 10.1515/labmed.2004.018 .
8. ↑ Sturgeon C (elokuu 2002). "Käytännölliset ohjeet kasvainmerkkiaineiden käyttöön klinikalla." Clin. Chem . 48 (8): 1151-9. DOI : 10.1093/clinchem/48.8.1151 . PMID  12142367 .
9. ↑ Fishman W.H. (joulukuu 1987). "Isotsyymikasvainmarkkerin - PLAP:n kliininen ja biologinen merkitys." Clin. Biochem . 20 (6): 387-92. DOI : 10.1016/0009-9120(87)90003-8 . PMID  3325192 .
10. ↑ "Eurooppalainen konsensus sukusolusyövän diagnosoinnista ja hoidosta: European Genm Cell Cancer Consensus Groupin (EGCCCG) raportti". Annals of Oncology . 15 (9): 1377-99. Syyskuu 2004. doi : 10.1093/ annonc /mdh301 . PMID  15319245 .
11. ↑ Kasvainmarkkerit kivessyövissä . Arkistoitu alkuperäisestä 12. marraskuuta 2010. (määrätön)

Lue lisää

• Nye KE, Riley GA, Pinching AJ (1992). "Fosfatidyyli-inositolin hydrolyysireitissä HIV-tartunnan saaneissa lymfosyyteissä ja lymfoblastoidisoluissa havaittu vika johtuu inositoli-1,4,5-trifosfaatti-1,3,4,5-tetrakisfosfaatti-5-fosfomonoesteraasin estämisestä. " Clin. Exp. Immunol . 89 (1): 89-93. DOI : 10.1111/j.1365-2249.1992.tb06883.x . PMC  1554388 . PMID  1321014 .
• Lowe M.E. (1992). "Paikkaspesifiset mutaatiot istukan alkalisen fosfataasin COOH-päässä: yksi aminohappomuutos muuttaa fosfatidyyli-inositoli-glykaaniin ankkuroidun proteiinin eritetyksi proteiiniksi" . J. Cell Biol . 116 (3): 799-807. DOI : 10.1083/jcb.116.3.799 . PMC2289307  _ _ PMID  1730777 .
• Micanovic R, Gerber LD, Berger J, Kodukula K, Udenfriend S (1990). "Fosfatidyyli-inositoli-glykaaniin ankkuroitujen kalvoproteiinien katkaisu-/kiinnittymiskohdan selektiivisyys määritettynä paikkaspesifisellä mutageneesillä istukan alkalisen fosfataasin Asp-484:ssä" . Proc. Natl. Acad. sci. USA . 87 (1): 157-61. DOI : 10.1073/pnas.87.1.157 . PMC  53219 . PMID2153284  . _
• Martin D, Spurr NK, Trowsdale J (1988). "ihmisen istukan alkalisen fosfataasigeenin (PLAP) RFLP" . Nucleic Acids Res . 15 (21): 9104. doi : 10.1093 /nar/15.21.9104 . PMC  306450 . PMID  2891112 .
• Knoll BJ, Rothblum KN, Longley M (1988). "Ihmisen istukan alkalisen fosfataasigeenin nukleotidisekvenssi. Viereisen 5'-alueen evoluutio deleetiolla/substituutiolla”. J Biol. Chem . 263 (24): 12020-7. PMID  3042787 .
• Micanovic R, Bailey CA, Brink L, Gerber L, Pan YC, Hulmes JD, Udenfriend S (1988). "Nousevan istukan alkalisen fosfataasin asparagiinihappo-484 kondensoituu fosfatidyyli-inositoliglykaanin kanssa, jolloin siitä tulee kypsän entsyymin karboksyylipää" . Proc. Natl. Acad. sci. USA . 85 (5): 1398-402. DOI : 10.1073/pnas.85.5.1398 . PMC  279778 . PMID  3422741 .
• Knoll BJ, Rothblum KN, Longley M (1988). "Kaksi geenin kaksoistapahtumaa ihmisen lämpöstabiilien alkalisten fosfataasien kehityksessä". Gene . 60 (2-3): 267-76. DOI : 10.1016/0378-1119(87)90235-6 . PMID  3443302 .
