Syndekan 1
Syndecan 1 ( englanniksi syndecan 1; CD138 ) on kalvoproteiini , syndekaaniperheen proteoglykaani tai transmembraaniset heparaanisulfaattiproteoglykaanit. Yhteensä 4 tämän perheen proteiinia on kuvattu. Ihmisen geenituote SDC1 .
Toiminnot
Proteiini on transmembraaninen heparaanisulfaattiproteoglykaani, joka kuuluu syndekaanien perheeseen. Syndekaanit välittävät solujen sitoutumista, solusignalointia ja sytoskeleton organisointia . Ne ovat HIV - viruksen Tat -proteiinin reseptoreita . Syndecan 1 osallistuu solujen lisääntymiseen, solujen migraatioon ja soluvuorovaikutukseen solunulkoisten matriisiproteiinien kanssa. [yksi]
Rakenne
Syndecan 1 kuljettaa heparaanisulfaatti- ja kondroitiinisulfaattiketjuja , jotka tarjoavat kommunikaatiota sytoskeleton ja solunulkoisen matriisin välillä. Sitoutuu CDCP1 :een .
Ektodomeenin pilkkominen johtaa proteiinin liukoisen muodon muodostumiseen. Halkeaminen voi tapahtua heparanaasin, trombiinin ja epidermaalisen kasvutekijän vaikutuksesta sekä stressin aikana ja haavan paranemisen aikana.
Proteiini koostuu 288 aminohaposta, proteiiniosan molekyylipaino on 32,5 kDa. Sisältää N-terminaalisen ekstrasellulaarisen domeenin (232 aminohappoa), yhden kierteisen transmembraanifragmentin ja pienen sytosolisen alueen. Solunulkoisessa domeenissa on 6 glykosylaatiokohtaa : 3 O -kondroitiinisulfaattiketjun kiinnityskohtaa, 2 O -heparaanisulfaattiketjun kiinnityskohtaa ja 1 N -glykosylaatiokohta . Sytosolinen fragmentti sisältää fosforyloitua tyrosiinia .
Sovellus
Syndecan 1:tä käytetään plasmasolujen markkerina [2] , jos solujen tiedetään olevan peräisin verisoluista. [3]
Katso myös
Muistiinpanot
- ↑ Entrez Gene: SDC1 syndecan 1 . (määrätön)
- ↑ Rawstron AC Plasmasolujen immunofenotyypitys (neopr.) // Curr Protoc Cytom. - 2006. - toukokuu ( osa 6 ). — C. Yksikkö 6.23 . - ISBN 0-471-14295-6 . - doi : 10.1002/0471142956.cy0623s36 . — PMID 18770841 .
- ↑ O'Connell FP, Pinkus JL, Pinkus GS CD138 (syndecan-1), plasmasolumarkkerin immunohistokemiallinen profiili hematopoieettisissa ja ei-hematopoieettisissa kasvaimissa // Am . J. Clin. Pathol. : päiväkirja. - 2004. - Helmikuu ( osa 121 , nro 2 ) . - s. 254-263 . - doi : 10.1309/617D-WB5G-NFWX-HW4L . — PMID 14983940 . Arkistoitu alkuperäisestä 9. kesäkuuta 2011. (linkki ei saatavilla)
Kirjallisuus
- Teng YH, Aquino RS, Park PW Syndecan-1:n molekyylifunktiot taudissa // Matrix Biol . : päiväkirja. - 2012. - tammikuu ( osa 31 , nro 1 ). - s. 3-16 . - doi : 10.1016/j.matbio.2011.10.001 . — PMID 22033227 .
- Katz BZ Adhesion molecules - The lifelines of multippeli myeloomasolujen (englanniksi) // Semin. Cancer biol. : päiväkirja. - 2010. - Kesäkuu ( osa 20 , nro 3 ) - s. 186-195 . - doi : 10.1016/j.semcancer.2010.04.003 . — PMID 20416379 .
- Bass MD, Morgan MR, Humphries MJ Syndecans luopuivat maineestaan inertteinä molekyyleinä // Sci Signal : päiväkirja. - 2009. - Maaliskuu ( osa 2 , nro 64 ). — P. pe18 . - doi : 10.1126/scisignal.264pe18 . — PMID 19336838 .
Linkit
Proteiinit : Erilaistumisklusterit |
---|
1-50 |
- CD1 ( AC , 1A , 1D , 1E )
- CD2
- CD3 ( γ , δ , ε )
- CD4
- CD5
- CD6
- CD7
- CD8 ( a )
- CD9
- CD10
- CD11 ( a , b , c , d )
- CD13
- CD14
- CD15
- CD16 ( A , B )
- CD18
- CD19
- CD20
- CD21
- CD22
- CD23
- CD24
- CD25
- CD26
- CD27
- CD28
- CD29
- CD30
- CD31
- CD32 ( A , B )
- CD33
- CD34
- CD35
- CD36
- CD37
- CD38
- CD39
- CD40
- CD41
- CD42 ( a , b , c , d )
- CD43
- CD44
- CD45
- CD46
- CD47
- CD48
- CD49 ( a , b , c , d , e , f )
- CD50
|
---|
51-100 |
- CD51
- CD52
- CD53
- CD54
- CD55
- CD56
- CD57
- CD58
- CD59
- CD61
- CD62 ( E , L , P )
- CD63
- CD64 ( A , B , C )
- CD66 ( a , b , c , d , e , f )
- CD68
- CD69
- CD70
- CD71
- CD72
- CD73
- CD74
- CD78
- CD79 ( a , b )
- CD80
- CD81
- CD82
- CD83
- CD84
- CD85 ( a , d , e , h , j , k )
- CD86
- CD87
- CD88
- CD89
- CD90
- CD91
- CD92
- CD93
- CD94
- CD95
- CD96
- CD97
- CD98
- CD99
- CD100
|
---|
101-150 |
|
---|
151-200 |
- CD151
- CD152
- CD153
- CD154
- CD155
- CD156 ( a , b , c )
- CD157
- CD158 ( a , d , e , i , k )
- CD159 ( a , c )
- CD160
- CD161
- CD162
- CD163
- CD164
- CD166
- CD167 ( a , b )
- CD168
- CD169
- CD170
- CD171
- CD172 ( a , b , g )
- CD174
- CD177
- CD178
- CD179 ( a , b )
- CD181
- CD182
- CD183
- CD184
- CD185
- CD186
- CD191
- CD192
- CD193
- CD194
- CD195
- CD196
- CD197
- CDw198
- CDw199
- CD200
|
---|
201-250 |
|
---|
251-300 |
|
---|
301-350 |
|
---|
351-400 |
|
---|