Haiman ribonukleaasi | |
---|---|
RNaasi A:n rakenne | |
Tunnisteet | |
Koodi KF | 3.1.27.5 |
CAS-numero | 9001-99-4 |
Entsyymitietokannat | |
IntEnz | IntEnz-näkymä |
BRENDA | BRENDA sisääntulo |
ExPASy | NiceZyme-näkymä |
MetaCyc | metabolinen reitti |
KEGG | KEGG-merkintä |
PRIAM | profiili |
ATE:n rakenteet | RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum |
Geeniontologia | AmiGO • EGO |
Hae | |
PMC | artikkeleita |
PubMed | artikkeleita |
NCBI | NCBI-proteiinit |
CAS | 9001-99-4 |
Haiman ribonukleaasi | |
---|---|
Tunnisteet | |
Symboli | RNaseA |
Pfam | PF00074 |
FIKSU | SM00092 |
PROSITE | PDOC00118 |
Saatavilla olevat proteiinirakenteet | |
Pfam | rakenteet |
ATE | RCSB ATE ; PDBe ; ATEj |
ATE-summa | 3D malli |
Haiman ribonukleaasit ( EC-koodi 3.1.27.5 , RNaasi, RNaasi I, RNaasi A, haiman RNaasi, ribonukleaasi I, endoribonukleaasi I, ribonukleiinifosfataasi, alkalinen ribonukleaasi, ribonukleaasi, s-geeniglykoproteiini S-glykoproteiini-S-glykoproteiini-Glykoproteiini-kapso-proteiini glykoproteiinit, ribonukleaatti-3'-pyrimidino-oligonukleotidihydrolaasi ) ovat pyrimidiinille spesifisiä endonukleaaseja , joita löytyy suuria määriä joidenkin nisäkkäiden ja joidenkin matelijoiden haimassa [1] .
Erityisesti entsyymit osallistuvat 3'-fosfomononukleotidien ja 3'-fosfoligonukleotidien, jotka päättyvät CP:hen tai UP:hen, endonukleolyyttiseen pilkkomiseen 2',3'-syklisten fosfaattivälituotteiden kanssa. Ribonukleaasi voi purkaa RNA-kierteen muodostaen kompleksin yksijuosteisen RNA:n kanssa; kompleksi syntyy entsyymin lysiini- ja arginiinitähteiden ja nukleotidien fosfaattiryhmien välisen laajennetun monikohtaisen kationi-anionivuorovaikutuksen seurauksena.
Naudan haiman ribonukleaasi on perheen tutkituin jäsen, ja se toimii mallijärjestelmänä proteiinien laskostumiseen , disulfidisidosten muodostukseen , proteiinikristallografiaan ja -spektroskopiaan sekä proteiinien dynamiikkaan liittyvissä töissä [2] . Ihmisen genomi sisältää 8 geeniä, joilla on yhteinen rakenne ja toiminta naudan haiman ribonukleaasin kanssa, ja lisäksi 5 pseudogeeniä. Näiden entsyymien rakenne ja dynamiikka liittyvät niiden biologisten toimintojen monimuotoisuuteen [3] .
Muita proteiineja, jotka kuuluvat haiman ribonukleaasien superperheeseen, ovat: naudan ja aivojen siemenrakkuloiden ribonukleaasit; munuaisten ei-erittävät ribonukleaasit [4] ; maksatyypin ribonukleaasi [5] ; angiogeniini , joka aiheuttaa normaalien ja pahanlaatuisten kudosten vaskularisaatiota; eosinofiilinen kationinen proteiini [6] , sytotoksiini ja helmintotoksiini, joilla on ribonukleaasiaktiivisuutta; ja sammakonmaksan ribonukleaasi ja siaalihappoa sitova lektiini. Haiman ribonukleaasien sekvenssi sisältää neljä konservoitunutta disulfidisidosta ja kolme aminohappotähdettä, jotka osallistuvat katalyyttiseen toimintaan [7] .
Ihmisgeenejä , jotka koodaavat tämän domeenin sisältäviä proteiineja, ovat mm.
Joillakin haiman ribonukleaasiperheen jäsenillä on sytotoksisia vaikutuksia. Nisäkässolut suojataan näiltä vaikutuksilta, koska niillä on erittäin korkea affiniteetti ribonukleaasi -inhibiittoriin (RI), joka suojaa solun RNA:ta haiman ribonukleaasien aiheuttamalta tuhoutumiselta [8] . Haiman RNaasit, joita RI ei estä, ovat suunnilleen yhtä myrkyllisiä kuin alfasarsiini , kurkkumätätoksiini tai risiini [9] .
RI ei estä kahta pohjoisleopardisammakon oosyyteistä eristettyä haiman ribonukleaasia , amfinaasia ja ranpyrnaasia , ja niillä on erilainen sytotoksisuus kasvainsoluja vastaan [10] . Ranpirnaasia on tutkittu vaiheen 3 kliinisissä tutkimuksissa ehdokkaana mesoteliooman hoitoon , mutta tutkimus ei osoittanut tilastollista merkitystä tärkeimmille päätepisteille [11] .
Entsyymit | |
---|---|
Toiminta | |
Säätö | |
Luokitus | |
Tyypit |
|
Hydrolaasit ( EC 3): esteraasit ( EC 3.1) | |||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
EC 3.1.1: Karboksyyliesterien hydrolaasit | |||||||||||||||
EC 3.1.2: Tioesteraasit |
| ||||||||||||||
EC 3.1.3: Fosfataasit |
| ||||||||||||||
EC 3.1.4: Fosfodiesteraasit |
| ||||||||||||||
EC 3.1.6: Sulfataasi |
| ||||||||||||||
Nukleaasit (mukaan lukien deoksiribonukleaasit ja ribonukleaasit ) |
|