• Ovitt CE, Strauss AW, Alpers DH, Chou JY, Boime I (1986). "Erikokoisten istukan alkalisen fosfataasin mRNA:iden ilmentyminen istukan ja koriokarsinoomasoluissa " Proc. Natl. Acad. sci. USA . 83 (11): 3781-5. DOI : 10.1073/pnas.83.11.3781 . PMC  323607 . PMID  3459156 .
• Millán JL (1986). "Ihmisen istukan alkalisen fosfataasin molekyylikloonaus ja sekvenssianalyysi". J Biol. Chem . 261 (7): 3112-5. PMID  3512548 .
• Ezra E, Blacher R, Udenfriend S (1984). "Ihmisen istukan alkalisen fosfataasin puhdistus ja osittainen sekvensointi". Biochem. Biophys. Res. yhteisö . 116 (3): 1076-83. DOI : 10.1016/S0006-291X(83)80252-6 . PMID  6651840 .
• Le Du MH, Stigbrand T, Taussig MJ, Menez A, Stura EA (2001). "Ihmisen istukasta peräisin olevan alkalisen fosfataasin kiderakenne 1,8 A:n resoluutiolla. Merkitys substraattispesifisyyteen". J Biol. Chem . 276 (12): 9158-65. DOI : 10.1074/jbc.M009250200 . PMID  11124260 .
• Spurway TD, Dalley JA, High S, Bulleid NJ (2001). "Varhaiset tapahtumat glykosyylifosfatidyyli-inositolin ankkurin lisäyksessä. substraattiproteiinit liittyvät transamidaasialayksikköön gpi8p”. J Biol. Chem . 276 (19): 15975-82. DOI : 10.1074/jbc.M010128200 . PMID  11278620 .
• Rump A, Kasper G, Hayes C, Wen G, Starke H, Liehr T, Lehmann R, Lagemann D, Rosenthal A (2001). "Geenien monimutkainen järjestely ihmisen 2q37.1:n kaksoiskappaleen DNA:n 220 kb:n alueella". Genomiikka . 73 (1): 50-5. DOI : 10.1006/geno.2000.6504 . PMID  11352565 .
• Wennberg C, Kozlenkov A, Di Mauro S, Fröhlander N, Beckman L, Hoylaerts MF, Millán JL (2002). "Istukan alkalisen fosfataasin (PLAP/ALPP) D-allotsyymin rakenne, genominen DNA-tyypitys ja kineettinen karakterisointi". Hyräillä. Mutat . 19 (3): 258-67. doi : 10.1002/ humu.10052 . PMID 11857742 . 
• Kozlenkov A, Manes T, Hoylaerts MF, Millán JL (2002). "Funktion määritys konservoituneille tähteille nisäkkäiden alkalisissa fosfataaseissa". J Biol. Chem . 277 (25): 22992-9. DOI : 10.1074/jbc.M202298200 . PMID  11937510 .
• Tang J, Li W (2002). "[Metodologinen tutkimus glykosyylifosfatidyyli-inositoli-spesifisen fosfolipaasi D-aktiivisuuden määrityksestä seerumissa]". Hunan Yi Ke da Xue Xue Bao . 24 (2): 119-22. PMID  11938765 .
• Lehto MT, Sharom FJ (2002). "GPI-ankkuroidun proteiinin proteiiniosan läheisyys kalvon pintaan: FRET-tutkimus." biokemia . 41 (26): 8368-76. DOI : 10.1021/bi012038+ . PMID  12081485 .
• Le Du MH, Millan JL (2003). "Rakenteellisia todisteita ihmisen alkalisten fosfataasien toiminnallisista eroista". J Biol. Chem . 277 (51): 49808-14. DOI : 10.1074/jbc.M207394200 . PMID  12372831 .
• Llinas P, Stura EA, Menez A, Kiss Z, Stigbrand T, Millán JL, Le Du MH (heinäkuu 2005). "Ihmisen istukan alkalisen fosfataasin rakennetutkimukset kompleksissa funktionaalisten ligandien kanssa". J. Mol. biol . 350 (3): 441-51. DOI : 10.1016/j.jmb.2005.04.068 . PMID  15946677 .