P-glykoproteiini

P-glykoproteiini
(monilääkeresistenssin proteiini 1)

Monilääkeresistenssin proteiinin rakenne. Proteiinin likimääräinen sijainti solukalvossa on merkitty sinisellä (ulkopuolella) ja punaisella (sisällä). Kaaviossa näkyy myös QZ59, proteiini-inhibiittori, tilaa täyttävänä mallina. . [yksi]
Käytettävissä olevat rakenteet
ATE Ortologinen haku: PDBe , RCSB
Tunnisteet
SymboliABCB1  ; ABC20; CD243; CLCS; GP170; MDR1; PGP; PGY1
Ulkoiset tunnuksetOMIM:  171050 MGI :  97570 Homologeeni :  55496 ChEMBL : 4302 GeneCards : ABCB1 Gene
EY-numero3.6.3.44
RNA-ekspressioprofiili
Lisää tietoa
ortologit
NäytäIhmisenHiiri
Entrez524318671
YhtyeENSG00000085563ENSMUSG00000040584
UniProtP08183P21447
RefSeq (mRNA)NM_000927NM_011076
RefSeq (proteiini)NP_000918NP_035206
Locus (UCSC)Chr 7:
87,13 – 87,34 Mb
Chr 5:
8,66 – 8,75 Mb
Hae PubMedistä[yksi][2]

P-glykoproteiini tai monilääkeresistenssiproteiini 1 (MDR1; CD243) on kalvoproteiini , ABC - kantajaperheen glykoproteiini . Tarjoaa monien aineiden, kuten lipidien, steroidien, peptidien, bilirubiinin jne., siirtymisen solukalvon läpi. ABCB1 - geenituote ( ATP:tä sitovan kasetin alaperheen B jäsen 1 ) . 

Tämän proteiiniryhmän löysi kiinalainen biologi Victor Ling useille lääkkeille vastustuskykyisistä kiinalaisen hamsterin munasarjasoluista. P-glykoproteiinit ovat osa ATP-riippuvaisia ​​kalvokuljetusproteiineja. Näiden proteiinien ilmentymisen lisääntyminen kasvainsoluissa vähentää lääkkeiden pitoisuuksia, mikä johtaa laajakirjoisten syöpälääkkeiden sytotoksisuuden vähenemiseen. P-glykoproteiinin estäjät voivat tehostaa useiden kliinisesti tärkeiden syöpälääkkeiden vaikutuksia [2] .

Gene

Havaittiin, että ABCB1 -geenin polymorfismilla on vain pieni vaikutus P-glykoproteiinin mRNA:n ja proteiinin ilmentymiseen sekä kudosilmentymiseen (ensisijaisesti maksassa, suolistossa ja sydämessä). Vaikka ABCB1- polymorfismeja ja haplotyyppejä on liitetty muutoksiin lääkejakaumassa ja lääkevasteessa, mukaan lukien sivuvaikutukset, tällä ei ole juurikaan kliinistä merkitystä [3] .

Proteiini

P-glykoproteiini on transmembraaninen proteiini, jonka molekyylipaino on 170 kDa, mukaan lukien N-terminaalinen glykosylaatio 10-15 kDa. Proteiini sisältää 6 transmembraanidomeenia N-terminaalisessa osassa, suuren sytosolisen domeenin, jossa on ATP -sitoutumiskohta , sitten taas 6 transmembraanidomeenia ja toisen ATP-sitoutumiskohdan. Proteiinin toinen puolisko on 65-prosenttisesti homologinen ensimmäisen puoliskon aminohapposekvenssin kanssa [4] . Nisäkkään P-glykoproteiinin rakenne selvitettiin vuonna 2009 [5] perustuen hiiren MDR3 -geeniin , joka ilmentyy heterologisesti Pichia pastoris -hiivassa . Hiiren P-glykoproteiinin rakenne oli rakenteeltaan samanlainen kuin bakteerien ABC-kuljettaja MsbA (3B5W ja 3B5X) [6] , jolla on sisäänpäin kovera konformaatio, jota pidetään tärkeänä substraatin sitoutumiselle kalvon sisäpinnalle. Lisäksi proteiinin lisärakenteet (3G60 ja 3G61) paljastivat sitoutumiskohdat kahdelle sykliselle peptidisubstraatille/inhibiittorille. P-glykoproteiinimolekyylin sitoutumiskohdat on vuorattu aromaattisilla aminohappotähteillä. Molekyylimallinnus on vahvistanut, että tällä sekvenssillä on suora vaikutus kuljettajan rakenteelliseen stabiilisuuteen sen nukleotideja sitovissa domeeneissa ja se määrittää sisäisten ligandia sitovien taskujen rajan [7] .

Kudosten ja solujen lokalisointi

P-glykoproteiini ekspressoituu tietyissä maksan, haiman, munuaisten, paksusuolen ja tyhjäsuolen soluissa [8] . Proteiinia on löydetty myös aivojen kapillaarien endoteelisoluista [9] .

Toiminnot

Substraatti saavuttaa P-glykoproteiinin joko kalvon kaksoiskerroksen sisäkerroksen kautta tai sytoplasmasta. ATP sitoutuu proteiiniin solun sytoplasmisella puolella. Substraatin ja ATP:n sitoutumisen jälkeen ATP:n hydrolyysi johtaa substraatin siirtymiseen asentoon, josta jälkimmäinen voidaan erittää solusta. Fosfaattiryhmän vapautuminen tapahtuu samanaikaisesti substraatin erittymisen kanssa. ADP poistuu katalyyttisestä kohdasta ja uusi ATP-molekyyli sitoutuu toissijaiseen ATP:tä sitovaan kohtaan. ATP:n hydrolyysi ja ADP:n ja fosfaatin poistaminen nollaavat proteiinin niin, että prosessi voi alkaa uudelleen.

