Haiman ribonukleaasi

Haiman ribonukleaasi

RNaasi A:n rakenne
Tunnisteet
Koodi KF 3.1.27.5
CAS-numero 9001-99-4
Entsyymitietokannat
IntEnz IntEnz-näkymä
BRENDA BRENDA sisääntulo
ExPASy NiceZyme-näkymä
MetaCyc metabolinen reitti
KEGG KEGG-merkintä
PRIAM profiili
ATE:n rakenteet RCSB PDB PDBe PDBj PDBsum
Geeniontologia AmiGO  • EGO
Hae
PMC artikkeleita
PubMed artikkeleita
NCBI NCBI-proteiinit
CAS 9001-99-4
Haiman ribonukleaasi
Tunnisteet
Symboli RNaseA
Pfam PF00074
FIKSU SM00092
PROSITE PDOC00118
Saatavilla olevat proteiinirakenteet
Pfam rakenteet
ATE RCSB ATE ; PDBe ; ATEj
ATE-summa 3D malli

Haiman ribonukleaasit ( EC-koodi 3.1.27.5 , RNaasi, RNaasi I, RNaasi A, haiman RNaasi, ribonukleaasi I, endoribonukleaasi I, ribonukleiinifosfataasi, alkalinen ribonukleaasi, ribonukleaasi, s-geeniglykoproteiini S-glykoproteiini-S-glykoproteiini-Glykoproteiini-kapso-proteiini glykoproteiinit, ribonukleaatti-3'-pyrimidino-oligonukleotidihydrolaasi ) ovat pyrimidiinille spesifisiä endonukleaaseja , joita löytyy suuria määriä joidenkin nisäkkäiden ja joidenkin matelijoiden haimassa [1] .

Erityisesti entsyymit osallistuvat 3'-fosfomononukleotidien ja 3'-fosfoligonukleotidien, jotka päättyvät CP:hen tai UP:hen, endonukleolyyttiseen pilkkomiseen 2',3'-syklisten fosfaattivälituotteiden kanssa. Ribonukleaasi voi purkaa RNA-kierteen muodostaen kompleksin yksijuosteisen RNA:n kanssa; kompleksi syntyy entsyymin lysiini- ja arginiinitähteiden ja nukleotidien fosfaattiryhmien välisen laajennetun monikohtaisen kationi-anionivuorovaikutuksen seurauksena.

Merkittäviä perheenjäseniä

Naudan haiman ribonukleaasi on perheen tutkituin jäsen, ja se toimii mallijärjestelmänä proteiinien laskostumiseen , disulfidisidosten muodostukseen , proteiinikristallografiaan ja -spektroskopiaan sekä proteiinien dynamiikkaan liittyvissä töissä [2] . Ihmisen genomi sisältää 8 geeniä, joilla on yhteinen rakenne ja toiminta naudan haiman ribonukleaasin kanssa, ja lisäksi 5 pseudogeeniä. Näiden entsyymien rakenne ja dynamiikka liittyvät niiden biologisten toimintojen monimuotoisuuteen [3] .

Muita proteiineja, jotka kuuluvat haiman ribonukleaasien superperheeseen, ovat: naudan ja aivojen siemenrakkuloiden ribonukleaasit; munuaisten ei-erittävät ribonukleaasit [4] ; maksatyypin ribonukleaasi [5] ; angiogeniini , joka aiheuttaa normaalien ja pahanlaatuisten kudosten vaskularisaatiota; eosinofiilinen kationinen proteiini [6] , sytotoksiini ja helmintotoksiini, joilla on ribonukleaasiaktiivisuutta; ja sammakonmaksan ribonukleaasi ja siaalihappoa sitova lektiini. Haiman ribonukleaasien sekvenssi sisältää neljä konservoitunutta disulfidisidosta ja kolme aminohappotähdettä, jotka osallistuvat katalyyttiseen toimintaan [7] .

Ihmisen geenit

Ihmisgeenejä , jotka koodaavat tämän domeenin sisältäviä proteiineja, ovat mm.

