Integriini alfa-5

Integriini alfa-5
Käytettävissä olevat rakenteet
ATE Ortologinen haku: PDBe , RCSB
Tunnisteet
SymboliITGA5  ; CD49e; FNRA; VLA5A
Ulkoiset tunnuksetOMIM:  135620 MGI :  96604 Homologeeni :  20508 ChEMBL : 3955 GeneCards : ITGA5 Gene
RNA-ekspressioprofiili
Lisää tietoa
ortologit
NäytäIhmisenHiiri
Entrez367816402
YhtyeENSG00000161638ENSMUSG00000000555
UniProtP08648P11688
RefSeq (mRNA)NM_002205NM_010577
RefSeq (proteiini)NP_002196NP_034707
Locus (UCSC)Chr 12:
54,79 – 54,81 Mb
Chr 15:
103,34 – 103,37 Mb
Hae PubMedistä[yksi][2]


Integriini alfa-5 (α5, CD49e ) on kalvoproteiini , glykoproteiini integriinien superperheestä , ITGA5 -geenin tuote, integriini α5β1 ( VLA-5 ) alfa-alayksikkö , yksi tärkeimmistä fibronektiinireseptoreista . Sillä on rooli solujen välisessä vuorovaikutuksessa.

Toiminnot

Integriini alfa-5 / beeta-1 (α5β1, englantilainen  very late antigen-5 , VLA-5 ) on fibronektiinin ja fibrinogeenin reseptori . Tunnistaa spesifisen aminohapposekvenssin glysiini-proliini-arginiini (RGD) useissa ligandeissa. HIV-infektion aikana vuorovaikutus viruksen Tat-peptidin kanssa tehostaa angiogeneesiä Kaposin sarkoomassa [1] .

Vuorovaikuttaa solunsisäisten proteiinien HPS5 , NISCH sekä RAB21 :n ja COMP:n kanssa. Sitoutuu HIV-1-viruksen Tat-peptidiin.

Rakenne

Integriini alfa-5 on suuri proteiini, koostuu 1008 aminohaposta , proteiiniosan molekyylipaino on 114,5 kDa . N-terminaalinen alue (954 aminohappoa) on solunulkoinen, jota seuraa yksi transmembraaninen fragmentti ja lyhyt solunsisäinen fragmentti (28 aminohappoa). Solunulkoinen fragmentti sisältää 7 FG-GAP-toistoa, SG1-motiivin, joka liittyy vuorovaikutukseen kondroitiinisulfaattien kanssa, ja 5 - 15 N-glykosylaatiokohtaa . Sytosolinen kohta sisältää GFFKR- motiivin ja HPS5-sitoutumiskohdan.

Rajoitetun proteolyysin prosessissa molekyylinsisäinen sidos hydrolysoituu ja muodostuu raskas- ja kevytketjuja, jotka liittyvät disulfidisidoksella [2] .

Muistiinpanot

  1. Uniprot-tietokantamerkintä CD49e:lle (liityntänumero P08648) . Haettu 21. helmikuuta 2012. Arkistoitu alkuperäisestä 2. helmikuuta 2017.
  2. Entrez-geeni: ITGA5-integriini, alfa 5 (fibronektiinireseptori, alfa-polypeptidi) .

Katso myös

Bibliografia

Linkit