P-glykoproteiini kuuluu ABC-kuljettajien superperheeseen . ABC-kantajat sisältävät lukuisia sekä solunulkoisia että intrasellulaarisia proteiineja. Näiden proteiinien geenit on jaettu 7 erilliseen alaperheeseen: ABC1, MDR/TAP, MRP, ALD, OABP, GCN20 ja White. P-glykoproteiinigeeni on osa MDR/TAP-alaperhettä, jonka jäsenet liittyvät monilääkeresistenssiin. P-glykoproteiini on ATP-riippuvainen pumppu laajakirjoisille ksenobiooteille . Proteiini on vastuussa lääkkeiden vähentyneestä kertymisestä monilääkeresistenttisiin soluihin ja välittää usein resistenssin kehittymistä syöpälääkkeille. Lisäksi proteiini toimii myös kantajana veri-aivoesteessä . Geenimutaatiot liittyvät kolkisiiniresistenssiin ja tyypin 13 tulehduksellisen suolistosairauden kehittymiseen . Vaihtoehtoinen silmukointi ja vaihtoehtoiset promoottorit johtavat useiden proteiinivarianttien muodostumiseen [10] .

P-glykoproteiini kuljettaa lukuisia substraatteja solukalvon läpi, mukaan lukien seuraavat:


Muistiinpanot

  1. ATE 3G60 ; Aller SG, Yu J., Ward A., Weng Y., Chittaboina S., Zhuo R., Harrell PM, Trinh YT, Zhang Q., Urbatsch IL, Chang G. P-glykoproteiinin rakenne paljastaa polyn molekyyliperustan -spesifinen lääkesidonna  (englanniksi)  // Science: Journal. - 2009. - maaliskuu ( nide 323 , nro 5922 ). - P. 1718-1722 . - doi : 10.1126/tiede.1168750 . — PMID 19325113 .
  2. Abdallah M., Al-Abd AM, El-Dine R. El-Halawany S. Ali M. Luonnollista alkuperää olevat P-glykoproteiini-inhibiittorit mahdollisina kasvaimen  kemoherkistäjänä : //Arvostelu Tekijän linkit avoimeen peittopaneeliinHossam - 2015. - Vol. 6 , ei. 1 . - s. 45-62 . - doi : 10.1016/j.jare.2014.11.008 .
  3. Wolking S, Schaeffeler E, Lerche H, Schwab M, Nies AT (heinäkuu 2015). "ABCB1:n (MDR1, P-glykoproteiini) geneettisten polymorfismien vaikutus lääkkeiden jakautumiseen ja mahdollisiin kliinisiin vaikutuksiin: Kirjallisuuden päivitys." Kliininen farmakokinetiikka . 54 (7): 709-35. DOI : 10.1007/s40262-015-0267-1 . PMID  25860377 . S2CID  35961181 .
  4. Franck Viguie. ABCB1 . Onkologian ja hematologian genetiikan ja sytogenetiikan atlas (1. maaliskuuta 1998). Haettu 2. maaliskuuta 2008. Arkistoitu alkuperäisestä 20. heinäkuuta 2011.
  5. Aller SG, Yu J, Ward A, Weng Y, Chittaboina S, Zhuo R, Harrell PM, Trinh YT, Zhang Q, Urbatsch IL, Chang G (maaliskuu 2009). "P-glykoproteiinin rakenne paljastaa molekyyliperustan polyspesifiselle lääkesitoutumiselle" . tiede . 323 (5922): 1718-22. Bibcode : 2009Sci...323.1718A . DOI : 10.1126/tiede.1168750 . PMC2720052  _ _ PMID  19325113 .
  6. Ward A, Reyes CL, Yu J, Roth CB, Chang G (marraskuu 2007). "Joustavuus ABC-kuljettimessa MsbA: Vuorotteleva pääsy kierteellä" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America . 104 (48): 19005-10. Tuotekoodi : 2007PNAS..10419005W . DOI : 10.1073/pnas.0709388104 . PMC2141898 _ _ PMID 18024585 .  
  7. Ferreira RJ, Ferreira MJ, Dos Santos DJ (kesäkuu 2012). "Molecular Dynamics Simulaatioiden avulla saatuja näkemyksiä P-glykoproteiinin ulosvirtausmekanismista." Journal of Chemical Theory and Computation . 8 (6): 1853-64. DOI : 10.1021/ct300083m . PMID26593820  _ _
  8. Thiebaut F, Tsuruo T, Hamada H, Gottesman MM, Pastan I, Willingham MC (marraskuu 1987). "Monilääkeresistenssin geenituotteen P-glykoproteiinin lokalisointi ihmisen normaaleihin kudoksiin " Proceedings of the National Academy of Sciences of the United of America . 84 (21): 7735-8. Bibcode : 1987PNAS...84.7735T . DOI : 10.1073/pnas.84.21.7735 . PMC299375  _ _ PMID  2444983 .
  9. Schinkel AH (huhtikuu 1999). "P-glykoproteiini, veri-aivoesteen portinvartija." Advanced Drug Delivery -arvostelut . 36 (2-3): 179-194. DOI : 10.1016/S0169-409X(98)00085-4 . PMID  10837715 .
  10. Entrez Gene: ABCB1 . Haettu 9. maaliskuuta 2021. Arkistoitu alkuperäisestä 5. joulukuuta 2010.
  11. Desloratadiini: Tietoja lääkkeistä . Ajantasainen . Haettu 1. helmikuuta 2019. Arkistoitu alkuperäisestä 2. helmikuuta 2019.

Bibliografia