Sytotoksisuus

Joillakin haiman ribonukleaasiperheen jäsenillä on sytotoksisia vaikutuksia. Nisäkässolut suojataan näiltä vaikutuksilta, koska niillä on erittäin korkea affiniteetti ribonukleaasi -inhibiittoriin (RI), joka suojaa solun RNA:ta haiman ribonukleaasien aiheuttamalta tuhoutumiselta [8] . Haiman RNaasit, joita RI ei estä, ovat suunnilleen yhtä myrkyllisiä kuin alfasarsiini , kurkkumätätoksiini tai risiini [9] .

RI ei estä kahta pohjoisleopardisammakon oosyyteistä eristettyä haiman ribonukleaasia  , amfinaasia ja ranpyrnaasia  , ja niillä on erilainen sytotoksisuus kasvainsoluja vastaan ​​[10] . Ranpirnaasia on tutkittu vaiheen 3 kliinisissä tutkimuksissa ehdokkaana mesoteliooman hoitoon , mutta tutkimus ei osoittanut tilastollista merkitystä tärkeimmille päätepisteille [11] .

Muistiinpanot

 

  1. "Kilpikonnan haiman ribonukleaasin rakenteen vertailu nisäkkäiden ribonukleaasien rakenteen kanssa". FEBS Lett . 194 (2): 338-343. 1986. DOI : 10.1016/0014-5793(86)80113-2 . PMID  3940901 .
  2. "Takaisin tulevaisuuteen: ribonukleaasi A". biopolymeerit . 90 (3): 259-77. 2008. doi : 10.1002/ bip.20845 . PMID 17868092 . 
  3. "Biologiseen toimintaan liittyvän dynamiikan säilyminen entsyymien superperheessä". rakennetta . 26 (3): 426-436. maaliskuu 2018. DOI : 10.1016/j.str.2018.01.015 . PMID29478822  . _
  4. "Ihmisen eosinofiilistä peräisin olevan neurotoksiinin molekyylikloonaus: ribonukleaasigeeniperheen jäsen". Proc. Natl. Acad. sci. USA . 86 (12): 4460-4464. 1989. doi : 10.1073/pnas.86.12.4460 . PMID2734298  _ _
  5. "Sian maksan ribonukleaasin primäärirakenne, uusi jäsen ribonukleaasien superperheeseen". biokemia . 28 (25): 9806-9813. 1989. doi : 10.1021/ bi00451a040 . PMID 2611266 . 
  6. "Ihmisen eosinofiilin kationinen proteiini. Ribonukleaasiaktiivisen sytotoksiinin ja helmintotoksiinin molekyylikloonaus". J. Exp. Med . 170 (1): 163-176. 1989. doi : 10.1084/ jem.170.1.163 . PMID2473157 _ _ 
  7. "Ribonukleaasi A". Chem. Rev. _ 98 (3): 1045-1066. 1998. doi : 10.1021/ cr960427h . PMID 11848924 . 
  8. Gaur, D (6. heinäkuuta 2001). "Ihmisen haiman ribonukleaasin vuorovaikutus ihmisen ribonukleaasi-inhibiittorin kanssa. Inhibiittoriresistenttien sytotoksisten varianttien luominen . The Journal of Biological Chemistry . 276 (27): 24978-84. doi : 10.1074/ jbc.m102440200 . PMID 11342552 . 
  9. Saxena, SK (5. marraskuuta 1991). "RNaasien ja toksiinien vertailu Xenopus-oosyytteihin injektoinnissa" . The Journal of Biological Chemistry . 266 (31): 21208-14. PMID  1939163 .
  10. "Ribonukleaasit uusina kemoterapeuttisina lääkkeinä: ranpirnaasiesimerkki". BioDrugs . 22 (1): 53-58. 2008. DOI : 10.2165/00063030-200822010-00006 . PMID  18215091 .
  11. Alfacell vuosikertomus 2009 . Haettu 2. helmikuuta 2015. Arkistoitu alkuperäisestä 8. huhtikuuta 2019.